{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304174442853],
[244.851017621876, 618.3147101610941, 0, 1, 0.2836662876441731, 0, 0.001617299384223711, 0.004908272422330581, 0.7163337123558269, 1, 0.001136304092364537],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136303865841722],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136543758438441],
[243.6711513911449, 616.4945763918253, 1, 0, 0.2832839574057361, 0.0041038916354722, 0, -0.01245472442215132, 1, 0.2832839574057362, 0.001137090416373974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136243938675198],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135741996484766],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001136508671117746],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136013330290512],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.00113638345226076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113611901901971],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001134959092451013],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.00113489600298077],
[244.6303082830166, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136760631731905],
[244.6303082830166, 618.4649153573753, 0, 1, 0.2834337412402849, 0, 0.001616906594325011, 0.00490708036114119, 0.7165662587597151, 1, 0.001135786455720309],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136326909695434],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136760571085588],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135799084601649],
[244.7040900017615, 618.4616377812088, 0, 2, 0.2834960681655894, 0, 0.00323383032644546, 0.009814212733041517, 0.5133778843341698, 1, 0.002273566643729383],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135907860537798],
[244.4669113575938, 618.5347836825783, 1, 0, 0.2832751230531639, 0.004090533129603175, 0, -0.01241418326656809, 1, 0.2832751230531638, 0.001136326909692079],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136362242282595],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135327972274881],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326930776762],
[244.4179688448247, 618.7161193222879, 1, 0, 0.2831749692146356, 0.004091352222286393, 0, -0.01241666909576433, 1, 0.2831749692146357, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135674668944846],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134989886186387],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092481173],
[244.735927391847, 618.4831026170242, 0, 1, 0.2835154449610915, 0, 0.001616859047189229, 0.00490693606238142, 0.7164845550389085, 1, 0.001136167787607203],
[244.7943410258146, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2835709766691778, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2835709766691779, 0.001134926672584438],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134895988356016],
[244.571696874821, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237105, 1, 0.001136326909734247],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768045457],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.001134989794252966],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326847308766],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.9524069503342, 616.2133208326359, 0, 1, 0.2836109357427064, 0, 0.001622814642579921, 0.004925010442981473, 0.7163890642572937, 1, 0.001135441544587106],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001135060261031333],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134895941647983],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.00113489600298077],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135708916896092],
[243.6876206964532, 616.478107086517, 0, 1, 0.2833031040710546, 0, 0.001622117620244476, 0.004922895079839568, 0.7166968959289455, 1, 0.001135575117482317],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135343390786118],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.00113597773778366],
[244.7530325145305, 618.4126952684396, 1, 0, 0.2835527693426562, 0.004085751215117761, 0, -0.01239967083972637, 1, 0.2835527693426563, 0.001136304179052142],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909699152],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252352, 1, 0.001135675022256527],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136362015641399],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326909699152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4985810593658, 616.8311794664024, 1, 1, 0.283029359475555, 0.004106800112137805, 0.001621189124818662, -0.007543474004076465, 0.9198943816748568, 0.4859531006259672, 0.002278297633057927],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135197926228176],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134989886179768],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959123107456],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.0011348960187613],
[244.7772359031311, 618.4417941057401, 0, 1, 0.2835632989933222, 0, 0.001616967044483125, 0.004907263818729125, 0.7164367010066779, 1, 0.00113532797243293],
[245.0571623816469, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2839051117229516, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7160948882770484, 1, 0.001134926611397587],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134959121632363],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362242272474],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.001136565954987474],
[244.7040900017614, 618.4649153573752, 1, 0, 0.283494991690472, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834949916904721, 0.001134959092488967],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747649, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252351, 1, 0.001134959092481173],
[244.5571623816469, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833433457105025, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166566542894975, 1, 0.001136220921571865],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001135771299063793],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001136326909692079],
[244.5571623816469, 618.6085654013232, 0, 1, 0.2833258486870057, 0, 0.001616531124736769, 0.00490594086461793, 0.7166741513129944, 1, 0.001134959194852489],
[244.735729617619, 618.4299981653512, 0, 1, 0.2835327234854649, 0, 0.001616997886529798, 0.004907357419931604, 0.716467276514535, 1, 0.001136167787607203],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362242138321],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134959092481173],
[243.6551474889924, 616.5105802939777, 1, 0, 0.2832653518026115, 0.004104161189720718, 0, -0.01245554248076015, 1, 0.2832653518026116, 0.001136259909346522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136407996798231],
[244.0639928774432, 619.1333745213846, 0, 1, 0.2827441348818166, 0, 0.001615160870261664, 0.004901782338177284, 0.7172558651181834, 1, 0.001138900277852651],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326909695325],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135327962569418],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362015800071],
[244.9412686459292, 618.388491879839, 1, 0, 0.283716929318827, 0.004082611335885312, 0, -0.01239014175513238, 1, 0.283716929318827, 0.001134896002858942],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362242086921],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001138790646592911],
[244.9215217644544, 618.2442060185158, 0, 1, 0.2837479685315265, 0, 0.001617483819929323, 0.004908832158330221, 0.7162520314684735, 1, 0.001134959195065098],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136340563261431],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768025059],
[244.6104646075479, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833876007054018, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166123992945982, 1, 0.001136304141952816],
[243.9590095859879, 616.0145971651308, 0, 1, 0.2836819731103574, 0, 0.001623338155624804, 0.004926599230231376, 0.7163180268896426, 1, 0.001135852021131916],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.001134984732671001],
[244.6104646075479, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833876007054019, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166123992945981, 1, 0.001136304092178205],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252352, 1, 0.001134959092451013],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.001135799084601649],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136760571098302],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002984506],
[245.0571623816469, 617.9445326585252, 1, 1, 0.283959074228979, 0.004080680565633176, 0.001618268221741186, -0.007473069437748363, 0.9193672441630211, 0.4872853926209793, 0.002278943472655956],
[244.8332055525355, 618.3325222304346, 1, 0, 0.2836456518974478, 0.004084413295750536, 0, -0.01239561044571552, 1, 0.2836456518974477, 0.00113489600298077],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092576249],
[244.6869848790779, 618.5320451297932, 0, 1, 0.2834587472852206, 0, 0.001616731110172569, 0.004906547791825706, 0.7165412527147794, 1, 0.001138790646591015],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134926611318127],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959183002185],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136595506479988],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.00113622000325613],
[245.2040900017614, 617.9616377812087, 0, 1, 0.2840753312015353, 0, 0.001618223428222017, 0.0049110767637643, 0.7159246687984647, 1, 0.001134896018988621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.2258154646438, 616.9399123183264, 0, 1, 0.2827662247036335, 0, 0.001620903397613257, 0.004919210087738837, 0.7172337752963664, 1, 0.001136106307420056],
[244.5749744509875, 618.5907533319827, 1, 0, 0.283346484433731, 0.004088725766995424, 0, -0.01240869817943375, 1, 0.283346484433731, 0.001135779805205712],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136304116293028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.9959393005745, 616.1697884823956, 0, 1, 0.2836615450018691, 0, 0.00162292929431507, 0.004925358394607062, 0.7163384549981309, 1, 0.001135046895279216],
[244.7745941443398, 618.3911336386303, 0, 1, 0.2835777490529428, 0, 0.001617099511301161, 0.004907665836584434, 0.7164222509470572, 1, 0.001139082776022593],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136394697829286],
[244.2040900017615, 618.9616377812088, 0, 1, 0.2829168051296435, 0, 0.001615609011868165, 0.004903142383886785, 0.7170831948703565, 1, 0.001136326909692079],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326847308766],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002995784],
[244.8063347404315, 618.3593930425386, 0, 1, 0.2836145213610524, 0, 0.001617182517564195, 0.004907917748726183, 0.7163854786389476, 1, 0.001134959195065098],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113624541938497],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136211768804074],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326909695325],
[244.1303082830165, 616.0354194999536, 1, 1, 0.2838177579014325, 0.004096173093103685, 0.001623283285905406, -0.007504867041026943, 0.9194474802998039, 0.4870829961026688, 0.002281886650848195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136355001457978],
[245.0082198688779, 618.1042056881913, 0, 1, 0.2838659398406238, 0, 0.001617850179302064, 0.00490994400665183, 0.7161340601593762, 1, 0.001139473915074826],
[244.3999601346451, 618.7974072641825, 0, 1, 0.2831333474418761, 0, 0.001616037798899618, 0.004904443691227937, 0.7168666525581239, 1, 0.001136168097952926],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136362242086283],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326847266605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001139157250897366],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001135552478711769],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135582048087408],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703298281],
[244.836483128702, 618.3292446542682, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.004908157048114279, 0.7163505509451107, 1, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909692079],
[245.071696874821, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.0011361676802018],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136361898504498],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092451013],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134959182891686],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135469812686456],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136217173027303],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909695325],
[244.4669113575938, 618.5347836825783, 1, 0, 0.2832751230531639, 0.004090533129603175, 0, -0.01241418326656809, 1, 0.2832751230531638, 0.001136362133123861],
[244.5400572589634, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2833598805939544, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7166401194060457, 1, 0.001136565969008557],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001134959092451013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7856058037987, 616.4334242050725, 0, 1, 0.2833994567654294, 0, 0.001622235201294543, 0.004923251921517159, 0.7166005432345706, 1, 0.00113518033641552],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001135539710268432],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.00113632690969197],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134895972236454],
[243.5235879536552, 616.6421398293151, 0, 1, 0.2831124050725943, 0, 0.001621686121348757, 0.004921585542378057, 0.7168875949274056, 1, 0.001136260000372938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136407996807308],
[244.6722526116759, 618.3013541394428, 0, 1, 0.2835222893233157, 0, 0.00161733431975385, 0.004908378446670177, 0.7164777106766843, 1, 0.001135568428388351],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326909667326],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[245.2040900017615, 617.9616377812087, 0, 1, 0.2840753312015353, 0, 0.001618223428222017, 0.0049110767637643, 0.7159246687984647, 1, 0.001134926672580694],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.00113616768025059],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326930776656],
[244.6551474889924, 618.5638825198787, 1, 0, 0.283421865116294, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834218651162941, 0.001134959183002185],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135675022418448],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703170818],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6876206964532, 616.6313473232675, 0, 1, 0.284084792953092, 0, 0.001621714504688897, 0.004921671681757704, 0.715915207046908, 1, 0.001135762593523238],
[245.0400572589634, 618.702290642382, 0, 1, 0.2836957778605424, 0, 0.001616286241581111, 0.004905197679248956, 0.7163042221394575, 1, 0.001135535798870248],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136362250446393],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326909699152],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909561304],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135675022418448],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703329891],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002877808],
[243.7537684137132, 616.6767456231381, 0, 1, 0.2832927987061992, 0, 0.001621595117859556, 0.00492130935979817, 0.7167072012938008, 1, 0.001135607350421349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6551474889924, 618.6429734209182, 1, 0, 0.2833958994734374, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2833958994734374, 0.001135071392935534],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135710704948764],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304209641757],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136167669683785],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134989884641141],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 0, 1, 0.2839898531567402, 0, 0.001618030243006283, 0.004910490474252265, 0.7160101468432598, 1, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136304093984812],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.001136595506479988],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136217173027822],
[244.2040900017615, 618.9616377812088, 0, 1, 0.2829168051296435, 0, 0.001615609011868165, 0.004903142383886785, 0.7170831948703565, 1, 0.001136326909699152],
[244.9902111586982, 618.2071562401295, 1, 0, 0.2838171435774364, 0.004081795738982512, 0, -0.01238766653512995, 1, 0.2838171435774364, 0.001134896002903377],
[244.6309441003918, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2835513401277764, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7164486598722235, 1, 0.001136245419247023],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136211768804074],
[244.4179688448247, 618.7161193222879, 1, 0, 0.2831749692146356, 0.004091352222286393, 0, -0.01241666909576433, 1, 0.2831749692146357, 0.00113632684868683],
[243.8516534392512, 617.0599064544271, 0, 1, 0.2832482043444354, 0, 0.00162058819498728, 0.004918253492830301, 0.7167517956555646, 1, 0.001137680352920798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.8345538365627, 0, 1, 0.2833736414088912, 0, 0.001615940793545451, 0.004904149293845906, 0.7166263585911088, 1, 0.001136467830196756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.8516534392512, 616.686990399073, 0, 1, 0.2833709504916382, 0, 0.001621568178944193, 0.004921227604041227, 0.7166290495083618, 1, 0.001137316574521506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136303275805219],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326909692079],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896003032628],
[244.404319847777, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2831312926978282, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7168687073021718, 1, 0.001136167680096718],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362133098755],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136326899700658],
[245.0571623816469, 618.1085654013233, 0, 1, 0.2839051117229515, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280318, 0.7160948882770485, 1, 0.001134989886055493],
[245.0716968748209, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.001136167680405778],
[244.7530325145305, 618.4126952684396, 1, 0, 0.2835527693426562, 0.004085751215117762, 0, -0.01239967083972637, 1, 0.2835527693426563, 0.001136304211450815],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896002995784],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136595506479988],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.00113622000325613],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896018768886],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001134959092606409],
[244.8332055525355, 618.3325222304346, 1, 0, 0.2836456518974478, 0.004084413295750536, 0, -0.01239561044571552, 1, 0.2836456518974477, 0.001134895941621387],
[244.735927391847, 618.6219214229745, 0, 1, 0.2834698586777307, 0, 0.001616496223896766, 0.004905834945557937, 0.7165301413222693, 1, 0.001136167680300694],
[243.1455086794804, 617.0834983352049, 0, 1, 0.2826520690383201, 0, 0.001620526237855726, 0.004918065461793414, 0.7173479309616799, 1, 0.001135967742670799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4496385465968, 616.7477288522309, 0, 1, 0.2830160237327513, 0, 0.001621408483920974, 0.004920742952475726, 0.7169839762672487, 1, 0.001134839890791241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001135524178427237],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135770595604575],
[244.7008124255949, 618.4649153573753, 0, 1, 0.2834922710081478, 0, 0.001616906594325011, 0.00490708036114119, 0.7165077289918522, 1, 0.001136304211348968],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7391340736939, 616.4798959351773, 0, 1, 0.2833454336288982, 0, 0.001622112913322237, 0.004922880795003475, 0.7166545663711017, 1, 0.00113518033641552],
[244.797715395975, 618.3680123869951, 0, 1, 0.2836045356257769, 0, 0.00161715997588531, 0.00490784933795332, 0.7163954643742232, 1, 0.001135539710268432],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.00113632690969197],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959182921848],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136167680453235],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113498988605924],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326878523644],
[244.7040900017614, 618.65375881306, 1, 0, 0.2834329824390664, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834329824390664, 0.001135327962618732],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136362015776236],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304209496575],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135786455720309],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.00113676145407205],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.6004565871591, 0, 1, 0.2834504821834121, 0, 0.001616552314747771, 0.004906005173272002, 0.7165495178165879, 1, 0.001136340906942067],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768045457],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113632690969197],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002995784],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136220004151873],
[244.5400572589634, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833164170103054, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166835829896947, 1, 0.001136595506479988],
[244.707367577928, 618.4583602050421, 0, 1, 0.2834998653230309, 0, 0.001616923732211272, 0.004907132372175963, 0.716500134676969, 1, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001138915430482507],
[243.1455086794804, 617.0202191034898, 0, 1, 0.2826728627123689, 0, 0.001620692432823299, 0.004918569839760798, 0.7173271372876311, 1, 0.001136796583130787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136123226159446],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113597773778366],
[244.7040900017614, 618.65375881306, 1, 0, 0.2834329824390664, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834329824390664, 0.001134959092451013],
[244.735729617619, 618.4299981653512, 0, 1, 0.2835327234854649, 0, 0.001616997886529798, 0.004907357419931604, 0.716467276514535, 1, 0.001136206821976837],
[243.8601910282323, 616.2152857306846, 0, 1, 0.2835334777212669, 0, 0.001622809467983642, 0.004924994738821526, 0.7164665222787332, 1, 0.001136782670220543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136123226159446],
[244.8931296388489, 618.1823471200681, 0, 1, 0.2837447433432927, 0, 0.001617645674708618, 0.004909323364446658, 0.7162552566567073, 1, 0.00113597773778366],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326847308766],
[244.9412686459292, 618.3884918798391, 1, 0, 0.2837169293188269, 0.004082611335885312, 0, -0.01239014175513238, 1, 0.2837169293188269, 0.001134896002876726],
[244.0055792434755, 617.0125851020049, 1, 0, 0.2833919066376039, 0.004098266945782304, 0, -0.01243765429304697, 1, 0.2833919066376038, 0.001135367142387328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.0793609622204, 616.9388033832601, 0, 1, 0.2834775978829228, 0, 0.001620906311154449, 0.004919218929919837, 0.7165224021170773, 1, 0.001135698600663597],
[244.735927391847, 618.8560186723782, 0, 1, 0.2833930173934786, 0, 0.001615884745122595, 0.00490397919489521, 0.7166069826065214, 1, 0.001135862032368373],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 0, 1, 0.2839898531567402, 0, 0.001618030243006283, 0.004910490474252265, 0.7160101468432598, 1, 0.001136469743438559],
[244.1059372061025, 615.9892864342894, 0, 1, 0.283812687824161, 0, 0.001623404857880876, 0.004926801662042815, 0.716187312175839, 1, 0.001135536790556761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.00113517515137788],
[244.6303082830165, 618.4649153573752, 0, 1, 0.2834337412402848, 0, 0.001616906594325011, 0.004907080361141191, 0.7165662587597152, 1, 0.00113679150493208],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896002995784],
[244.1303082830165, 616.0354194999536, 0, 1, 0.2838177579014325, 0, 0.001623283285905406, 0.004926432708477168, 0.7161822420985675, 1, 0.001138209275600926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7040900017614, 616.4616377812087, 0, 1, 0.283322250736373, 0, 0.001622160956518295, 0.004923026599235264, 0.7166777492636269, 1, 0.001137387781498404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001135783290831122],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136215597000179],
[244.7008124255949, 618.4649153573752, 0, 1, 0.2834922710081478, 0, 0.001616906594325011, 0.004907080361141191, 0.7165077289918522, 1, 0.001136245486304359],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136214610216651],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959194969958],
[244.7040900017614, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2835499529237549, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7164500470762452, 1, 0.001136206397065375],
[243.7614024151981, 616.404325367772, 1, 0, 0.2833888802376255, 0.004102372197123738, 0, -0.01245011314398233, 1, 0.2833888802376254, 0.001136906649150772],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136123226159446],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.00113597773778366],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.001134959194969958],
[244.0389042276783, 616.159646288349, 0, 1, 0.2837006689691363, 0, 0.001622956008274554, 0.004925439467655075, 0.7162993310308637, 1, 0.00113519107664885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.797715395975, 618.4213146128961, 0, 1, 0.2835870235546814, 0, 0.00161702059157834, 0.004907426326508019, 0.7164129764453186, 1, 0.001135143587467835],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135562872825327],
[245.0571623816469, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2839051117229516, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7160948882770484, 1, 0.001134959092481173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3595552108571, 616.7745329562556, 0, 1, 0.2829321132120688, 0, 0.001621338019919387, 0.004920529104304426, 0.7170678867879312, 1, 0.001136565944300231],
[243.6876206964532, 616.478107086517, 0, 1, 0.2833031040710546, 0, 0.001622117620244476, 0.004922895079839568, 0.7166968959289455, 1, 0.001135441990350648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135078395635862],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134895972358156],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002858942],
[244.6551474889924, 618.6429734209182, 1, 0, 0.2833958994734374, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2833958994734374, 0.001134959092451013],
[244.6722526116759, 618.4401729453932, 0, 1, 0.2834766889768269, 0, 0.001616971283151584, 0.004907276682481938, 0.7165233110231731, 1, 0.001135674668944172],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362242113854],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326817543032],
[245.071696874821, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.00113616768025059],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136362242333995],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134959123107456],
[243.3336447290716, 616.8953622856136, 1, 0, 0.282870773648438, 0.004109583782026538, 0, -0.01247199927319563, 1, 0.2828707736484379, 0.00113524042675329],
[243.5964660849039, 616.4685081869833, 0, 1, 0.2832303062813685, 0, 0.001622142877891641, 0.004922971733187888, 0.7167696937186315, 1, 0.001139169854414253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.3999601346451, 618.7974072641825, 0, 1, 0.2831333474418761, 0, 0.001616037798899618, 0.004904443691227937, 0.7168666525581239, 1, 0.001135582048087408],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703298281],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001139579543069972],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001139827446894817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896003003371],
[244.7040900017614, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2835395577151034, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7164604422848966, 1, 0.00113676145407205],
[244.7040900017614, 618.4932773970661, 0, 1, 0.2834856769074222, 0, 0.001616832448379242, 0.004906855338795669, 0.7165143230925778, 1, 0.001135786455720309],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326909805284],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135503493900997],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135481035329303],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.00113599046848098],
[244.6507877758604, 618.6537588130602, 0, 1, 0.2833887400947, 0, 0.001616413035166205, 0.00490558247965333, 0.7166112599053001, 1, 0.001136329095217816],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001139453139344225],
[244.7943410258146, 615.3713867571556, 1, 0, 0.2845897402315232, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2845897402315232, 0.00116097557057582],
[244.7040900017615, 615.4616377812088, 0, 0, 0.2844848173996339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001088930396367675],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 1, 1, 0.2839898531567402, 0.004079462906910085, 0.001618030243006283, -0.007470096249039063, 0.9193497633040133, 0.4873294696174935, 0.001186036081063019],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 0, 1, 0.2834938030695148, 0, 0.001622549348828109, 0.004924205314371066, 0.7165061969304851, 1, 0.001163960228883848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135287634410886],
[244.59410991273, 618.7657342877226, 0.5, 2.5, 0.2833049412197827, 0.002044202945763484, 0.004040301298968689, 0.006057873140166471, 0.5864118548144238, 0.6318682877889106, 0.003408818945401574]
],
"NAMES": [
["epi_isl_447389_North_District_20200329_null_1"],
["epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2"],
["epi_isl_455292_Utrecht_20200312_null_1"],
["epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1"],
