{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[275.5885783909941, 720.9086321084679, 0, 2, 0.2765573003991293, 0, 0.002774276671026294, 0.006125467482587937, 0.5233693396057957, 1, 0.001944639151725094],
[274.4630295280446, 719.0569099643832, 0, 0, 0.2762531667640843, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003802918257178761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0005907928219498236],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009711998201557291],
[275.4630295280446, 720.9650386750587, 0, 2, 0.2764504918300801, 0, 0.00277405961830752, 0.006124988240778804, 0.523523890772933, 1, 0.001944938665409077],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.9196945308227, 718.8058484700283, 0, 0, 0.2766555579326466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798752780502931],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.000591295153869873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003804497677488717],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005910718363402804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.0355883330483, 719.1466196705808, 0, 0, 0.2766450517006681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798926713218511],
[275.7493089305464, 721.2045665716936, 1, 0, 0.2765918421166987, 0.003626482343249941, 0, -0.00800709601235957, 1, 0.2765918421166986, 0.000591295153869873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009709847801858067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798752782181605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.000591295153869873],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080511060171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 0, 0, 0.276322993307938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.6227556792626, 0, 0, 0.2760676342632609, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000379475671438998],
[275.4436088249112, 721.4426345760346, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.276303952079042, 0.000591661472816435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080506439135],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 718.2625134728065, 0, 0, 0.2772023235874582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003794756676457557],
[275.9630295280446, 720.7625134728065, 0, 1, 0.2768696272167361, 0, 0.001387419547087376, 0.003063354642724477, 0.7231303727832639, 1, 0.000591661472816435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755845, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801364602872607],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0005913806723916686],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515409999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801079918059144],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5789233302702, 719.5189490496165, 0, 0, 0.2762091449536289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000465331596990158],
[275.5209764291574, 721.3907312612115, 0, 1, 0.2763745016772654, 0, 0.001386211323025587, 0.00306068694296711, 0.7236254983227346, 1, 0.0005057207883436676],
[274.9436088249113, 721.9680988654576, 1, 2, 0.2757953454693564, 0.00363710945773181, 0.002770205502352411, -0.001914081621584975, 0.8137664650130518, 0.6201746600407525, 0.002919759655890061],
[275.2859203599857, 721.4396226408652, 0, 1, 0.2761902935999612, 0, 0.001386117380605533, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009711194496637904],
[274.6521461891488, 718.8550563428161, 0, 0, 0.2764470609666387, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801226053400898],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312243, 1, 0.0005913684186189582],
[275.6401386961033, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2765456756192191, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7234543243807809, 1, 0.0009717680128293642],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 2, 0, 0.2764775134916476, 0.007257626138354218, 0, -0.01602448428289713, 1, 0.07643981546652412, 0.001943630774809272],
[275.4118061947143, 721.397099741443, 0, 1, 0.2762934846935984, 0, 0.00138619908557771, 0.003060659923279482, 0.7237065153064015, 1, 0.0009729282217659443],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000465903151587225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009718779419553759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004661260818234208],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000505527388897253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.0009726830841312508],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716985947808297],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.0009717722745544475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715082184545109],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009720719178429337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719612214931614],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009722618673149849],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009721606868315268],
[275.6916120295051, 721.6431012057891, 1, 2, 0.2764283729132199, 0.003627241295585656, 0.002771453086239184, -0.001889538596882173, 0.813007310394642, 0.6211698059098054, 0.002925637746941219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719927226780153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971147705914238],
[275.300839096198, 721.424703904653, 1, 0, 0.2762052613474189, 0.003632389945787892, 0, -0.008020139710424796, 1, 0.2762052613474189, 0.0009728190184621044],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2859203599857, 721.4396226408653, 0, 1, 0.2761902935999611, 0, 0.001386117380605532, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718727261455639],
[275.4630295280446, 721.0757191045662, 0, 2, 0.276419787896876, 0, 0.002773633818212053, 0.006124048094950485, 0.5235683233472018, 1, 0.001949937727094995],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713730345785863],
[275.4630295280446, 721.0678404292702, 0, 1, 0.2764219733000782, 0, 0.001386832062021618, 0.003062057504373285, 0.7235780266999218, 1, 0.0009772230605046958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711137413710076],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.000972030388896968],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720007942120193],
[275.6401386961033, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2765456756192191, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7234543243807809, 1, 0.0009716450854171894],
[275.6595593992366, 721.1493465369206, 0, 1, 0.2765420310328686, 0, 0.001386675318784059, 0.003061711422955086, 0.7234579689671314, 1, 0.0009717446466257981],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645799448994],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717671045837159],
[275.5306616293389, 721.1948813715122, 0, 1, 0.2764358388968302, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482684, 0.7235641611031698, 1, 0.0009718610609333482],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716451038054505],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718017793003279],
[274.3994242676507, 720.0877941993084, 0, 0, 0.2759205137806076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001666880238451327],
[274.5085945020937, 719.9786239648653, 1, 0, 0.276030289182861, 0.003642873192417926, 0, -0.008043286207317072, 1, 0.276030289182861, 0.0009242236207849835],
[274.4506476009809, 719.6557331329242, 0, 1, 0.2760777447161802, 0, 0.001389553301613585, 0.003068065868573946, 0.7239222552838198, 1, 0.0009053889009716175],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.000919365438278022],
[275.6237299281393, 721.1018130727118, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407145, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.000971192459225355],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.000971843556999647],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.8172478641622, 719.9082951366889, 0, 1, 0.2755461503357247, 0, 0.001389065811236597, 0.003066989513615011, 0.7244538496642753, 1, 0.0009727370641791637],
[275.1401386961033, 721.5854043047477, 0, 1, 0.276044033012073, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009722823434944004],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715298663864658],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721226340604769],
[275.1767501255426, 721.3204603739193, 1, 0, 0.276144024515251, 0.003634027945833994, 0, -0.008023756334579, 1, 0.276144024515251, 0.000972030387624341],
[274.7593009630493, 721.9662420378017, 0, 1, 0.2756619441454554, 0, 0.001385106313527109, 0.003058247135927829, 0.7243380558545446, 1, 0.0009720007942120193],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711590333562128],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009723438741955709],
[274.0257852283997, 719.6997577724513, 1, 0, 0.2757560044203926, 0.003649291613803798, 0, -0.008057457768466439, 1, 0.2757560044203926, 0.0009721523064690666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009719094743483141],
[275.4824502311778, 721.2430927696731, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009715119008250542],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711137597835499],
[274.5821917949905, 722.1433512058605, 0, 1, 0.2754842531358265, 0, 0.00138476660946911, 0.00305749708594806, 0.7245157468641735, 1, 0.0009721234511034078],
[275.1573294224094, 721.5005814771473, 1, 0, 0.2760800134261311, 0.003634284436831571, 0, -0.008024322654182823, 1, 0.2760800134261311, 0.0009719527807052929],
[274.6234230958178, 719.018756969727, 0, 1, 0.2763806011915703, 0, 0.001390784301948472, 0.00307078385723065, 0.7236193988084296, 1, 0.0009716230605728797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009712694488896375],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711773289649445],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009711137412860118],
[275.2859203599857, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762133952045672, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237866047954329, 1, 0.000972123440712866],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009719527807526481],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773289649445],
[275.2346970266555, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.723842359533136, 1, 0.0009720303861612602],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009720007939831724],
[275.2859203599857, 721.4396226408653, 0, 1, 0.2761902935999611, 0, 0.001386117380605532, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009721226339736421],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009719062452831576],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645798978727],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009712803784242803],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715369029324534],
[275.4436088249113, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.5599882705543, 0, 1, 0.2762855266233069, 0, 0.001385886158123616, 0.003059968994734222, 0.7237144733766931, 1, 0.0009726190445219939],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719062538093974],
[275.2859203599857, 721.4396226408652, 0, 1, 0.2761902935999612, 0, 0.001386117380605533, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009721226340214099],
[276.0209764291574, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2768219938839388, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7231780061160612, 1, 0.0009730178326292473],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009718760039307663],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721226340214099],
[275.4824502311778, 721.2430927696732, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009717671027402408],
[275.4312268978476, 721.3776790383097, 0, 1, 0.2763129675684179, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403916, 0.7236870324315821, 1, 0.0009718610609333482],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009721353155340546],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009715124602880113],
[276.0381671554634, 721.226684001709, 0, 1, 0.2767952433449986, 0, 0.001386526624960025, 0.003061383114249075, 0.7232047566550014, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645991912855],
[275.5209764291574, 721.3907312612115, 0, 1, 0.2763745016772654, 0, 0.001386211323025587, 0.00306068694296711, 0.7236254983227346, 1, 0.0009718890792584197],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009712611562186775],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711137672986586],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124865374033],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009717668619841647],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645799448994],
[275.5381671554634, 721.1197437440933, 0, 1, 0.2764621282208757, 0, 0.001386732243396839, 0.003061837109721725, 0.7235378717791243, 1, 0.0009717668813178756],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124602880113],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711773364765997],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009717796429383708],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312242, 1, 0.0009716973446726014],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971964001835364],
[275.5575878585967, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7234737990681557, 1, 0.0009720367213534625],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009717677955747246],
[275.4755724538567, 721.2499705469943, 0, 1, 0.2763805687416014, 0, 0.001386481859044795, 0.003061284273293183, 0.7236194312583986, 1, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009730178326292473],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124864450083],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.000971113741334892],
[275.3692832952919, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762739304003738, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237260695996262, 1, 0.0009717671045420571],
[275.2235016314096, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2761045773090604, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.7238954226909396, 1, 0.0009718610609333482],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711768222167705],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0009717668526344996],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009718760039307663],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009721226340214099],
[275.4630295280446, 721.4486781623242, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752648, 0.0009717572416211763],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009716451038054505],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645991912855],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 1, 0, 0.2763645068021533, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763645068021533, 0.0009716451038551036],
[275.300839096198, 721.424703904653, 1, 0, 0.2762052613474189, 0.003632389945787892, 0, -0.008020139710424796, 1, 0.2762052613474189, 0.0009731334575653129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.0341809714174, 0, 1, 0.2762594868183509, 0, 0.001390754468235428, 0.003070717985848373, 0.723740513181649, 1, 0.0009718936037597675],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009710344175044315],
[275.3538592936014, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2762887173218659, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.276288717321866, 0.0009719645992457547],
[274.758994130728, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764938428582716, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235061571417284, 1, 0.0009716230543586902],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009712694485347104],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711137597835499],
[275.6913620294335, 721.0341809714174, 0, 1, 0.276597067232176, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711773364765997],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720303861727327],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0009720007871374899],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 0, 1, 0.2763645068021533, 0, 0.001386433637388039, 0.003061177802228673, 0.7236354931978467, 1, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719062452831576],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645992457547],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009717440592881594],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009715124679711687],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711132114437051],
[275.4630295280446, 721.1558941316728, 0, 1, 0.2763975507473886, 0, 0.001386662728735064, 0.0030616836247414, 0.7236024492526114, 1, 0.0009718017792431922],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009716451038054505],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009719645798978727],
[275.4630295280446, 721.4486781623244, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752647999, 0.0009716450854171894],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773548722941],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716450854171894],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773289649445],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009720367213534625],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717677971842718],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711250690897687],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009716450854171894],
[275.5575878585967, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7234737990681557, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009721226340214099],
[275.1598803157186, 721.1848249520784, 0, 1, 0.2761693607251732, 0, 0.001386607101815333, 0.003061560803217677, 0.7238306392748268, 1, 0.0009719062452462722],
[275.2346970266555, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.723842359533136, 1, 0.0009717668619841647],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.000971964001835364],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009715124602880113],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717663027387865],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009720131814196865],
[275.3538592936015, 721.2625134728065, 1, 0, 0.276288717321866, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.276288717321866, 0.0009718754314913775],
[275.4630295280446, 721.3301455741009, 0, 1, 0.2763492331293467, 0, 0.001386327753159558, 0.003060944015020188, 0.7236507668706533, 1, 0.0009717663027387865],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720131619893412],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716456468220816],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009731334575653129],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009720131620441719],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124865374033],
[275.625219959891, 721.10032304096, 1, 0, 0.2765307078717613, 0.003628115018449763, 0, -0.008010700879513081, 1, 0.2765307078717614, 0.0009730051194652213],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713502014888037],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009716451038551036],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009717668619841647],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009720131619893412],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715124865374033],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009775172926649292],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009721353155340546],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 0, 1, 0.2763645068021533, 0, 0.001386433637388039, 0.003061177802228673, 0.7236354931978467, 1, 0.0009716450854171894],
[275.7346970266555, 721.530154130517, 0, 1, 0.2764909409037206, 0, 0.001385943462342269, 0.003060095519652102, 0.7235090590962794, 1, 0.0009717668620073182],
[275.6913620294336, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.723402932767824, 1, 0.0009713502199949188],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009718760230916502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009726190637929692],
[275.3692832952919, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762739304003738, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237260695996262, 1, 0.0009721353155413721],
[275.314872053762, 721.410670947089, 1, 0, 0.2762193404062556, 0.003632204800780706, 0, -0.008019730919285496, 1, 0.2762193404062556, 0.0009718760039613231],
[276.0209764291574, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2768219938839388, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7231780061160612, 1, 0.0009730045086062672],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009721353155413721],
[275.4824502311778, 721.2430927696732, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009719056235700715],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009775173903901764],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713502014888037],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0009716451038054505],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009726190638496067],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711250765922276],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 1, 0, 0.2763645068021533, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763645068021533, 0.0009716450854171894],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009730050996444354],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711250690897687],
[275.5721997624876, 721.1533432383635, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124602880113],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009717440592881594],