["epi_isl_439503_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_452070_Denmark_20200427_null_1"],
["Node228"],
["epi_isl_455983_Louisiana_20200328_null_9"],
["epi_isl_436574_Wisconsin_20200403_null_1"],
["epi_isl_456648_Victoria_20200527_null_15"],
["Node234"],
["epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_456998_Scotland_20200519_null_3"],
["Node237"],
["epi_isl_455944_Bangkok_20200315_null_1"],
["epi_isl_439940_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_3"],
["epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1"],
["epi_isl_456834_Scotland_20200507_null_18"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_453833_Portugal_20200325_null_10"],
["epi_isl_455319_Andalusia_20200305_null_1"],
["epi_isl_457009_Scotland_20200330_null_6"],
["epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_448768_England_20200101_null_14"],
["epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1"],
["epi_isl_451831_Zurich_20200331_null_19"],
["epi_isl_454788_Utrecht_20200316_null_3"],
["epi_isl_456839_Scotland_20200507_null_2"],
["epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3"],
["epi_isl_441368_Northern_Ireland_20200323_null_4"],
["epi_isl_451274_Louisiana_20200506_null_2"],
["epi_isl_457484_England_20200507_null_12"],
["epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1"],
["epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1"],
["Node147"],
["epi_isl_438391_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_448583_England_20200101_null_2"],
["Node155"],
["epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1"],
["epi_isl_446473_Wales_20200413_null_1"],
["epi_isl_423319_England_20200326_null_2"],
["epi_isl_451216_Louisiana_20200427_null_2"],
["epi_isl_456108_New_York_20200417_null_10"],
["epi_isl_446504_Wales_20200411_null_6"],
["epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1"],
["Node172"],
["epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1"],
["epi_isl_450149_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_442094_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_445106_California_20200325_null_1"],
["epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_453432_England_20200505_null_2"],
["epi_isl_456071_Rio_de_Janeiro_20200330_null_1"],
["epi_isl_449940_Washington_20200413_null_1"],
["epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_457670_England_20200504_null_5"],
["epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_444434_England_20200101_null_2"],
["epi_isl_450503_Hubei_20200126_null_7"],
["epi_isl_455328_Galicia_20200309_null_1"],
["epi_isl_447940_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_454996_Hubei_20200226_null_7"],
["Node125"],
["epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1"],
["epi_isl_457340_England_20200512_null_1"],
["epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1"],
["epi_isl_442548_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_446629_Wales_20200408_null_4"],
["epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_454062_Portugal_20200318_null_33"],
["epi_isl_455335_Galicia_20200311_null_1"],
["epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_454227_Portugal_20200317_null_1"],
["epi_isl_456673_England_20200504_null_14"],
["epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_7"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_449009_England_20200420_null_1"],
["Node272"],
["epi_isl_438460_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_437695_Makkah_20200405_null_1"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_2"],
["epi_isl_450464_California_20200407_null_1"],
["epi_isl_454260_Portugal_20200407_null_1"],
["epi_isl_456878_Scotland_20200512_null_16"],
["epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1"],
["epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2"],
["epi_isl_446603_Wales_20200413_null_1"],
["epi_isl_457720_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1"],
["epi_isl_457267_England_20200513_null_2"],
["epi_isl_457605_England_20200501_null_16"],
["epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1"],
["epi_isl_453660_England_20200516_null_1"],
["Node300"],
["epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1"],
["epi_isl_454524_Maharashtra_20200420_null_3"],
["epi_isl_458061_Telangana_20200513_null_9"],
["Node4"],
["epi_isl_442413_England_20200410_null_4"],
["epi_isl_443487_England_20200412_null_5"],
["epi_isl_443332_England_20200415_null_3"],
["epi_isl_414007_England_20200228_null_3"],
["epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_2"],
["epi_isl_444647_New_York_20200329_null_1"],
["epi_isl_456727_England_20200519_null_67"],
["epi_isl_418692_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_441813_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_455931_Bangkok_20200313_null_3"],
["Node318"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_442945_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_449708_England_20200416_null_6"],
["epi_isl_446876_Wales_20200416_null_9"],
["epi_isl_457571_England_20200517_null_38"],
["epi_isl_420282_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_432626_England_20200401_null_10"],
["Node325"],
["epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2"],
["epi_isl_441705_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_447367_Jerusalem_District_20200401_null_2"],
["epi_isl_455448_Malopolska_20200401_null_5"],
["epi_isl_443600_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1"],
["epi_isl_437458_Indiana_20200407_null_1"],
["epi_isl_455405_Hubei_20200302_null_2"],
["epi_isl_423903_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_452796_Virginia_20200409_null_12"],
["epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1"],
["epi_isl_443664_England_20200414_null_5"],
["epi_isl_432942_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_456787_Scotland_20200501_null_9"],
["Node357"],
["epi_isl_436998_Unknown_20200325_null_1"],
["epi_isl_442428_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_452980_England_20200513_null_1"],
["epi_isl_457236_England_20200429_null_8"],
["Node364"],
["epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_420943_Wales_20200321_null_2"],
["epi_isl_455567_Istria_20200329_null_1"],
["epi_isl_452093_Denmark_20200414_null_1"],
["epi_isl_454558_Maharashtra_20200413_null_1"],
["epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_1"],
["epi_isl_423107_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_447256_Taipei_20200320_null_2"],
["epi_isl_454613_California_20200416_null_1"],
["epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1"],
["epi_isl_455345_Melilla_20200311_null_1"],
["Node39"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_445334_Puerto_Montt_20200329_null_6"],
["epi_isl_423217_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_449051_England_20200504_null_1"],
["epi_isl_455793_Selangor_20200229_null_4"],
["epi_isl_455337_LaRioja_20200301_null_1"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4"],
["Node393"],
["epi_isl_456750_England_20200521_null_4"],
["epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_452591_Andalusia_20200327_null_1"],
["epi_isl_456115_New_York_20200503_null_4"],
["epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_3"],
["epi_isl_423092_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_437278_Bavaria_20200401_null_1"],
["epi_isl_437535_Oregon_20200408_null_5"],
["epi_isl_457299_England_20200418_null_7"],
["epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_445410_Wales_20200403_null_1"],
["epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_1"],
["epi_isl_437473_Madinah_20200329_null_1"],
["epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1"],
["epi_isl_455299_Zuid_Holland_20200407_null_42"],
["Node423"],
["epi_isl_453977_Portugal_20200404_null_10"],
["epi_isl_455287_Netherlands_20200401_null_2"],
["Node426"],
["epi_isl_456882_Scotland_20200512_null_1"],
["epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3"],
["epi_isl_442397_England_20200326_null_20"],
["epi_isl_451446_New_York_20200326_null_9"],
["epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2"],
["epi_isl_453587_England_20200427_null_3"],
["epi_isl_456660_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_445770_Wales_20200408_null_5"],
["epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1"],
["epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2"],
["epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1"],
["epi_isl_456667_England_20200507_null_1"],
["epi_isl_448463_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_436937_Utah_20200415_null_1"],
["epi_isl_424140_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_433893_England_20200410_null_1"],
["epi_isl_439916_England_20200329_null_3"],
["Node456"],
["epi_isl_448182_Scotland_20200413_null_2"],
["Node455"],
["epi_isl_444225_England_20200415_null_7"],
["epi_isl_441132_England_20200402_null_2"],
["epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1"],
["epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1"],
["Node465"],
["epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_443386_England_20200413_null_1"],
["epi_isl_441103_England_20200401_null_6"],
["epi_isl_450788_Gujarat_20200506_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_2"],
["epi_isl_449709_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_456718_England_20200518_null_4"],
["epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_449975_Washington_20200415_null_33"],
["epi_isl_452361_Beijing_20200211_null_1"],
["epi_isl_423445_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_452044_Denmark_20200330_null_1"],
["epi_isl_457646_England_20200328_null_26"],
["epi_isl_445225_Stockholm_20200330_null_2"],
["epi_isl_439569_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1"],
["epi_isl_446375_Wales_20200410_null_7"],
["epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3"],
["epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1"],
["epi_isl_454224_Portugal_20200314_null_1"],
["epi_isl_456874_Scotland_20200512_null_20"],
["Node499"],
["epi_isl_454223_Portugal_20200313_null_5"],
["epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2"],
["epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_451504_New_South_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_456421_Victoria_20200411_null_18"],
["Node508"],
["epi_isl_435360_Utah_20200403_null_3"],
["epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_5"],
["epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1"],
["epi_isl_457087_England_20200412_null_2"],
["epi_isl_440822_England_20200401_null_3"],
["epi_isl_455582_Iowa_20200526_null_2"],
["Node532"],
["epi_isl_445124_Louisiana_20200402_null_2"],
["epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1"],
["epi_isl_458019_New_York_20200318_null_94"],
["Node520"],
["epi_isl_443523_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_437540_Louisiana_20200412_null_1"],
["epi_isl_444524_Illinois_20200317_null_4"],
["epi_isl_451215_Louisiana_20200424_null_8"],
["Node526"],
["epi_isl_453124_Scotland_20200424_null_3"],
["Node525"],
["epi_isl_448166_Scotland_20200412_null_8"],
["epi_isl_436250_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1"],
["epi_isl_438282_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_455346_Melilla_20200311_null_2"],
["epi_isl_424099_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_451459_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_456849_Scotland_20200507_null_15"],
["Node542"],
["epi_isl_438617_England_20200421_null_7"],
["epi_isl_441213_England_20200403_null_2"],
["epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1"],
["epi_isl_452838_Virginia_20200421_null_3"],
["epi_isl_458068_Telangana_20200414_null_80"],
["Node551"],
["epi_isl_456566_Victoria_20200509_null_6"],
["epi_isl_448195_Scotland_20200421_null_1"],
["epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3"],
["epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6"],
["Node560"],
["epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1"],
["Node559"],
["epi_isl_440594_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_456856_Scotland_20200509_null_3"],
["epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1"],
["epi_isl_437886_Athens_20200317_null_1"],
["epi_isl_450755_Minnesota_20200330_null_3"],
["epi_isl_420179_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_451999_Denmark_20200309_null_11"],
["epi_isl_455112_Flevoland_20200331_null_1"],
["epi_isl_440831_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_451152_Gujarat_20200509_null_1"],
["epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_8"],
["epi_isl_455665_West_Bengal_20200501_null_12"],
["Node64"],
["epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1"],
["epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1"],
["epi_isl_424185_USA_20200318_null_1"],
["epi_isl_458006_North_Carolina_20200401_null_30887"],
["epi_isl_440082_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_446054_Wales_20200410_null_2"],
["epi_isl_457295_England_20200418_null_3"],
["epi_isl_455151_Netherlands_20200405_null_10"],
["epi_isl_445182_California_20200412_null_1"],
["epi_isl_444680_New_York_20200330_null_2"],
["epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2"],
["epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_11"],
["epi_isl_453135_Scotland_20200428_null_1"],
["epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_452345_Beijing_20200307_null_2"],
["Node93"],
["epi_isl_452348_Beijing_20200318_null_1"],
["epi_isl_452364_Beijing_20200205_null_7"],
["Node89"],
["epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304174442853],
[244.851017621876, 618.3147101610941, 0, 1, 0.2836662876441731, 0, 0.001617299384223711, 0.004908272422330581, 0.7163337123558269, 1, 0.001136304092364537],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136303865841722],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136543758438441],
[243.6711513911449, 616.4945763918253, 1, 0, 0.2832839574057361, 0.0041038916354722, 0, -0.01245472442215132, 1, 0.2832839574057362, 0.001137090416373974],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136243938675198],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135741996484766],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001136508671117746],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136013330290512],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.00113638345226076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113611901901971],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001134959092451013],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.00113489600298077],
[244.6303082830166, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136760631731905],
[244.6303082830166, 618.4649153573753, 0, 1, 0.2834337412402849, 0, 0.001616906594325011, 0.00490708036114119, 0.7165662587597151, 1, 0.001135786455720309],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136326909695434],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136760571085588],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135799084601649],
[244.7040900017615, 618.4616377812088, 0, 2, 0.2834960681655894, 0, 0.00323383032644546, 0.009814212733041517, 0.5133778843341698, 1, 0.002273566643729383],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135907860537798],
[244.4669113575938, 618.5347836825783, 1, 0, 0.2832751230531639, 0.004090533129603175, 0, -0.01241418326656809, 1, 0.2832751230531638, 0.001136326909692079],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136362242282595],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135327972274881],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326930776762],
[244.4179688448247, 618.7161193222879, 1, 0, 0.2831749692146356, 0.004091352222286393, 0, -0.01241666909576433, 1, 0.2831749692146357, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135674668944846],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134989886186387],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092481173],
[244.735927391847, 618.4831026170242, 0, 1, 0.2835154449610915, 0, 0.001616859047189229, 0.00490693606238142, 0.7164845550389085, 1, 0.001136167787607203],
[244.7943410258146, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2835709766691778, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2835709766691779, 0.001134926672584438],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134895988356016],
[244.571696874821, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237105, 1, 0.001136326909734247],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768045457],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.001134989794252966],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326847308766],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.9524069503342, 616.2133208326359, 0, 1, 0.2836109357427064, 0, 0.001622814642579921, 0.004925010442981473, 0.7163890642572937, 1, 0.001135441544587106],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001135060261031333],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134895941647983],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.00113489600298077],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135708916896092],
[243.6876206964532, 616.478107086517, 0, 1, 0.2833031040710546, 0, 0.001622117620244476, 0.004922895079839568, 0.7166968959289455, 1, 0.001135575117482317],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135343390786118],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.00113597773778366],
[244.7530325145305, 618.4126952684396, 1, 0, 0.2835527693426562, 0.004085751215117761, 0, -0.01239967083972637, 1, 0.2835527693426563, 0.001136304179052142],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909699152],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252352, 1, 0.001135675022256527],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136362015641399],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326909699152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4985810593658, 616.8311794664024, 1, 1, 0.283029359475555, 0.004106800112137805, 0.001621189124818662, -0.007543474004076465, 0.9198943816748568, 0.4859531006259672, 0.002278297633057927],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135197926228176],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134989886179768],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959123107456],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.0011348960187613],
[244.7772359031311, 618.4417941057401, 0, 1, 0.2835632989933222, 0, 0.001616967044483125, 0.004907263818729125, 0.7164367010066779, 1, 0.00113532797243293],
[245.0571623816469, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2839051117229516, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7160948882770484, 1, 0.001134926611397587],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134959121632363],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362242272474],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.001136565954987474],
[244.7040900017614, 618.4649153573752, 1, 0, 0.283494991690472, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834949916904721, 0.001134959092488967],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747649, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252351, 1, 0.001134959092481173],
[244.5571623816469, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833433457105025, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166566542894975, 1, 0.001136220921571865],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001135771299063793],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001136326909692079],
[244.5571623816469, 618.6085654013232, 0, 1, 0.2833258486870057, 0, 0.001616531124736769, 0.00490594086461793, 0.7166741513129944, 1, 0.001134959194852489],
[244.735729617619, 618.4299981653512, 0, 1, 0.2835327234854649, 0, 0.001616997886529798, 0.004907357419931604, 0.716467276514535, 1, 0.001136167787607203],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362242138321],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134959092481173],
[243.6551474889924, 616.5105802939777, 1, 0, 0.2832653518026115, 0.004104161189720718, 0, -0.01245554248076015, 1, 0.2832653518026116, 0.001136259909346522],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136407996798231],
[244.0639928774432, 619.1333745213846, 0, 1, 0.2827441348818166, 0, 0.001615160870261664, 0.004901782338177284, 0.7172558651181834, 1, 0.001138900277852651],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326909695325],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135327962569418],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362015800071],
[244.9412686459292, 618.388491879839, 1, 0, 0.283716929318827, 0.004082611335885312, 0, -0.01239014175513238, 1, 0.283716929318827, 0.001134896002858942],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362242086921],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001138790646592911],
[244.9215217644544, 618.2442060185158, 0, 1, 0.2837479685315265, 0, 0.001617483819929323, 0.004908832158330221, 0.7162520314684735, 1, 0.001134959195065098],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136340563261431],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768025059],
[244.6104646075479, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833876007054018, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166123992945982, 1, 0.001136304141952816],
[243.9590095859879, 616.0145971651308, 0, 1, 0.2836819731103574, 0, 0.001623338155624804, 0.004926599230231376, 0.7163180268896426, 1, 0.001135852021131916],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2836006263299699, 0.001134984732671001],
[244.6104646075479, 618.5552631754222, 0, 1, 0.2833876007054019, 0, 0.001616670424670528, 0.004906363620002599, 0.7166123992945981, 1, 0.001136304092178205],
[244.8681227445595, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7163138956252352, 1, 0.001134959092451013],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.001135799084601649],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136760571098302],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002984506],
[245.0571623816469, 617.9445326585252, 1, 1, 0.283959074228979, 0.004080680565633176, 0.001618268221741186, -0.007473069437748363, 0.9193672441630211, 0.4872853926209793, 0.002278943472655956],
[244.8332055525355, 618.3325222304346, 1, 0, 0.2836456518974478, 0.004084413295750536, 0, -0.01239561044571552, 1, 0.2836456518974477, 0.00113489600298077],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092576249],
[244.6869848790779, 618.5320451297932, 0, 1, 0.2834587472852206, 0, 0.001616731110172569, 0.004906547791825706, 0.7165412527147794, 1, 0.001138790646591015],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134926611318127],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959183002185],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136595506479988],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.00113622000325613],
[245.2040900017614, 617.9616377812087, 0, 1, 0.2840753312015353, 0, 0.001618223428222017, 0.0049110767637643, 0.7159246687984647, 1, 0.001134896018988621],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.2258154646438, 616.9399123183264, 0, 1, 0.2827662247036335, 0, 0.001620903397613257, 0.004919210087738837, 0.7172337752963664, 1, 0.001136106307420056],
[244.5749744509875, 618.5907533319827, 1, 0, 0.283346484433731, 0.004088725766995424, 0, -0.01240869817943375, 1, 0.283346484433731, 0.001135779805205712],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136304116293028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.9959393005745, 616.1697884823956, 0, 1, 0.2836615450018691, 0, 0.00162292929431507, 0.004925358394607062, 0.7163384549981309, 1, 0.001135046895279216],
[244.7745941443398, 618.3911336386303, 0, 1, 0.2835777490529428, 0, 0.001617099511301161, 0.004907665836584434, 0.7164222509470572, 1, 0.001139082776022593],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136394697829286],
[244.2040900017615, 618.9616377812088, 0, 1, 0.2829168051296435, 0, 0.001615609011868165, 0.004903142383886785, 0.7170831948703565, 1, 0.001136326909692079],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326847308766],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002995784],
[244.8063347404315, 618.3593930425386, 0, 1, 0.2836145213610524, 0, 0.001617182517564195, 0.004907917748726183, 0.7163854786389476, 1, 0.001134959195065098],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113624541938497],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136211768804074],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326909695325],
[244.1303082830165, 616.0354194999536, 1, 1, 0.2838177579014325, 0.004096173093103685, 0.001623283285905406, -0.007504867041026943, 0.9194474802998039, 0.4870829961026688, 0.002281886650848195],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136355001457978],
[245.0082198688779, 618.1042056881913, 0, 1, 0.2838659398406238, 0, 0.001617850179302064, 0.00490994400665183, 0.7161340601593762, 1, 0.001139473915074826],
[244.3999601346451, 618.7974072641825, 0, 1, 0.2831333474418761, 0, 0.001616037798899618, 0.004904443691227937, 0.7168666525581239, 1, 0.001136168097952926],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136362242086283],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326847266605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001139157250897366],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 1, 0, 0.2834938030695148, 0.004100853883482573, 0, -0.0124455052791392, 1, 0.2834938030695149, 0.001135552478711769],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135582048087408],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703298281],
[244.836483128702, 618.3292446542682, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.004908157048114279, 0.7163505509451107, 1, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909692079],
[245.071696874821, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.0011361676802018],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136361898504498],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959092451013],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134959182891686],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135469812686456],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136217173027303],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909695325],
[244.4669113575938, 618.5347836825783, 1, 0, 0.2832751230531639, 0.004090533129603175, 0, -0.01241418326656809, 1, 0.2832751230531638, 0.001136362133123861],
[244.5400572589634, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2833598805939544, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7166401194060457, 1, 0.001136565969008557],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001134959092451013],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7856058037987, 616.4334242050725, 0, 1, 0.2833994567654294, 0, 0.001622235201294543, 0.004923251921517159, 0.7166005432345706, 1, 0.00113518033641552],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001135539710268432],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.00113632690969197],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134895972236454],
[243.5235879536552, 616.6421398293151, 0, 1, 0.2831124050725943, 0, 0.001621686121348757, 0.004921585542378057, 0.7168875949274056, 1, 0.001136260000372938],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136407996807308],
[244.6722526116759, 618.3013541394428, 0, 1, 0.2835222893233157, 0, 0.00161733431975385, 0.004908378446670177, 0.7164777106766843, 1, 0.001135568428388351],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326909667326],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[245.2040900017615, 617.9616377812087, 0, 1, 0.2840753312015353, 0, 0.001618223428222017, 0.0049110767637643, 0.7159246687984647, 1, 0.001134926672580694],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.00113616768025059],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326930776656],
[244.6551474889924, 618.5638825198787, 1, 0, 0.283421865116294, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834218651162941, 0.001134959183002185],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135675022418448],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703170818],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6876206964532, 616.6313473232675, 0, 1, 0.284084792953092, 0, 0.001621714504688897, 0.004921671681757704, 0.715915207046908, 1, 0.001135762593523238],
[245.0400572589634, 618.702290642382, 0, 1, 0.2836957778605424, 0, 0.001616286241581111, 0.004905197679248956, 0.7163042221394575, 1, 0.001135535798870248],
[244.5400572589634, 618.6256705240066, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.004905805214378431, 0.7166939680435861, 1, 0.001136362250446393],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326909699152],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326909561304],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135675022418448],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703329891],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002877808],
[243.7537684137132, 616.6767456231381, 0, 1, 0.2832927987061992, 0, 0.001621595117859556, 0.00492130935979817, 0.7167072012938008, 1, 0.001135607350421349],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6551474889924, 618.6429734209182, 1, 0, 0.2833958994734374, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2833958994734374, 0.001135071392935534],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135710704948764],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304209641757],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136167669683785],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001134989884641141],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 0, 1, 0.2839898531567402, 0, 0.001618030243006283, 0.004910490474252265, 0.7160101468432598, 1, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136304093984812],
[244.7040900017614, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2835499529237548, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7164500470762452, 1, 0.001136595506479988],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136217173027822],
[244.2040900017615, 618.9616377812088, 0, 1, 0.2829168051296435, 0, 0.001615609011868165, 0.004903142383886785, 0.7170831948703565, 1, 0.001136326909699152],
[244.9902111586982, 618.2071562401295, 1, 0, 0.2838171435774364, 0.004081795738982512, 0, -0.01238766653512995, 1, 0.2838171435774364, 0.001134896002903377],
[244.6309441003918, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2835513401277764, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7164486598722235, 1, 0.001136245419247023],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136211768804074],
[244.4179688448247, 618.7161193222879, 1, 0, 0.2831749692146356, 0.004091352222286393, 0, -0.01241666909576433, 1, 0.2831749692146357, 0.00113632684868683],
[243.8516534392512, 617.0599064544271, 0, 1, 0.2832482043444354, 0, 0.00162058819498728, 0.004918253492830301, 0.7167517956555646, 1, 0.001137680352920798],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.8345538365627, 0, 1, 0.2833736414088912, 0, 0.001615940793545451, 0.004904149293845906, 0.7166263585911088, 1, 0.001136467830196756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.8516534392512, 616.686990399073, 0, 1, 0.2833709504916382, 0, 0.001621568178944193, 0.004921227604041227, 0.7166290495083618, 1, 0.001137316574521506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136303275805219],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001136326909692079],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896003032628],
[244.404319847777, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2831312926978282, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7168687073021718, 1, 0.001136167680096718],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136362133098755],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136326899700658],
[245.0571623816469, 618.1085654013233, 0, 1, 0.2839051117229515, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280318, 0.7160948882770485, 1, 0.001134989886055493],
[245.0716968748209, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.001136167680405778],
[244.7530325145305, 618.4126952684396, 1, 0, 0.2835527693426562, 0.004085751215117762, 0, -0.01239967083972637, 1, 0.2835527693426563, 0.001136304211450815],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896002995784],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136595506479988],
[244.5716968748209, 618.5940309081492, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666534, 0.7166573127237106, 1, 0.00113622000325613],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896018768886],
[244.836483128702, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2836494490548893, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7163505509451107, 1, 0.001134959092606409],
[244.8332055525355, 618.3325222304346, 1, 0, 0.2836456518974478, 0.004084413295750536, 0, -0.01239561044571552, 1, 0.2836456518974477, 0.001134895941621387],
[244.735927391847, 618.6219214229745, 0, 1, 0.2834698586777307, 0, 0.001616496223896766, 0.004905834945557937, 0.7165301413222693, 1, 0.001136167680300694],
[243.1455086794804, 617.0834983352049, 0, 1, 0.2826520690383201, 0, 0.001620526237855726, 0.004918065461793414, 0.7173479309616799, 1, 0.001135967742670799],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.4496385465968, 616.7477288522309, 0, 1, 0.2830160237327513, 0, 0.001621408483920974, 0.004920742952475726, 0.7169839762672487, 1, 0.001134839890791241],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6551474889924, 618.5105802939777, 1, 0, 0.2834393669885226, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2834393669885226, 0.001135524178427237],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135770595604575],
[244.7008124255949, 618.4649153573753, 0, 1, 0.2834922710081478, 0, 0.001616906594325011, 0.00490708036114119, 0.7165077289918522, 1, 0.001136304211348968],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7391340736939, 616.4798959351773, 0, 1, 0.2833454336288982, 0, 0.001622112913322237, 0.004922880795003475, 0.7166545663711017, 1, 0.00113518033641552],
[244.797715395975, 618.3680123869951, 0, 1, 0.2836045356257769, 0, 0.00161715997588531, 0.00490784933795332, 0.7163954643742232, 1, 0.001135539710268432],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.00113632690969197],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959182921848],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136167680453235],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113498988605924],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326878523644],
[244.7040900017614, 618.65375881306, 1, 0, 0.2834329824390664, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834329824390664, 0.001135327962618732],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.001136362015776236],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136326847308766],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136304209496575],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135786455720309],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435862, 1, 0.00113676145407205],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.6004565871591, 0, 1, 0.2834504821834121, 0, 0.001616552314747771, 0.004906005173272002, 0.7165495178165879, 1, 0.001136340906942067],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113616768045457],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.00113632690969197],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002995784],
[244.5400572589634, 618.6256705240068, 0, 1, 0.2833060319564139, 0, 0.001616486427330037, 0.00490580521437843, 0.7166939680435861, 1, 0.001136220004151873],
[244.5400572589634, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833164170103054, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166835829896947, 1, 0.001136595506479988],
[244.707367577928, 618.4583602050421, 0, 1, 0.2834998653230309, 0, 0.001616923732211272, 0.004907132372175963, 0.716500134676969, 1, 0.001134896002984506],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001138915430482507],
[243.1455086794804, 617.0202191034898, 0, 1, 0.2826728627123689, 0, 0.001620692432823299, 0.004918569839760798, 0.7173271372876311, 1, 0.001136796583130787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.351017621876, 618.8147101610941, 0, 1, 0.2830870246082272, 0, 0.001615992612295324, 0.004904306556343772, 0.7169129753917728, 1, 0.001136123226159446],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.00113597773778366],
[244.7040900017614, 618.65375881306, 1, 0, 0.2834329824390664, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834329824390664, 0.001134959092451013],
[244.735729617619, 618.4299981653512, 0, 1, 0.2835327234854649, 0, 0.001616997886529798, 0.004907357419931604, 0.716467276514535, 1, 0.001136206821976837],
[243.8601910282323, 616.2152857306846, 0, 1, 0.2835334777212669, 0, 0.001622809467983642, 0.004924994738821526, 0.7164665222787332, 1, 0.001136782670220543],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136123226159446],
[244.8931296388489, 618.1823471200681, 0, 1, 0.2837447433432927, 0, 0.001617645674708618, 0.004909323364446658, 0.7162552566567073, 1, 0.00113597773778366],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136326847308766],
[244.9412686459292, 618.3884918798391, 1, 0, 0.2837169293188269, 0.004082611335885312, 0, -0.01239014175513238, 1, 0.2837169293188269, 0.001134896002876726],
[244.0055792434755, 617.0125851020049, 1, 0, 0.2833919066376039, 0.004098266945782304, 0, -0.01243765429304697, 1, 0.2833919066376038, 0.001135367142387328],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.0793609622204, 616.9388033832601, 0, 1, 0.2834775978829228, 0, 0.001620906311154449, 0.004919218929919837, 0.7165224021170773, 1, 0.001135698600663597],
[244.735927391847, 618.8560186723782, 0, 1, 0.2833930173934786, 0, 0.001615884745122595, 0.00490397919489521, 0.7166069826065214, 1, 0.001135862032368373],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 0, 1, 0.2839898531567402, 0, 0.001618030243006283, 0.004910490474252265, 0.7160101468432598, 1, 0.001136469743438559],
[244.1059372061025, 615.9892864342894, 0, 1, 0.283812687824161, 0, 0.001623404857880876, 0.004926801662042815, 0.716187312175839, 1, 0.001135536790556761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.00113517515137788],
[244.6303082830165, 618.4649153573752, 0, 1, 0.2834337412402848, 0, 0.001616906594325011, 0.004907080361141191, 0.7165662587597152, 1, 0.00113679150493208],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134896002995784],
[244.1303082830165, 616.0354194999536, 0, 1, 0.2838177579014325, 0, 0.001623283285905406, 0.004926432708477168, 0.7161822420985675, 1, 0.001138209275600926],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.7040900017614, 616.4616377812087, 0, 1, 0.283322250736373, 0, 0.001622160956518295, 0.004923026599235264, 0.7166777492636269, 1, 0.001137387781498404],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001135783290831122],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136215597000179],
[244.7008124255949, 618.4649153573752, 0, 1, 0.2834922710081478, 0, 0.001616906594325011, 0.004907080361141191, 0.7165077289918522, 1, 0.001136245486304359],
[244.6303082830165, 618.5354194999536, 0, 1, 0.2834105901207944, 0, 0.001616722290226219, 0.004906521024549432, 0.7165894098792056, 1, 0.001136214610216651],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001134959194969958],
[244.7040900017614, 618.2976050384106, 0, 1, 0.2835499529237549, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047632, 0.7164500470762452, 1, 0.001136206397065375],
[243.7614024151981, 616.404325367772, 1, 0, 0.2833888802376255, 0.004102372197123738, 0, -0.01245011314398233, 1, 0.2833888802376254, 0.001136906649150772],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136123226159446],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.00113597773778366],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134896002995784],
[244.8681227445595, 618.2976050384107, 0, 1, 0.2836861043747648, 0, 0.001617344126600453, 0.004908408209047631, 0.7163138956252352, 1, 0.001134959194969958],
[244.0389042276783, 616.159646288349, 0, 1, 0.2837006689691363, 0, 0.001622956008274554, 0.004925439467655075, 0.7162993310308637, 1, 0.00113519107664885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.797715395975, 618.4213146128961, 0, 1, 0.2835870235546814, 0, 0.00161702059157834, 0.004907426326508019, 0.7164129764453186, 1, 0.001135143587467835],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135562872825327],
[245.0571623816469, 618.1085654013232, 0, 1, 0.2839051117229516, 0, 0.001617838768098487, 0.004909909375280319, 0.7160948882770484, 1, 0.001134959092481173],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[243.3595552108571, 616.7745329562556, 0, 1, 0.2829321132120688, 0, 0.001621338019919387, 0.004920529104304426, 0.7170678867879312, 1, 0.001136565944300231],
[243.6876206964532, 616.478107086517, 0, 1, 0.2833031040710546, 0, 0.001622117620244476, 0.004922895079839568, 0.7166968959289455, 1, 0.001135441990350648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135078395635862],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134895972358156],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896002858942],
[244.6551474889924, 618.6429734209182, 1, 0, 0.2833958994734374, 0.004087385899146031, 0, -0.01240463187205808, 1, 0.2833958994734374, 0.001134959092451013],
[244.6722526116759, 618.4401729453932, 0, 1, 0.2834766889768269, 0, 0.001616971283151584, 0.004907276682481938, 0.7165233110231731, 1, 0.001135674668944172],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.001136362242113854],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001136326817543032],
[245.071696874821, 618.0940309081492, 0, 1, 0.2839219503122354, 0, 0.001617876811608626, 0.004910024831894897, 0.7160780496877646, 1, 0.00113616768025059],
[244.6138389777083, 618.5518888052618, 1, 0, 0.2833915100012089, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2833915100012089, 0.001136362242333995],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001134959123107456],
[243.3336447290716, 616.8953622856136, 1, 0, 0.282870773648438, 0.004109583782026538, 0, -0.01247199927319563, 1, 0.2828707736484379, 0.00113524042675329],
[243.5964660849039, 616.4685081869833, 0, 1, 0.2832303062813685, 0, 0.001622142877891641, 0.004922971733187888, 0.7167696937186315, 1, 0.001139169854414253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.3999601346451, 618.7974072641825, 0, 1, 0.2831333474418761, 0, 0.001616037798899618, 0.004904443691227937, 0.7168666525581239, 1, 0.001135582048087408],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134926703298281],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001139579543069972],
[244.7778717205063, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835815462103843, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164184537896157, 1, 0.001139827446894817],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7943410258146, 618.3713867571555, 1, 0, 0.2836006263299699, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.28360062632997, 0.001134896003003371],
[244.7040900017614, 618.3292446542681, 0, 1, 0.2835395577151034, 0, 0.001617261367864201, 0.00490815704811428, 0.7164604422848966, 1, 0.00113676145407205],
[244.7040900017614, 618.4932773970661, 0, 1, 0.2834856769074222, 0, 0.001616832448379242, 0.004906855338795669, 0.7165143230925778, 1, 0.001135786455720309],
[244.6138389777083, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834211439957717, 0.004088076145565624, 0, -0.01240672667126406, 1, 0.2834211439957717, 0.001136326909805284],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001135503493900997],
[244.7040900017614, 618.3878560624638, 0, 1, 0.2835203029267432, 0, 0.001617108082243758, 0.004907691848169916, 0.7164796970732568, 1, 0.001135481035329303],
[244.571696874821, 618.5940309081493, 0, 1, 0.2833426872762895, 0, 0.001616569106772521, 0.004906056134666533, 0.7166573127237106, 1, 0.00113599046848098],
[244.6507877758604, 618.6537588130602, 0, 1, 0.2833887400947, 0, 0.001616413035166205, 0.00490558247965333, 0.7166112599053001, 1, 0.001136329095217816],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 1, 0, 0.2834960681655894, 0.004086568393657833, 0, -0.01240215085977181, 1, 0.2834960681655894, 0.001139453139344225],
[244.7943410258146, 615.3713867571556, 1, 0, 0.2845897402315232, 0.004085061753509023, 0, -0.01239757842230914, 1, 0.2845897402315232, 0.00116097557057582],
[244.7040900017615, 615.4616377812088, 0, 0, 0.2844848173996339, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001088930396367675],
[245.1303082830165, 618.0354194999536, 1, 1, 0.2839898531567402, 0.004079462906910085, 0.001618030243006283, -0.007470096249039063, 0.9193497633040133, 0.4873294696174935, 0.001186036081063019],
[243.8516534392512, 616.3140743437189, 0, 1, 0.2834938030695148, 0, 0.001622549348828109, 0.004924205314371066, 0.7165061969304851, 1, 0.001163960228883848],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[244.7040900017614, 618.4616377812087, 0, 1, 0.2834960681655894, 0, 0.00161691516322273, 0.00490710636652076, 0.7165039318344106, 1, 0.001135287634410886],
[244.59410991273, 618.7657342877226, 0.5, 2.5, 0.2833049412197827, 0.002044202945763484, 0.004040301298968689, 0.006057873140166471, 0.5864118548144238, 0.6318682877889106, 0.003408818945401574]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.9994341993616052, 2.000000000000001, 0, 1, 0.333207576140301, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6667924238596989, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.7059761757174454, 1.441587261772342, 1, 0, 0.3287335607383205, 1.416478394591367, 0, -4.298809428123922, 1, 0.3287335607383205, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0, 1.789671386690582, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3283649850540734],
[0.7059761802776847, 1.441587257212102, 1, 0, 0.3287335628617685, 1.416478385441653, 0, -4.298809400355847, 1, 0.3287335628617685, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -6.069714080410046, 1, 0.111111111111111, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9989776580349576, 2.001022341965044, 1, 2, 0.332992552678319, 1.001023388217764, 0.9994890901797527, -0.004656375202431031, 0.7411949987368207, 0.7032490971945331, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612382929, 2.327754638761708, 1, 0, 0.2240817870794309, 1.487552101747455, 0, -4.514507968660046, 1, 0.2240817870794309, 0.3295048125009682],
[0.9994343184001951, 2.000565681599807, 0, 1, 0.3331447728000648, 0, 0.4998586195881971, 1.516999450764405, 0.6668552271999352, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562426, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417112019, 1.173536300496168, 0, -3.561514903496954, 1, 0.2987685417112018, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.002989717743486981, 2.99701028225651, 0, 2, 0.0009965725811623279, 0, 0.6673317111525422, 2.025256341743359, 0.9980078479945848, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.851618605321748, 1.147815695512604, 1, 0, 0.6173226080686892, 0.54006802325592, 0, -1.63902924256784, 1, 0.6173226080686892, 0.3295048125009682],
[1.376941499560009, 1.29700120318111, 0.5, 1.5, 0.5149480196970845, 0.3631236331825071, 1.156513961838279, 2.407826224551548, 0.4850519803029155, 0.7647245764042201, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6082597342328198, 2.285135813965134, 0, 0, 0.2102234983432017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.851502652372442, 2.148497347627558, 1, 0, 0.2838342174574807, 1.174394462793295, 0, -3.56411930338603, 1, 0.2838342174574806, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7053015142119378, 1.447410404227148, 1, 2, 0.3276339523977487, 1.417833337728391, 1.381778101193013, -0.109422488435649, 0.7483070621131387, 0.6960393781041601, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6730663320841027, 2.326368249044773, 0, 3, 0.2243977369330674, 0, 1.289563679882506, 3.913641412684123, 0.4665704213080467, 1, 0.3295048125009682],
[0.6743046648885594, 2.325695335111442, 0, 3, 0.2247682216295197, 0, 1.289936800710075, 3.914773781054517, 0.4659021355655808, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333334, 0, 1.499999999999999, 4.552285560307535, 0.2962962962962962, 1, 0.3295048125009682],
[0.9963464063778954, 2.003653593622106, 0, 1, 0.3321154687926316, 0, 0.4990882671451451, 1.51466154122917, 0.6678845312073685, 1, 0.3295048125009682],
[1.377573326478978, 1.295729813966469, 1, 0, 0.5153075630059059, 0.7259141715206986, 0, -2.20304573402419, 1, 0.5153075630059059, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994911381452425, 2.000265837634248, 0, 2, 0.333190703852109, 0, 0.9998670988479398, 3.034453704208044, 0.4446346374292457, 1, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427534, 2.327754630357248, 1, 0, 0.2240817898809177, 1.487552083149971, 0, -4.51450791221934, 1, 0.2240817898809178, 0.3295048125009682],
[0.9997455927796162, 2.000254407220385, 1, 1, 0.3332485309265385, 1.000254471959888, 0.4999364062842539, -1.518393803957457, 0.8889454166353039, 0.5554424784883809, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7059761757172159, 2.187419372480737, 1, 0, 0.2439957357910873, 1.416478394591828, 0, -4.29880942812532, 1, 0.2439957357910872, 0.3295048125009682],
[0.672245369634341, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2515657346714115, 1.487552083168586, 0, -4.514507912275834, 1, 0.2515657346714115, 0.3295048125009682],
[0.999543416364887, 2.000456583635115, 0, 1, 0.3331811387882955, 0, 0.4998858801438507, 1.517082182653651, 0.6668188612117045, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.851449848082166, 1.148441039869641, 1, 0, 0.6171723963421397, 0.5401172497520552, 0, -1.639178637946201, 1, 0.6171723963421397, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237504987, 2.147874676249501, 1, 0, 0.2840417745834996, 1.173536300504078, 0, -3.561514903520961, 1, 0.2840417745834996, 0.3295048125009682],
[0.9982763477498675, 2.00153985188687, 0, 2, 0.3327791708941213, 0, 0.9992306663864734, 3.032522222671747, 0.4451836347927361, 1, 0.3295048125009682],
[1.378727596558106, 1.294227907144197, 2, 0, 0.5158064152764363, 1.450612873052556, 0, -4.402402690395587, 1, 0.2660562580403275, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -6.069714080410046, 1, 0.111111111111111, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 4, 1, 0.3333333333333334, 3.999999999999997, 0.4999999999999997, -10.62199964071758, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.002319271432681395, 2.997496401984742, 0, 2, 0.0007731379808544218, 0, 0.6672234864654828, 2.024927895289913, 0.9984543217806285, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.2950714093562704, 2.704928590643727, 0, 1, 0.09835713645209021, 0, 0.3696955266985502, 1.1219730719334, 0.9016428635479098, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339748, 2.327754638766026, 1, 0, 0.2240817870779915, 1.487552101757011, 0, -4.514507968689045, 1, 0.2240817870779915, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722525044002988, 2.327181893235793, 1, 1, 0.2241264236117693, 1.487536295446124, 0.4297042714652468, -3.210368965332697, 0.9497673462389979, 0.3980201934625363, 0.3295048125009682],
[0.7086415839021095, 2.194984585887144, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283438369303924],
[1.003351385275668, 1.62213590955186, 0, 1, 0.3821581567933581, 0, 0.6164711564003694, 1.877517063099494, 0.6178418432066419, 1, 0.3283438369303924],
[1.003077804808906, 2.007529754462768, 1, 3, 0.3331811885344402, 0.9969316390073123, 1.494373865857259, 1.5150040015991, 0.59286307222098, 0.8022887543033197, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.006816553706892, 0, 1, 0.3333615861134893, 0, 0.498301650020202, 1.51762145036345, 0.6666384138865107, 1, 0.3283438369303924],
[1.01091656835254, 1.999690990919134, 1, 2, 0.3357849033625295, 0.989201316217094, 1.000154528415775, 0.03335896997817867, 0.7374659999750353, 0.7069604580858313, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.007071706181116, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9964766051161313, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333333, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.007071706181116, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283438369303924],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.375638023131171, 1.297430664114753, 0, 1, 0.5146287597078164, 0, 0.7707540970463399, 2.339128497687951, 0.4853712402921836, 1, 0.3295048125009682],
[0.8930726791091262, 2.000322869088829, 0, 1, 0.308659035459339, 0, 0.4999192957562456, 1.51718359426018, 0.691340964540661, 1, 0.3295048125009682],
[0.6082597342328198, 1.539303703256969, 0, 0, 0.2832324873922203, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.278035298727337, 1.65912156861393, 1, 1, 0.435126674008468, 0.7824510019369548, 0.6027285877763759, -0.5454318338978761, 0.8106647775663282, 0.6809181255832646, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.9982757051390738, 2.001724294860928, 1, 1, 0.3327585683796911, 1.00172727318921, 0.4995692976137237, -1.523977667470367, 0.8892717351698984, 0.5547888719292806, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9982757051390631, 2.001724294860939, 1, 2, 0.3327585683796875, 1.001727273189221, 0.999138595227442, -0.007856267537127501, 0.7415067632777641, 0.7029366895327955, 0.3295048125009682],
[1.851449848083363, 1.148441039868576, 2, 0, 0.6171723963425115, 1.080234499503412, 0, -3.278357275890281, 1, 0.3809017668071581, 0.3295048125009682],
[0.9994343183691362, 2.000565681630865, 0, 1, 0.3331447727897119, 0, 0.4998586195804368, 1.516999450740854, 0.6668552272102881, 1, 0.3295048125009682],
[0.9999886972102998, 2.000011302789702, 1, 1, 0.3333295657367664, 1.000011302917455, 0.4999971743185436, -1.517471398380386, 0.8888914006057388, 0.5555505320792715, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339726, 2.327754638766028, 1, 0, 0.2240817870779908, 1.487552101757015, 0, -4.51450796868906, 1, 0.2240817870779908, 0.3295048125009682],
[1.001303901449739, 1.850510154358087, 0, 2, 0.3511112161785394, 0, 1.080783045307724, 3.280022033986373, 0.4210566537692943, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994343183691521, 2.00056568163085, 0, 1, 0.3331447727897172, 0, 0.4998586195804407, 1.516999450740866, 0.6668552272102828, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253140787, 2.1478746859213, 1, 1, 0.2840417713595667, 1.173536313823958, 0.4655765099121992, -2.14855679508377, 0.9193202721229197, 0.487403814842053, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.671824793593592, 2.326947286688003, 0, 3, 0.2240332961651775, 0, 1.289242784811842, 3.91266754201975, 0.4672284281261787, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.85243656251021, 0, 0, 0.3505774723066855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434162268269, 2.000456583773175, 0, 1, 0.3331811387422754, 0, 0.4998858801093514, 1.51708218254895, 0.6668188612577246, 1, 0.3295048125009682],
[1.274266755906612, 1.662542100701879, 1, 3, 0.4338950262422494, 0.7847650386896603, 1.804465582395467, 3.094645373966459, 0.417577234782373, 0.8972958760852385, 0.3295048125009682],
[0.7356697407657105, 2.264330259234288, 0, 1, 0.2452232469219036, 0, 0.4416316903958005, 1.340289044775341, 0.7547767530780964, 1, 0.3295048125009682],
[0.9988685562458008, 2.001022305909028, 0, 2, 0.3329682985628055, 0, 0.9994891081893446, 3.033306556596674, 0.4449312907221986, 1, 0.3295048125009682],
[0.6728103619862733, 2.327189638013728, 1, 1, 0.224270120662091, 1.486302911637384, 0.4297028414295909, -3.206630161751243, 0.9497029129782111, 0.3982431543023932, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.99974574904164, 0, 3, 0.3333615858342264, 0, 1.500190712463183, 4.552864345369084, 0.2962586278914907, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434163177583, 2.000456583682244, 1, 1, 0.3331811387725859, 1.000456792246127, 0.4998858801320739, -1.519161156751186, 0.8889903287662028, 0.5553526063113747, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6724995303973885, 2.327500469602612, 0, 1, 0.2241665101324628, 0, 0.4296454557410834, 1.303912536147923, 0.7758334898675372, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612382907, 2.327754638761711, 1, 0, 0.2240817870794301, 1.48755210174746, 0, -4.514507968660062, 1, 0.2240817870794302, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339352, 2.327754638766065, 1, 0, 0.2240817870779783, 1.487552101757098, 0, -4.514507968689311, 1, 0.2240817870779783, 0.3295048125009682],
[0.9992366832174772, 2.000763316782525, 0, 1, 0.3330788944058255, 0, 0.4998092436081464, 1.516849601723732, 0.6669211055941745, 1, 0.3295048125009682],
[0.7356697661147554, 2.264330233885243, 0, 1, 0.2452232553715853, 0, 0.4416316953398416, 1.340289059779799, 0.7547767446284147, 1, 0.3295048125009682],
[0.7361144719551372, 2.263885528044862, 1, 1, 0.2453714906517125, 1.35848436363977, 0.4417184471617788, -2.782253495843244, 0.9397928315753566, 0.4305358128787815, 0.3295048125009682],
[0.6724995151135577, 2.327500484886444, 0, 1, 0.2241665050378525, 0, 0.4296454529197613, 1.303912527585614, 0.7758334949621475, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.0005066829062384593, 2.999493317093758, 0, 1, 0.0001688943020794866, 0, 0.3333896409440615, 1.01178989895051, 0.9998311056979206, 1, 0.3295048125009682],
[0.8524365625102102, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2988450553866291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733605, 2.147874676226639, 1, 0, 0.2840417745911202, 1.173536300472593, 0, -3.561514903425408, 1, 0.2840417745911201, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 3.034857040205023, 0.4444444444444444, 1, 0.3295048125009682],
[0.6084285135030545, 2.284967034694899, 1, 0, 0.2102818309380451, 1.643578461243467, 0, -4.988025664234076, 1, 0.2102818309380451, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339726, 2.327754638766028, 1, 0, 0.2240817870779908, 1.487552101757015, 0, -4.51450796868906, 1, 0.2240817870779908, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9987823603599315, 2.00121763964007, 0, 2, 0.3329274534533103, 0, 0.9993915506160094, 3.033010483308412, 0.4449857823562855, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8524365625102102, 2.14756343748979, 0, 0, 0.2841455208367367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6083695129439887, 2.008050877128659, 0, 1, 0.2325197874364129, 0, 0.4979953503119973, 1.511344694883733, 0.7674802125635871, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8515024507267099, 2.14849754927329, 1, 0, 0.2838341502422366, 1.174394740903629, 0, -3.564120147411136, 1, 0.2838341502422366, 0.3295048125009682],
[0.9995434304231724, 2.000456569576829, 1, 1, 0.3331811434743906, 1.000456778127824, 0.4998858836568179, -1.51916110320706, 0.8889903256330978, 0.5553526125818786, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562718, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417112091, 1.173536300496127, 0, -3.561514903496832, 1, 0.2987685417112091, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264438569865571, 0, 2, 0.2288314512905492, 0, 0.8832211333155002, 2.680449874500407, 0.5947009305186405, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427185, 2.327754630357282, 1, 0, 0.2240817898809061, 1.487552083150048, 0, -4.514507912219574, 1, 0.2240817898809061, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7068936901931663, 1.440669747296621, 0, 1, 0.3291607958363408, 0, 0.6941216068960104, 2.106559845446782, 0.6708392041636592, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6092273792500912, 2.28471906257812, 0, 1, 0.2105178487219066, 0, 0.4376905749066501, 1.328328322686832, 0.7894821512780934, 1, 0.3295048125009682],
[1.85161863067569, 1.147815687693448, 2, 0, 0.6173226129127101, 1.080136031721696, 0, -3.278058440249707, 1, 0.3810872084133756, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.3295048125009682],
[0.9966061390018986, 2.003393860998103, 1, 3, 0.332202046333966, 1.003405418515182, 1.497458916293864, 1.49938173597155, 0.5946037636841121, 0.8011249345207013, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.616419900466967, 1, 0, 0.3822016488337842, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3822016488337843, 0.3295048125009682],