[275.3023291279499, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.7237932437257557, 1, 0.0009720131814196865],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009715119379962767],
[275.4312268978476, 721.4804807925212, 0, 1, 0.276284474114526, 0, 0.00138603888341031, 0.00306030620471302, 0.7237155258854739, 1, 0.0009717668813178756],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720131814196865],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715124602880113],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009731328846799884],
[275.7859203599857, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2766919362071071, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7233080637928928, 1, 0.0009711250691829219],
[275.4312268978476, 721.4804807925212, 0, 1, 0.276284474114526, 0, 0.00138603888341031, 0.00306030620471302, 0.7237155258854739, 1, 0.0009717668619841647],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718760230916502],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009720131620441719],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009717663027387865],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009719062538093974],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009717056704923537],
[276.1667580930397, 720.5587849078113, 0, 1, 0.2770740250737248, 0, 0.001387811821804297, 0.003064220766153274, 0.7229259749262753, 1, 0.0009712783239790608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000384720624206374],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005871394767149302],
[274.0739966265608, 719.6515463742902, 0, 1, 0.2758045202289079, 0, 0.001389561385698601, 0.003068083717839094, 0.7241954797710921, 1, 0.0009724255889926756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009711317651304809],
[274.4993257491967, 719.1585851503598, 0, 1, 0.2762513363383712, 0, 0.001390513887546684, 0.003070186795429902, 0.7237486636616288, 1, 0.0009712203679294896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004655733175057488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0005057207883436676],
[274.4436088249112, 719.2819341759397, 1, 0, 0.2761764661861734, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761764661861734, 0.0009718909380330449],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719536790293398],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009724874362819885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6133047828822, 718.9769740153802, 0, 1, 0.2763848546455429, 0, 0.001390865126618934, 0.003070962314158135, 0.723615145354457, 1, 0.0009720855610317391],
[274.3849722814931, 719.2053065167692, 0, 1, 0.276155049155029, 0, 0.001390423556304341, 0.0030699873484557, 0.7238449508449709, 1, 0.0009725038947775024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.9361956148234, 718.654083183439, 0, 1, 0.2767098284690909, 0, 0.001391490041453986, 0.003072342095613054, 0.723290171530909, 1, 0.0009714847941453729],
[274.5456726815878, 719.0446061166745, 0, 1, 0.276316786244777, 0, 0.001390734304232771, 0.003070673464714672, 0.723683213755223, 1, 0.0009718179760433952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5381671554634, 721.1197437440933, 0, 1, 0.2764621282208757, 0, 0.001386732243396839, 0.003061837109721725, 0.7235378717791243, 1, 0.0009716985947808297],
[274.4745618950695, 719.3500748750996, 0, 1, 0.2761800741699104, 0, 0.001390143735195453, 0.003069369517104798, 0.7238199258300897, 1, 0.000972277503174772],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009721253753888726],
[274.6913620294335, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764445983032088, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235554016967912, 1, 0.0008294368531565257],
[274.9196945308227, 718.8058484700283, 0, 1, 0.2766555579326466, 0, 0.001391196248790255, 0.003071693415750984, 0.7233444420673534, 1, 0.001388930371916453],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0006965504798104276],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720385258956313],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009716206000788592],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009713730085741103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009774056498294181],
[274.4436088249112, 718.8252691731617, 1, 0, 0.2763034409958063, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2763034409958063, 0.0009719693930669063],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009722035691961251],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009722216553591714],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003817425827422831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005899905345280843],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711477058785305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5475958260937, 718.1779471747573, 0, 1, 0.2772874238434039, 0, 0.001392412568408573, 0.003074378990102038, 0.722712576156596, 1, 0.0009723618333100912],
[275.8438672610985, 720.8816757397525, 0, 1, 0.2767500734762077, 0, 0.001387190205623999, 0.00306284826796705, 0.7232499265237924, 1, 0.0009722035691961251],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009731399279762796],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711477059224787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009719927226780153],
[275.3796665927383, 721.4486781623243, 0, 1, 0.2762558549239525, 0, 0.001386099982256815, 0.003060441107983985, 0.7237441450760475, 1, 0.0009721606590251948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.000972004836325849],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009714151258828015],
[274.4436088249112, 718.8252691731617, 1, 0, 0.2763034409958063, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2763034409958063, 0.0009726499856131805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 1, 0, 0.276322993307938, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.276322993307938, 0.0009723476063794103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 0, 0, 0.276322993307938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004682063521419797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0005034641793401502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719375445711334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719596520660151],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711768222167705],
[274.6710917662616, 719.7604852615233, 0, 1, 0.2762091410926578, 0, 0.001389351069525097, 0.003067619349993118, 0.7237908589073423, 1, 0.0009725438921734739],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383097, 0, 1, 0.2763129675684179, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403916, 0.7236870324315821, 1, 0.0009717861223914839],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711301365058718],
[274.4436088249112, 719.4426345760345, 1, 0, 0.2761318115097377, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761318115097378, 0.0009721616823495593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718959276629737],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.000971132062421623],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 1, 0, 0.2764010293865392, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2764010293865391, 0.0009722940272725626],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719367712335154],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009718240932366389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5306616293389, 719.1948813715121, 0, 1, 0.2762640686484837, 0, 0.001390443711296985, 0.003070031849695731, 0.7237359313515163, 1, 0.0005287393214375931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004429215987907232],
[274.7713084560948, 718.4975695419781, 0, 1, 0.2766333613612204, 0, 0.001391793156151484, 0.003073011358070691, 0.7233666386387796, 1, 0.000971511566334829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 720.9396226408652, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.00138707870755794, 0.003062602085679195, 0.7234737990681556, 1, 0.0009722618509336161],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720335315627672],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718443586555353],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1009228558186, 719.3962876436434, 0, 1, 0.2758950100302944, 0, 0.001390054434775392, 0.003069172346135882, 0.7241049899697056, 1, 0.000972285093998957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009723363289476497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 720.9396226408652, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.00138707870755794, 0.003062602085679195, 0.7234737990681556, 1, 0.0009720482028879344],
[274.2361870584073, 719.2610234410546, 0, 1, 0.2760311595847765, 0, 0.001390315848363154, 0.003069749534578572, 0.7239688404152235, 1, 0.0009722591074005168],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3023291279499, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.7237932437257557, 1, 0.0009717353332879155],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720395738409457],
[273.2369475366495, 717.4947968648493, 0, 1.5, 0.2757930681848819, 0, 0.002090607495070863, 0.004615959310638566, 0.6163026229775034, 1, 0.0009732603107629589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 1, 0.2761960095130708, 0, 0.001390312968170289, 0.003069743175253304, 0.7238039904869291, 1, 0.000486006394703511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00048550595406203],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718332704084645],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009716967384423023],
[275.8438672610985, 720.8816757397525, 0, 1, 0.2767500734762077, 0, 0.001387190205623999, 0.00306284826796705, 0.7232499265237924, 1, 0.0009716905971476007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1222080247218, 718.7640353762239, 1, 0, 0.2768145850206061, 0.003634748380291214, 0, -0.008025347018697539, 1, 0.2768145850206061, 0.0009718693799976346],
[274.8023291279499, 718.9232138729011, 0, 1, 0.2765374514758896, 0, 0.001390969133703326, 0.003071191956724088, 0.7234625485241104, 1, 0.0005088387615494811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004628606761616671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1925110990122, 719.6937323019334, 1, 0, 0.2758791691901903, 0.003647072620589902, 0, -0.008052558339754889, 1, 0.2758791691901903, 0.0009716023630258024],
[275.337480665095, 721.388062335756, 0, 1, 0.2762420232917217, 0, 0.001386216451603228, 0.003060698266616224, 0.7237579767082783, 1, 0.000972188718473853],
[275.1222080247218, 718.7640353762239, 1, 0, 0.2768145850206061, 0.003634748380291214, 0, -0.008025347018697539, 1, 0.2768145850206061, 0.0009719245041262648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.8023291279499, 720.9232138729012, 0, 1, 0.2767083988813903, 0, 0.001387110278538347, 0.003062671792863016, 0.7232916011186097, 1, 0.0009720602424740742],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.652520623167, 719.3944231778735, 0, 1, 0.2762973341811702, 0, 0.001390058037401196, 0.00306918030055782, 0.7237026658188298, 1, 0.0009708385639247826],
[274.8050258548319, 719.2419179462084, 0, 1, 0.2764507527220308, 0, 0.001390352779848392, 0.003069831077495425, 0.7235492472779692, 1, 0.0009712694783376347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4047674186446, 719.6421763823957, 1, 0, 0.2760480972552208, 0.003644251553670545, 0, -0.008046329561687727, 1, 0.2760480972552208, 0.0009705749027192479],
[274.5848885218726, 719.4620552791678, 0, 1, 0.2762292970510164, 0, 0.001389927366790702, 0.003068891786227628, 0.7237707029489836, 1, 0.0009708674312492003],
[274.4241881217779, 719.5551235779682, 0, 1, 0.2760864183908426, 0, 0.001389747591577873, 0.003068494851332179, 0.7239135816091573, 1, 0.0009721793146892438],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009713221691347126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.000971431258297607],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009728708397778808],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009708448542879951],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009714229121091303],
[274.6012972898367, 719.4456465112037, 0, 1, 0.2762458040862892, 0, 0.001389959067581108, 0.00306896178002559, 0.7237541959137108, 1, 0.0009706041865968485],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009716082616639588],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009706046660049392],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009716082616639588],
[274.4241881217779, 719.5199539250508, 0, 1, 0.2760961874141702, 0, 0.001389815521508338, 0.003068644837303119, 0.7239038125858297, 1, 0.0009706046660049392],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009719121992734086],
[274.4436088249112, 719.2043100421425, 1, 0, 0.2761980411913193, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761980411913193, 0.0009717010259037589],
[274.6237299281393, 718.8634885388198, 0, 1, 0.2764240191755145, 0, 0.001391084699589661, 0.003071447120560571, 0.7235759808244855, 1, 0.0009719017923170955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009716958311979454],
[274.2252683560251, 719.6609750449205, 1, 0, 0.2759121279490326, 0.00364663696381803, 0, -0.008051596430866155, 1, 0.2759121279490326, 0.0009720127510410673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009722110825333952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3800035645173, 720.2679153025364, 1, 0, 0.2758564094489313, 0.003644580461436074, 0, -0.008047055773980669, 1, 0.2758564094489313, 0.0009717050043341428],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.0009715304627723225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.4486781623242, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752648, 0.0009718133176176436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6111870023271, 721.1143559985239, 1, 0, 0.2765166288129247, 0.003628299746742706, 0, -0.00801110875056767, 1, 0.2765166288129246, 0.0009713530229529878],
[275.1237299281393, 721.6018130727117, 0, 1, 0.27602757033779, 0, 0.0013858058307002, 0.003059791635703945, 0.7239724296622101, 1, 0.0009714613797940681],
[275.6913620294336, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.723402932767824, 1, 0.0009711773289649445],
[274.683082525458, 719.4147898544287, 1, 2, 0.276313922559619, 0.003640559115639453, 0.002780037369546842, -0.001899990014982944, 0.8131446440448828, 0.6209900140008736, 0.002800148220406365],
[274.8172478641621, 719.4667892052423, 1, 0, 0.2763971235766495, 0.003638781800530527, 0, -0.008034252613722559, 1, 0.2763971235766496, 0.001205821965515799],
[275.6401386961033, 721.2715689942655, 0, 1, 0.2764940330921608, 0, 0.001386440340902929, 0.003061192603262364, 0.7235059669078392, 1, 0.0008611164660317071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3816757397525, 0, 1, 0.2763349477329499, 0, 0.001386228724169537, 0.003060725363843635, 0.72366505226705, 1, 0.0009714673091596636],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 1, 0.2761960095130708, 0, 0.001390312968170289, 0.003069743175253304, 0.7238039904869291, 1, 0.0003875885006476178],
[273.6421636803396, 717.1731849793196, 0, 1.75, 0.2761787693847429, 0, 0.002440135850938798, 0.005387700860597039, 0.5680084615823741, 1, 0.0009726548795503182],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002970405024005357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002869077989919281],
[275.4630295280446, 721.4486781623243, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752647999, 0.0009718246620835875],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 1, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0.001390312968170289, -0.004974878338053564, 0.9237157643290557, 0.4761077833551974, 0.001944184194189544],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971541171243436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009722618672993415],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721723624242589],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801371587168565],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005913561648462581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.5839142729959, 0, 0, 0.2757739989733741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.2346970266555, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.723842359533136, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6913620294335, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764445983032088, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235554016967912, 1, 0.0009712318250215003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711079612695685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4881153796689, 719.2374276211821, 0, 0, 0.2762212537586284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003794922525704073],
[275.4755724538567, 721.2499705469943, 0, 1, 0.2763805687416014, 0, 0.001386481859044795, 0.003061284273293183, 0.7236194312583986, 1, 0.000591661472816435],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801371566474895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005913561648462581],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009712783332247089],
[276.0524581428724, 720.7407169592731, 1, 1, 0.2769405580195552, 0.003622499892692297, 0.001387461505184405, -0.004934855671749119, 0.9233039273238174, 0.4771850433629278, 0.001943303677500844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.9630295280446, 719.7625134728065, 0, 1, 0.2756928524758772, 0, 0.001389347154487202, 0.003067610705780531, 0.7243071475241228, 1, 0.000677365493311809],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00029431566469142],
[275.2664996568524, 721.3756804086923, 0, 1, 0.2761939090705045, 0, 0.001386240245073765, 0.003060750801437858, 0.7238060909294955, 1, 0.0009723013673778581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6813699969306, 719.0441730039203, 0, 0, 0.2764157285999193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000379492978464942],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.000591661472816435],
[274.1834736933253, 719.4068051049371, 0, 1, 0.2759522506852095, 0, 0.001390034112693907, 0.003069127475971846, 0.7240477493147905, 1, 0.0009719434927362337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2346970266555, 719.4232138729011, 0, 1, 0.2759850186050362, 0, 0.001390002408480341, 0.003069057474615712, 0.7240149813949639, 1, 0.0005297827637719833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000441876554278918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.444876252433, 716.287108390281, 1.5, 0.25, 0.2770122298528654, 0.005465578445051048, 0.0003490220570377533, -0.01129710677558661, 0.9823177636278456, 0.2430911671401171, 0.0009724915850237401],
[275.1416287278552, 718.5839142729959, 0, 0, 0.2768788934387083, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004663065750612707],
[275.8023291279499, 720.9232138729012, 0, 1, 0.2767083988813903, 0, 0.001387110278538347, 0.003062671792863016, 0.7232916011186097, 1, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009711998201557291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3438672610985, 721.3816757397525, 0, 1, 0.2762484308690616, 0, 0.001386228724169537, 0.003060725363843635, 0.7237515691309384, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080506439135],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801079985034864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005913806723916686],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003793648296017734],
[273.8185860138016, 717.0567960540993, 0.25, 1.5, 0.2763400836968598, 0.0009130132604928394, 0.002091884503785988, 0.002602890166783136, 0.6626447015950823, 0.4322130508669374, 0.0009725166660454858],
[275.4436088249113, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0005919688534927615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312243, 1, 0.000971621352073655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.7083194944375, 719.0172235064134, 0, 2, 0.2764428482585581, 0, 0.002781574536207422, 0.006141580812713288, 0.5235349518361879, 1, 0.001942945844523622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6237299281393, 721.1018130727117, 0, 1, 0.276529212944936, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009705853355988183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.0341809714174, 0, 1, 0.2762594868183509, 0, 0.001390754468235428, 0.003070717985848373, 0.723740513181649, 1, 0.0009709129994035236],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009720770988531882],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074871006585035],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005640301873733476],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009713669926190838],
[275.3796665927383, 721.4486781623242, 0, 1, 0.2762558549239525, 0, 0.001386099982256815, 0.003060441107983986, 0.7237441450760475, 1, 0.0009719777931257319],
[275.1244201476451, 723.2815234782843, 11.08333333333333, 32.91666666666666, 0.2755636841948984, 0.04028480397118322, 0.04551017217800525, 0.01153735796062347, 0.4374447772349834, 0.6910455331001923, 0.05052005108060629],
[275.2963036574321, 721.8404463602653, 0, 0, 0.2760868092090137, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003531131755634999],
[275.3796665927383, 721.6542816707475, 0, 1, 0.2761988867804969, 0, 0.001385705074297954, 0.003059569170485509, 0.7238011132195031, 1, 0.0006193489172141957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009720924959577413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4824502311778, 721.2430927696731, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009721380864520773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003827604292444448],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005889173430479834],