[0.9994341993739053, 2.000456665619535, 0, 1, 0.3331568528164076, 0, 0.4998858596571015, 1.517082120479295, 0.6668431471835924, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[0.2950713415559433, 2.704928658444055, 0, 1, 0.09835711385198119, 0, 0.3696955174319555, 1.12197304381061, 0.9016428861480188, 1, 0.3295048125009682],
[0.6084285135078669, 2.284967034690087, 1, 0, 0.2102818309397083, 1.643578461230467, 0, -4.988025664194623, 1, 0.2102818309397083, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 2, 0.223978171467962, 0, 0.8590823636079499, 2.60719215931156, 0.6022098783582078, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 3.034857040205023, 0.4444444444444444, 1, 0.3295048125009682],
[0.6724995151135428, 2.326934863248702, 0, 2, 0.224208777483154, 0, 0.8594997786950259, 2.60845895442726, 0.6018520209341826, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6083695129543568, 2.285209827011665, 0, 1, 0.2102480842849468, 0, 0.4375965778633488, 1.328043055098211, 0.7897519157150532, 1, 0.3295048125009682],
[0.9997342800632701, 2.000265719936731, 1, 3, 0.3332447600210899, 1.000265790562581, 1.499800736521591, 1.516017147572137, 0.5927500562560233, 0.8023641391025247, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.615757936297119, 0, 0, 0.3822983717735005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521272597788658, 2.146402993645963, 1, 2, 0.2841816449260741, 1.173533634236168, 0.9317914696916828, -0.7336529099822336, 0.8036229468155377, 0.6332175972166572, 0.3295048125009682],
[0.8526917892168132, 2.147308210783186, 0, 1, 0.2842305964056044, 0, 0.4656993322981197, 1.413330897243728, 0.7157694035943956, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999745695101775, 0, 3, 0.3333615918285608, 0, 1.500190752928371, 4.552864468175144, 0.2962586198997222, 1, 0.3295048125009682],
[0.003473882295891587, 1.785968868406375, 0, 1, 0.001941320723743893, 0, 0.5599201742482236, 1.699277682770046, 0.9980586792762561, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.674376457480249, 2.324489048168473, 0, 1, 0.2248771931285282, 0, 0.4302020699077617, 1.305601780570345, 0.7751228068714718, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434162268376, 2.000456583773164, 0, 1, 0.333181138742279, 0, 0.4998858801093541, 1.517082182548958, 0.6668188612577211, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.003470463461691, 2.006940926923383, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283652329578982],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0.4999999999999997, -7.587142600512558, 0.9876543209876543, 0.1111111111111112, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.85243656251021, 0, 0, 0.3505774723066855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.852447851920047, 1, 0, 0.3505760847921822, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3505760847921822, 0.3295048125009682],
[0.9994343007759494, 2.000565699224052, 0, 1, 0.3331447669253162, 0, 0.4998586151846271, 1.5169994374002, 0.6668552330746838, 1, 0.3295048125009682],
[0.7059761802867838, 1.909781756010335, 1, 0, 0.2698935442345125, 1.416478385423396, 0, -4.29880940030044, 1, 0.2698935442345125, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999745675312071, 1, 2, 0.3333615940277897, 0.9999999999999993, 1.000127178516283, 0.0003859686155058746, 0.7407030590161773, 0.7037413830323344, 0.3295048125009682],
[0.6724999151091716, 2.327500084890829, 0, 1, 0.2241666383697238, 0, 0.4296455267570505, 1.303912751671231, 0.7758333616302762, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.616419685393576, 1, 0, 0.3822016802512991, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3822016802512991, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.00249498111833, 1.997505018881672, 1, 1, 0.3341649937061097, 0.9975112283200195, 0.5006245243678349, -1.507980111673557, 0.8883337569813956, 0.5566637443936151, 0.3295048125009682],
[0.9987236445498903, 2.001276355450111, 0, 2, 0.3329078815166299, 0, 0.9993622292860077, 3.032921497263629, 0.4450118945426307, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.002942323587154, 1.997057676412848, 0, 2, 0.3343141078623844, 0, 1.001473329299351, 3.039328384001699, 0.4431377069910533, 1, 0.3295048125009682],
[0.9979633584434838, 2.001550431485976, 1, 5, 0.3327083748686327, 1.00204079793039, 2.49806346187737, 4.540214913985769, 0.3524016231801165, 0.9117135517575516, 0.3295048125009682],
[0.7059759870761935, 1.909781949220926, 1, 0, 0.2698934703704184, 1.416478773083359, 0, -4.298810576793008, 1, 0.2698934703704184, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.2945652931495856, 2.705434706850412, 0, 2, 0.09818843104986193, 0, 0.7392527326332489, 2.243526360122818, 0.8132641058923096, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427535, 2.327754630357247, 1, 1, 0.2240817898809178, 1.487552083149971, 0.4295985440039817, -3.210737746487027, 0.9497873514437642, 0.3979509312055998, 0.3295048125009682],
[0.9994343297160567, 2.000565670283945, 1, 1, 0.3331447765720187, 1.000565990447921, 0.4998586224155629, -1.51957528095553, 0.8890145578427797, 0.5553041109868171, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612299629, 2.327754638770038, 1, 0, 0.2240817870766542, 1.487552101765888, 0, -4.514507968715987, 1, 0.2240817870766543, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999491539659264, 1, 2, 0.333389838503628, 0.9999999999999993, 1.000254294819783, 0.0007717484241094977, 0.7406653973212077, 0.7037790375452752, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733604, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417154105, 1.173536300472593, 0, -3.561514903425409, 1, 0.2987685417154105, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7958626984154342, 2.204137301584566, 0, 1, 0.2652875661384781, 0, 0.453692244707757, 1.376891102937757, 0.7347124338615219, 1, 0.3295048125009682],
[0.6718247833284247, 2.327991504672669, 0, 2, 0.2239553088686275, 0, 0.8591096642688193, 2.607275012914402, 0.6022453626331874, 1, 0.3295048125009682],
[0.9987823982303634, 2.001217601769639, 0, 1, 0.3329274660767876, 0, 0.4996957847640952, 1.516505270352089, 0.6670725339232124, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.001469851903309, 1.998275705219768, 0, 2, 0.3338515993549048, 0, 1.000862891329624, 3.037475792031666, 0.4437536916820182, 1, 0.3295048125009682],
[0.7364616994305886, 2.26353830056941, 1, 2, 0.2454872331435296, 1.357843864484972, 0.8835724138164063, -1.439346051029745, 0.8487961313108998, 0.5704637926313403, 0.3295048125009682],
[0.6091193287852562, 1.545788658910192, 1, 1, 0.2826660499025179, 1.641714443694083, 0.6469189654328408, -3.019062060765255, 0.9200999042325071, 0.4854320040375432, 0.3295048125009682],
[1.279145576084611, 1.657684289005013, 0, 1, 0.4355531763313689, 0, 0.6032511779430733, 1.83078108439251, 0.5644468236686311, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9997455571230762, 2.000254442876925, 1, 1, 0.3332485190410252, 1.000254507634579, 0.4999363973723864, -1.518393939271288, 0.8889454245569633, 0.555442462639014, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[5.194932734205473, 13.08771595547897, 0, 0, 0.284145520836737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04660709224585539],
[0.998869184815749, 2.001130815184253, 0, 2, 0.3329563949385828, 0, 0.9994349119129682, 3.03314207864576, 0.444947171053332, 1, 0.3295048125009682],
[1.378896176037868, 1.293603307668668, 1, 0, 0.515957508858132, 0.7252177628582657, 0, -2.200932233292146, 1, 0.515957508858132, 0.3295048125009682],
[0.6724998715148006, 2.327500128485201, 0, 1, 0.2241666238382668, 0, 0.4296455187097354, 1.30391272724878, 0.7758333761617332, 1, 0.3295048125009682],
[0.8526915570596327, 2.147308442940367, 0, 1, 0.2842305190198776, 0, 0.4656992819488351, 1.413330744440847, 0.7157694809801224, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.705683562980241, 2.188079249284484, 1, 3, 0.2438636504655186, 1.417065739460903, 1.371065513729002, -0.1396041089134807, 0.7485928186373476, 0.6731108806524698, 0.3295048125009682],
[0.672245369642762, 2.327754630357239, 1, 0, 0.2240817898809206, 1.487552083149952, 0, -4.514507912219281, 1, 0.2240817898809206, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.706085643324086, 2.187494120927763, 0, 1, 0.2440180333188943, 0, 0.4571440857522756, 1.387366947033383, 0.7559819666811057, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7955105226598822, 2.204489477340117, 0, 0, 0.2651701742199608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9988681823197838, 2.001131817680218, 1, 1, 0.3329560607732611, 1.001133100142992, 0.4997172056157874, -1.521725557576585, 0.8891402615943524, 0.5550523831408747, 0.3295048125009682],
[0.9995434304231894, 2.000456569576813, 0, 1, 0.3331811434743963, 0, 0.4998858836568221, 1.517082193315017, 0.6668188565256037, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.999434318369138, 2.000565681630864, 0, 1, 0.3331447727897124, 0, 0.4998586195804373, 1.516999450740855, 0.6668552272102876, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994341020460276, 2.000565897953974, 0, 2, 0.333144700682009, 0, 0.99971713106049, 3.033998573412497, 0.4446959902284874, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9908532448587395, 2.009146755141259, 1, 2, 0.3302844149529133, 1.009231190581169, 0.9954474429914821, -0.04183170341296973, 0.744796612659776, 0.6996198590474458, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339686, 2.327754638766033, 1, 0, 0.2240817870779894, 1.487552101757024, 0, -4.514507968689087, 1, 0.2240817870779894, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.002989671229025259, 2.997010328770971, 0, 2, 0.000996557076341754, 0, 0.6673317007953622, 2.025256310310798, 0.998007878973323, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994343008927721, 2.00056569910723, 0, 2, 0.3331447669642572, 0, 0.9997172304276324, 3.033998874977569, 0.444695901827155, 1, 0.3295048125009682],
[0.6720436149269079, 2.327956385073094, 0, 1, 0.2240145383089692, 0, 0.4295613124077502, 1.303657173160371, 0.7759854616910309, 1, 0.3295048125009682],
[0.706396788223113, 2.187182415890513, 0, 1, 0.2441256099777299, 0, 0.4572092353773105, 1.387564666831587, 0.7558743900222701, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8930726790949833, 2.000322869102972, 0, 1, 0.3086590354544509, 0, 0.499919295752711, 1.517183594249453, 0.6913409645455491, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.910091911530602, 0, 1, 0.2699085933305905, 0, 0.5235350162802775, 1.588853929952053, 0.7300914066694095, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562727, 2.147874676243727, 1, 2, 0.2840417745854243, 1.173536300496126, 0.9311530240198489, -0.7355985930419909, 0.8037936380706842, 0.6330025482271597, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733719, 2.147874676226627, 1, 0, 0.2840417745911241, 1.173536300472577, 0, -3.561514903425361, 1, 0.2840417745911241, 0.3295048125009682],
[0.8921933292934279, 2.001569606913789, 1, 1, 0.308315970921517, 1.120833307274276, 0.4996079059882886, -1.885330282646971, 0.9049412620747224, 0.5215732039177563, 0.3295048125009682],
[0.9989776580349576, 2.001022341965044, 0, 2, 0.332992552678319, 0, 0.9994890901797527, 3.033306501940138, 0.444898934782585, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339686, 2.327754638766033, 1, 0, 0.2240817870779894, 1.487552101757024, 0, -4.514507968689087, 1, 0.2240817870779894, 0.3295048125009682],
[0.6726154581174452, 2.326722272155221, 1, 1, 0.2242546583963048, 1.486733597825506, 0.4297891553140588, -3.20767528246144, 0.9497098481875565, 0.3982191649801664, 0.3295048125009682],
[0.9994343976359904, 2.000565602364011, 0, 1, 0.3331447992119966, 0, 0.499858639385946, 1.516999510847743, 0.6668552007880033, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.851814021850126, 2.148185978149874, 2, 1, 0.2839380072833753, 2.347930356506732, 0.4655090435238994, -5.712879574337937, 0.977108692979576, 0.196079761899314, 0.3295048125009682],
[0.8528660659116809, 2.147133934088319, 1, 2, 0.2842886886372269, 1.172517045722811, 0.9314742635508705, -0.731530384465119, 0.8034922814245262, 0.6333821188933326, 0.3295048125009682]
],
"RESOLVED": [
[0.9994341993616052, 2.000000000000001, 0, 1, 0.333207576140301, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6667924238596989, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.7059761757174454, 1.441587261772342, 1, 0, 0.3287335607383205, 1.416478394591367, 0, -4.298809428123922, 1, 0.3287335607383205, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0, 1.789671386690582, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3283649850540734],
[0.7059761802776847, 1.441587257212102, 1, 0, 0.3287335628617685, 1.416478385441653, 0, -4.298809400355847, 1, 0.3287335628617685, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -6.069714080410046, 1, 0.111111111111111, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9989776580349576, 2.001022341965044, 1, 2, 0.332992552678319, 1.001023388217764, 0.9994890901797527, -0.004656375202431031, 0.7411949987368207, 0.7032490971945331, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612382929, 2.327754638761708, 1, 0, 0.2240817870794309, 1.487552101747455, 0, -4.514507968660046, 1, 0.2240817870794309, 0.3295048125009682],
[0.9994343184001951, 2.000565681599807, 0, 1, 0.3331447728000648, 0, 0.4998586195881971, 1.516999450764405, 0.6668552271999352, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562426, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417112019, 1.173536300496168, 0, -3.561514903496954, 1, 0.2987685417112018, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.002989717743486981, 2.99701028225651, 0, 2, 0.0009965725811623279, 0, 0.6673317111525422, 2.025256341743359, 0.9980078479945848, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.851618605321748, 1.147815695512604, 1, 0, 0.6173226080686892, 0.54006802325592, 0, -1.63902924256784, 1, 0.6173226080686892, 0.3295048125009682],
[1.376941499560009, 1.29700120318111, 0.5, 1.5, 0.5149480196970845, 0.3631236331825071, 1.156513961838279, 2.407826224551548, 0.4850519803029155, 0.7647245764042201, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6082597342328198, 2.285135813965134, 0, 0, 0.2102234983432017, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.851502652372442, 2.148497347627558, 1, 0, 0.2838342174574807, 1.174394462793295, 0, -3.56411930338603, 1, 0.2838342174574806, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7053015142119378, 1.447410404227148, 1, 2, 0.3276339523977487, 1.417833337728391, 1.381778101193013, -0.109422488435649, 0.7483070621131387, 0.6960393781041601, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6730663320841027, 2.326368249044773, 0, 3, 0.2243977369330674, 0, 1.289563679882506, 3.913641412684123, 0.4665704213080467, 1, 0.3295048125009682],
[0.6743046648885594, 2.325695335111442, 0, 3, 0.2247682216295197, 0, 1.289936800710075, 3.914773781054517, 0.4659021355655808, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 3, 0.3333333333333334, 0, 1.499999999999999, 4.552285560307535, 0.2962962962962962, 1, 0.3295048125009682],
[0.9963464063778954, 2.003653593622106, 0, 1, 0.3321154687926316, 0, 0.4990882671451451, 1.51466154122917, 0.6678845312073685, 1, 0.3295048125009682],
[1.377573326478978, 1.295729813966469, 1, 0, 0.5153075630059059, 0.7259141715206986, 0, -2.20304573402419, 1, 0.5153075630059059, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994911381452425, 2.000265837634248, 0, 2, 0.333190703852109, 0, 0.9998670988479398, 3.034453704208044, 0.4446346374292457, 1, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427534, 2.327754630357248, 1, 0, 0.2240817898809177, 1.487552083149971, 0, -4.51450791221934, 1, 0.2240817898809178, 0.3295048125009682],
[0.9997455927796162, 2.000254407220385, 1, 1, 0.3332485309265385, 1.000254471959888, 0.4999364062842539, -1.518393803957457, 0.8889454166353039, 0.5554424784883809, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7059761757172159, 2.187419372480737, 1, 0, 0.2439957357910873, 1.416478394591828, 0, -4.29880942812532, 1, 0.2439957357910872, 0.3295048125009682],
[0.672245369634341, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2515657346714115, 1.487552083168586, 0, -4.514507912275834, 1, 0.2515657346714115, 0.3295048125009682],
[0.999543416364887, 2.000456583635115, 0, 1, 0.3331811387882955, 0, 0.4998858801438507, 1.517082182653651, 0.6668188612117045, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.851449848082166, 1.148441039869641, 1, 0, 0.6171723963421397, 0.5401172497520552, 0, -1.639178637946201, 1, 0.6171723963421397, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237504987, 2.147874676249501, 1, 0, 0.2840417745834996, 1.173536300504078, 0, -3.561514903520961, 1, 0.2840417745834996, 0.3295048125009682],
[0.9982763477498675, 2.00153985188687, 0, 2, 0.3327791708941213, 0, 0.9992306663864734, 3.032522222671747, 0.4451836347927361, 1, 0.3295048125009682],
[1.378727596558106, 1.294227907144197, 2, 0, 0.5158064152764363, 1.450612873052556, 0, -4.402402690395587, 1, 0.2660562580403275, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 2, 0, 0.3333333333333334, 1.999999999999999, 0, -6.069714080410046, 1, 0.111111111111111, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 4, 1, 0.3333333333333334, 3.999999999999997, 0.4999999999999997, -10.62199964071758, 0.9958847736625515, 0.04526748971193417, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.002319271432681395, 2.997496401984742, 0, 2, 0.0007731379808544218, 0, 0.6672234864654828, 2.024927895289913, 0.9984543217806285, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.2950714093562704, 2.704928590643727, 0, 1, 0.09835713645209021, 0, 0.3696955266985502, 1.1219730719334, 0.9016428635479098, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339748, 2.327754638766026, 1, 0, 0.2240817870779915, 1.487552101757011, 0, -4.514507968689045, 1, 0.2240817870779915, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722525044002988, 2.327181893235793, 1, 1, 0.2241264236117693, 1.487536295446124, 0.4297042714652468, -3.210368965332697, 0.9497673462389979, 0.3980201934625363, 0.3295048125009682],
[0.7086415839021095, 2.194984585887144, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283438369303924],
[1.003351385275668, 1.62213590955186, 0, 1, 0.3821581567933581, 0, 0.6164711564003694, 1.877517063099494, 0.6178418432066419, 1, 0.3283438369303924],
[1.003077804808906, 2.007529754462768, 1, 3, 0.3331811885344402, 0.9969316390073123, 1.494373865857259, 1.5150040015991, 0.59286307222098, 0.8022887543033197, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.006816553706892, 0, 1, 0.3333615861134893, 0, 0.498301650020202, 1.51762145036345, 0.6666384138865107, 1, 0.3283438369303924],
[1.01091656835254, 1.999690990919134, 1, 2, 0.3357849033625295, 0.989201316217094, 1.000154528415775, 0.03335896997817867, 0.7374659999750353, 0.7069604580858313, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.007071706181116, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9964766051161313, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333333, 0.3283438369303924],
[1.003535853090558, 2.007071706181116, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283438369303924],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.375638023131171, 1.297430664114753, 0, 1, 0.5146287597078164, 0, 0.7707540970463399, 2.339128497687951, 0.4853712402921836, 1, 0.3295048125009682],
[0.8930726791091262, 2.000322869088829, 0, 1, 0.308659035459339, 0, 0.4999192957562456, 1.51718359426018, 0.691340964540661, 1, 0.3295048125009682],
[0.6082597342328198, 1.539303703256969, 0, 0, 0.2832324873922203, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.278035298727337, 1.65912156861393, 1, 1, 0.435126674008468, 0.7824510019369548, 0.6027285877763759, -0.5454318338978761, 0.8106647775663282, 0.6809181255832646, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.9982757051390738, 2.001724294860928, 1, 1, 0.3327585683796911, 1.00172727318921, 0.4995692976137237, -1.523977667470367, 0.8892717351698984, 0.5547888719292806, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9982757051390631, 2.001724294860939, 1, 2, 0.3327585683796875, 1.001727273189221, 0.999138595227442, -0.007856267537127501, 0.7415067632777641, 0.7029366895327955, 0.3295048125009682],
[1.851449848083363, 1.148441039868576, 2, 0, 0.6171723963425115, 1.080234499503412, 0, -3.278357275890281, 1, 0.3809017668071581, 0.3295048125009682],
[0.9994343183691362, 2.000565681630865, 0, 1, 0.3331447727897119, 0, 0.4998586195804368, 1.516999450740854, 0.6668552272102881, 1, 0.3295048125009682],
[0.9999886972102998, 2.000011302789702, 1, 1, 0.3333295657367664, 1.000011302917455, 0.4999971743185436, -1.517471398380386, 0.8888914006057388, 0.5555505320792715, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339726, 2.327754638766028, 1, 0, 0.2240817870779908, 1.487552101757015, 0, -4.51450796868906, 1, 0.2240817870779908, 0.3295048125009682],
[1.001303901449739, 1.850510154358087, 0, 2, 0.3511112161785394, 0, 1.080783045307724, 3.280022033986373, 0.4210566537692943, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994343183691521, 2.00056568163085, 0, 1, 0.3331447727897172, 0, 0.4998586195804407, 1.516999450740866, 0.6668552272102828, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253140787, 2.1478746859213, 1, 1, 0.2840417713595667, 1.173536313823958, 0.4655765099121992, -2.14855679508377, 0.9193202721229197, 0.487403814842053, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.671824793593592, 2.326947286688003, 0, 3, 0.2240332961651775, 0, 1.289242784811842, 3.91266754201975, 0.4672284281261787, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.85243656251021, 0, 0, 0.3505774723066855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434162268269, 2.000456583773175, 0, 1, 0.3331811387422754, 0, 0.4998858801093514, 1.51708218254895, 0.6668188612577246, 1, 0.3295048125009682],
[1.274266755906612, 1.662542100701879, 1, 3, 0.4338950262422494, 0.7847650386896603, 1.804465582395467, 3.094645373966459, 0.417577234782373, 0.8972958760852385, 0.3295048125009682],
[0.7356697407657105, 2.264330259234288, 0, 1, 0.2452232469219036, 0, 0.4416316903958005, 1.340289044775341, 0.7547767530780964, 1, 0.3295048125009682],
[0.9988685562458008, 2.001022305909028, 0, 2, 0.3329682985628055, 0, 0.9994891081893446, 3.033306556596674, 0.4449312907221986, 1, 0.3295048125009682],
[0.6728103619862733, 2.327189638013728, 1, 1, 0.224270120662091, 1.486302911637384, 0.4297028414295909, -3.206630161751243, 0.9497029129782111, 0.3982431543023932, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.99974574904164, 0, 3, 0.3333615858342264, 0, 1.500190712463183, 4.552864345369084, 0.2962586278914907, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434163177583, 2.000456583682244, 1, 1, 0.3331811387725859, 1.000456792246127, 0.4998858801320739, -1.519161156751186, 0.8889903287662028, 0.5553526063113747, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6724995303973885, 2.327500469602612, 0, 1, 0.2241665101324628, 0, 0.4296454557410834, 1.303912536147923, 0.7758334898675372, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612382907, 2.327754638761711, 1, 0, 0.2240817870794301, 1.48755210174746, 0, -4.514507968660062, 1, 0.2240817870794302, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339352, 2.327754638766065, 1, 0, 0.2240817870779783, 1.487552101757098, 0, -4.514507968689311, 1, 0.2240817870779783, 0.3295048125009682],
[0.9992366832174772, 2.000763316782525, 0, 1, 0.3330788944058255, 0, 0.4998092436081464, 1.516849601723732, 0.6669211055941745, 1, 0.3295048125009682],
[0.7356697661147554, 2.264330233885243, 0, 1, 0.2452232553715853, 0, 0.4416316953398416, 1.340289059779799, 0.7547767446284147, 1, 0.3295048125009682],
[0.7361144719551372, 2.263885528044862, 1, 1, 0.2453714906517125, 1.35848436363977, 0.4417184471617788, -2.782253495843244, 0.9397928315753566, 0.4305358128787815, 0.3295048125009682],
[0.6724995151135577, 2.327500484886444, 0, 1, 0.2241665050378525, 0, 0.4296454529197613, 1.303912527585614, 0.7758334949621475, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.0005066829062384593, 2.999493317093758, 0, 1, 0.0001688943020794866, 0, 0.3333896409440615, 1.01178989895051, 0.9998311056979206, 1, 0.3295048125009682],
[0.8524365625102102, 2.000000000000001, 0, 0, 0.2988450553866291, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733605, 2.147874676226639, 1, 0, 0.2840417745911202, 1.173536300472593, 0, -3.561514903425408, 1, 0.2840417745911201, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 3.034857040205023, 0.4444444444444444, 1, 0.3295048125009682],
[0.6084285135030545, 2.284967034694899, 1, 0, 0.2102818309380451, 1.643578461243467, 0, -4.988025664234076, 1, 0.2102818309380451, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339726, 2.327754638766028, 1, 0, 0.2240817870779908, 1.487552101757015, 0, -4.51450796868906, 1, 0.2240817870779908, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9987823603599315, 2.00121763964007, 0, 2, 0.3329274534533103, 0, 0.9993915506160094, 3.033010483308412, 0.4449857823562855, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8524365625102102, 2.14756343748979, 0, 0, 0.2841455208367367, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6083695129439887, 2.008050877128659, 0, 1, 0.2325197874364129, 0, 0.4979953503119973, 1.511344694883733, 0.7674802125635871, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8515024507267099, 2.14849754927329, 1, 0, 0.2838341502422366, 1.174394740903629, 0, -3.564120147411136, 1, 0.2838341502422366, 0.3295048125009682],
[0.9995434304231724, 2.000456569576829, 1, 1, 0.3331811434743906, 1.000456778127824, 0.4998858836568179, -1.51916110320706, 0.8889903256330978, 0.5553526125818786, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562718, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417112091, 1.173536300496127, 0, -3.561514903496832, 1, 0.2987685417112091, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264438569865571, 0, 2, 0.2288314512905492, 0, 0.8832211333155002, 2.680449874500407, 0.5947009305186405, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427185, 2.327754630357282, 1, 0, 0.2240817898809061, 1.487552083150048, 0, -4.514507912219574, 1, 0.2240817898809061, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7068936901931663, 1.440669747296621, 0, 1, 0.3291607958363408, 0, 0.6941216068960104, 2.106559845446782, 0.6708392041636592, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6092273792500912, 2.28471906257812, 0, 1, 0.2105178487219066, 0, 0.4376905749066501, 1.328328322686832, 0.7894821512780934, 1, 0.3295048125009682],
[1.85161863067569, 1.147815687693448, 2, 0, 0.6173226129127101, 1.080136031721696, 0, -3.278058440249707, 1, 0.3810872084133756, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 2, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.9999999999999993, 0, 0.7407407407407406, 0.7037037037037037, 0.3295048125009682],
[0.9966061390018986, 2.003393860998103, 1, 3, 0.332202046333966, 1.003405418515182, 1.497458916293864, 1.49938173597155, 0.5946037636841121, 0.8011249345207013, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.616419900466967, 1, 0, 0.3822016488337842, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3822016488337843, 0.3295048125009682],
[0.9994341993739053, 2.000456665619535, 0, 1, 0.3331568528164076, 0, 0.4998858596571015, 1.517082120479295, 0.6668431471835924, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[0.2950713415559433, 2.704928658444055, 0, 1, 0.09835711385198119, 0, 0.3696955174319555, 1.12197304381061, 0.9016428861480188, 1, 0.3295048125009682],
[0.6084285135078669, 2.284967034690087, 1, 0, 0.2102818309397083, 1.643578461230467, 0, -4.988025664194623, 1, 0.2102818309397083, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 0, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3333333333333334, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 2, 0.223978171467962, 0, 0.8590823636079499, 2.60719215931156, 0.6022098783582078, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 0.9999999999999993, 3.034857040205023, 0.4444444444444444, 1, 0.3295048125009682],
[0.6724995151135428, 2.326934863248702, 0, 2, 0.224208777483154, 0, 0.8594997786950259, 2.60845895442726, 0.6018520209341826, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6083695129543568, 2.285209827011665, 0, 1, 0.2102480842849468, 0, 0.4375965778633488, 1.328043055098211, 0.7897519157150532, 1, 0.3295048125009682],
[0.9997342800632701, 2.000265719936731, 1, 3, 0.3332447600210899, 1.000265790562581, 1.499800736521591, 1.516017147572137, 0.5927500562560233, 0.8023641391025247, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.615757936297119, 0, 0, 0.3822983717735005, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521272597788658, 2.146402993645963, 1, 2, 0.2841816449260741, 1.173533634236168, 0.9317914696916828, -0.7336529099822336, 0.8036229468155377, 0.6332175972166572, 0.3295048125009682],
[0.8526917892168132, 2.147308210783186, 0, 1, 0.2842305964056044, 0, 0.4656993322981197, 1.413330897243728, 0.7157694035943956, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999745695101775, 0, 3, 0.3333615918285608, 0, 1.500190752928371, 4.552864468175144, 0.2962586198997222, 1, 0.3295048125009682],
[0.003473882295891587, 1.785968868406375, 0, 1, 0.001941320723743893, 0, 0.5599201742482236, 1.699277682770046, 0.9980586792762561, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.674376457480249, 2.324489048168473, 0, 1, 0.2248771931285282, 0, 0.4302020699077617, 1.305601780570345, 0.7751228068714718, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9995434162268376, 2.000456583773164, 0, 1, 0.333181138742279, 0, 0.4998858801093541, 1.517082182548958, 0.6668188612577211, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.003470463461691, 2.006940926923383, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3283652329578982],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 3, 1, 0.3333333333333334, 2.999999999999998, 0.4999999999999997, -7.587142600512558, 0.9876543209876543, 0.1111111111111112, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.85243656251021, 0, 0, 0.3505774723066855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.852447851920047, 1, 0, 0.3505760847921822, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3505760847921822, 0.3295048125009682],