[275.6813699969307, 721.1533432383634, 2, 0, 0.2765567514218965, 0.007254752107559053, 0, -0.01601813856317725, 1, 0.07648363675703251, 0.001943326972366456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.8584791649895, 719.0532285253794, 0, 1, 0.2765421486016095, 0, 0.001390717627470752, 0.003070636643238094, 0.7234578513983905, 1, 0.000972216779608097],
[274.9650985061233, 718.7604444947277, 0, 1, 0.2767012485920248, 0, 0.001391284130421197, 0.003071887454102771, 0.7232987514079752, 1, 0.0009711346891952883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6813699969306, 719.0441730039204, 0, 0, 0.2764157285999193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004653767103277664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.7074639650763, 719.0180790357747, 1, 0, 0.2764419873273208, 0.00364023600074853, 0, -0.008037463416827231, 1, 0.2764419873273208, 0.0009718839456175056],
[275.5306616293389, 721.1948813715121, 0, 1, 0.2764358388968302, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482685, 0.7235641611031698, 1, 0.0009718783048551833],
[274.3538592936014, 719.3716837072495, 1, 0, 0.2760861499696466, 0.003644927768010159, 0, -0.008047822609944893, 1, 0.2760861499696465, 0.0009719843471901424],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 1, 0.2759762904262224, 0, 0.001389891050639467, 0.003068811601938222, 0.7240237095737776, 1, 0.0009728322451622516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009717106502328375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004658806237952161],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005057207883436676],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.000972120535599463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009717856675877535],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1401386961033, 721.5854043047477, 1, 1, 0.276044033012073, 0.003634511506532734, 0.001385837343763219, -0.004964962797991163, 0.9237996918384295, 0.4758877578625756, 0.001944643546882456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.0455803655512, 721.9082951366888, 0, 1, 0.2758859633571215, 0, 0.001385217494710538, 0.003058492618554305, 0.7241140366428785, 1, 0.0009812165769131217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3115293687477, 719.4269061337833, 1, 1.75, 0.2760399714538857, 0.003645490228942342, 0.002432491730681217, -0.002678241480067616, 0.8426789882839647, 0.5886465743608069, 0.001946374800153743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6473373899065, 718.0105735096503, 1, 1, 0.2774066752413448, 0.003627823905244142, 0.001392737150251116, -0.004934962464795569, 0.9230455365315431, 0.4778588870142326, 0.001943132182102707],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.9630295280446, 720.7625134728065, 0, 1, 0.2768696272167361, 0, 0.001387419547087376, 0.003063354642724477, 0.7231303727832639, 1, 0.0009710031833737852],
[275.4630295280446, 721.1948813715121, 0, 1, 0.2763867386347428, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482685, 0.7236132613652572, 1, 0.0009752035876670677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.8653090959552, 718.8666798884279, 1, 0.5, 0.2765990348935772, 0.003638145545864069, 0.000695539261991671, -0.006497131051911751, 0.9681576772541838, 0.3847259114439459, 0.0009731470447506559],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6132400185019, 719.4904768911837, 1, 0.75, 0.276242041295426, 0.003641485020651683, 0.001042404345976397, -0.005738643273620093, 0.9472565058499167, 0.4320784261073082, 0.0009729062586625667],
[275.7859203599857, 720.7112901394762, 0, 1, 0.2767553360453031, 0, 0.001387518155579988, 0.003063572365463277, 0.723244663954697, 1, 0.0009733999599593036],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 1, 0.2759762904262224, 0, 0.001389891050639467, 0.003068811601938222, 0.7240237095737776, 1, 0.0009727021152761096],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000479177557212953],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0004923689153635719],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.8172478641621, 719.9082951366888, 0, 1, 0.2755461503357247, 0, 0.001389065811236597, 0.003066989513615012, 0.7244538496642753, 1, 0.0009725423019491965],
[273.9264180986053, 719.7991249022458, 1, 0, 0.275656009879149, 0.003650615398621502, 0, -0.008060380620732568, 1, 0.275656009879149, 0.0009723316529610617],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720845857540209],
[274.4630295280446, 719.0569099643832, 0, 1, 0.2762531667640843, 0, 0.001390710507252524, 0.003070620922143772, 0.7237468332359157, 1, 0.0009715234443431463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0009712490600961673],
[273.1378616381988, 717.7290926116755, 0.25, 1.5, 0.2756554353404338, 0.0009152887062254026, 0.002089925036397499, 0.002593539685309711, 0.6634172149775366, 0.4312726553540985, 0.0009739968550470777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3684711974924, 719.5854043047476, 0, 1, 0.276037427852329, 0, 0.00138968910989264, 0.003068365726625561, 0.723962572147671, 1, 0.0009723531319072946],
[274.1401386961033, 719.5854043047477, 0, 1, 0.2758710799243977, 0, 0.001389689109892639, 0.00306836572662556, 0.7241289200756023, 1, 0.0009724795925431703],
[274.5721997624876, 719.1533432383634, 1, 0, 0.2763058690564951, 0.003642029312745526, 0, -0.008041422962188537, 1, 0.276305869056495, 0.0009723440373246018],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717358677755367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
],
"NAMES": [
["epi_isl_454396_Pennsylvania_20200101_null_1"],
["epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1"],
["epi_isl_448989_England_20200420_null_1"],
["Node1183"],
["epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1"],
["epi_isl_452739_Basque_Country_20200308_null_1"],
["epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1"],
["epi_isl_443803_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1"],
["epi_isl_454619_California_20200426_null_1"],
["epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1"],
["epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1"],
["epi_isl_440364_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_439419_England_20200330_null_2"],
["epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2"],
["epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_417312_England_20200308_null_1"],
["epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_2"],
["epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1"],
["epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1"],
["epi_isl_454681_California_20200512_null_2"],
["epi_isl_454676_California_20200512_null_1"],
["epi_isl_454632_California_20200429_null_1"],
["epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1"],
["epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1"],
["epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1"],
["epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1"],
["epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_2"],
["epi_isl_451808_Luzern_20200331_null_2"],
["epi_isl_451794_Vaud_20200325_null_1"],
["epi_isl_451778_Basel_Stadt_20200326_null_1"],
["epi_isl_451775_Vaud_20200326_null_1"],
["epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1"],
["epi_isl_451725_Graubunden_20200315_null_1"],
["epi_isl_451718_Graubunden_20200315_null_1"],
["epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1"],
["epi_isl_449150_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_449064_England_20200504_null_1"],
["epi_isl_449016_England_20200419_null_1"],
["epi_isl_448318_England_20200422_null_1"],
["epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2"],
["epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1"],
["epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1"],
["epi_isl_443979_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_443923_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_440382_England_20200316_null_1"],
["epi_isl_440325_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_440019_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_439651_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_439445_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_438461_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1"],
["epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1"],
["epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1"],
["epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2"],
["epi_isl_425023_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_424138_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_423933_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_423825_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_423780_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423740_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_423579_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_423130_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_423068_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_421956_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1"],
["epi_isl_455165_Netherlands_20200330_null_2"],
["Node1108"],
["epi_isl_449014_England_20200420_null_3"],
["epi_isl_455113_Flevoland_20200401_null_50"],
["Node1105"],
["epi_isl_451857_Basel_Land_20200407_null_1"],
["epi_isl_454268_Portugal_20200409_null_1"],
["Node1102"],
["epi_isl_442776_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1"],
["epi_isl_442854_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_443907_England_20200326_null_1"],
["Node908"],
["epi_isl_451449_New_York_20200326_null_18"],
["epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_2"],
["Node905"],
["epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_2"],
["epi_isl_451908_Bern_20200407_null_8"],
["Node902"],
["epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1"],
["epi_isl_454379_Pennsylvania_20200402_null_11"],
["Node899"],
["epi_isl_451809_Basel_Land_20200331_null_2"],
["epi_isl_453720_England_20200422_null_1"],
["Node896"],
["epi_isl_423227_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_452931_England_20200101_null_17"],
["Node893"],
["epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_454455_Stockholm_20200305_null_2"],
["Node875"],
["epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1"],
["epi_isl_453456_England_20200501_null_3"],
["Node872"],
["epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1"],
["Node116"],
["epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2"],
["epi_isl_454249_Portugal_20200323_null_13"],
["Node113"],
["epi_isl_438473_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_443625_England_20200414_null_6"],
["Node107"],
["epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1"],
["epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1"],
["epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7"],
["epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1"],
["Node866"],
["epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1"],
["epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2"],
["epi_isl_443989_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_423354_England_20200329_null_2"],
["epi_isl_442231_England_20200406_null_1"],
["Node133"],
["epi_isl_441130_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1"],
["epi_isl_443599_England_20200416_null_3"],
["epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_19"],
["Node141"],
["epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15"],
["epi_isl_449628_England_20200404_null_1"],
["Node145"],
["epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1"],
["epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3"],
["Node148"],
["epi_isl_444241_England_20200418_null_2"],
["epi_isl_423412_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2"],
["epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7"],
["epi_isl_452961_England_20200511_null_1"],
["epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1"],
["epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_27010"],
["epi_isl_448589_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1"],
["epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1"],
["epi_isl_449029_England_20200420_null_1"],
["epi_isl_449072_England_20200504_null_1"],
["epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2"],
["epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1"],
["epi_isl_438515_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6"],
["epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1"],
["epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1"],
["epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1"],
["epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_3"],
["epi_isl_432760_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_3"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1"],
["epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1"],
["epi_isl_453337_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1"],
["epi_isl_453635_England_20200506_null_1"],
["Node275"],
["epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1"],
["epi_isl_442662_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6"],
["epi_isl_448006_England_20200501_null_3"],
["Node283"],
["epi_isl_444438_England_20200417_null_5"],
["epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1"],
["epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_454331_Portugal_20200314_null_3"],
["epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1"],
["epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2"],
["epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1"],
["epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7"],
["Node296"],
["epi_isl_442518_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5"],
["epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1"],
["epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1"],
["epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2"],
["Node308"],
["epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1"],
["epi_isl_453601_England_20200422_null_2"],
["epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1"],
["epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4"],
["epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4"],
["epi_isl_438396_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_443488_England_20200415_null_2"],
["epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2"],
["epi_isl_451376_Sichuan_20200128_null_1"],
["epi_isl_452097_Denmark_20200509_null_1"],
["epi_isl_453520_England_20200407_null_5"],
["epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1"],
["epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1"],
["epi_isl_449114_England_20200408_null_2"],
["epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2"],
["epi_isl_454541_Maharashtra_20200330_null_2"],
["epi_isl_449142_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_2"],
["epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8"],
["epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_450811_Uppsala_20200406_null_2"],
["epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2"],
["epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1"],
["epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2"],
["epi_isl_454097_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_452014_Denmark_20200311_null_1"],
["epi_isl_442207_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_451624_New_South_Wales_20200419_null_5"],
["epi_isl_448739_England_20200101_null_1"],
["epi_isl_451946_Bavaria_20200402_null_17"],
["epi_isl_453402_England_20200410_null_2"],
["epi_isl_438282_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1"],
["epi_isl_440767_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1"],
["epi_isl_449996_Washington_20200416_null_2"],
["epi_isl_452884_England_20200506_null_2"],
["epi_isl_449604_England_20200428_null_2"],
["epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2"],
["epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_3"],
["epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1"],
["epi_isl_440669_England_20200401_null_4"],
["epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2"],
["epi_isl_450810_Halland_20200401_null_1"],
["epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2"],
["epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2"],
["epi_isl_454812_North_Carolina_20200401_null_21"],
["epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1"],
["epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1"],
["epi_isl_453191_Scotland_20200421_null_2"],
["epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_439379_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1"],
["epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1"],
["Node406"],
["epi_isl_454211_Portugal_20200401_null_21"],
["epi_isl_423752_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1"],
["Node411"],
["epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1"],
["epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1"],
["epi_isl_449109_England_20200408_null_2"],
["epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1"],
["epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2"],
["epi_isl_452971_England_20200511_null_4"],
["epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_1"],
["epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1"],
["epi_isl_454595_Pula_20200309_null_1"],
["epi_isl_449655_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_425585_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_442025_England_20200411_null_3"],
["epi_isl_450721_Wisconsin_20200401_null_26"],
["epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1"],
["epi_isl_454442_Halland_20200309_null_16"],
["epi_isl_452916_England_20200507_null_4"],
["epi_isl_425485_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_449975_Washington_20200415_null_38"],
["epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1"],
["epi_isl_451337_Sichuan_20200130_null_6"],
["epi_isl_455269_Netherlands_20200413_null_38"],
["epi_isl_455406_Hubei_20200302_null_2"],
["epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2"],
["epi_isl_454537_Maharashtra_20200326_null_6"],
["epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_7"],
["epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1"],
["epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2"],
["epi_isl_452424_Andalusia_20200313_null_3"],
["epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1"],
["epi_isl_441534_England_20200426_null_1"],
["epi_isl_455422_Osun_State_20200329_null_6"],
["epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1"],
["epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1"],
["epi_isl_454900_Stockholm_20200310_null_10"],
["epi_isl_423913_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3"],
["epi_isl_454786_Utrecht_20200311_null_4"],
["epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1"],
["epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1"],
["epi_isl_448403_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3"],
["epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1"],
["epi_isl_447940_England_20200429_null_5"],
["epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1"],
["epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1"],
["epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2"],
["epi_isl_433733_England_20200405_null_2"],
["epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1"],
["epi_isl_441783_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_440591_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4"],
["epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1"],
["epi_isl_454525_Maharashtra_20200312_null_1"],
["epi_isl_433000_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1"],
["epi_isl_438260_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_452425_Andalusia_20200313_null_1"],
["epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_440082_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6"],
["epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2"],
["epi_isl_455189_Netherlands_20200101_null_1"],
["epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7"],
["epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1"],
["epi_isl_454618_California_20200426_null_3"],
["epi_isl_440217_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1"],
["epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3"],
["epi_isl_417240_England_20200303_null_4"],
["epi_isl_445169_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_420725_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423548_England_20200331_null_3"],
["epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_445109_California_20200312_null_4"],
["Node587"],
["epi_isl_450185_Louisiana_20200404_null_1"],
["epi_isl_454118_Portugal_20200423_null_10"],
["Node584"],
["epi_isl_442533_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_452935_England_20200513_null_14"],
["Node552"],
["epi_isl_441072_England_20200403_null_2"],
["Node551"],
["epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1"],
["epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6"],
["Node557"],
["epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2"],
["epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1"],
["epi_isl_421775_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_443510_England_20200416_null_2"],
["epi_isl_423453_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_421895_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_440096_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_444128_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_454298_Portugal_20200411_null_174"],
["epi_isl_423446_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_440247_England_20200321_null_1"],