[0.9994343007759494, 2.000565699224052, 0, 1, 0.3331447669253162, 0, 0.4998586151846271, 1.5169994374002, 0.6668552330746838, 1, 0.3295048125009682],
[0.7059761802867838, 1.909781756010335, 1, 0, 0.2698935442345125, 1.416478385423396, 0, -4.29880940030044, 1, 0.2698935442345125, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999745675312071, 1, 2, 0.3333615940277897, 0.9999999999999993, 1.000127178516283, 0.0003859686155058746, 0.7407030590161773, 0.7037413830323344, 0.3295048125009682],
[0.6724999151091716, 2.327500084890829, 0, 1, 0.2241666383697238, 0, 0.4296455267570505, 1.303912751671231, 0.7758333616302762, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.616419685393576, 1, 0, 0.3822016802512991, 0.9999999999999993, 0, -3.034857040205023, 1, 0.3822016802512991, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2288043594952668, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.00249498111833, 1.997505018881672, 1, 1, 0.3341649937061097, 0.9975112283200195, 0.5006245243678349, -1.507980111673557, 0.8883337569813956, 0.5566637443936151, 0.3295048125009682],
[0.9987236445498903, 2.001276355450111, 0, 2, 0.3329078815166299, 0, 0.9993622292860077, 3.032921497263629, 0.4450118945426307, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.002942323587154, 1.997057676412848, 0, 2, 0.3343141078623844, 0, 1.001473329299351, 3.039328384001699, 0.4431377069910533, 1, 0.3295048125009682],
[0.9979633584434838, 2.001550431485976, 1, 5, 0.3327083748686327, 1.00204079793039, 2.49806346187737, 4.540214913985769, 0.3524016231801165, 0.9117135517575516, 0.3295048125009682],
[0.7059759870761935, 1.909781949220926, 1, 0, 0.2698934703704184, 1.416478773083359, 0, -4.298810576793008, 1, 0.2698934703704184, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.2945652931495856, 2.705434706850412, 0, 2, 0.09818843104986193, 0, 0.7392527326332489, 2.243526360122818, 0.8132641058923096, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453696427535, 2.327754630357247, 1, 1, 0.2240817898809178, 1.487552083149971, 0.4295985440039817, -3.210737746487027, 0.9497873514437642, 0.3979509312055998, 0.3295048125009682],
[0.9994343297160567, 2.000565670283945, 1, 1, 0.3331447765720187, 1.000565990447921, 0.4998586224155629, -1.51957528095553, 0.8890145578427797, 0.5553041109868171, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612299629, 2.327754638770038, 1, 0, 0.2240817870766542, 1.487552101765888, 0, -4.514507968715987, 1, 0.2240817870766543, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 1.999491539659264, 1, 2, 0.333389838503628, 0.9999999999999993, 1.000254294819783, 0.0007717484241094977, 0.7406653973212077, 0.7037790375452752, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733604, 2.000000000000001, 1, 0, 0.2987685417154105, 1.173536300472593, 0, -3.561514903425409, 1, 0.2987685417154105, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 1.783480531534358, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7958626984154342, 2.204137301584566, 0, 1, 0.2652875661384781, 0, 0.453692244707757, 1.376891102937757, 0.7347124338615219, 1, 0.3295048125009682],
[0.6718247833284247, 2.327991504672669, 0, 2, 0.2239553088686275, 0, 0.8591096642688193, 2.607275012914402, 0.6022453626331874, 1, 0.3295048125009682],
[0.9987823982303634, 2.001217601769639, 0, 1, 0.3329274660767876, 0, 0.4996957847640952, 1.516505270352089, 0.6670725339232124, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 1, 0.223978171467962, 0, 0.4295411818039749, 1.30359607965578, 0.776021828532038, 1, 0.3295048125009682],
[1.001469851903309, 1.998275705219768, 0, 2, 0.3338515993549048, 0, 1.000862891329624, 3.037475792031666, 0.4437536916820182, 1, 0.3295048125009682],
[0.7364616994305886, 2.26353830056941, 1, 2, 0.2454872331435296, 1.357843864484972, 0.8835724138164063, -1.439346051029745, 0.8487961313108998, 0.5704637926313403, 0.3295048125009682],
[0.6091193287852562, 1.545788658910192, 1, 1, 0.2826660499025179, 1.641714443694083, 0.6469189654328408, -3.019062060765255, 0.9200999042325071, 0.4854320040375432, 0.3295048125009682],
[1.279145576084611, 1.657684289005013, 0, 1, 0.4355531763313689, 0, 0.6032511779430733, 1.83078108439251, 0.5644468236686311, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9997455571230762, 2.000254442876925, 1, 1, 0.3332485190410252, 1.000254507634579, 0.4999363973723864, -1.518393939271288, 0.8889454245569633, 0.555442462639014, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.000000000000001, 0, 0, 0.25147866116539, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[5.194932734205473, 13.08771595547897, 0, 0, 0.284145520836737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.04660709224585539],
[0.998869184815749, 2.001130815184253, 0, 2, 0.3329563949385828, 0, 0.9994349119129682, 3.03314207864576, 0.444947171053332, 1, 0.3295048125009682],
[1.378896176037868, 1.293603307668668, 1, 0, 0.515957508858132, 0.7252177628582657, 0, -2.200932233292146, 1, 0.515957508858132, 0.3295048125009682],
[0.6724998715148006, 2.327500128485201, 0, 1, 0.2241666238382668, 0, 0.4296455187097354, 1.30391272724878, 0.7758333761617332, 1, 0.3295048125009682],
[0.8526915570596327, 2.147308442940367, 0, 1, 0.2842305190198776, 0, 0.4656992819488351, 1.413330744440847, 0.7157694809801224, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.705683562980241, 2.188079249284484, 1, 3, 0.2438636504655186, 1.417065739460903, 1.371065513729002, -0.1396041089134807, 0.7485928186373476, 0.6731108806524698, 0.3295048125009682],
[0.672245369642762, 2.327754630357239, 1, 0, 0.2240817898809206, 1.487552083149952, 0, -4.514507912219281, 1, 0.2240817898809206, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 1, 1, 0.3333333333333334, 0.9999999999999993, 0.4999999999999997, -1.517428520102512, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.706085643324086, 2.187494120927763, 0, 1, 0.2440180333188943, 0, 0.4571440857522756, 1.387366947033383, 0.7559819666811057, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7955105226598822, 2.204489477340117, 0, 0, 0.2651701742199608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9988681823197838, 2.001131817680218, 1, 1, 0.3329560607732611, 1.001133100142992, 0.4997172056157874, -1.521725557576585, 0.8891402615943524, 0.5550523831408747, 0.3295048125009682],
[0.9995434304231894, 2.000456569576813, 0, 1, 0.3331811434743963, 0, 0.4998858836568221, 1.517082193315017, 0.6668188565256037, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.999434318369138, 2.000565681630864, 0, 1, 0.3331447727897124, 0, 0.4998586195804373, 1.516999450740855, 0.6668552272102876, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 2.187250788427061, 0, 0, 0.2440540009162209, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.909613176526226, 0, 0, 0.2699579918968018, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994341020460276, 2.000565897953974, 0, 2, 0.333144700682009, 0, 0.99971713106049, 3.033998573412497, 0.4446959902284874, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.441418677718894, 0, 0, 0.3288120608890049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9908532448587395, 2.009146755141259, 1, 2, 0.3302844149529133, 1.009231190581169, 0.9954474429914821, -0.04183170341296973, 0.744796612659776, 0.6996198590474458, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339686, 2.327754638766033, 1, 0, 0.2240817870779894, 1.487552101757024, 0, -4.514507968689087, 1, 0.2240817870779894, 0.3295048125009682],
[0.6719345144038861, 2.328065485596115, 0, 0, 0.223978171467962, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.002989671229025259, 2.997010328770971, 0, 2, 0.000996557076341754, 0, 0.6673317007953622, 2.025256310310798, 0.998007878973323, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.378079274174777, 1.293855240229105, 0, 0, 0.5157608716627665, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.9994343008927721, 2.00056569910723, 0, 2, 0.3331447669642572, 0, 0.9997172304276324, 3.033998874977569, 0.444695901827155, 1, 0.3295048125009682],
[0.6720436149269079, 2.327956385073094, 0, 1, 0.2240145383089692, 0, 0.4295613124077502, 1.303657173160371, 0.7759854616910309, 1, 0.3295048125009682],
[0.706396788223113, 2.187182415890513, 0, 1, 0.2441256099777299, 0, 0.4572092353773105, 1.387564666831587, 0.7558743900222701, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8930726790949833, 2.000322869102972, 0, 1, 0.3086590354544509, 0, 0.499919295752711, 1.517183594249453, 0.6913409645455491, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.2938552402291068, 2.706144759770891, 0, 0, 0.09795174674303565, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.8933955481979543, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3087706237587781, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.7061447597708926, 1.910091911530602, 0, 1, 0.2699085933305905, 0, 0.5235350162802775, 1.588853929952053, 0.7300914066694095, 1, 0.3295048125009682],
[0.8521253237562727, 2.147874676243727, 1, 2, 0.2840417745854243, 1.173536300496126, 0.9311530240198489, -0.7355985930419909, 0.8037936380706842, 0.6330025482271597, 0.3295048125009682],
[0.8521253237733719, 2.147874676226627, 1, 0, 0.2840417745911241, 1.173536300472577, 0, -3.561514903425361, 1, 0.2840417745911241, 0.3295048125009682],
[0.8921933292934279, 2.001569606913789, 1, 1, 0.308315970921517, 1.120833307274276, 0.4996079059882886, -1.885330282646971, 0.9049412620747224, 0.5215732039177563, 0.3295048125009682],
[0.9989776580349576, 2.001022341965044, 0, 2, 0.332992552678319, 0, 0.9994890901797527, 3.033306501940138, 0.444898934782585, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.4999999999999997, 1.517428520102512, 0.6666666666666666, 1, 0.3295048125009682],
[0.7352137461189343, 2.264786253881065, 0, 0, 0.2450712487063115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.6722453612339686, 2.327754638766033, 1, 0, 0.2240817870779894, 1.487552101757024, 0, -4.514507968689087, 1, 0.2240817870779894, 0.3295048125009682],
[0.6726154581174452, 2.326722272155221, 1, 1, 0.2242546583963048, 1.486733597825506, 0.4297891553140588, -3.20767528246144, 0.9497098481875565, 0.3982191649801664, 0.3295048125009682],
[0.9994343976359904, 2.000565602364011, 0, 1, 0.3331447992119966, 0, 0.499858639385946, 1.516999510847743, 0.6668552007880033, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[1.000000000000001, 2.000000000000001, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.3295048125009682],
[0.851814021850126, 2.148185978149874, 2, 1, 0.2839380072833753, 2.347930356506732, 0.4655090435238994, -5.712879574337937, 0.977108692979576, 0.196079761899314, 0.3295048125009682],
[0.8528660659116809, 2.147133934088319, 1, 2, 0.2842886886372269, 1.172517045722811, 0.9314742635508705, -0.731530384465119, 0.8034922814245262, 0.6333821188933326, 0.3295048125009682]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.001136407996798231,
"Nucleotide GTR":0.001119850500437418,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.001135060261031333,
"Nucleotide GTR":0.001118522401218414,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "T", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ACT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.001135343390786118,
"Nucleotide GTR":0.001118801405764736,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node172":{
"Global MG94xREV":0.001135197926228176,
"Nucleotide GTR":0.001118658060629482,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTG", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node228":{
"Global MG94xREV":0.001136243938675198,
"Nucleotide GTR":0.001119688832645836,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTT", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.001136013330290512,
"Nucleotide GTR":0.001119461584231779,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCT", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node237":{
"Global MG94xREV":0.00113611901901971,
"Nucleotide GTR":0.001119565733073228,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node272":{
"Global MG94xREV":0.001134984732671001,
"Nucleotide GTR":0.001118447973308409,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAC", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.001135779805205712,
"Nucleotide GTR":0.001119231461614009,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATT", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node318":{
"Global MG94xREV":0.001136355001457978,
"Nucleotide GTR":0.001119798277240757,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "D", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GAC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node318_1":{
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node325":{
"Global MG94xREV":0.001135582048087408,
"Nucleotide GTR":0.00111903658582246,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node357":{
"Global MG94xREV":0.001135539710268432,
"Nucleotide GTR":0.001118994864866692,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.001136407996807308,
"Nucleotide GTR":0.001119850500446363,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "F", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "TTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node39":{
"Global MG94xREV":0.001135535798870248,
"Nucleotide GTR":0.00111899101045769,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "C", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGT", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node393":{
"Global MG94xREV":0.001135071392935534,
"Nucleotide GTR":0.001118533370930461,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node4":{
"Global MG94xREV":0.001139082776022593,
"Nucleotide GTR":0.001122486308053522,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.001136467830196756,
"Nucleotide GTR":0.00111990946206165,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.001136303275805219,
"Nucleotide GTR":0.001119747305232209,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTT", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node455":{
"Global MG94xREV":0.001135524178427237,
"Nucleotide GTR":0.001118979559324859,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node456":{
"Global MG94xREV":0.001134839890791241,
"Nucleotide GTR":0.001118305241778896,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.001135539710268432,
"Nucleotide GTR":0.001118994864866692,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node499":{
"Global MG94xREV":0.001136123226159446,
"Nucleotide GTR":0.001119569878914821,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node508":{
"Global MG94xREV":0.001136123226159446,
"Nucleotide GTR":0.001119569878914821,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node520":{
"Global MG94xREV":0.00113517515137788,
"Nucleotide GTR":0.001118635617609394,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node525":{
"Global MG94xREV":0.001135783290831122,
"Nucleotide GTR":0.001119234896453758,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.001137387781498404,
"Nucleotide GTR":0.001120816009647052,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node532":{
"Global MG94xREV":0.001135862032368373,
"Nucleotide GTR":0.001119312490724605,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAT", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.001136123226159446,
"Nucleotide GTR":0.001119569878914821,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "V", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GTA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.001135143587467835,
"Nucleotide GTR":0.001118604513586401,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node559":{
"Global MG94xREV":0.001135078395635862,
"Nucleotide GTR":0.001118540271601248,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "P", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CCT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node560":{
"Global MG94xREV":0.001135441990350648,
"Nucleotide GTR":0.001118898568730849,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node64":{
"Global MG94xREV":0.001135582048087408,
"Nucleotide GTR":0.00111903658582246,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "F", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTT", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node89":{
"Global MG94xREV":0.001135287634410886,
"Nucleotide GTR":0.001118746461761457,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node93":{
"Global MG94xREV":0.001186036081063019,
"Nucleotide GTR":0.001168755502123659,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "L", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CTA", "GGC", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113638345226076,
"Nucleotide GTR":0.001119826313514547,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCA", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304209496575,
"Nucleotide GTR":0.001119748225319656,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "N", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "AAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAC", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414007_England_20200228_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326878523644,
"Nucleotide GTR":0.001119770564058366,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "S", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "TCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113597773778366,
"Nucleotide GTR":0.001119426510308749,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135575117482317,
"Nucleotide GTR":0.001119029756196479,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "P", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CCT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113632690969197,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "F", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TTC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136220921571865,
"Nucleotide GTR":0.001119666150902344,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "K", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "AAA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304116293028,
"Nucleotide GTR":0.001119748133474089,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "S", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "AGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002273566643729383,
"Nucleotide GTR":0.002240440714014286,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "G", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "S", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GGT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "AGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135907860537798,
"Nucleotide GTR":0.001119357651176315,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "S", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "TCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135568428388351,
"Nucleotide GTR":0.0011190231645628,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "E", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAG", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002903377,
"Nucleotide GTR":0.001118360536335986,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "CTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134959195065098,
"Nucleotide GTR":0.001118422807786142,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "G", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "GGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959182891686,
"Nucleotide GTR":0.001118422795790096,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAG", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136362250446393,
"Nucleotide GTR":0.001119805420611208,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "F", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TTT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139579543069972,
"Nucleotide GTR":0.001122975837191098,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "-", "D", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "---", "GAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTG", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909695325,
"Nucleotide GTR":0.001119770594775875,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCT", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418692_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135852021131916,
"Nucleotide GTR":0.001119302625352143,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "E", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAA", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002858942,
"Nucleotide GTR":0.001118360536292199,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "CTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909692079,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772676,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "TTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959121632363,
"Nucleotide GTR":0.001118422735423323,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAG", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136760631731905,
"Nucleotide GTR":0.001120197997470226,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "S", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "AGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135607350421349,
"Nucleotide GTR":0.001119061519500687,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "T", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "ACA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420179_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326817543032,
"Nucleotide GTR":0.001119770503966243,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "V", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GTT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420179_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420282_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139157250897366,
"Nucleotide GTR":0.001122559697827281,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCA", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420282_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304209641757,
"Nucleotide GTR":0.001119748225462723,
"amino-acid": [
["S", "N", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AAT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136543758438441,
"Nucleotide GTR":0.001119984284026726,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCA", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092481173,
"Nucleotide GTR":0.001118422706696866,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "S", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AGC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136326909667326,
"Nucleotide GTR":0.001119770594748283,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "F", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "TTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGG", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139473915074826,
"Nucleotide GTR":0.001122871748198802,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "K", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "AAG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135708916896092,
"Nucleotide GTR":0.001119161606149045,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACG", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135799084601649,
"Nucleotide GTR":0.001119250460108606,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "Y", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "TAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136206821976837,
"Nucleotide GTR":0.001119652256738811,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "I", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "ATT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134896002984506,
"Nucleotide GTR":0.001118360536415933,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "T", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ACC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113489600298077,
"Nucleotide GTR":0.001118360536412252,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAC", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136760571085588,
"Nucleotide GTR":0.001120197937707527,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "T", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "ACA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134896003032628,
"Nucleotide GTR":0.001118360536463353,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "A", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GCG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001137680352920798,
"Nucleotide GTR":0.001121104318295622,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304093984812,
"Nucleotide GTR":0.001119748111490903,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTA", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423092_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959183002185,
"Nucleotide GTR":0.001118422795898984,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGG", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423107_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909561304,
"Nucleotide GTR":0.001119770594643805,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "V", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GTT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423217_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136326909699152,
"Nucleotide GTR":0.001119770594779646,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "V", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GTC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423319_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002984506,
"Nucleotide GTR":0.001118360536415933,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCC", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423445_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909695325,
"Nucleotide GTR":0.001119770594775875,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "V", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GTT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423903_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136206397065375,
"Nucleotide GTR":0.001119651838018319,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "Y", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "TAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424099_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136167680300694,
"Nucleotide GTR":0.001119613685357986,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "D", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAT", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424140_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139827446894817,
"Nucleotide GTR":0.001123220129050269,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "-", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "L", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "---", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "CTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136326899700658,
"Nucleotide GTR":0.00111977058492683,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "I", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ATA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "C", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGT", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138915430482507,
"Nucleotide GTR":0.001122321400742644,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCT", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959195065098,
"Nucleotide GTR":0.001118422807786142,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "R", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CGA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "TTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092576249,
"Nucleotide GTR":0.001118422706790556,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "A", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "GCG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00116097557057582,
"Nucleotide GTR":0.00114406012397657,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135771299063793,
"Nucleotide GTR":0.001119223079406815,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "I", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ATA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "R", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AGA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001136326909734247,
"Nucleotide GTR":0.001119770594814229,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "I", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ATT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0011348960187613,
"Nucleotide GTR":0.001118360551962859,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAC", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTG", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136565944300231,
"Nucleotide GTR":0.001120006146639887,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "H", "G", "C", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CAT", "GGA", "TGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113518033641552,
"Nucleotide GTR":0.001118640727100888,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "I", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "ATA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCC", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136595506479988,
"Nucleotide GTR":0.001120035278097857,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "F", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "TTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959194852489,
"Nucleotide GTR":0.001118422807576629,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "M", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATG", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138900277852651,
"Nucleotide GTR":0.001122306468887031,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "M", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "ATG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136220004151873,
"Nucleotide GTR":0.001119665246849186,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "S", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "AGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909692079,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772676,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "L", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CTC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002278297633057927,
"Nucleotide GTR":0.002245102772695729,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "F", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTT", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTT", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432626_England_20200401_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001135552478711769,
"Nucleotide GTR":0.001119007447273454,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432626_England_20200401_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAG", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432942_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909695434,
"Nucleotide GTR":0.001119770594775983,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "F", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135967742670799,
"Nucleotide GTR":0.001119416660824961,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433893_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092481173,
"Nucleotide GTR":0.001118422706696866,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "G", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "GGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959194969958,
"Nucleotide GTR":0.001118422807692384,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "G", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GGT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136595506479988,
"Nucleotide GTR":0.001120035278097857,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "F", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "TTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135674668944846,
"Nucleotide GTR":0.001119127857191408,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGG", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136760571098302,
"Nucleotide GTR":0.001120197937720057,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "N", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "AAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134989886179768,
"Nucleotide GTR":0.001118453051730409,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "S", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AGT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002876726,
"Nucleotide GTR":0.001118360536309725,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "CTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136304092364537,
"Nucleotide GTR":0.001119748109894237,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "I", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATA", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134926703298281,
"Nucleotide GTR":0.001118390789425274,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAC", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435360_Utah_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113597773778366,
"Nucleotide GTR":0.001119426510308749,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "L", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TTA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435360_Utah_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436250_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136245486304359,
"Nucleotide GTR":0.001119690357725996,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "I", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "ATC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436250_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113622000325613,
"Nucleotide GTR":0.001119665245966495,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "I", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "ATT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134926703298281,
"Nucleotide GTR":0.001118390789425274,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAC", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436574_Wisconsin_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136508671117746,
"Nucleotide GTR":0.001119949707929278,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCT", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436574_Wisconsin_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113599046848098,
"Nucleotide GTR":0.001119439055519452,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "I", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "ATT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436937_Utah_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134895941621387,
"Nucleotide GTR":0.001118360475946876,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATC", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436937_Utah_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436998_Unknown_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113632690969197,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "I", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ATT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436998_Unknown_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437278_Bavaria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136595506479988,
"Nucleotide GTR":0.001120035278097857,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "Y", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "TAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437278_Bavaria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437458_Indiana_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135469812686456,
"Nucleotide GTR":0.001118925985694444,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "S", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "TCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437458_Indiana_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437473_Madinah_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113632684868683,
"Nucleotide GTR":0.001119770534656275,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "TTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437473_Madinah_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437535_Oregon_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136217173027822,
"Nucleotide GTR":0.001119662456974691,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "N", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "AAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437535_Oregon_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437540_Louisiana_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "P", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "CCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437540_Louisiana_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437695_Makkah_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "G", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GGT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437695_Makkah_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATT", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001138790646591015,
"Nucleotide GTR":0.001122198434955949,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "N", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAT", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437886_Athens_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135674668944172,
"Nucleotide GTR":0.001119127857190745,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "K", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAG", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437886_Athens_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136214610216651,
"Nucleotide GTR":0.001119659931503753,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "F", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "TTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438282_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438391_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134895941647983,
"Nucleotide GTR":0.001118360475973084,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCC", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438391_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304092178205,
"Nucleotide GTR":0.00111974810971062,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "K", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AAA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438460_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438617_England_20200421_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00113597773778366,
"Nucleotide GTR":0.001119426510308749,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAT", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438617_England_20200421_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_439503_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001137090416373974,
"Nucleotide GTR":0.001120522977140818,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTT", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439503_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439569_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAC", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439569_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439916_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "F", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTT", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439916_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439940_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113489600298077,
"Nucleotide GTR":0.001118360536412252,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGC", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439940_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896003003371,
"Nucleotide GTR":0.001118360536434524,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAC", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440082_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440594_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134895972358156,
"Nucleotide GTR":0.001118360506235811,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAC", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440594_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440822_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAT", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440822_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440831_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001134959123107456,
"Nucleotide GTR":0.001118422736876922,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTG", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440831_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441103_England_20200401_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136167680453235,
"Nucleotide GTR":0.001119613685508304,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "F", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "TTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441103_England_20200401_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441132_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136304211348968,
"Nucleotide GTR":0.00111974822714506,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "I", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "ATC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441132_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441213_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCC", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441213_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441368_Northern_Ireland_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00113616768045457,
"Nucleotide GTR":0.001119613685509621,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACT", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441368_Northern_Ireland_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441705_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002984506,
"Nucleotide GTR":0.001118360536415933,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "T", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ACT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441705_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441813_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002281886650848195,
"Nucleotide GTR":0.002248639498396211,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "N", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTA", "AAC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441813_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442094_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113532797243293,
"Nucleotide GTR":0.001118786212057387,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "N", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAC", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442094_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442397_England_20200326_null_20":{
"Global MG94xREV":0.001136167680096718,
"Nucleotide GTR":0.001119613685156981,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "I", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "ATA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442397_England_20200326_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442413_England_20200410_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001136394697829286,
"Nucleotide GTR":0.001119837395234824,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTT", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442413_England_20200410_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442428_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134895972236454,
"Nucleotide GTR":0.001118360506115881,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTC", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442428_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442548_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135327962569418,
"Nucleotide GTR":0.001118786202337587,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCC", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442548_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442945_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136168097952926,
"Nucleotide GTR":0.001119614096925012,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "F", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTT", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442945_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "T", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ACT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135327962618732,
"Nucleotide GTR":0.001118786202386183,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGC", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443332_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAT", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443332_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443386_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959182921848,
"Nucleotide GTR":0.001118422795819817,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "D", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "GAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_443386_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443487_England_20200412_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136326909692079,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772676,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "M", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ATG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443487_England_20200412_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443523_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113679150493208,
"Nucleotide GTR":0.00112022842084701,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "C", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "TGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443523_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443600_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "S", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AGT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443600_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443664_England_20200414_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "V", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "GTT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443664_England_20200414_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444225_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001135770595604575,
"Nucleotide GTR":0.001119222386197017,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "V", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GTA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444225_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444434_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136167787607203,
"Nucleotide GTR":0.001119613791101035,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "I", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "ATT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444434_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "L", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CTA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444524_Illinois_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001138209275600926,
"Nucleotide GTR":0.00112162553455748,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "L", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CTA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444524_Illinois_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444647_New_York_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113624541938497,
"Nucleotide GTR":0.001119690291781627,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "T", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "ACT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444647_New_York_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444680_New_York_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135481035329303,
"Nucleotide GTR":0.00111893704482307,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "S", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "TCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444680_New_York_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001139169854414253,
"Nucleotide GTR":0.001122572117710575,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTA", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445106_California_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134926611397587,
"Nucleotide GTR":0.001118390698863577,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "T", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ACA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445106_California_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445124_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136469743438559,
"Nucleotide GTR":0.001119911347427466,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "L", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CTA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445124_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326930776656,
"Nucleotide GTR":0.00111977061555005,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "V", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GTG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135503493900997,
"Nucleotide GTR":0.001118959176172746,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCG", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445182_California_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445225_Stockholm_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113632690969197,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCT", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445225_Stockholm_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445334_Puerto_Montt_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136326909699152,
"Nucleotide GTR":0.001119770594779646,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAT", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445334_Puerto_Montt_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445410_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136245419247023,
"Nucleotide GTR":0.001119690291645688,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "Q", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAA", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445410_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445770_Wales_20200408_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136304211450815,
"Nucleotide GTR":0.001119748227245424,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAA", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445770_Wales_20200408_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446054_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113676145407205,
"Nucleotide GTR":0.001120198807828853,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "Y", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TAT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446054_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446375_Wales_20200410_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001136595506479988,
"Nucleotide GTR":0.001120035278097857,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "C", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "TGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446375_Wales_20200410_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446473_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304179052142,
"Nucleotide GTR":0.0011197481953188,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAA", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446473_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136326909699152,
"Nucleotide GTR":0.001119770594779646,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "F", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "TTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446603_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134926611318127,
"Nucleotide GTR":0.001118390698785276,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTC", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446603_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446629_Wales_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001136362015800071,
"Nucleotide GTR":0.00111980518938369,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "I", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ATT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446629_Wales_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446876_Wales_20200416_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001136326847266605,
"Nucleotide GTR":0.001119770533256744,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAT", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446876_Wales_20200416_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447256_Taipei_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135675022418448,
"Nucleotide GTR":0.001119128205514889,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "G", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GGT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447256_Taipei_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447367_Jerusalem_District_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0011361676802018,
"Nucleotide GTR":0.001119613685260533,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "I", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATT", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447367_Jerusalem_District_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447389_North_District_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136304174442853,
"Nucleotide GTR":0.001119748190776669,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "N", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "AAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447389_North_District_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135536790556761,
"Nucleotide GTR":0.001118991987695302,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "C", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "TGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447940_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136259909346522,
"Nucleotide GTR":0.001119704570624031,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAG", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447940_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448166_Scotland_20200412_null_8":{
"Global MG94xREV":0.001136215597000179,
"Nucleotide GTR":0.001119660903909816,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "S", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448166_Scotland_20200412_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448182_Scotland_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAG", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448182_Scotland_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448195_Scotland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092481173,
"Nucleotide GTR":0.001118422706696866,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "V", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "GTA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448195_Scotland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448463_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092606409,
"Nucleotide GTR":0.001118422706820276,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "V", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "GTT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448463_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448583_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448583_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448768_England_20200101_null_14":{
"Global MG94xREV":0.001134989886186387,
"Nucleotide GTR":0.001118453051736931,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAG", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448768_England_20200101_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449009_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAC", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449009_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449051_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135675022418448,
"Nucleotide GTR":0.001119128205514889,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "R", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CGC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449051_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001136304141952816,
"Nucleotide GTR":0.001119748158760013,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "K", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AAA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136362242086283,
"Nucleotide GTR":0.001119805412372906,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCT", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449708_England_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449709_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136362015776236,
"Nucleotide GTR":0.001119805189360204,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "F", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "TTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449709_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449940_Washington_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092488967,
"Nucleotide GTR":0.001118422706704547,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCG", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449940_Washington_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_33":{
"Global MG94xREV":0.001135786455720309,
"Nucleotide GTR":0.001119238015230422,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "V", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GTT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450149_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959123107456,
"Nucleotide GTR":0.001118422736876922,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "S", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AGT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450149_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450464_California_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002984506,
"Nucleotide GTR":0.001118360536415933,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCC", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450464_California_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450503_Hubei_20200126_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001136362242138321,
"Nucleotide GTR":0.001119805412424185,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "S", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "TCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450503_Hubei_20200126_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450755_Minnesota_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001136362242113854,
"Nucleotide GTR":0.001119805412400075,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "I", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ATT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450755_Minnesota_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450788_Gujarat_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113498988605924,
"Nucleotide GTR":0.001118453051611637,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "D", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "GAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450788_Gujarat_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451152_Gujarat_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113524042675329,