["Node563"],
["epi_isl_439944_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_449719_England_20200417_null_5"],
["Node580"],
["epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4"],
["epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1"],
["Node593"],
["epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3"],
["epi_isl_432532_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_443690_England_20200329_null_3"],
["epi_isl_449123_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_453983_Portugal_20200404_null_3"],
["epi_isl_414010_England_20200226_null_1"],
["epi_isl_449697_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1"],
["epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2"],
["Node609"],
["epi_isl_451447_New_York_20200326_null_9"],
["epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2"],
["epi_isl_448574_England_20200101_null_6"],
["Node615"],
["epi_isl_439434_England_20200401_null_9"],
["epi_isl_429008_California_20200328_null_1"],
["epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1"],
["Node620"],
["epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4"],
["epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3"],
["epi_isl_440640_England_20200402_null_1"],
["epi_isl_455088_New_South_Wales_20200321_null_6"],
["epi_isl_432908_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_440731_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_444199_England_20200415_null_2"],
["epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1"],
["epi_isl_448511_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_448784_England_20200407_null_3"],
["Node643"],
["epi_isl_450826_Uppsala_20200427_null_2"],
["Node642"],
["epi_isl_453563_England_20200424_null_3"],
["Node641"],
["epi_isl_455286_Netherlands_20200326_null_34"],
["epi_isl_417236_England_20200301_null_1"],
["epi_isl_454799_North_Carolina_20200401_null_2"],
["epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3"],
["epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1"],
["epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1"],
["Node662"],
["epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_442906_England_20200408_null_1"],
["epi_isl_455446_Mazowieckie_20200313_null_30"],
["Node653"],
["epi_isl_443501_England_20200414_null_1"],
["epi_isl_452539_Navarra_20200310_null_1"],
["epi_isl_452541_Navarra_20200310_null_10"],
["Node656"],
["epi_isl_441079_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_451670_Ticino_20200312_null_2"],
["epi_isl_444240_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_449670_England_20200415_null_5"],
["epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2"],
["epi_isl_441570_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_454831_Rajasthan_20200429_null_5"],
["Node676"],
["epi_isl_442963_England_20200407_null_1"],
["Node675"],
["epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1"],
["epi_isl_454546_Maharashtra_20200403_null_61"],
["Node681"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_443028_England_20200408_null_7"],
["epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1"],
["epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1"],
["epi_isl_453651_England_20200513_null_1"],
["Node696"],
["epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_455246_Netherlands_20200411_null_97"],
["Node690"],
["epi_isl_454143_Portugal_20200325_null_1"],
["epi_isl_454154_Portugal_20200331_null_3"],
["Node693"],
["epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1"],
["epi_isl_423324_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6"],
["Node704"],
["epi_isl_452399_Andalusia_20200316_null_1"],
["Node703"],
["epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3"],
["epi_isl_453467_Northern_Ireland_20200324_null_2"],
["epi_isl_440740_England_20200405_null_4"],
["epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2"],
["epi_isl_453468_Northern_Ireland_20200324_null_1"],
["Node780"],
["epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1"],
["Node779"],
["epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5"],
["epi_isl_454052_Portugal_20200318_null_3"],
["epi_isl_455146_Netherlands_20200404_null_2"],
["Node770"],
["epi_isl_420696_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_444283_England_20200416_null_1"],
["Node767"],
["epi_isl_448775_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1"],
["epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1"],
["epi_isl_451181_Ghent_20200414_null_1"],
["epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1"],
["epi_isl_455438_Quintana_Roo_20200314_null_1533"],
["epi_isl_455091_New_South_Wales_20200513_null_1"],
["epi_isl_453101_Scotland_20200428_null_1"],
["epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1"],
["epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2"],
["epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_1"],
["epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1"],
["epi_isl_420697_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_454087_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1"],
["epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5"],
["epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1"],
["epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1"],
["epi_isl_437571_California_20200425_null_1"],
["epi_isl_440819_England_20200401_null_2"],
["epi_isl_448394_England_20200501_null_1"],
["epi_isl_449139_England_20200408_null_2"],
["Node719"],
["epi_isl_443538_England_20200416_null_1"],
["epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1"],
["epi_isl_449700_England_20200416_null_7"],
["Node762"],
["epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1"],
["Node775"],
["epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_2"],
["epi_isl_421964_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_449622_England_20200430_null_8"],
["epi_isl_453183_Scotland_20200516_null_2"],
["Node786"],
["epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1"],
["epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1"],
["epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1"],
["epi_isl_439681_England_20200407_null_1"],
["epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3"],
["epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1"],
["epi_isl_423927_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_455314_Andalusia_20200228_null_1"],
["Node803"],
["epi_isl_441555_England_20200405_null_5"],
["epi_isl_443011_England_20200410_null_1"],
["Node806"],
["epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3"],
["epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2"],
["Node812"],
["epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2"],
["Node811"],
["epi_isl_440779_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10"],
["epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1"],
["Node823"],
["epi_isl_439399_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_439920_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2"],
["epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2"],
["epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1"],
["epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2"],
["epi_isl_453464_England_20200419_null_10"],
["Node837"],
["epi_isl_420726_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_445165_California_20200317_null_5"],
["Node97"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1"],
["Node832"],
["epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1"],
["Node831"],
["epi_isl_423060_England_20200324_null_1"],
["epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2"],
["epi_isl_442935_England_20200408_null_2"],
["Node94"],
["epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2"],
["epi_isl_448368_England_20200502_null_1"],
["Node852"],
["epi_isl_453990_Portugal_20200405_null_2"],
["epi_isl_455317_Andalusia_20200305_null_1"],
["epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1"],
["epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3"],
["epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_5"],
["Node847"],
["epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3"],
["epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1"],
["epi_isl_443615_England_20200414_null_2"],
["Node91"],
["epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_432558_England_20200402_null_2"],
["Node858"],
["epi_isl_441224_England_20200402_null_1"],
["Node857"],
["epi_isl_448524_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1"],
["epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1"],
["Node87"],
["epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1"],
["epi_isl_442349_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1"],
["epi_isl_440508_England_20200312_null_1"],
["epi_isl_452338_Beijing_20200319_null_1"],
["epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1"],
["epi_isl_454781_Utrecht_20200404_null_8"],
["Node887"],
["epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5"],
["epi_isl_442636_England_20200405_null_1"],
["Node881"],
["epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_455391_Hubei_20200204_null_1"],
["Node884"],
["epi_isl_423328_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_450832_Vastmanland_20200504_null_1"],
["epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2"],
["epi_isl_454627_California_20200430_null_2"],
["epi_isl_452809_Virginia_20200401_null_7"],
["epi_isl_449175_England_20200418_null_1"],
["epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1"],
["epi_isl_451891_Ticino_20200406_null_1"],
["epi_isl_443382_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1"],
["epi_isl_441548_England_20200406_null_1"],
["epi_isl_440277_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_441325_England_20200401_null_3"],
["epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3"],
["Node1041"],
["epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1"],
["Node1038"],
["epi_isl_443505_England_20200416_null_2"],
["epi_isl_449715_England_20200416_null_10"],
["Node1032"],
["epi_isl_448749_England_20200101_null_6"],
["epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1"],
["epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1"],
["epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1"],
["Node1025"],
["epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1"],
["Node1024"],
["epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1"],
["epi_isl_443325_England_20200415_null_1"],
["epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1"],
["epi_isl_452741_Basque_Country_20200308_null_1"],
["epi_isl_452930_England_20200511_null_6"],
["Node1092"],
["epi_isl_448489_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_439476_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_439408_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1"],
["epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1"],
["epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1"],
["epi_isl_442209_England_20200405_null_1"],
["epi_isl_455475_Arges_20200514_null_418"],
["Node1057"],
["epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5"],
["Node1056"],
["epi_isl_450806_Virgin_Islands_20200408_null_4"],
["epi_isl_452943_England_20200511_null_2"],
["Node1071"],
["epi_isl_433719_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_444435_England_20200418_null_2"],
["Node1075"],
["epi_isl_443807_England_20200329_null_1"],
["epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1"],
["epi_isl_453664_England_20200517_null_4"],
["Node1083"],
["epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_440821_England_20200331_null_2"],
["epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2"],
["Node1086"],
["epi_isl_421953_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421948_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_421947_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1"],
["epi_isl_453609_England_20200422_null_1"],
["epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1"],
["epi_isl_418715_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1"],
["epi_isl_423648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1"],
["epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2"],
["epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1"],
["epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1"],
["epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_442282_England_20200404_null_1"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_423052_England_20200319_null_5"],
["epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1"],
["epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1"],
["Node954"],
["epi_isl_455224_Netherlands_20200101_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_421847_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_442233_England_20200403_null_1"],
["epi_isl_424007_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1"],
["epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3"],
["epi_isl_432594_England_20200412_null_1"],
["epi_isl_448608_England_20200101_null_2"],
["epi_isl_438534_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_449643_England_20200404_null_5"],
["Node999"],
["epi_isl_441060_England_20200402_null_1"],
["Node998"],
["epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1"],
["epi_isl_448423_England_20200429_null_1"],
["epi_isl_425404_England_20200319_null_1"],
["epi_isl_454889_Stockholm_20200306_null_18"],
["Node992"],
["epi_isl_440515_England_20200311_null_2"],
["epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1"],
["Node989"],
["epi_isl_424062_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_453748_England_20200421_null_165"],
["epi_isl_423639_England_20200321_null_1"],
["epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_417288_England_20200305_null_1"],
["epi_isl_453654_England_20200513_null_1"],
["Node977"],
["epi_isl_448642_England_20200101_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[275.5885783909941, 720.9086321084679, 0, 2, 0.2765573003991293, 0, 0.002774276671026294, 0.006125467482587937, 0.5233693396057957, 1, 0.001944639151725094],
[274.4630295280446, 719.0569099643832, 0, 0, 0.2762531667640843, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003802918257178761],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0005907928219498236],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009711998201557291],
[275.4630295280446, 720.9650386750587, 0, 2, 0.2764504918300801, 0, 0.00277405961830752, 0.006124988240778804, 0.523523890772933, 1, 0.001944938665409077],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.9196945308227, 718.8058484700283, 0, 0, 0.2766555579326466, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798752780502931],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.000591295153869873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003804497677488717],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005910718363402804],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.0355883330483, 719.1466196705808, 0, 0, 0.2766450517006681, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798926713218511],
[275.7493089305464, 721.2045665716936, 1, 0, 0.2765918421166987, 0.003626482343249941, 0, -0.00800709601235957, 1, 0.2765918421166986, 0.000591295153869873],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009709847801858067],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003798752782181605],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.000591295153869873],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080511060171],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 0, 0, 0.276322993307938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.6227556792626, 0, 0, 0.2760676342632609, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000379475671438998],
[275.4436088249112, 721.4426345760346, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.276303952079042, 0.000591661472816435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080506439135],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 718.2625134728065, 0, 0, 0.2772023235874582, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003794756676457557],
[275.9630295280446, 720.7625134728065, 0, 1, 0.2768696272167361, 0, 0.001387419547087376, 0.003063354642724477, 0.7231303727832639, 1, 0.000591661472816435],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755845, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801364602872607],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0005913806723916686],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515409999],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801079918059144],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5789233302702, 719.5189490496165, 0, 0, 0.2762091449536289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000465331596990158],
[275.5209764291574, 721.3907312612115, 0, 1, 0.2763745016772654, 0, 0.001386211323025587, 0.00306068694296711, 0.7236254983227346, 1, 0.0005057207883436676],
[274.9436088249113, 721.9680988654576, 1, 2, 0.2757953454693564, 0.00363710945773181, 0.002770205502352411, -0.001914081621584975, 0.8137664650130518, 0.6201746600407525, 0.002919759655890061],
[275.2859203599857, 721.4396226408652, 0, 1, 0.2761902935999612, 0, 0.001386117380605533, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009711194496637904],
[274.6521461891488, 718.8550563428161, 0, 0, 0.2764470609666387, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801226053400898],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312243, 1, 0.0005913684186189582],
[275.6401386961033, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2765456756192191, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7234543243807809, 1, 0.0009717680128293642],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 2, 0, 0.2764775134916476, 0.007257626138354218, 0, -0.01602448428289713, 1, 0.07643981546652412, 0.001943630774809272],
[275.4118061947143, 721.397099741443, 0, 1, 0.2762934846935984, 0, 0.00138619908557771, 0.003060659923279482, 0.7237065153064015, 1, 0.0009729282217659443],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000465903151587225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009718779419553759],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004661260818234208],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000505527388897253],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.0009726830841312508],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716985947808297],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.0009717722745544475],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715082184545109],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009720719178429337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719612214931614],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009722618673149849],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009721606868315268],
[275.6916120295051, 721.6431012057891, 1, 2, 0.2764283729132199, 0.003627241295585656, 0.002771453086239184, -0.001889538596882173, 0.813007310394642, 0.6211698059098054, 0.002925637746941219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719927226780153],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971147705914238],
[275.300839096198, 721.424703904653, 1, 0, 0.2762052613474189, 0.003632389945787892, 0, -0.008020139710424796, 1, 0.2762052613474189, 0.0009728190184621044],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2859203599857, 721.4396226408653, 0, 1, 0.2761902935999611, 0, 0.001386117380605532, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718727261455639],
[275.4630295280446, 721.0757191045662, 0, 2, 0.276419787896876, 0, 0.002773633818212053, 0.006124048094950485, 0.5235683233472018, 1, 0.001949937727094995],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713730345785863],
[275.4630295280446, 721.0678404292702, 0, 1, 0.2764219733000782, 0, 0.001386832062021618, 0.003062057504373285, 0.7235780266999218, 1, 0.0009772230605046958],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711137413710076],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.000972030388896968],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720007942120193],
[275.6401386961033, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2765456756192191, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7234543243807809, 1, 0.0009716450854171894],
[275.6595593992366, 721.1493465369206, 0, 1, 0.2765420310328686, 0, 0.001386675318784059, 0.003061711422955086, 0.7234579689671314, 1, 0.0009717446466257981],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645799448994],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717671045837159],
[275.5306616293389, 721.1948813715122, 0, 1, 0.2764358388968302, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482684, 0.7235641611031698, 1, 0.0009718610609333482],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716451038054505],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718017793003279],
[274.3994242676507, 720.0877941993084, 0, 0, 0.2759205137806076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001666880238451327],
[274.5085945020937, 719.9786239648653, 1, 0, 0.276030289182861, 0.003642873192417926, 0, -0.008043286207317072, 1, 0.276030289182861, 0.0009242236207849835],
[274.4506476009809, 719.6557331329242, 0, 1, 0.2760777447161802, 0, 0.001389553301613585, 0.003068065868573946, 0.7239222552838198, 1, 0.0009053889009716175],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.000919365438278022],
[275.6237299281393, 721.1018130727118, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407145, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.000971192459225355],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.000971843556999647],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.8172478641622, 719.9082951366889, 0, 1, 0.2755461503357247, 0, 0.001389065811236597, 0.003066989513615011, 0.7244538496642753, 1, 0.0009727370641791637],
[275.1401386961033, 721.5854043047477, 0, 1, 0.276044033012073, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009722823434944004],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715298663864658],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721226340604769],
[275.1767501255426, 721.3204603739193, 1, 0, 0.276144024515251, 0.003634027945833994, 0, -0.008023756334579, 1, 0.276144024515251, 0.000972030387624341],
[274.7593009630493, 721.9662420378017, 0, 1, 0.2756619441454554, 0, 0.001385106313527109, 0.003058247135927829, 0.7243380558545446, 1, 0.0009720007942120193],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711590333562128],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009723438741955709],
[274.0257852283997, 719.6997577724513, 1, 0, 0.2757560044203926, 0.003649291613803798, 0, -0.008057457768466439, 1, 0.2757560044203926, 0.0009721523064690666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009719094743483141],
[275.4824502311778, 721.2430927696731, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009715119008250542],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711137597835499],
[274.5821917949905, 722.1433512058605, 0, 1, 0.2754842531358265, 0, 0.00138476660946911, 0.00305749708594806, 0.7245157468641735, 1, 0.0009721234511034078],
[275.1573294224094, 721.5005814771473, 1, 0, 0.2760800134261311, 0.003634284436831571, 0, -0.008024322654182823, 1, 0.2760800134261311, 0.0009719527807052929],
[274.6234230958178, 719.018756969727, 0, 1, 0.2763806011915703, 0, 0.001390784301948472, 0.00307078385723065, 0.7236193988084296, 1, 0.0009716230605728797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009712694488896375],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711773289649445],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009711137412860118],
[275.2859203599857, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762133952045672, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237866047954329, 1, 0.000972123440712866],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009719527807526481],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773289649445],
[275.2346970266555, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.723842359533136, 1, 0.0009720303861612602],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009720007939831724],
[275.2859203599857, 721.4396226408653, 0, 1, 0.2761902935999611, 0, 0.001386117380605532, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009721226339736421],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009719062452831576],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645798978727],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009712803784242803],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715369029324534],
[275.4436088249113, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.5599882705543, 0, 1, 0.2762855266233069, 0, 0.001385886158123616, 0.003059968994734222, 0.7237144733766931, 1, 0.0009726190445219939],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719062538093974],
[275.2859203599857, 721.4396226408652, 0, 1, 0.2761902935999612, 0, 0.001386117380605533, 0.003060479522688775, 0.7238097064000388, 1, 0.0009721226340214099],
[276.0209764291574, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2768219938839388, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7231780061160612, 1, 0.0009730178326292473],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009718760039307663],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721226340214099],
[275.4824502311778, 721.2430927696732, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009717671027402408],
[275.4312268978476, 721.3776790383097, 0, 1, 0.2763129675684179, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403916, 0.7236870324315821, 1, 0.0009718610609333482],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009721353155340546],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009715124602880113],
[276.0381671554634, 721.226684001709, 0, 1, 0.2767952433449986, 0, 0.001386526624960025, 0.003061383114249075, 0.7232047566550014, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645991912855],
[275.5209764291574, 721.3907312612115, 0, 1, 0.2763745016772654, 0, 0.001386211323025587, 0.00306068694296711, 0.7236254983227346, 1, 0.0009718890792584197],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009712611562186775],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711137672986586],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124865374033],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009717668619841647],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719645799448994],
[275.5381671554634, 721.1197437440933, 0, 1, 0.2764621282208757, 0, 0.001386732243396839, 0.003061837109721725, 0.7235378717791243, 1, 0.0009717668813178756],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124602880113],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711773364765997],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009717796429383708],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312242, 1, 0.0009716973446726014],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971964001835364],
[275.5575878585967, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7234737990681557, 1, 0.0009720367213534625],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009717677955747246],
[275.4755724538567, 721.2499705469943, 0, 1, 0.2763805687416014, 0, 0.001386481859044795, 0.003061284273293183, 0.7236194312583986, 1, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009730178326292473],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124864450083],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.000971113741334892],
[275.3692832952919, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762739304003738, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237260695996262, 1, 0.0009717671045420571],
[275.2235016314096, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2761045773090604, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.7238954226909396, 1, 0.0009718610609333482],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711768222167705],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0009717668526344996],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009718760039307663],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009721226340214099],
[275.4630295280446, 721.4486781623242, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752648, 0.0009717572416211763],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009716451038054505],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645991912855],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 1, 0, 0.2763645068021533, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763645068021533, 0.0009716451038551036],
[275.300839096198, 721.424703904653, 1, 0, 0.2762052613474189, 0.003632389945787892, 0, -0.008020139710424796, 1, 0.2762052613474189, 0.0009731334575653129],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.0341809714174, 0, 1, 0.2762594868183509, 0, 0.001390754468235428, 0.003070717985848373, 0.723740513181649, 1, 0.0009718936037597675],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009710344175044315],
[275.3538592936014, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2762887173218659, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.276288717321866, 0.0009719645992457547],
[274.758994130728, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764938428582716, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235061571417284, 1, 0.0009716230543586902],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009712694485347104],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711137597835499],
[275.6913620294335, 721.0341809714174, 0, 1, 0.276597067232176, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711773364765997],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720303861727327],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0009720007871374899],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 0, 1, 0.2763645068021533, 0, 0.001386433637388039, 0.003061177802228673, 0.7236354931978467, 1, 0.0009711137412860118],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719062452831576],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009719645992457547],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009717440592881594],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009715124679711687],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711132114437051],
[275.4630295280446, 721.1558941316728, 0, 1, 0.2763975507473886, 0, 0.001386662728735064, 0.0030616836247414, 0.7236024492526114, 1, 0.0009718017792431922],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009716451038054505],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009719645798978727],
[275.4630295280446, 721.4486781623244, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752647999, 0.0009716450854171894],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773548722941],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716450854171894],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009717663027387865],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009711773289649445],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009720367213534625],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717677971842718],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711250690897687],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009716450854171894],
[275.5575878585967, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7234737990681557, 1, 0.000971766852657502],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009721226340214099],
[275.1598803157186, 721.1848249520784, 0, 1, 0.2761693607251732, 0, 0.001386607101815333, 0.003061560803217677, 0.7238306392748268, 1, 0.0009719062452462722],
[275.2346970266555, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.723842359533136, 1, 0.0009717668619841647],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.000971964001835364],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009715124602880113],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717663027387865],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009720131814196865],
[275.3538592936015, 721.2625134728065, 1, 0, 0.276288717321866, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.276288717321866, 0.0009718754314913775],
[275.4630295280446, 721.3301455741009, 0, 1, 0.2763492331293467, 0, 0.001386327753159558, 0.003060944015020188, 0.7236507668706533, 1, 0.0009717663027387865],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720131619893412],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009716456468220816],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009731334575653129],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009720131620441719],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124865374033],
[275.625219959891, 721.10032304096, 1, 0, 0.2765307078717613, 0.003628115018449763, 0, -0.008010700879513081, 1, 0.2765307078717614, 0.0009730051194652213],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713502014888037],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009716451038551036],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009717668619841647],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009720131619893412],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715124865374033],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009775172926649292],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009721353155340546],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 0, 1, 0.2763645068021533, 0, 0.001386433637388039, 0.003061177802228673, 0.7236354931978467, 1, 0.0009716450854171894],
[275.7346970266555, 721.530154130517, 0, 1, 0.2764909409037206, 0, 0.001385943462342269, 0.003060095519652102, 0.7235090590962794, 1, 0.0009717668620073182],
[275.6913620294336, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.723402932767824, 1, 0.0009713502199949188],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009718760230916502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009726190637929692],
[275.3692832952919, 721.3562597055591, 0, 1, 0.2762739304003738, 0, 0.001386277566106069, 0.003060833204455618, 0.7237260695996262, 1, 0.0009721353155413721],
[275.314872053762, 721.410670947089, 1, 0, 0.2762193404062556, 0.003632204800780706, 0, -0.008019730919285496, 1, 0.2762193404062556, 0.0009718760039613231],
[276.0209764291574, 721.0854043047476, 0, 1, 0.2768219938839388, 0, 0.00138679828218708, 0.003061982920147352, 0.7231780061160612, 1, 0.0009730045086062672],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009721353155413721],
[275.4824502311778, 721.2430927696732, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009719056235700715],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009775173903901764],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009713502014888037],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0009716451038054505],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009726190638496067],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711250765922276],
[275.4630295280446, 721.2750563986186, 1, 0, 0.2763645068021533, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763645068021533, 0.0009716450854171894],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009730050996444354],
[275.4436088249112, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052852, 0.0009711250690897687],
[275.5721997624876, 721.1533432383635, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009715124602880113],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009717440592881594],
[275.3023291279499, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.7237932437257557, 1, 0.0009720131814196865],
[275.5821917949905, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764875383501185, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235124616498815, 1, 0.0009715119379962767],
[275.4312268978476, 721.4804807925212, 0, 1, 0.276284474114526, 0, 0.00138603888341031, 0.00306030620471302, 0.7237155258854739, 1, 0.0009717668813178756],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720131814196865],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009715124602880113],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009731328846799884],
[275.7859203599857, 720.9396226408653, 0, 1, 0.2766919362071071, 0, 0.001387078707557939, 0.003062602085679194, 0.7233080637928928, 1, 0.0009711250691829219],
[275.4312268978476, 721.4804807925212, 0, 1, 0.276284474114526, 0, 0.00138603888341031, 0.00306030620471302, 0.7237155258854739, 1, 0.0009717668619841647],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718760230916502],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009720131620441719],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009717663027387865],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009719062538093974],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009717056704923537],
[276.1667580930397, 720.5587849078113, 0, 1, 0.2770740250737248, 0, 0.001387811821804297, 0.003064220766153274, 0.7229259749262753, 1, 0.0009712783239790608],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000384720624206374],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005871394767149302],
[274.0739966265608, 719.6515463742902, 0, 1, 0.2758045202289079, 0, 0.001389561385698601, 0.003068083717839094, 0.7241954797710921, 1, 0.0009724255889926756],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3023291279499, 721.4232138729011, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282642, 0.7237932437257557, 1, 0.0009711317651304809],
[274.4993257491967, 719.1585851503598, 0, 1, 0.2762513363383712, 0, 0.001390513887546684, 0.003070186795429902, 0.7237486636616288, 1, 0.0009712203679294896],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004655733175057488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0005057207883436676],
[274.4436088249112, 719.2819341759397, 1, 0, 0.2761764661861734, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761764661861734, 0.0009718909380330449],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719536790293398],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009724874362819885],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6133047828822, 718.9769740153802, 0, 1, 0.2763848546455429, 0, 0.001390865126618934, 0.003070962314158135, 0.723615145354457, 1, 0.0009720855610317391],
[274.3849722814931, 719.2053065167692, 0, 1, 0.276155049155029, 0, 0.001390423556304341, 0.0030699873484557, 0.7238449508449709, 1, 0.0009725038947775024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.9361956148234, 718.654083183439, 0, 1, 0.2767098284690909, 0, 0.001391490041453986, 0.003072342095613054, 0.723290171530909, 1, 0.0009714847941453729],
[274.5456726815878, 719.0446061166745, 0, 1, 0.276316786244777, 0, 0.001390734304232771, 0.003070673464714672, 0.723683213755223, 1, 0.0009718179760433952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5381671554634, 721.1197437440933, 0, 1, 0.2764621282208757, 0, 0.001386732243396839, 0.003061837109721725, 0.7235378717791243, 1, 0.0009716985947808297],
[274.4745618950695, 719.3500748750996, 0, 1, 0.2761800741699104, 0, 0.001390143735195453, 0.003069369517104798, 0.7238199258300897, 1, 0.000972277503174772],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009721253753888726],
[274.6913620294335, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764445983032088, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235554016967912, 1, 0.0008294368531565257],
[274.9196945308227, 718.8058484700283, 0, 1, 0.2766555579326466, 0, 0.001391196248790255, 0.003071693415750984, 0.7233444420673534, 1, 0.001388930371916453],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0006965504798104276],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009720385258956313],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009711477059224787],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009716206000788592],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009713730085741103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009774056498294181],
[274.4436088249112, 718.8252691731617, 1, 0, 0.2763034409958063, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2763034409958063, 0.0009719693930669063],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2764313102190999, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.7235686897809001, 1, 0.0009722035691961251],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009722216553591714],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003817425827422831],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005899905345280843],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711477058785305],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5475958260937, 718.1779471747573, 0, 1, 0.2772874238434039, 0, 0.001392412568408573, 0.003074378990102038, 0.722712576156596, 1, 0.0009723618333100912],
[275.8438672610985, 720.8816757397525, 0, 1, 0.2767500734762077, 0, 0.001387190205623999, 0.00306284826796705, 0.7232499265237924, 1, 0.0009722035691961251],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009731399279762796],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711477059224787],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383096, 0, 1, 0.276312967568418, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403917, 0.7236870324315821, 1, 0.0009719927226780153],
[275.3796665927383, 721.4486781623243, 0, 1, 0.2762558549239525, 0, 0.001386099982256815, 0.003060441107983985, 0.7237441450760475, 1, 0.0009721606590251948],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.000972004836325849],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009714151258828015],
[274.4436088249112, 718.8252691731617, 1, 0, 0.2763034409958063, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2763034409958063, 0.0009726499856131805],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 1, 0, 0.276322993307938, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.276322993307938, 0.0009723476063794103],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 718.8058484700283, 0, 0, 0.276322993307938, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004682063521419797],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0005034641793401502],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719375445711334],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719596520660151],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0009711768222167705],
[274.6710917662616, 719.7604852615233, 0, 1, 0.2762091410926578, 0, 0.001389351069525097, 0.003067619349993118, 0.7237908589073423, 1, 0.0009725438921734739],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4312268978476, 721.3776790383097, 0, 1, 0.2763129675684179, 0, 0.001386236404393785, 0.003060742321403916, 0.7236870324315821, 1, 0.0009717861223914839],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009711301365058718],