"Nucleotide GTR":0.001118699941920753,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "F", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTC", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451152_Gujarat_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451215_Louisiana_20200424_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451215_Louisiana_20200424_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451216_Louisiana_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135675022256527,
"Nucleotide GTR":0.001119128205355328,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "V", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "GTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451216_Louisiana_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451274_Louisiana_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134989794252966,
"Nucleotide GTR":0.001118452961142984,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "R", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CGT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451274_Louisiana_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451446_New_York_20200326_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001136362133098755,
"Nucleotide GTR":0.00111980530497333,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "V", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GTA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451446_New_York_20200326_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451459_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136906649150772,
"Nucleotide GTR":0.00112034188741121,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "V", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GTA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAT", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451459_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_451504_New_South_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136782670220543,
"Nucleotide GTR":0.001120219714857467,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "L", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TTA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451504_New_South_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451831_Zurich_20200331_null_19":{
"Global MG94xREV":0.001136167787607203,
"Nucleotide GTR":0.001119613791101035,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "N", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAT", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451831_Zurich_20200331_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451999_Denmark_20200309_null_11":{
"Global MG94xREV":0.00113616768025059,
"Nucleotide GTR":0.001119613685308613,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "I", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATT", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451999_Denmark_20200309_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452044_Denmark_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136340906942067,
"Nucleotide GTR":0.001119784388082339,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "K", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "AAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452044_Denmark_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452070_Denmark_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTT", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452070_Denmark_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_11":{
"Global MG94xREV":0.001136329095217816,
"Nucleotide GTR":0.001119772748455243,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "R", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "AGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452093_Denmark_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134926672580694,
"Nucleotide GTR":0.001118390759155245,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "T", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ACG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452093_Denmark_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135786455720309,
"Nucleotide GTR":0.001119238015230422,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "C", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "TGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452345_Beijing_20200307_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001088930396367675,
"Nucleotide GTR":0.001073064649975679,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "L", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CTA", "GGC", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452345_Beijing_20200307_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452348_Beijing_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001163960228883848,
"Nucleotide GTR":0.001147001295729406,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "A", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "GCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452348_Beijing_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "P", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CCT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452361_Beijing_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113676145407205,
"Nucleotide GTR":0.001120198807828853,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "D", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GAT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452361_Beijing_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452364_Beijing_20200205_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452364_Beijing_20200205_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452591_Andalusia_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136167669683785,
"Nucleotide GTR":0.001119613674895764,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "F", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "TTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452591_Andalusia_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452796_Virginia_20200409_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001136362133123861,
"Nucleotide GTR":0.00111980530499807,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "TTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452796_Virginia_20200409_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452838_Virginia_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0.00113519107664885,
"Nucleotide GTR":0.001118651310848718,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "S", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "TCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452838_Virginia_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452980_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136260000372938,
"Nucleotide GTR":0.001119704660324189,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "F", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "S", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "TTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AGT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452980_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453124_Scotland_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "H", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453124_Scotland_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453135_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001139453139344225,
"Nucleotide GTR":0.001122851275171179,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTA", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453135_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453432_England_20200505_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136362242272474,
"Nucleotide GTR":0.001119805412556385,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "S", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "TCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453432_England_20200505_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453587_England_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134989886055493,
"Nucleotide GTR":0.001118453051607944,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "V", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "GTA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453587_England_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453660_England_20200516_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136106307420056,
"Nucleotide GTR":0.001119553206681938,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "M", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATG", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453660_England_20200516_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453833_Portugal_20200325_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001136362242282595,
"Nucleotide GTR":0.001119805412566357,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "I", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ATA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453833_Portugal_20200325_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453977_Portugal_20200404_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTT", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453977_Portugal_20200404_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454062_Portugal_20200318_null_33":{
"Global MG94xREV":0.001136362242086921,
"Nucleotide GTR":0.001119805412373533,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "I", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ATT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454062_Portugal_20200318_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454223_Portugal_20200313_null_5":{
"Global MG94xREV":0.00113597773778366,
"Nucleotide GTR":0.001119426510308749,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "T", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "ACT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454223_Portugal_20200313_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454224_Portugal_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136796583130787,
"Nucleotide GTR":0.00112023342505622,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "T", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "ACT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454224_Portugal_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454227_Portugal_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136340563261431,
"Nucleotide GTR":0.001119784049409139,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "N", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "AAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454227_Portugal_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454260_Portugal_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002278943472655956,
"Nucleotide GTR":0.002245739202392716,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "L", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTA", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCG", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454260_Portugal_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136211768804074,
"Nucleotide GTR":0.001119657131490637,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAT", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454524_Maharashtra_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454524_Maharashtra_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454558_Maharashtra_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00113616768025059,
"Nucleotide GTR":0.001119613685308613,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "Y", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "TAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454558_Maharashtra_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454613_California_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134926703170818,
"Nucleotide GTR":0.00111839078929967,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTC", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454613_California_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454788_Utrecht_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134926672584438,
"Nucleotide GTR":0.001118390759158935,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAC", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454788_Utrecht_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454996_Hubei_20200226_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454996_Hubei_20200226_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455112_Flevoland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136362242333995,
"Nucleotide GTR":0.001119805412617009,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAT", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455112_Flevoland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455151_Netherlands_20200405_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001136326909805284,
"Nucleotide GTR":0.001119770594884231,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAT", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455151_Netherlands_20200405_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455287_Netherlands_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001137316574521506,
"Nucleotide GTR":0.001120745840157804,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTT", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455287_Netherlands_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455292_Utrecht_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136303865841722,
"Nucleotide GTR":0.001119747886671865,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTA", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455292_Utrecht_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455299_Zuid_Holland_20200407_null_42":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "K", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "AAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455299_Zuid_Holland_20200407_null_42",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455319_Andalusia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135327972274881,
"Nucleotide GTR":0.001118786211901641,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "H", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "CAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455319_Andalusia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136565969008557,
"Nucleotide GTR":0.001120006170988213,
"amino-acid": [
["Y", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TAT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455328_Galicia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092481173,
"Nucleotide GTR":0.001118422706696866,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACG", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455328_Galicia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135441544587106,
"Nucleotide GTR":0.001118898129462094,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "N", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "AAT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455335_Galicia_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001138790646592911,
"Nucleotide GTR":0.001122198434957819,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "V", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GTC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455335_Galicia_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455337_LaRioja_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002877808,
"Nucleotide GTR":0.00111836053631079,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455337_LaRioja_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455345_Melilla_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001135762593523238,
"Nucleotide GTR":0.00111921450070623,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "C", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "S", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGT", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TCT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455345_Melilla_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455346_Melilla_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134959194969958,
"Nucleotide GTR":0.001118422807692384,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "S", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AGT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455346_Melilla_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455405_Hubei_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001136217173027303,
"Nucleotide GTR":0.00111966245697418,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "T", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "ACA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455405_Hubei_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455448_Malopolska_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136361898504498,
"Nucleotide GTR":0.001119805073797119,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "I", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ATT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455448_Malopolska_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455567_Istria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896002995784,
"Nucleotide GTR":0.001118360536427046,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACC", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455567_Istria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455582_Iowa_20200526_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135698600663597,
"Nucleotide GTR":0.001119151440224346,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAT", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455582_Iowa_20200526_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455665_West_Bengal_20200501_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "F", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTT", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455665_West_Bengal_20200501_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAT", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455793_Selangor_20200229_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001134926703329891,
"Nucleotide GTR":0.001118390789456426,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTC", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455793_Selangor_20200229_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455931_Bangkok_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "D", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GAC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455931_Bangkok_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455944_Bangkok_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959092451013,
"Nucleotide GTR":0.001118422706667146,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "R", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CGC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455944_Bangkok_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455983_Louisiana_20200328_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135741996484766,
"Nucleotide GTR":0.001119194203767187,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455983_Louisiana_20200328_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456071_Rio_de_Janeiro_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136565954987474,
"Nucleotide GTR":0.001120006157171418,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "I", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "ATT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456071_Rio_de_Janeiro_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456108_New_York_20200417_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001136362015641399,
"Nucleotide GTR":0.001119805189227332,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456108_New_York_20200417_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_456115_New_York_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001134989884641141,
"Nucleotide GTR":0.001118453050214199,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAG", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456115_New_York_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456421_Victoria_20200411_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456421_Victoria_20200411_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456566_Victoria_20200509_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001135562872825327,
"Nucleotide GTR":0.001119017689944485,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "S", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "TCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456566_Victoria_20200509_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456648_Victoria_20200527_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCT", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456648_Victoria_20200527_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456660_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136167680405778,
"Nucleotide GTR":0.001119613685461539,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "I", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATT", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456660_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456667_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134896018768886,
"Nucleotide GTR":0.001118360551970335,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAC", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456667_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456673_England_20200504_null_14":{
"Global MG94xREV":0.00113616768025059,
"Nucleotide GTR":0.001119613685308613,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACT", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456673_England_20200504_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456718_England_20200518_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "F", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "TTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456718_England_20200518_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456727_England_20200519_null_67":{
"Global MG94xREV":0.001136211768804074,
"Nucleotide GTR":0.001119657131490637,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "S", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "TCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456727_England_20200519_null_67",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456750_England_20200521_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001135710704948764,
"Nucleotide GTR":0.00111916336814974,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "S", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "TCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456750_England_20200521_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456787_Scotland_20200501_null_9":{
"Global MG94xREV":0.00113518033641552,
"Nucleotide GTR":0.001118640727100888,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "N", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAT", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456787_Scotland_20200501_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456834_Scotland_20200507_null_18":{
"Global MG94xREV":0.001135799084601649,
"Nucleotide GTR":0.001119250460108606,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "S", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "TCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456834_Scotland_20200507_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456839_Scotland_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001134895988356016,
"Nucleotide GTR":0.001118360522000581,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAC", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456839_Scotland_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456849_Scotland_20200507_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "V", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GTA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456849_Scotland_20200507_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456856_Scotland_20200509_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001134896002858942,
"Nucleotide GTR":0.001118360536292199,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAC", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456856_Scotland_20200509_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456874_Scotland_20200512_null_20":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456874_Scotland_20200512_null_20",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456878_Scotland_20200512_null_16":{
"Global MG94xREV":0.00113489600298077,
"Nucleotide GTR":0.001118360536412252,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATC", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456878_Scotland_20200512_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456882_Scotland_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909692079,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772676,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTT", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456882_Scotland_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_456998_Scotland_20200519_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_456998_Scotland_20200519_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457009_Scotland_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.001136326930776762,
"Nucleotide GTR":0.001119770615550155,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAT", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457009_Scotland_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457087_England_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001135367142387328,
"Nucleotide GTR":0.001118824811304452,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "H", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAC", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457087_England_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457236_England_20200429_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "F", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "TTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457236_England_20200429_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457267_England_20200513_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00113622000325613,
"Nucleotide GTR":0.001119665245966495,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "I", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "ATT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457267_England_20200513_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457295_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001135786455720309,
"Nucleotide GTR":0.001119238015230422,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "F", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TTT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457295_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457299_England_20200418_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001136326909699152,
"Nucleotide GTR":0.001119770594779646,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "M", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ATG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457299_England_20200418_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457340_England_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001136326909695325,
"Nucleotide GTR":0.001119770594775875,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAT", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457340_England_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457484_England_20200507_null_12":{
"Global MG94xREV":0.001136326847308766,
"Nucleotide GTR":0.00111977053329829,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGT", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457484_England_20200507_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457571_England_20200517_null_38":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCT", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457571_England_20200517_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457605_England_20200501_null_16":{
"Global MG94xREV":0.001134896018988621,
"Nucleotide GTR":0.001118360552186867,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "T", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ACG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457605_England_20200501_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457646_England_20200328_null_26":{
"Global MG94xREV":0.00113616768045457,
"Nucleotide GTR":0.001119613685509621,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGT", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457646_England_20200328_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457670_England_20200504_null_5":{
"Global MG94xREV":0.001136326909692079,
"Nucleotide GTR":0.001119770594772676,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "S", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "TCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457670_England_20200504_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_457720_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001134959183002185,
"Nucleotide GTR":0.001118422795898984,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "A", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "GCA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_457720_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003408818945401574,
"Nucleotide GTR":0.003359152357836038,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "P", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "A", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "CCA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GCT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458006_North_Carolina_20200401_null_30887":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458006_North_Carolina_20200401_null_30887",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458019_New_York_20200318_null_94":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458019_New_York_20200318_null_94",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458061_Telangana_20200513_null_9":{