[274.4436088249112, 719.4426345760345, 1, 0, 0.2761318115097377, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761318115097378, 0.0009721616823495593],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718959276629737],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.000971132062421623],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 1, 0, 0.2764010293865392, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2764010293865391, 0.0009722940272725626],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009719367712335154],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009718240932366389],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.5306616293389, 719.1948813715121, 0, 1, 0.2762640686484837, 0, 0.001390443711296985, 0.003070031849695731, 0.7237359313515163, 1, 0.0005287393214375931],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004429215987907232],
[274.7713084560948, 718.4975695419781, 0, 1, 0.2766333613612204, 0, 0.001391793156151484, 0.003073011358070691, 0.7233666386387796, 1, 0.000971511566334829],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 720.9396226408652, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.00138707870755794, 0.003062602085679195, 0.7234737990681556, 1, 0.0009722618509336161],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720335315627672],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718443586555353],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1009228558186, 719.3962876436434, 0, 1, 0.2758950100302944, 0, 0.001390054434775392, 0.003069172346135882, 0.7241049899697056, 1, 0.000972285093998957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009723363289476497],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 720.9396226408652, 0, 1, 0.2765262009318444, 0, 0.00138707870755794, 0.003062602085679195, 0.7234737990681556, 1, 0.0009720482028879344],
[274.2361870584073, 719.2610234410546, 0, 1, 0.2760311595847765, 0, 0.001390315848363154, 0.003069749534578572, 0.7239688404152235, 1, 0.0009722591074005168],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3023291279499, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2762067562742443, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.7237932437257557, 1, 0.0009717353332879155],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720395738409457],
[273.2368459379187, 717.495143796722, 0, 1, 0.2757928973415938, 0, 0.001393737656130138, 0.003077304719116306, 0.7242071026584063, 1, 0.0009732603107629589],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 1, 0.2761960095130708, 0, 0.001390312968170289, 0.003069743175253304, 0.7238039904869291, 1, 0.000486006394703511],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00048550595406203],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009718332704084645],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009716967384423023],
[275.8438672610985, 720.8816757397525, 0, 1, 0.2767500734762077, 0, 0.001387190205623999, 0.00306284826796705, 0.7232499265237924, 1, 0.0009716905971476007],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1222080247218, 718.7640353762239, 1, 0, 0.2768145850206061, 0.003634748380291214, 0, -0.008025347018697539, 1, 0.2768145850206061, 0.0009718693799976346],
[274.8023291279499, 718.9232138729011, 0, 1, 0.2765374514758896, 0, 0.001390969133703326, 0.003071191956724088, 0.7234625485241104, 1, 0.0005088387615494811],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004628606761616671],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.1925110990122, 719.6937323019334, 1, 0, 0.2758791691901903, 0.003647072620589902, 0, -0.008052558339754889, 1, 0.2758791691901903, 0.0009716023630258024],
[275.337480665095, 721.388062335756, 0, 1, 0.2762420232917217, 0, 0.001386216451603228, 0.003060698266616224, 0.7237579767082783, 1, 0.000972188718473853],
[275.1222080247218, 718.7640353762239, 1, 0, 0.2768145850206061, 0.003634748380291214, 0, -0.008025347018697539, 1, 0.2768145850206061, 0.0009719245041262648],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.8023291279499, 720.9232138729012, 0, 1, 0.2767083988813903, 0, 0.001387110278538347, 0.003062671792863016, 0.7232916011186097, 1, 0.0009720602424740742],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.652520623167, 719.3944231778735, 0, 1, 0.2762973341811702, 0, 0.001390058037401196, 0.00306918030055782, 0.7237026658188298, 1, 0.0009708385639247826],
[274.8050258548319, 719.2419179462084, 0, 1, 0.2764507527220308, 0, 0.001390352779848392, 0.003069831077495425, 0.7235492472779692, 1, 0.0009712694783376347],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4047674186446, 719.6421763823957, 1, 0, 0.2760480972552208, 0.003644251553670545, 0, -0.008046329561687727, 1, 0.2760480972552208, 0.0009705749027192479],
[274.5848885218726, 719.4620552791678, 0, 1, 0.2762292970510164, 0, 0.001389927366790702, 0.003068891786227628, 0.7237707029489836, 1, 0.0009708674312492003],
[274.4241881217779, 719.5551235779682, 0, 1, 0.2760864183908426, 0, 0.001389747591577873, 0.003068494851332179, 0.7239135816091573, 1, 0.0009721793146892438],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009713221691347126],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.000971431258297607],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009728708397778808],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009708448542879951],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009714229121091303],
[274.6012972898367, 719.4456465112037, 0, 1, 0.2762458040862892, 0, 0.001389959067581108, 0.00306896178002559, 0.7237541959137108, 1, 0.0009706041865968485],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 0, 1, 0.2760676342632609, 0, 0.001389616979324237, 0.00306820646585108, 0.7239323657367391, 1, 0.0009716082616639588],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009706046660049392],
[274.4241881217779, 719.6227556792625, 1, 0, 0.2760676342632609, 0.003643993653927627, 0, -0.008045760131642949, 1, 0.2760676342632609, 0.0009716082616639588],
[274.4241881217779, 719.5199539250508, 0, 1, 0.2760961874141702, 0, 0.001389815521508338, 0.003068644837303119, 0.7239038125858297, 1, 0.0009706046660049392],
[275.4436088249112, 721.4426345760345, 1, 0, 0.2763039520790421, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763039520790421, 0.0009719121992734086],
[274.4436088249112, 719.2043100421425, 1, 0, 0.2761980411913193, 0.003643735790684699, 0, -0.008045190782188365, 1, 0.2761980411913193, 0.0009717010259037589],
[274.6237299281393, 718.8634885388198, 0, 1, 0.2764240191755145, 0, 0.001391084699589661, 0.003071447120560571, 0.7235759808244855, 1, 0.0009719017923170955],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009716958311979454],
[274.2252683560251, 719.6609750449205, 1, 0, 0.2759121279490326, 0.00364663696381803, 0, -0.008051596430866155, 1, 0.2759121279490326, 0.0009720127510410673],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936015, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0009722110825333952],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3800035645173, 720.2679153025364, 1, 0, 0.2758564094489313, 0.003644580461436074, 0, -0.008047055773980669, 1, 0.2758564094489313, 0.0009717050043341428],
[275.4312268978476, 721.6751538360573, 0, 1, 0.276230532889701, 0, 0.00138566499717291, 0.003059480682149499, 0.723769467110299, 1, 0.0009715304627723225],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.4486781623242, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752648, 0.0009718133176176436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6111870023271, 721.1143559985239, 1, 0, 0.2765166288129247, 0.003628299746742706, 0, -0.00801110875056767, 1, 0.2765166288129246, 0.0009713530229529878],
[275.1237299281393, 721.6018130727117, 0, 1, 0.27602757033779, 0, 0.0013858058307002, 0.003059791635703945, 0.7239724296622101, 1, 0.0009714613797940681],
[275.6913620294336, 721.0341809714175, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.00306220044793717, 0.723402932767824, 1, 0.0009711773289649445],
[274.683082525458, 719.4147898544287, 1, 2, 0.276313922559619, 0.003640559115639453, 0.002780037369546842, -0.001899990014982944, 0.8131446440448828, 0.6209900140008736, 0.002800148220406365],
[274.8172478641621, 719.4667892052423, 1, 0, 0.2763971235766495, 0.003638781800530527, 0, -0.008034252613722559, 1, 0.2763971235766496, 0.001205821965515799],
[275.6401386961033, 721.2715689942655, 0, 1, 0.2764940330921608, 0, 0.001386440340902929, 0.003061192603262364, 0.7235059669078392, 1, 0.0008611164660317071],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3816757397525, 0, 1, 0.2763349477329499, 0, 0.001386228724169537, 0.003060725363843635, 0.72366505226705, 1, 0.0009714673091596636],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 1, 0.2761960095130708, 0, 0.001390312968170289, 0.003069743175253304, 0.7238039904869291, 1, 0.0003875885006476178],
[273.642286270604, 717.1730623890552, 0, 1, 0.2761788931113934, 0, 0.001394363581739655, 0.003078686732311909, 0.7238211068886066, 1, 0.0009726548795503182],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002970405024005357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002869077989919281],
[275.4630295280446, 721.4486781623243, 1, 0, 0.2763163752648, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763163752647999, 0.0009718246620835875],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 1, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0.001390312968170289, -0.004974878338053564, 0.9237157643290557, 0.4761077833551974, 0.001944184194189544],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.000971541171243436],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1433512058605, 0, 1, 0.2764010293865392, 0, 0.001386686847112781, 0.00306173687694223, 0.7235989706134609, 1, 0.0009722618672993415],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009721723624242589],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801371587168565],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005913561648462581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.0063645252665, 719.5839142729959, 0, 0, 0.2757739989733741, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080515630684],
[275.2346970266555, 721.4232138729012, 0, 1, 0.2761576404668639, 0, 0.001386148907839522, 0.003060549133282641, 0.723842359533136, 1, 0.0005913806723916686],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6913620294335, 718.9665488701231, 0, 1, 0.2764445983032088, 0, 0.001390885294415337, 0.003071006843668241, 0.7235554016967912, 1, 0.0009712318250215003],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6913620294336, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2765970672321761, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.723402932767824, 1, 0.0009711079612695685],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4881153796689, 719.2374276211821, 0, 0, 0.2762212537586284, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003794922525704073],
[275.4755724538567, 721.2499705469943, 0, 1, 0.2763805687416014, 0, 0.001386481859044795, 0.003061284273293183, 0.7236194312583986, 1, 0.000591661472816435],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801371566474895],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005913561648462581],
[275.6237299281392, 721.1018130727117, 0, 1, 0.2765292129449359, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009712783332247089],
[276.0524581428724, 720.7407169592731, 1, 1, 0.2769405580195552, 0.003622499892692297, 0.001387461505184405, -0.004934855671749119, 0.9233039273238174, 0.4771850433629278, 0.001943303677500844],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.9630295280446, 719.7625134728065, 0, 1, 0.2756928524758772, 0, 0.001389347154487202, 0.003067610705780531, 0.7243071475241228, 1, 0.000677365493311809],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00029431566469142],
[275.2664996568524, 721.3756804086923, 0, 1, 0.2761939090705045, 0, 0.001386240245073765, 0.003060750801437858, 0.7238060909294955, 1, 0.0009723013673778581],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6813699969306, 719.0441730039203, 0, 0, 0.2764157285999193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000379492978464942],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.000591661472816435],
[274.1834736933253, 719.4068051049371, 0, 1, 0.2759522506852095, 0, 0.001390034112693907, 0.003069127475971846, 0.7240477493147905, 1, 0.0009719434927362337],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2346970266555, 719.4232138729011, 0, 1, 0.2759850186050362, 0, 0.001390002408480341, 0.003069057474615712, 0.7240149813949639, 1, 0.0005297827637719833],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 0, 0.2763679846095901, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000441876554278918],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4443373737469, 716.2876472689671, 1, 1, 0.2770116859331228, 0.003643726117905536, 0.00139608717784365, -0.004962677076779922, 0.9232645258564889, 0.4772878977227345, 0.0009724915850237401],
[275.1416287278552, 718.5839142729959, 0, 0, 0.2768788934387083, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004663065750612707],
[275.8023291279499, 720.9232138729012, 0, 1, 0.2767083988813903, 0, 0.001387110278538347, 0.003062671792863016, 0.7232916011186097, 1, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2764472345351011, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764472345351011, 0.0009711998201557291],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3438672610985, 721.3816757397525, 0, 1, 0.2762484308690616, 0, 0.001386228724169537, 0.003060725363843635, 0.7237515691309384, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416927, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801080506439135],
[275.3538592936015, 721.3716837072496, 1, 0, 0.2762584557275326, 0.003631690518394842, 0, -0.00801859540887863, 1, 0.2762584557275326, 0.0005913806723916686],
[274.0063645252665, 719.7191784755846, 0, 0, 0.2757364610934951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003801079985034864],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741956, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129959, 1, 0.0005913806723916686],
[274.4241881217779, 719.3013548790731, 0, 0, 0.2761569228592757, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003793648296017734],
[273.818592829844, 717.0565893651927, 1, 1, 0.2763401463171852, 0.003652052951062453, 0.001394590071175967, -0.00498436785642528, 0.9236361235333967, 0.476316416167767, 0.0009725166660454858],
[275.4436088249113, 721.2819341759398, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0005919688534927615],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.2346970266555, 721.4908459741955, 0, 1, 0.2761389019870041, 0, 0.001386018971106621, 0.003060262239318354, 0.7238610980129958, 1, 0.0009719596520660151],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5575878585967, 721.0587849078113, 0, 1, 0.2764931375687757, 0, 0.001386849478753458, 0.003062095959667111, 0.7235068624312243, 1, 0.000971621352073655],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.7083194944375, 719.0172235064134, 0, 2, 0.2764428482585581, 0, 0.002781574536207422, 0.006141580812713288, 0.5235349518361879, 1, 0.001942945844523622],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6237299281393, 721.1018130727117, 0, 1, 0.276529212944936, 0, 0.001386766725407146, 0.003061913244317482, 0.7234707870550641, 1, 0.0009705853355988183],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.0341809714174, 0, 1, 0.2762594868183509, 0, 0.001390754468235428, 0.003070717985848373, 0.723740513181649, 1, 0.0009709129994035236],
[275.4630295280446, 721.0341809714174, 0, 1, 0.2764313102191, 0, 0.001386896802385629, 0.003062200447937171, 0.7235686897808999, 1, 0.0009720770988531882],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004074871006585035],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005640301873733476],
[275.4436088249112, 721.2819341759397, 1, 0, 0.2763485001052853, 0.003630507181728297, 0, -0.008015982659275256, 1, 0.2763485001052853, 0.0009713669926190838],
[275.3796665927383, 721.4486781623242, 0, 1, 0.2762558549239525, 0, 0.001386099982256815, 0.003060441107983986, 0.7237441450760475, 1, 0.0009719777931257319],
[275.1244201476451, 723.2815234782843, 11.08333333333333, 32.91666666666666, 0.2755636841948984, 0.04028480397118322, 0.04551017217800525, 0.01153735796062347, 0.4374447772349834, 0.6910455331001923, 0.05052005108060629],
[275.2963036574321, 721.8404463602653, 0, 0, 0.2760868092090137, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003531131755634999],
[275.3796665927383, 721.6542816707475, 0, 1, 0.2761988867804969, 0, 0.001385705074297954, 0.003059569170485509, 0.7238011132195031, 1, 0.0006193489172141957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.3653152270181, 0, 1, 0.2763394830989988, 0, 0.001386260163735893, 0.003060794780871644, 0.7236605169010012, 1, 0.0009720924959577413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4824502311778, 721.2430927696731, 1, 0, 0.2763874691138949, 0.003629995301554874, 0, -0.008014852452836211, 1, 0.2763874691138949, 0.0009721380864520773],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003827604292444448],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0005889173430479834],
[275.6813699969307, 721.1533432383634, 2, 0, 0.2765567514218965, 0.007254752107559053, 0, -0.01601813856317725, 1, 0.07648363675703251, 0.001943326972366456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.8584791649895, 719.0532285253794, 0, 1, 0.2765421486016095, 0, 0.001390717627470752, 0.003070636643238094, 0.7234578513983905, 1, 0.000972216779608097],
[274.9650985061233, 718.7604444947277, 0, 1, 0.2767012485920248, 0, 0.001391284130421197, 0.003071887454102771, 0.7232987514079752, 1, 0.0009711346891952883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6813699969306, 719.0441730039204, 0, 0, 0.2764157285999193, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004653767103277664],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.5721997624876, 721.1533432383634, 1, 0, 0.2764775134916476, 0.003628813069177109, 0, -0.008012242141448564, 1, 0.2764775134916476, 0.0005057207883436676],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.7074639650763, 719.0180790357747, 1, 0, 0.2764419873273208, 0.00364023600074853, 0, -0.008037463416827231, 1, 0.2764419873273208, 0.0009718839456175056],
[275.5306616293389, 721.1948813715121, 0, 1, 0.2764358388968302, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482685, 0.7235641611031698, 1, 0.0009718783048551833],
[274.3538592936014, 719.3716837072495, 1, 0, 0.2760861499696466, 0.003644927768010159, 0, -0.008047822609944893, 1, 0.2760861499696465, 0.0009719843471901424],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 1, 0.2759762904262224, 0, 0.001389891050639467, 0.003068811601938222, 0.7240237095737776, 1, 0.0009728322451622516],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0009717106502328375],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 0, 0, 0.2761960095130708, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004658806237952161],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0005057207883436676],
[274.4630295280446, 719.2625134728065, 1, 0, 0.2761960095130708, 0.003643477963934011, 0, -0.008044621513306868, 1, 0.2761960095130709, 0.000972120535599463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 1, 0, 0.2763679846095901, 0.003630251223597289, 0, -0.008015417516214807, 1, 0.2763679846095901, 0.0009717856675877535],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1401386961033, 721.5854043047477, 1, 1, 0.276044033012073, 0.003634511506532734, 0.001385837343763219, -0.004964962797991163, 0.9237996918384295, 0.4758877578625756, 0.001944643546882456],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.0455803655512, 721.9082951366888, 0, 1, 0.2758859633571215, 0, 0.001385217494710538, 0.003058492618554305, 0.7241140366428785, 1, 0.0009812165769131217],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3117746835109, 719.4266608190202, 1, 1, 0.2760402183143817, 0.003645486968810424, 0.001389995748644574, -0.004980014527994983, 0.9238017978729485, 0.475882234501712, 0.001946374800153743],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.6473373899065, 718.0105735096503, 1, 1, 0.2774066752413448, 0.003627823905244142, 0.001392737150251116, -0.004934962464795569, 0.9230455365315431, 0.4778588870142326, 0.001943132182102707],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.9630295280446, 720.7625134728065, 0, 1, 0.2768696272167361, 0, 0.001387419547087376, 0.003063354642724477, 0.7231303727832639, 1, 0.0009710031833737852],
[275.4630295280446, 721.1948813715121, 0, 1, 0.2763867386347428, 0, 0.001386587766815924, 0.003061518112482685, 0.7236132613652572, 1, 0.0009752035876670677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.8651810762868, 718.8668079080963, 1, 0, 0.2765989060664187, 0.003638147240346376, 0, -0.008032851535807602, 1, 0.2765989060664187, 0.0009731470447506559],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.6133351318605, 719.4901818248912, 1, 0, 0.2762421925359786, 0.003641483759409688, 0, -0.0080402184070504, 1, 0.2762421925359786, 0.0009729062586625667],
[275.7859203599857, 720.7112901394762, 0, 1, 0.2767553360453031, 0, 0.001387518155579988, 0.003063572365463277, 0.723244663954697, 1, 0.0009733999599593036],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 1, 0.2759762904262224, 0, 0.001389891050639467, 0.003068811601938222, 0.7240237095737776, 1, 0.0009727021152761096],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.2446890591584, 719.4808539416925, 0, 0, 0.2759762904262224, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000479177557212953],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.3538592936014, 721.3716837072495, 1, 0, 0.2762584557275325, 0.003631690518394843, 0, -0.008018595408878632, 1, 0.2762584557275325, 0.0004923689153635719],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[273.8172478641621, 719.9082951366888, 0, 1, 0.2755461503357247, 0, 0.001389065811236597, 0.003066989513615012, 0.7244538496642753, 1, 0.0009725423019491965],
[273.9264180986053, 719.7991249022458, 1, 0, 0.275656009879149, 0.003650615398621502, 0, -0.008060380620732568, 1, 0.275656009879149, 0.0009723316529610617],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.1401386961033, 721.5854043047476, 0, 1, 0.2760440330120731, 0, 0.001385837343763219, 0.003059861215008999, 0.723955966987927, 1, 0.0009720845857540209],
[274.4630295280446, 719.0569099643832, 0, 1, 0.2762531667640843, 0, 0.001390710507252524, 0.003070620922143772, 0.7237468332359157, 1, 0.0009715234443431463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[275.4630295280446, 721.1597117185948, 0, 1, 0.2763964920000499, 0, 0.00138665538818981, 0.003061667417175759, 0.7236035079999501, 1, 0.0009712490600961673],
[273.1381188152386, 717.7288491100099, 0, 1, 0.2756556910834919, 0, 0.001393283830293305, 0.003076302693818932, 0.724344308916508, 1, 0.0009739968550470777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[274.3684711974924, 719.5854043047476, 0, 1, 0.276037427852329, 0, 0.00138968910989264, 0.003068365726625561, 0.723962572147671, 1, 0.0009723531319072946],
[274.1401386961033, 719.5854043047477, 0, 1, 0.2758710799243977, 0, 0.001389689109892639, 0.00306836572662556, 0.7241289200756023, 1, 0.0009724795925431703],
[274.5721997624876, 719.1533432383634, 1, 0, 0.2763058690564951, 0.003642029312745526, 0, -0.008041422962188537, 1, 0.276305869056495, 0.0009723440373246018],
[275.4630295280446, 721.2625134728065, 0, 1, 0.2763679846095901, 0, 0.001386457747797124, 0.003061231036835149, 0.7236320153904099, 1, 0.0009717358677755367],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.5455047693983337, 2.454371372141176, 0, 3, 0.1818424307072843, 0, 1.222308911378323, 2.698798417807267, 0.5476597931182826, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.982109555157666, 0, 1, 0.2457413987319739, 0, 0.5045129808278712, 1.113940037372482, 0.7542586012680261, 1, 0.4529085623117528],
[0.5439132062125196, 2.455907955591249, 1, 2, 0.1813152107659208, 1.8385286265862, 0.8143627677277949, -2.261308228819563, 0.9132959327193805, 0.4512807901748173, 0.4529085623117528],
[0.9967766565937861, 2.003223343406211, 1, 1, 0.3322588855312623, 1.003233766947582, 0.4991954608015075, -1.112891978843021, 0.8896040329855235, 0.5541218040480481, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9985297993622868, 2.00147020063771, 0, 2, 0.3328432664540959, 0, 0.9992654396566875, 2.20632931856311, 0.4450981071156405, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995101423094582, 1.999999808275496, 0, 2, 0.3332244795902534, 0, 1.000000095862261, 2.207951403607879, 0.4445895946176883, 1, 0.4529085623117528],
[0.5436605607215192, 2.456339439278479, 1, 2, 0.1812201869071732, 1.839383012578381, 0.8142197157358174, -2.263510523205583, 0.913380547504683, 0.451089700259855, 0.4529085623117528],
[0.6068720055938646, 2.226581030030408, 0, 1, 0.2141810709278819, 0, 0.4491190693322053, 0.9916329844589269, 0.7858189290721181, 1, 0.4529085623117528],
[0.9994413081469466, 1.630145764646701, 1, 3, 0.3800753808411257, 1.000559004164126, 1.840326224231969, 1.854165034508229, 0.5098897905981012, 0.8523084883558871, 0.4529085623117528],
[0.7605036753972048, 2.239240579063145, 1, 2, 0.2535228375773716, 1.314918037020279, 0.8931599483771242, -0.9312212745336531, 0.8397682795881005, 0.5840419087662416, 0.4529085623117528],
[0.5442633338275169, 2.45524592948476, 1, 1, 0.1814507927961862, 1.837345890944972, 0.4072911751898731, -3.15749101420331, 0.9670756097936356, 0.3299771953860078, 0.4529085623117528],
[0.5440591152811773, 2.45594088471882, 1, 1, 0.1813530384270592, 1.83803555884398, 0.4071759243970929, -3.159268235388264, 0.9671110754532737, 0.3298171523073919, 0.4529085623117528],
[0.9996198530006237, 1.628450229249142, 1, 1, 0.3803627078867306, 1.000380291566074, 0.6140807880023987, -0.8529304493426022, 0.8553242104490736, 0.6160496262225349, 0.4529085623117528],
[0.6469573992703173, 1.591367134621657, 1, 1, 0.2890364598494548, 1.545696828149532, 0.6283905066556167, -2.025367585924555, 0.9164579248776945, 0.4945308445766041, 0.4529085623117528],
[0.6067355744157246, 1.634040048754543, 0, 1, 0.2707703386907209, 0, 0.6119801046260737, 1.35122220145802, 0.7292296613092791, 1, 0.4529085623117528],
[0.9998774097355855, 2.000122590264412, 0, 1.75, 0.3332924699118621, 0, 0.8749463700465749, 1.931838880635511, 0.4919113921353099, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.000608926683219, 1.997920681951678, 1, 3, 0.3336998653612608, 0.9993914438828387, 1.501561111559963, 1.108766116308181, 0.5919409802954132, 0.8029031860078853, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744271769898, 0, 1, 0.3333617500034372, 0, 0.5000639402331869, 1.104116772888421, 0.6666382499965628, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9749515533922815, 2.025048446607717, 0, 1, 0.3249838511307606, 0, 0.4938153463316698, 1.090320182535563, 0.6750161488692394, 1, 0.4529085623117528],
[0.6787988590923072, 2.321201140907693, 0, 2, 0.2262662863641024, 0, 0.8616228747922769, 1.902421253407861, 0.5986638596167972, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690922828682, 2.45643090771713, 1, 0, 0.1811896974276229, 1.839692532554094, 0, -4.061951320071908, 1, 0.1811896974276228, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 2.238324533891975, 0, 2, 0.2538918220360087, 0, 0.8935254784177438, 1.972860645108977, 0.556677413224747, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9996551495448774, 2.00034485045512, 2, 1, 0.3332183831816261, 2.000689938835967, 0.4999138022488869, -3.313640459625586, 0.9630012664681802, 0.2591060056068915, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2758019453970965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9965338673854116, 2.003466132614586, 1, 1, 0.3321779557951375, 1.003478188477109, 0.4991349660076204, -1.113565219202748, 0.8896578056837638, 0.5540137172740386, 0.4529085623117528],
[0.6461620190155266, 2.186629647932129, 0, 2, 0.2281007906634266, 0, 0.914649630718845, 2.019501742361098, 0.5958283893744271, 1, 0.4529085623117528],
[0.9985294502759385, 2.001470549724059, 0, 1, 0.3328431500919798, 0, 0.4996326326849372, 1.103164466873167, 0.6671568499080203, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690813698946, 2.456430918630103, 1, 0, 0.181189693789965, 1.839692569488712, 0, -4.061951401621741, 1, 0.181189693789965, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.453977963665683, 0, 1, 0.1812740292094829, 0, 0.4075016217774948, 0.8997436915246421, 0.8187259707905171, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993069202062559, 2.000693079793741, 0, 1, 0.333102306735419, 0, 0.4998267900757141, 1.103593156915558, 0.666897693264581, 1, 0.4529085623117528],
[0.6458402413023928, 1.98242079459412, 1, 1, 0.2457291085175995, 1.54837053507755, 0.5044337724497787, -2.304961419363039, 0.9396172052271458, 0.4310754222623449, 0.4529085623117528],
[1.150018077797909, 1.714704044239121, 0.25, 0.5, 0.4014414064635913, 0.2173878870484436, 0.2915955098373078, 0.1638468091883511, 0.7870019568013822, 0.3194970647979267, 0.4529085623117528],
[0.5435690921589096, 2.456430907841088, 1, 0, 0.1811896973863033, 1.839692532973628, 0, -4.061951320998219, 1, 0.1811896973863033, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438034949386843, 2.456196505061313, 1, 0, 0.1812678316462282, 1.838899546080985, 0, -4.060200444643408, 1, 0.1812678316462282, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9989269211133046, 2.000894148589848, 0, 2, 0.3329955013657376, 0, 0.9995531254911819, 2.206964514844289, 0.4448950011983439, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5438246133806155, 2.456175386619382, 0, 1, 0.181274871126872, 0, 0.4071370495151711, 0.898938733763493, 0.8187251288731281, 1, 0.4529085623117528],
[0.6068720214534987, 2.021198037037969, 0, 1, 0.2309192707753948, 0, 0.4947560712385625, 1.092397257215033, 0.7690807292246052, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.0005833596192740104, 1.786694197433705, 0, 1, 0.0003263956496135415, 0, 0.5596928682235254, 1.235774535519311, 0.9996736043503864, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069553251889418, 2.226497775068733, 2, 1, 0.2142104717151468, 3.295135435836915, 0.4491358631468336, -6.283828148806514, 0.9901707112631397, 0.1179998011035567, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 2.238324533891975, 0, 0, 0.2538918220360087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457399634776003, 2.187313856844039, 1, 1, 0.2279307081445734, 1.548610983614132, 0.4571817605740622, -2.409822453938948, 0.9480475922847134, 0.4039090085738601, 0.4529085623117528],
[1.000817066567164, 1.997904534740621, 1, 2, 0.3337479098195356, 0.9991836004855849, 1.001048831524701, 0.004118339096076249, 0.7401878003613179, 0.7042561286759021, 0.4529085623117528],
[1.000202885657104, 1.999307200981349, 1, 1, 0.3334554166403988, 0.9997971554971359, 0.5001732597717626, -1.103145176092883, 0.888807485113178, 0.5557183183939758, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6068720214521411, 2.021198037047273, 0, 1, 0.2309192707741799, 0, 0.4947560712362849, 1.092397257210004, 0.76908072922582, 1, 0.4529085623117528],
[1.000161216333587, 1.999693671293581, 0, 2, 0.3334031990876387, 0, 1.000153187816122, 2.208289423169885, 0.4443512949865942, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.3549106775913853, 2.645089322408613, 0, 1, 0.1183035591971285, 0, 0.3780590664852868, 0.8347359664731961, 0.8816964408028715, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5450866643802292, 2.45491333561977, 3, 0, 0.1816955547934098, 5.503711971033156, 0, -12.15192740658491, 0.9999999999999999, 0.005998365249751281, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.151586928294352, 1.713439059504353, 1, 0, 0.4019464162624071, 0.868366925179611, 0, -1.917311787499137, 1, 0.4019464162624071, 0.4529085623117528],
[0.9988284687499134, 2.001171531250084, 0, 2, 0.3329428229166381, 0, 0.9994145772954546, 2.20665860719039, 0.4449652774984237, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.7616967786126462, 2.238303221387355, 1, 1, 0.2538989262042153, 1.312858381548363, 0.446766993160192, -1.912287513328153, 0.9355353352723466, 0.443333187680777, 0.4529085623117528],
[0.6792883093293146, 2.320711690670686, 0, 2, 0.2264294364431048, 0, 0.8618045955643892, 1.902822484003248, 0.5984114168017323, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.207951191948687, 0.4444444444444445, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 1, 0.1811116657406323, 0, 0.4070559066332436, 0.8987595742406229, 0.8188883342593677, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 0, -4.415902383897374, 1, 0.1111111111111109, 0.4529085623117528],
[0.9749141483756629, 2.025085851624336, 0, 0, 0.3249713827918878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0, 1.78611948476847, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614412026384705, 2.23855879736153, 1, 1, 0.2538137342128234, 1.313299039420115, 0.446715985829207, -1.913373086098576, 0.935578588324942, 0.4432060567505892, 0.4529085623117528],
[0.7614411812832299, 2.000026908902227, 1, 1, 0.2757378164134761, 1.31329907625266, 0.4999932728649531, -1.79573951800867, 0.9239686565995281, 0.4754442894264803, 0.4529085623117528],
[0.6457400220737552, 2.187534107313807, 1, 0, 0.2279130054434012, 1.548610843089081, 0, -3.419257156863195, 1, 0.2279130054434012, 0.4529085623117528],
[0.8330729099116219, 2.000201219475939, 0, 1, 0.2940318768560874, 0, 0.4999497001916657, 1.103864536452576, 0.7059681231439126, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435693735074149, 2.455940713126337, 1, 1, 0.1812193851021332, 1.839691580758935, 0.407175952845796, -3.162924588135934, 0.9671595344632047, 0.3295983046674712, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744193557344, 1, 2, 0.3333617586952029, 1.000000000000001, 1.000127919582654, 0.0002824401949935247, 0.7407028394502926, 0.703741602570217, 0.4529085623117528],
[0.5440586820931117, 2.454961796537606, 1, 3, 0.1814121263825167, 1.838037022316753, 1.222014943055773, -1.360146684170989, 0.8470512736199103, 0.5509846094285991, 0.4529085623117528],
[0.3545668284018837, 2.645433171598115, 1, 0, 0.118188942800628, 2.820342795481562, 0, -6.227179236987401, 1, 0.118188942800628, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7615692223022508, 2.23843077769775, 1, 0.5, 0.2538564074340835, 1.313078274062815, 0.2233707671381535, -2.406020988789737, 0.9734361157209221, 0.3554841221279867, 0.4529085623117528],
[0.3560403389256013, 2.643959661074397, 0, 3, 0.1186801129752005, 0, 1.134661789348527, 2.505277850250708, 0.6845429629840334, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6071571198056698, 2.226612172892107, 0, 3, 0.2142577807481463, 0, 1.347338362972908, 2.974857344484222, 0.4851100449288804, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.002452759891094, 1.997291511878817, 0, 2, 0.3341794063330693, 0, 1.001356080524588, 2.210945351559327, 0.4433170629509841, 1, 0.4529085623117528],
[0.9983298592223371, 2.00167014077766, 0, 3, 0.3327766197407793, 0, 1.49874843955782, 3.309163403552921, 0.2970392011189588, 1, 0.4529085623117528],
[0.6466245556862872, 1.981845175504096, 1, 3, 0.2460079901294672, 1.546492460278843, 1.51374084972956, -0.07231395755052779, 0.7449995196477881, 0.6768032577558254, 0.4529085623117528],
[0.9988302958847963, 2.000990741068944, 3, 3, 0.3329632946701011, 3.00351322177558, 1.499257312103992, -3.321323628755236, 0.9002278903967071, 0.3188851748716545, 0.4529085623117528],
[0.6789439927160893, 2.321056007283911, 0, 1, 0.2263146642386964, 0, 0.4308383756625483, 0.9512701050813589, 0.7736853357613036, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4529085623117528],
[1.000816712460516, 1.998927559314472, 1, 2, 0.3336340106979584, 0.9991839540144092, 1.000536508029284, 0.002986373249317002, 0.7403397472353961, 0.7041044260699654, 0.4529085623117528],
[0.9997442730715237, 2.000255726928474, 0, 1, 0.3332480910238415, 0, 0.4999360764413693, 1.10383445587687, 0.6667519089761584, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995096569987233, 2.000490343001274, 0, 1, 0.3331698856662414, 0, 0.4998774442968472, 1.103704998963486, 0.6668301143337585, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5446937674264749, 2.455306232573523, 1, 2, 0.1815645891421585, 1.83589396428147, 0.8145623439825285, -2.25505036841393, 0.9130737074725098, 0.451782071117189, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.8332741293875633, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2941028969786567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.999510086915695, 2.000489913084302, 0, 1, 0.3331700289718986, 0, 0.4998775517234308, 1.10370523615614, 0.6668299710281014, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438245813286153, 2.455685276022412, 0, 3, 0.1813044821292522, 0, 1.22165492023442, 2.697354437281564, 0.5487407825461884, 1, 0.4529085623117528],
[0.9990192409883457, 2.000980759011651, 0, 3, 0.3330064136627823, 0, 1.499264791272554, 3.310303482936932, 0.2967324029782464, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.592542870009604, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9994086052817784, 2.000346061576221, 0, 1.5, 0.3331634471056856, 0, 0.7498702493597726, 1.655676910880768, 0.5445391344926984, 1, 0.4529085623117528],
[0.7611124988639486, 2.238631762319396, 1, 2, 0.253725795466212, 1.313866217533702, 0.8934028515381398, -0.9283625901206571, 0.8395377612123733, 0.5843810980773796, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.8325590019471429, 2.000894009443301, 0, 2, 0.2938319423686458, 0, 0.9995531950022929, 2.206964668321429, 0.4986733256188396, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 3, 1, 0.3333333333333333, 3.000000000000003, 0.5000000000000004, -5.519877979871718, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.4529085623117528],
[0.9990199224764589, 2.000834925801958, 0, 3, 0.3330227537674982, 0, 1.499374066952357, 3.310544758304405, 0.2967105953333684, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6789439576048572, 2.321056042395143, 0, 1, 0.2263146525349523, 0, 0.4308383691451415, 0.9512700906912429, 0.7736853474650477, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993070253807282, 2.000692974619269, 1, 1, 0.3331023417935765, 1.000693455166102, 0.4998268163511194, -1.105889092178872, 0.8890428298916353, 0.5552475134787882, 0.4529085623117528],
[0.6455950846189755, 1.982075536345365, 2, 0, 0.2456910236268675, 3.097917018963027, 0, -6.840049574577534, 0.9999999999999999, 0.06036407909081809, 0.4529085623117528],
[0.999509989439208, 2.000490010560789, 0, 1, 0.3331699964797363, 0, 0.4998775273662447, 1.103705182376661, 0.6668300035202637, 1, 0.4529085623117528],
[0.5447496107534966, 2.45510535677276, 0, 3, 0.1815919824959766, 0, 1.221943486752644, 2.697991578069432, 0.5481628835187203, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[1.188913653043675, 1.354911553110702, 0, 1, 0.4673723847720705, 0, 0.7380555562495051, 1.629590645145445, 0.5326276152279295, 1, 0.4529085623117528],
[0.6469803271347823, 1.592162378154565, 0, 1, 0.2889410869644317, 0, 0.6280766420062471, 1.386762570352821, 0.7110589130355682, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.999509962452544, 2.000490037547453, 0, 1, 0.3331699874841816, 0, 0.4998775206228835, 1.103705167487649, 0.6668300125158184, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457400220737552, 1.592584511818219, 1, 0, 0.2884925810784684, 1.548610843089081, 0, -3.419257156863195, 1, 0.2884925810784684, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.5434139530075042, 2.456586046992494, 0, 1, 0.1811379843358349, 0, 0.4070689895940192, 0.8987884607794616, 0.8188620156641652, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995099872462848, 2.000490012753712, 0, 2, 0.3331699957487619, 0, 0.9997550536365648, 2.207410362333575, 0.4446622545697062, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[2.384838251560849, 4.769676503121699, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1492006463152711],
[0.9996198530006051, 1.64881665849104, 1, 1, 0.3774377254894444, 1.000380291566093, 0.6064955705355245, -0.8696782392898184, 0.857540763377355, 0.6124162143562435, 0.4529085623117528],
[0.978589627501865, 2.021410372498132, 1, 1, 0.326196542500622, 1.02187880588188, 0.4947041004663312, -1.163976019187459, 0.8935958156606401, 0.5459889006618838, 0.4529085623117528],
[0.9802442149216501, 2.010456999185665, 0, 1, 0.3277640074166486, 0, 0.4973993477130074, 1.098233482657433, 0.6722359925833514, 1, 0.4529085623117528],
[1.16527702458366, 1.403527505770175, 0, 1, 0.453626194914547, 0, 0.7124904897758009, 1.573144226152582, 0.546373805085453, 1, 0.4529085623117528],
[0.6813247816555233, 2.313645833465787, 1, 2, 0.2274896382006494, 1.467728793850916, 0.8644365404034406, -1.332039850092762, 0.8682912697033007, 0.5389872462206049, 0.4529085623117528],
[1.103606187112102, 1.88104483835881, 1, 3.75, 0.3697605440950931, 0.9061203277745146, 1.993572892856627, 2.702494069114813, 0.4225965668738747, 0.8884032503659147, 0.4023885112311465],
[0.6396768562595817, 2.023988463273653, 0.5, 2.5, 0.2401491101636128, 0.7816446618432907, 1.235184906121665, 1.001394722951134, 0.6467012258785572, 0.5612823274016664, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2, 2, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 1.000000000000001, -2.207951191948687, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.4529085623117528],
[0.9909252355390811, 2.007605032228056, 1, 4, 0.3304703128032708, 1.009157869973896, 1.992423776483948, 2.171003130281374, 0.4665727376628087, 0.8654606910070468, 0.4529085623117528],
[0.6777959286367522, 2.153409560722192, 1.833333333333333, 3.166666666666667, 0.2394018841741587, 2.704845597141175, 1.470536178730746, -2.725294951612796, 0.8653137931394925, 0.411608989731288, 0.4529085623117528],
[0.9799207159478133, 2.016979688754624, 1.5, 1.5, 0.3269780718806068, 1.530736084652673, 0.7436862197289499, -1.737767687381387, 0.8571073853718911, 0.4729877332128801, 0.4529085623117528],
[0.6830650654526981, 1.837201800032882, 0, 1, 0.2710288639695669, 0, 0.5443060201563608, 1.352687775530678, 0.7289711360304331, 1, 0.4023885112311465],
[0.8572250530816018, 2.519426240411113, 1, 1, 0.2538683975847894, 1.166554799588676, 0.3969157675506398, -1.912676457096777, 0.9355508367077314, 0.4432876318773099, 0.4023885112311465],
[0.6118145171145806, 2.764284644323117, 1, 1, 0.1812193563811206, 1.634482301459872, 0.3617572459672899, -3.162925928472851, 0.9671595448728123, 0.3295982576350537, 0.4023885112311465],
[0.6115509403897258, 2.251100862328474, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.611814517107484, 2.251100862328474, 1, 0, 0.2137033184781108, 1.634482301478831, 0, -4.061950716430681, 1, 0.2137033184781107, 0.4023885112311465],
[0.6091482408660543, 2.224125888521504, 2, 0, 0.214997989268948, 3.2832730455833, 0, -7.249306634488637, 1, 0.04622413538969061, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.176025360870566, 0, 1, 0.2288539429583822, 0, 0.459553467520217, 1.014671626375415, 0.7711460570416179, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5758861321435174, 2.410708861618601, 0.75, 4.25, 0.1928236447681485, 1.302340789503664, 1.762966929630175, 1.017040035135052, 0.6495915665935946, 0.6573567681460035, 0.4529085623117528],
[0.999510086633753, 2.000344800996302, 0, 1, 0.3331861453549794, 0, 0.4999138146093288, 1.103785302838282, 0.6668138546450206, 1, 0.4529085623117528],
[0.9680653951203674, 2.03193460487963, 0, 4, 0.3226884650401228, 0, 1.968567290696325, 4.346500495924145, 0.2104524023708923, 1, 0.4529085623117528],