"Global MG94xREV":0.001135046895279216,
"Nucleotide GTR":0.00111850923020568,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "L"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "CTC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_458061_Telangana_20200513_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_458068_Telangana_20200414_null_80":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_458068_Telangana_20200414_null_80",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7794.781183562305,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03659185416707075],
[0.01169530811345341],
[0.01684816367828507],
[0.05002019103830854],
[0.02217457131459129],
[0.007087327212876549],
[0.01020994468600186],
[0.03031210958275539],
[0.0175340759780392],
[0.005604154960598059],
[0.008073299064777604],
[0.02396866324666892],
[0.03143619522706619],
[0.01004748180883571],
[0.01447431879756352],
[0.04297252835551764],
[0.01663558976549728],
[0.005316985224858791],
[0.007659604729899888],
[0.02274045404493141],
[0.01008112543111489],
[0.003222079633050138],
[0.004641701143354293],
[0.01378065778364695],
[0.007971437947799158],
[0.002547791715640437],
[0.003670327572978638],
[0.01089676536144917],
[0.01429169577463422],
[0.004567841377617399],
[0.006580394329073927],
[0.01953640691845318],
[0.03075230981499547],
[0.009828901723444441],
[0.01415943414298573],
[0.04203767332456176],
[0.01863582216871335],
[0.005956289648934057],
[0.008580581370496606],
[0.02547472398580585],
[0.01473588450408651],
[0.004709810790474942],
[0.006784914285447067],
[0.02014360230688095],
[0.0264194213994598],
[0.008444045279451919],
[0.01216442145815752],
[0.03611471830557816],
[0.009679326004889976],
[0.04139794618405316],
[0.01835222318988851],
[0.005865647140826281],
[0.008450002526570865],
[0.02508705095250399],
[0.004638137133227915],
[0.006681661810437015],
[0.01983705800782256],
[0.02601737200973078],
[0.008315544234704689],
[0.01197930392095972],
[0.03556512638850119]
],
"Log Likelihood":-3563.075631151231,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5977452170662204, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":333
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8385.744661272618,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3154345496943342],
[0.1598088800655448],
[0.1944956513518624],
[0.3302609188882586]
],
"Log Likelihood":-3618.578327315749,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3227296759812595,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.0889066632865356,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.0243319224710268,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.863409971565783,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6033480500461285
},
"display order":0,
"estimated parameters":573
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-06-03/sequences.methyltransferase.compressed.fas",
"number of sequences":284,
"number of sites":299,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_447389_North_District_20200329_null_1,epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2,epi_isl_455292_Utrecht_20200312_null_1,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1,(epi_isl_439503_England_20200331_null_1,epi_isl_452070_Denmark_20200427_null_1)Node228,epi_isl_455983_Louisiana_20200328_null_9,(epi_isl_436574_Wisconsin_20200403_null_1,epi_isl_456648_Victoria_20200527_null_15)Node234,(epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_456998_Scotland_20200519_null_3)Node237,epi_isl_455944_Bangkok_20200315_null_1,epi_isl_439940_England_20200324_null_1,epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_3,epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1,epi_isl_456834_Scotland_20200507_null_18,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_453833_Portugal_20200325_null_10,epi_isl_455319_Andalusia_20200305_null_1,epi_isl_457009_Scotland_20200330_null_6,epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_448768_England_20200101_null_14,epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1,epi_isl_451831_Zurich_20200331_null_19,epi_isl_454788_Utrecht_20200316_null_3,epi_isl_456839_Scotland_20200507_null_2,epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3,epi_isl_441368_Northern_Ireland_20200323_null_4,epi_isl_451274_Louisiana_20200506_null_2,epi_isl_457484_England_20200507_null_12,(epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1)Node147,epi_isl_438391_England_20200331_null_1,epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1,(epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1,epi_isl_448583_England_20200101_null_2)Node155,epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1,epi_isl_446473_Wales_20200413_null_1,epi_isl_423319_England_20200326_null_2,epi_isl_451216_Louisiana_20200427_null_2,epi_isl_456108_New_York_20200417_null_10,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_6,(epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1)Node172,epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_450149_New_York_20200320_null_1,epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_442094_England_20200404_null_1,epi_isl_445106_California_20200325_null_1,epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_453432_England_20200505_null_2,epi_isl_456071_Rio_de_Janeiro_20200330_null_1,epi_isl_449940_Washington_20200413_null_1,epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2,epi_isl_457670_England_20200504_null_5,epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1,epi_isl_444434_England_20200101_null_2,epi_isl_450503_Hubei_20200126_null_7,epi_isl_455328_Galicia_20200309_null_1,(epi_isl_447940_England_20200429_null_1,epi_isl_454996_Hubei_20200226_null_7)Node125,epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1,epi_isl_457340_England_20200512_null_1,epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1,epi_isl_442548_England_20200412_null_1,epi_isl_446629_Wales_20200408_null_4,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_454062_Portugal_20200318_null_33,epi_isl_455335_Galicia_20200311_null_1,epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_454227_Portugal_20200317_null_1,epi_isl_456673_England_20200504_null_14,epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_7,(epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_449009_England_20200420_null_1)Node272,epi_isl_438460_England_20200330_null_1,epi_isl_437695_Makkah_20200405_null_1,epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_2,epi_isl_450464_California_20200407_null_1,epi_isl_454260_Portugal_20200407_null_1,epi_isl_456878_Scotland_20200512_null_16,epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1,epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2,epi_isl_446603_Wales_20200413_null_1,epi_isl_457720_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1,epi_isl_457267_England_20200513_null_2,epi_isl_457605_England_20200501_null_16,(epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1,epi_isl_453660_England_20200516_null_1)Node300,epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1,(epi_isl_454524_Maharashtra_20200420_null_3,epi_isl_458061_Telangana_20200513_null_9)Node4,epi_isl_442413_England_20200410_null_4,epi_isl_443487_England_20200412_null_5,epi_isl_443332_England_20200415_null_3,epi_isl_414007_England_20200228_null_3,epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_2,epi_isl_444647_New_York_20200329_null_1,epi_isl_456727_England_20200519_null_67,epi_isl_418692_England_20200317_null_1,(epi_isl_441813_England_20200403_null_2,epi_isl_455931_Bangkok_20200313_null_3)Node318,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_442945_England_20200407_null_1,epi_isl_449708_England_20200416_null_6,epi_isl_446876_Wales_20200416_null_9,(epi_isl_457571_England_20200517_null_38,epi_isl_420282_England_20200321_null_1,epi_isl_432626_England_20200401_null_10)Node325,epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2,epi_isl_441705_England_20200407_null_1,epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1,epi_isl_447367_Jerusalem_District_20200401_null_2,epi_isl_455448_Malopolska_20200401_null_5,epi_isl_443600_England_20200414_null_1,epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1,epi_isl_437458_Indiana_20200407_null_1,epi_isl_455405_Hubei_20200302_null_2,epi_isl_423903_England_20200318_null_1,epi_isl_452796_Virginia_20200409_null_12,epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1,epi_isl_443664_England_20200414_null_5,(epi_isl_432942_England_20200330_null_1,epi_isl_456787_Scotland_20200501_null_9)Node357,epi_isl_436998_Unknown_20200325_null_1,epi_isl_442428_England_20200324_null_1,(epi_isl_452980_England_20200513_null_1,epi_isl_457236_England_20200429_null_8)Node364,epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1,epi_isl_420943_Wales_20200321_null_2,epi_isl_455567_Istria_20200329_null_1,epi_isl_452093_Denmark_20200414_null_1,epi_isl_454558_Maharashtra_20200413_null_1,epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_1,epi_isl_423107_England_20200323_null_1,epi_isl_447256_Taipei_20200320_null_2,epi_isl_454613_California_20200416_null_1,(epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1,epi_isl_455345_Melilla_20200311_null_1)Node39,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_445334_Puerto_Montt_20200329_null_6,epi_isl_423217_England_20200325_null_1,epi_isl_449051_England_20200504_null_1,epi_isl_455793_Selangor_20200229_null_4,epi_isl_455337_LaRioja_20200301_null_1,(epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4)Node393,epi_isl_456750_England_20200521_null_4,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_452591_Andalusia_20200327_null_1,epi_isl_456115_New_York_20200503_null_4,epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_3,epi_isl_423092_England_20200324_null_1,epi_isl_437278_Bavaria_20200401_null_1,epi_isl_437535_Oregon_20200408_null_5,epi_isl_457299_England_20200418_null_7,epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_445410_Wales_20200403_null_1,epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_1,epi_isl_437473_Madinah_20200329_null_1,(epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1,epi_isl_455299_Zuid_Holland_20200407_null_42)Node423,(epi_isl_453977_Portugal_20200404_null_10,epi_isl_455287_Netherlands_20200401_null_2)Node426,epi_isl_456882_Scotland_20200512_null_1,epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3,epi_isl_442397_England_20200326_null_20,epi_isl_451446_New_York_20200326_null_9,epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2,epi_isl_453587_England_20200427_null_3,epi_isl_456660_England_20200101_null_1,epi_isl_445770_Wales_20200408_null_5,epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1,epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2,epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_456667_England_20200507_null_1,epi_isl_448463_England_20200407_null_1,epi_isl_436937_Utah_20200415_null_1,epi_isl_424140_England_20200321_null_1,((epi_isl_433893_England_20200410_null_1,epi_isl_439916_England_20200329_null_3)Node456,epi_isl_448182_Scotland_20200413_null_2)Node455,epi_isl_444225_England_20200415_null_7,epi_isl_441132_England_20200402_null_2,(epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1,epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1)Node465,epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1,epi_isl_443386_England_20200413_null_1,epi_isl_441103_England_20200401_null_6,epi_isl_450788_Gujarat_20200506_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_2,epi_isl_449709_England_20200416_null_1,epi_isl_456718_England_20200518_null_4,epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_449975_Washington_20200415_null_33,epi_isl_452361_Beijing_20200211_null_1,epi_isl_423445_England_20200327_null_1,epi_isl_452044_Denmark_20200330_null_1,epi_isl_457646_England_20200328_null_26,epi_isl_445225_Stockholm_20200330_null_2,epi_isl_439569_England_20200323_null_1,epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1,epi_isl_446375_Wales_20200410_null_7,epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3,epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1,(epi_isl_454224_Portugal_20200314_null_1,epi_isl_456874_Scotland_20200512_null_20)Node499,epi_isl_454223_Portugal_20200313_null_5,epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2,epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1,(epi_isl_451504_New_South_Wales_20200328_null_1,epi_isl_456421_Victoria_20200411_null_18)Node508,epi_isl_435360_Utah_20200403_null_3,epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_5,epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1,(epi_isl_457087_England_20200412_null_2,epi_isl_440822_England_20200401_null_3,epi_isl_455582_Iowa_20200526_null_2)Node532,epi_isl_445124_Louisiana_20200402_null_2,(epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1,epi_isl_458019_New_York_20200318_null_94)Node520,epi_isl_443523_England_20200414_null_1,epi_isl_437540_Louisiana_20200412_null_1,((epi_isl_444524_Illinois_20200317_null_4,epi_isl_451215_Louisiana_20200424_null_8)Node526,epi_isl_453124_Scotland_20200424_null_3)Node525,epi_isl_448166_Scotland_20200412_null_8,epi_isl_436250_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_438282_England_20200331_null_1,epi_isl_455346_Melilla_20200311_null_2,epi_isl_424099_England_20200313_null_1,(epi_isl_451459_New_York_20200320_null_1,epi_isl_456849_Scotland_20200507_null_15)Node542,epi_isl_438617_England_20200421_null_7,epi_isl_441213_England_20200403_null_2,epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1,(epi_isl_452838_Virginia_20200421_null_3,epi_isl_458068_Telangana_20200414_null_80)Node551,epi_isl_456566_Victoria_20200509_null_6,epi_isl_448195_Scotland_20200421_null_1,((epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6)Node560,epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1)Node559,epi_isl_440594_England_20200402_null_1,epi_isl_456856_Scotland_20200509_null_3,epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1,epi_isl_437886_Athens_20200317_null_1,epi_isl_450755_Minnesota_20200330_null_3,epi_isl_420179_England_20200327_null_1,epi_isl_451999_Denmark_20200309_null_11,epi_isl_455112_Flevoland_20200331_null_1,epi_isl_440831_England_20200401_null_4,(epi_isl_451152_Gujarat_20200509_null_1,epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_8,epi_isl_455665_West_Bengal_20200501_null_12)Node64,epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1,epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1,epi_isl_424185_USA_20200318_null_1,epi_isl_458006_North_Carolina_20200401_null_30887,epi_isl_440082_England_20200323_null_1,epi_isl_446054_Wales_20200410_null_2,epi_isl_457295_England_20200418_null_3,epi_isl_455151_Netherlands_20200405_null_10,epi_isl_445182_California_20200412_null_1,epi_isl_444680_New_York_20200330_null_2,epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2,epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_11,epi_isl_453135_Scotland_20200428_null_1,(epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_452345_Beijing_20200307_null_2)Node93,(epi_isl_452348_Beijing_20200318_null_1,epi_isl_452364_Beijing_20200205_null_7)Node89,epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node125":"test",
"Node147":"test",
"Node155":"test",
"Node172":"test",
"Node228":"test",
"Node234":"test",
"Node237":"test",
"Node272":"test",
"Node300":"test",
"Node318":"test",
"Node325":"test",
"Node357":"test",
"Node364":"test",
"Node39":"test",
"Node393":"test",
"Node4":"test",
"Node423":"test",
"Node426":"test",
"Node455":"test",
"Node456":"test",
"Node465":"test",
"Node499":"test",
"Node508":"test",
"Node520":"test",
"Node525":"test",
"Node526":"test",
"Node532":"test",
"Node542":"test",
"Node551":"test",
"Node559":"test",
"Node560":"test",
"Node64":"test",
"Node89":"test",
"Node93":"test",
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_2":"test",
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420179_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420282_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_422507_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422534_New_York_20200319_null_3":"test",
"epi_isl_422804_Netherlands_20200307_null_3":"test",
"epi_isl_422849_Netherlands_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_422875_Noord_Brabant_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_422957_Zuid_Holland_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423092_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423107_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423217_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_423319_England_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_423445_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_423903_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424099_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_424140_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424185_USA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_424440_Reykjavik_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_424973_Taoyuan_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_426011_Scotland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_427032_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427158_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427380_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427527_New_York_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_428286_Wisconsin_20200323_null_3":"test",
"epi_isl_428306_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_428347_Ile_De_France_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_429640_Connecticut_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430234_Washington_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_430394_New_Jersey_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_430398_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430802_Buenos_Aires_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430818_Ciudad_Autonoma_de_Buenos_Aires_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_430867_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_432626_England_20200401_null_10":"test",
"epi_isl_432942_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_433194_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433893_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434340_Washington_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_434370_Antwerp_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_434383_Antwerp_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434602_Virginia_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_434622_Occitanie_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_434941_Texas_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_435006_Texas_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_435360_Utah_20200403_null_3":"test",
"epi_isl_436250_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_436390_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_436404_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_436574_Wisconsin_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_436928_Utah_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_436937_Utah_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_436998_Unknown_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_437278_Bavaria_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_437458_Indiana_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_437473_Madinah_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_437535_Oregon_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_437540_Louisiana_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_437695_Makkah_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_437740_Madinah_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_437823_Washington_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_437886_Athens_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438391_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438460_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438617_England_20200421_null_7":"test",
"epi_isl_439503_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439569_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_439916_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_439940_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_440594_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_440822_England_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_440831_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_441103_England_20200401_null_6":"test",
"epi_isl_441132_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_441213_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_441368_Northern_Ireland_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_441705_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_441813_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_442094_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442397_England_20200326_null_20":"test",
"epi_isl_442413_England_20200410_null_4":"test",
"epi_isl_442428_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_442548_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_442945_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_443257_Minnesota_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_443332_England_20200415_null_3":"test",
"epi_isl_443386_England_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_443487_England_20200412_null_5":"test",
"epi_isl_443523_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_443600_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_443664_England_20200414_null_5":"test",
"epi_isl_444225_England_20200415_null_7":"test",
"epi_isl_444434_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_444467_Gujarat_20200429_null_3":"test",
"epi_isl_444524_Illinois_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_444647_New_York_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_444680_New_York_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_445076_Luxembourg_20200422_null_8":"test",
"epi_isl_445106_California_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_445124_Louisiana_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_445125_Louisiana_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_445182_California_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_445225_Stockholm_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_445334_Puerto_Montt_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_445410_Wales_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_445770_Wales_20200408_null_5":"test",
"epi_isl_446054_Wales_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_446375_Wales_20200410_null_7":"test",
"epi_isl_446473_Wales_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_6":"test",
"epi_isl_446603_Wales_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_446629_Wales_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_446876_Wales_20200416_null_9":"test",
"epi_isl_447256_Taipei_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_447367_Jerusalem_District_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_447389_North_District_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_447404_North_District_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_447940_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_448166_Scotland_20200412_null_8":"test",
"epi_isl_448182_Scotland_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_448195_Scotland_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_448463_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_448583_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_448768_England_20200101_null_14":"test",
"epi_isl_449009_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_449051_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_449252_Scotland_20200427_null_7":"test",
"epi_isl_449708_England_20200416_null_6":"test",
"epi_isl_449709_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_449940_Washington_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_33":"test",
"epi_isl_450149_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_450464_California_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_450503_Hubei_20200126_null_7":"test",
"epi_isl_450755_Minnesota_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_450788_Gujarat_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_451152_Gujarat_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_451215_Louisiana_20200424_null_8":"test",
"epi_isl_451216_Louisiana_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_451274_Louisiana_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_451446_New_York_20200326_null_9":"test",
"epi_isl_451459_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_451504_New_South_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_451831_Zurich_20200331_null_19":"test",
"epi_isl_451999_Denmark_20200309_null_11":"test",
"epi_isl_452044_Denmark_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_452070_Denmark_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_11":"test",
"epi_isl_452093_Denmark_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_452196_Maharashtra_20200419_null_3":"test",
"epi_isl_452345_Beijing_20200307_null_2":"test",
"epi_isl_452348_Beijing_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_452359_Beijing_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_452361_Beijing_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_452364_Beijing_20200205_null_7":"test",
"epi_isl_452591_Andalusia_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_452796_Virginia_20200409_null_12":"test",
"epi_isl_452838_Virginia_20200421_null_3":"test",
"epi_isl_452980_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_453124_Scotland_20200424_null_3":"test",
"epi_isl_453135_Scotland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_453432_England_20200505_null_2":"test",
"epi_isl_453587_England_20200427_null_3":"test",
"epi_isl_453660_England_20200516_null_1":"test",
"epi_isl_453833_Portugal_20200325_null_10":"test",
"epi_isl_453977_Portugal_20200404_null_10":"test",
"epi_isl_454062_Portugal_20200318_null_33":"test",
"epi_isl_454223_Portugal_20200313_null_5":"test",
"epi_isl_454224_Portugal_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_454227_Portugal_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_454260_Portugal_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_454524_Maharashtra_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_454558_Maharashtra_20200413_null_1":"test",
"epi_isl_454613_California_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_454788_Utrecht_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_454996_Hubei_20200226_null_7":"test",
"epi_isl_455112_Flevoland_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_455151_Netherlands_20200405_null_10":"test",
"epi_isl_455287_Netherlands_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_455292_Utrecht_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_455299_Zuid_Holland_20200407_null_42":"test",
"epi_isl_455319_Andalusia_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455328_Galicia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_455335_Galicia_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_455337_LaRioja_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_455345_Melilla_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_455346_Melilla_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_455405_Hubei_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_455448_Malopolska_20200401_null_5":"test",
"epi_isl_455567_Istria_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_455582_Iowa_20200526_null_2":"test",
"epi_isl_455665_West_Bengal_20200501_null_12":"test",
"epi_isl_455712_Hanoi_20200410_null_5":"test",
"epi_isl_455793_Selangor_20200229_null_4":"test",
"epi_isl_455931_Bangkok_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_455944_Bangkok_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_455983_Louisiana_20200328_null_9":"test",
"epi_isl_456071_Rio_de_Janeiro_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_456108_New_York_20200417_null_10":"test",
"epi_isl_456115_New_York_20200503_null_4":"test",
"epi_isl_456421_Victoria_20200411_null_18":"test",
"epi_isl_456566_Victoria_20200509_null_6":"test",
"epi_isl_456648_Victoria_20200527_null_15":"test",
"epi_isl_456660_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_456667_England_20200507_null_1":"test",
"epi_isl_456673_England_20200504_null_14":"test",
"epi_isl_456718_England_20200518_null_4":"test",
"epi_isl_456727_England_20200519_null_67":"test",
"epi_isl_456750_England_20200521_null_4":"test",
"epi_isl_456787_Scotland_20200501_null_9":"test",
"epi_isl_456834_Scotland_20200507_null_18":"test",
"epi_isl_456839_Scotland_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_456849_Scotland_20200507_null_15":"test",
"epi_isl_456856_Scotland_20200509_null_3":"test",
"epi_isl_456874_Scotland_20200512_null_20":"test",
"epi_isl_456878_Scotland_20200512_null_16":"test",
"epi_isl_456882_Scotland_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_456998_Scotland_20200519_null_3":"test",
"epi_isl_457009_Scotland_20200330_null_6":"test",
"epi_isl_457087_England_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_457236_England_20200429_null_8":"test",
"epi_isl_457267_England_20200513_null_2":"test",
"epi_isl_457295_England_20200418_null_3":"test",
"epi_isl_457299_England_20200418_null_7":"test",
"epi_isl_457340_England_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_457484_England_20200507_null_12":"test",
"epi_isl_457571_England_20200517_null_38":"test",
"epi_isl_457605_England_20200501_null_16":"test",
"epi_isl_457646_England_20200328_null_26":"test",
"epi_isl_457670_England_20200504_null_5":"test",
"epi_isl_457720_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_458001_North_Carolina_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_458006_North_Carolina_20200401_null_30887":"test",
"epi_isl_458019_New_York_20200318_null_94":"test",
"epi_isl_458061_Telangana_20200513_null_9":"test",
"epi_isl_458068_Telangana_20200414_null_80":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":12
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":10
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":23
}
}
}