[0.978589627501865, 2.015656177097672, 3, 2, 0.3268234110902413, 3.065636417645642, 0.9922327144502314, -4.577974177861124, 0.9578694229358916, 0.2003273002762291, 0.4529085623117528],
[0.6521667539822714, 1.59560599436221, 1, 3, 0.2901390963399668, 1.53335016526645, 1.880163405376995, 0.7657467068856645, 0.669049547039235, 0.746082267928847, 0.4529085623117528],
[0.6655374489607196, 1.62632862599348, 0, 2, 0.2903910731232494, 0, 1.229763756250834, 2.715258351429322, 0.5035448291031736, 1, 0.4529085623117528],
[1.163047507910155, 1.409816183077484, 0, 2, 0.4520439664114885, 0, 1.418624657601961, 3.132254003680046, 0.3002558147460538, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6721227106535026, 1.97437439686023, 0, 2, 0.2539669167766189, 0, 1.012979100205372, 2.236608411717559, 0.5565653612637843, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.8573041492851111, 2.251100862328474, 0, 0, 0.2758019453970965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6120781757735683, 2.764573117719144, 1, 0, 0.1812678072364565, 1.63377823222689, 0, -4.060200991395574, 1, 0.1812678072364564, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6831418686503572, 1.836205275557245, 0, 0, 0.2711582920285575, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.613045840777259, 2.771859478658067, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[0.9401846777039349, 2.256603546290216, 0, 0, 0.2941028969786568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[0.613045840777259, 2.771859478658067, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[1.337345957332821, 1.526250477923383, 1, 1, 0.4670162111069851, 0.7477496712925218, 0.6552004500339947, -0.2299996612114093, 0.781895858563276, 0.715928280777246, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 1.792487313986843, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 2.230715970163253, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.611814479273461, 2.764836814219251, 1, 0, 0.1811897131493899, 1.634482402553655, 0, -4.061950967617833, 1, 0.1811897131493899, 0.4023885112311465],
[0.7267660027123998, 2.462226915226252, 2, 0, 0.227898280558797, 2.7519173881768, 0, -6.838956161439707, 1, 0.05193762628165621, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 2, 2, 0.3333333333333334, 1.776908385998535, 0.8884541929992676, -2.207951191948687, 0.8888888888888888, 0.4074074074074074, 0.4023885112311465],
[0.8932644648585354, 2.483386828634177, 0, 1, 0.2645415197536042, 0, 0.4026758894223435, 1.00071418090521, 0.7354584802463958, 1, 0.4023885112311465],
[0.6115509403897258, 2.764936952488773, 0, 1, 0.1811204303973887, 0, 0.3616718996430934, 0.8988126886041634, 0.8188795696026113, 1, 0.4023885112311465],
[0.7267946239414392, 1.793271550868379, 1, 1, 0.2884029916382208, 1.375904508727591, 0.5576400292057033, -2.033518494398183, 0.9168237144141242, 0.493629697690566, 0.4023885112311465],
[0, 3.37665129349271, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 2.230715970163253, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7641857667312157, 2.612465526761499, 0, 1, 0.2263146828942361, 0, 0.3827801705921969, 0.9512701280189237, 0.7736853171057639, 1, 0.4023885112311465],
[0.6125810152327521, 2.76407027825996, 1, 1, 0.1814167238450956, 1.632437139143215, 0.361785301866319, -3.157773648629316, 0.9670879723093124, 0.3299214199995034, 0.4023885112311465],
[0.8565129581284355, 2.52013833536428, 1, 0, 0.2536575096691379, 1.167524659737895, 0, -2.90148606918657, 1, 0.2536575096691379, 0.4023885112311465],
[1.339325126104518, 1.524481181280856, 2, 0, 0.4676730834241749, 1.493289389572703, 0, -3.711063680729453, 0.9999999999999998, 0.2187181129594754, 0.4023885112311465],
[0.7298316269965274, 2.231849285300954, 1, 3, 0.2464248001755094, 1.370179042685907, 1.344176786379849, -0.06461977810077529, 0.7442997909111949, 0.6775173236060773, 0.4023885112311465],
[1.336676176683169, 1.540328862177332, 7, 0, 0.4646068250240494, 5.236870471777102, 0, -13.01446320063759, 0.9999999999999994, 0.004673035677285386, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.8884541929992676, 1.776908385998535, 2.207951191948687, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.4023885112311465],
[0.00846643130313892, 3.367858267098259, 0, 3, 0.00250758800157685, 0, 0.8907738277789211, 2.213715856482862, 0.9924960842203192, 1, 0.4023885112311465],
[0.6123655879795096, 2.76373413018281, 1, 3, 0.1813825535677106, 1.633011422636409, 1.085487915511454, -1.360683746784305, 0.8470944107379268, 0.5509197202749484, 0.4023885112311465],
[0.7268129591725856, 2.23029006681034, 1, 1, 0.2457854707077704, 1.375869798934811, 0.4483721713517536, -2.304980390084419, 0.9395895023889598, 0.4311604438045005, 0.4023885112311465],
[0.7616967787104452, 2.238303221289556, 1, 1, 0.253898926236815, 1.312858381379796, 0.4467669931797127, -1.912287512912866, 0.9355353352557925, 0.4433331877294223, 0.4529085623117528],
[0.6900226153202065, 2.292997695925169, 1.5, 5.5, 0.2313167673444806, 2.173841794017029, 2.398606858512731, 0.4962702920617088, 0.6433860278349379, 0.674409458538725, 0.4529085623117528],
[0.7272874946493511, 2.230288305734664, 0, 1, 0.2459066288529002, 0, 0.4483725253944678, 1.11427765177149, 0.7540933711470998, 1, 0.4023885112311465],
[1.364829112625098, 2.010902327142049, 0, 1, 0.4043061887409035, 0, 0.4972891952545643, 1.235843423394619, 0.5956938112590966, 1, 0.4023885112311465],
[0.5661363866742937, 2.006362779018231, 1, 2, 0.2200725248911355, 1.766358820132355, 0.9968286996326033, -1.699084946797842, 0.8760213195362854, 0.52558036012361, 0.4529085623117528],
[0.6522037549509107, 2.190369160329333, 1, 1, 0.2294413457065572, 1.533263174903473, 0.4565440465979008, -2.377343282736238, 0.9473566688803641, 0.4062393602934785, 0.4529085623117528],
[1.338410770610487, 1.524241032107716, 0, 0, 0.4675422869591097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690977023915, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2137032951821118, 1.839692514211888, 0, -4.061951279573212, 1, 0.2137032951821117, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614411812878936, 2.238302783100888, 1, 1, 0.2538353907291026, 1.313299076244616, 0.446767080642515, -1.913260352551332, 0.9355675944134038, 0.4432383758716091, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455983599293371, 0, 1, 0.1811528117930405, 0, 0.4071688427755451, 0.8990089317306317, 0.8188471882069596, 1, 0.4529085623117528],
[0.9746231181381735, 2.025376881861826, 1, 1, 0.3248743727127246, 1.026037635871293, 0.4937352692012318, -1.175297644966269, 0.8944566419545137, 0.5442053873799628, 0.4529085623117528],
[0.9996550682695078, 2.000344931730489, 0, 2, 0.3332183560898362, 0, 0.999827563874101, 2.207570461398972, 0.4445977606555404, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.628070077586709, 1, 0, 0.3805073572917335, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3805073572917335, 0.4529085623117528],
[0.5438248990922314, 2.456175100907767, 0, 2, 0.1812749663640773, 0, 0.8142741937497978, 1.797877676662921, 0.6703106807021428, 1, 0.4529085623117528],
[0.544976819893639, 2.461496724726435, 1, 0, 0.1812677915855426, 1.834940429567566, 0, -4.060201341958988, 1, 0.1812677915855426, 0.4519333587240857],
[0.5438740623989822, 2.4559803120304, 0, 3, 0.1813001547791584, 0, 1.221508163279961, 2.69703040508904, 0.5487494839717233, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455684618747501, 0, 1, 0.1811708714170147, 0, 0.4072184157385978, 0.8991183864134923, 0.8188291285829853, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069205213842293, 1.634773027952181, 1, 2, 0.2707419671898912, 1.647662197546489, 1.223411425196637, -0.9367249984950058, 0.8197877907070343, 0.6121679777264125, 0.4529085623117528],
[1.189033332819805, 1.354991180562256, 2, 0, 0.4673828127697904, 1.682038631547005, 0, -3.713859201427945, 1, 0.2184466936726009, 0.4529085623117528],
[0.9987529067709101, 2.000877704136075, 0, 1, 0.3329586326860832, 0, 0.4997806702193091, 1.103491326523636, 0.6670413673139168, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435691730619658, 2.456430826938032, 1, 0, 0.1811897243539888, 1.839692259159814, 0, -4.061950716430681, 1, 0.1811897243539887, 0.4529085623117528],
[1.759550761293976, 1.239959192484112, 1, 1, 0.5866127428841174, 0.5683268832009134, 0.8064781535242449, 0.5258263811744933, 0.6558854898859724, 0.8291109756542071, 0.4529085623117528],
[1.759128795144762, 1.240726064722354, 1, 1, 0.5864046353304859, 0.5684632090384877, 0.8059796827301898, 0.5244247811950423, 0.6561296036629197, 0.8289388743238917, 0.4529085623117528],
[0.6785954221828722, 2.321404577817128, 1, 1, 0.2261984740609574, 1.473632104359398, 0.430773683120899, -2.302580494207268, 0.9488342503324945, 0.4012311984544091, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.628070008436116, 1, 0, 0.380507367303761, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.380507367303761, 0.4529085623117528],
[1.761675466108025, 1.238324533891974, 0, 0, 0.5872251553693418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.207951191948687, 0.4444444444444445, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.999318596515269, 2.000479571729629, 0, 2, 0.3331286108158216, 0, 0.9997602716186628, 2.207421883383368, 0.444717449712436, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069819328945282, 2.226292196493031, 1, 0, 0.2142333940082718, 1.647495495016265, 0, -3.637589641951251, 1, 0.2142333940082718, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.982109610698179, 0, 1, 0.2457413935382265, 0, 0.5045129666909589, 1.11394000615887, 0.7542586064617735, 1, 0.4529085623117528],
[1.000282190134992, 1.761323076969063, 0, 2, 0.3622104150981481, 0, 1.135510018662595, 2.50715069917575, 0.4067755546092767, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995099687010844, 2.000490031298913, 0, 3, 0.3331699895670284, 0, 1.49963256655276, 3.311115512805233, 0.2965141413514331, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438246133768285, 2.456175386623169, 0, 1, 0.1812748711256097, 0, 0.4071370495145434, 0.8989387337621071, 0.8187251288743903, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089416557, 0, 1, 0.1811412469130288, 0, 0.4071370987796888, 0.8989388425371436, 0.8188587530869712, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6782507123920404, 2.32174928760796, 1, 0, 0.2260835707973468, 1.474381053686211, 0, -3.255361404873029, 1, 0.2260835707973468, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 3, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.500000000000001, 1.103975595974344, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4529085623117528],
[0.002344965396849728, 2.997655034603146, 0.5, 1.25, 0.0007816551322832438, 213.2227625498055, 0.4169926110812431, -469.8647533897638, 0.999316051746187, 0.001367495496632176, 0.4529085623117528],
[0.7616967502146623, 2.238047573727935, 1, 2, 0.2539205572072075, 1.312858430495048, 0.8936360529050696, -0.9256225482913538, 0.8393164375126261, 0.5847064163193072, 0.4529085623117528],
[0.5439695690259623, 2.455739249934747, 0, 4, 0.1813407906752856, 0, 1.628837426492363, 3.596393537314442, 0.4491719285251238, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737761218, 2.238137288892948, 1, 1, 0.2538266321046586, 1.313456923203535, 0.4468001158653814, -1.913535930772718, 0.9355720408344064, 0.4432253050437235, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737761218, 2.238421554074184, 1, 1, 0.2538025789125659, 1.313456923203535, 0.4467433751162221, -1.913661211577456, 0.9355842509373309, 0.4431894087624625, 0.4529085623117528],
[0.3545667775772246, 2.645433222422774, 1, 0, 0.1181889258590749, 2.820343199757908, 0, -6.227180129609842, 1, 0.1181889258590749, 0.4529085623117528],
[0.9993066928497008, 2.000693307150296, 0, 1, 0.3331022309499005, 0, 0.4998267332759552, 1.103593031504463, 0.6668977690500995, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089693797, 0, 1, 0.1811412468962862, 0, 0.4071370987337334, 0.8989388424356762, 0.8188587531037138, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.646348361644151, 1.591976172247823, 1, 1, 0.2887643645313075, 1.54715329896752, 0.6281501051539168, -2.029114197185395, 0.9166151417768302, 0.4941438708394451, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[1.000202855279466, 1.761265317643675, 1, 1, 0.3621996679471796, 0.9997971858624521, 0.5677736284149735, -0.9538869286160718, 0.868811400538953, 0.5932107364333119, 0.4529085623117528],
[0.9993185795221052, 2.000681420477892, 0, 1, 0.3331061931740354, 0, 0.4998297029024918, 1.103599588294914, 0.6668938068259646, 1, 0.4529085623117528],
[0.6067354386524979, 2.227075574316026, 0, 1, 0.214105822821586, 0, 0.4490193379751459, 0.9914127824902329, 0.785894177178414, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321545912475824, 0, 1, 0.1896536066761759, 0, 0.4307474578151009, 0.951069362911718, 0.8103463933238241, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.543824700539326, 2.456175299460672, 0, 1, 0.1812749001797755, 0, 0.4071370639626498, 0.8989387656628206, 0.8187250998202246, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995100866384666, 2.000489913361531, 1, 1, 0.3331700288794892, 1.000490153494279, 0.4998775516541576, -1.10532819093743, 0.8889977318564403, 0.5553377896154188, 0.4529085623117528],
[0.6461612170953308, 1.98150940386901, 0, 1, 0.245906473946949, 0, 0.5046657856114349, 1.114277422876487, 0.754093526053051, 1, 0.4529085623117528],
[0.3542183361176297, 2.645781663882369, 0, 0, 0.1180727787058766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.3549115593141681, 2.64508844068583, 0, 1, 0.1183038531047228, 0, 0.3780591925087827, 0.8347362447269242, 0.8816961468952772, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457400225583756, 2.187534106829186, 1, 0, 0.2279130056144473, 1.548610841926867, 0, -3.419257154297082, 1, 0.2279130056144473, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744185095911, 2, 0, 0.3333617596355224, 2.000000000000002, 0, -4.415902383897374, 1, 0.1111300627872919, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.592542870009604, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089411855, 0, 1, 0.1811412469133128, 0, 0.4071370987804683, 0.8989388425388646, 0.8188587530866872, 1, 0.4529085623117528],
[1.189058746874499, 1.354755472949743, 1, 0, 0.4674314411830962, 0.8410013404539942, 0, -1.856889912085839, 1, 0.4674314411830962, 0.4529085623117528],
[0.9993185965687686, 2.000681403431229, 0, 1, 0.3331061988562565, 0, 0.4998297071612552, 1.103599597698056, 0.6668938011437435, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9987199441192134, 2.001280055880784, 0, 1.75, 0.3329066480397381, 0, 0.8744403337541916, 1.930721577200573, 0.4924096689104753, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993315137098531, 2.000668486290144, 1, 1, 0.3331105045699513, 1.000668933462996, 0.4998329342680396, -1.105821441393315, 0.8890373917451523, 0.5552584008850552, 0.4529085623117528],
[0.6069136841779709, 2.226539327212471, 1, 1, 0.2141957822269105, 1.647680759339677, 0.4491274812791903, -2.646347138907656, 0.9541201668762019, 0.3825117313300229, 0.4529085623117528],
[0.9992752750026498, 2.000724724997347, 0, 1, 0.3330917583342169, 0, 0.4998188843801717, 1.103575701525662, 0.6669082416657831, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6456300088257436, 2.187823198987703, 1, 1, 0.2278597744424977, 1.548874721326501, 0.4570753251280523, -2.41063977820522, 0.948079923191014, 0.4037994720760095, 0.4529085623117528],
[1.001773636022355, 1.996629897130816, 2, 3, 0.3341023397770856, 1.996459008385573, 1.502531843438306, -1.090567072581153, 0.7889828753446257, 0.5406127971565095, 0.4529085623117528],
[0.9996551116049682, 2.000344888395029, 0, 1, 0.3332183705349897, 0, 0.4999137927671798, 1.103785254611883, 0.6667816294650103, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737756894, 2.238650326224311, 1, 0, 0.2537832245918964, 1.313456923204281, 0, -2.900048779162145, 1, 0.2537832245918964, 0.4529085623117528],
[0.543803421709369, 1.999999999999998, 1, 0, 0.213775725383665, 1.838899793709723, 0, -4.060200991395574, 1, 0.213775725383665, 0.4529085623117528],
[0.9979198520562519, 2.002080147943745, 0, 1, 0.3326399506854176, 0, 0.4994805033290297, 1.10282857268046, 0.6673600493145824, 1, 0.4529085623117528],
[0.645740022559491, 1.981930598404849, 1, 0, 0.2457461819634411, 1.548610841924192, 0, -3.419257154291176, 1, 0.2457461819634411, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.000202871145215, 1.761265283459966, 1, 1, 0.362199676095203, 0.9997971700031391, 0.5677736394346696, -0.9538868692685314, 0.8688113946365299, 0.5932107468269361, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.003675517278120767, 2.996324482721875, 0, 2, 0.001225172426040258, 0, 0.6674844502098755, 1.473773087448107, 0.997551156195393, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993185965152689, 2.000681403484728, 0, 1, 0.3331061988384233, 0, 0.4998297071478894, 1.103599597668545, 0.6668938011615767, 1, 0.4529085623117528],
[0.001816916753518583, 1.786616862050495, 0, 2, 0.001015926211555687, 0, 1.119434190106437, 2.471656054353619, 0.997969179682956, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456174711400373, 0, 1, 0.181141269741534, 0, 0.4071371614398945, 0.8989389808878193, 0.818858730258466, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455194838303841, 0, 1, 0.1812004639022151, 0, 0.4072996506830573, 0.8992977492059396, 0.8187995360977849, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6460553054018202, 1.982035792926792, 1.25, 2.5, 0.2458268306653039, 1.934818876260989, 1.261329391185389, -1.487031911337579, 0.8190269490433608, 0.5467674459414286, 0.4529085623117528],
[0.9986136107264624, 2.001386389273535, 0, 1, 0.3328712035754878, 0, 0.4996536427745873, 1.103210856125653, 0.6671287964245123, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614412027764528, 2.000026894187094, 1, 1, 0.2757378235199305, 1.313299039182129, 0.4999932765436375, -1.795739428036392, 0.9239686526804917, 0.4754442997203527, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744258992808, 0, 1, 0.3333617514233559, 0, 0.5000639434282762, 1.104116779943022, 0.6666382485766441, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.186215010662715, 0, 1, 0.2280305163091708, 0, 0.4574115515275264, 1.009942380406299, 0.7719694836908292, 1, 0.4529085623117528],
[1.18703089438516, 1.357779054384369, 0, 1, 0.4664516872700515, 0, 0.7364968525408654, 1.626149103434059, 0.5335483127299485, 1, 0.4529085623117528],
[0.6493439970659085, 1.591440621134464, 1, 1, 0.2897842085275524, 1.540015776720116, 0.6283614900360823, -2.012888168929142, 0.91602511248806, 0.4955935295431648, 0.4529085623117528]
],
"RESOLVED": [
[0.5455047693983337, 2.454371372141176, 0, 3, 0.1818424307072843, 0, 1.222308911378323, 2.698798417807267, 0.5476597931182826, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.982109555157666, 0, 1, 0.2457413987319739, 0, 0.5045129808278712, 1.113940037372482, 0.7542586012680261, 1, 0.4529085623117528],
[0.5439132062125196, 2.455907955591249, 1, 2, 0.1813152107659208, 1.8385286265862, 0.8143627677277949, -2.261308228819563, 0.9132959327193805, 0.4512807901748173, 0.4529085623117528],
[0.9967766565937861, 2.003223343406211, 1, 1, 0.3322588855312623, 1.003233766947582, 0.4991954608015075, -1.112891978843021, 0.8896040329855235, 0.5541218040480481, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9985297993622868, 2.00147020063771, 0, 2, 0.3328432664540959, 0, 0.9992654396566875, 2.20632931856311, 0.4450981071156405, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995101423094582, 1.999999808275496, 0, 2, 0.3332244795902534, 0, 1.000000095862261, 2.207951403607879, 0.4445895946176883, 1, 0.4529085623117528],
[0.5436605607215192, 2.456339439278479, 1, 2, 0.1812201869071732, 1.839383012578381, 0.8142197157358174, -2.263510523205583, 0.913380547504683, 0.451089700259855, 0.4529085623117528],
[0.6068720055938646, 2.226581030030408, 0, 1, 0.2141810709278819, 0, 0.4491190693322053, 0.9916329844589269, 0.7858189290721181, 1, 0.4529085623117528],
[0.9994413081469466, 1.630145764646701, 1, 3, 0.3800753808411257, 1.000559004164126, 1.840326224231969, 1.854165034508229, 0.5098897905981012, 0.8523084883558871, 0.4529085623117528],
[0.7605036753972048, 2.239240579063145, 1, 2, 0.2535228375773716, 1.314918037020279, 0.8931599483771242, -0.9312212745336531, 0.8397682795881005, 0.5840419087662416, 0.4529085623117528],
[0.5442633338275169, 2.45524592948476, 1, 1, 0.1814507927961862, 1.837345890944972, 0.4072911751898731, -3.15749101420331, 0.9670756097936356, 0.3299771953860078, 0.4529085623117528],
[0.5440591152811773, 2.45594088471882, 1, 1, 0.1813530384270592, 1.83803555884398, 0.4071759243970929, -3.159268235388264, 0.9671110754532737, 0.3298171523073919, 0.4529085623117528],
[0.9996198530006237, 1.628450229249142, 1, 1, 0.3803627078867306, 1.000380291566074, 0.6140807880023987, -0.8529304493426022, 0.8553242104490736, 0.6160496262225349, 0.4529085623117528],
[0.6469573992703173, 1.591367134621657, 1, 1, 0.2890364598494548, 1.545696828149532, 0.6283905066556167, -2.025367585924555, 0.9164579248776945, 0.4945308445766041, 0.4529085623117528],
[0.6067355744157246, 1.634040048754543, 0, 1, 0.2707703386907209, 0, 0.6119801046260737, 1.35122220145802, 0.7292296613092791, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.000608926683219, 1.997920681951678, 1, 3, 0.3336998653612608, 0.9993914438828387, 1.501561111559963, 1.108766116308181, 0.5919409802954132, 0.8029031860078853, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744271769898, 0, 1, 0.3333617500034372, 0, 0.5000639402331869, 1.104116772888421, 0.6666382499965628, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9749515533922815, 2.025048446607717, 0, 1, 0.3249838511307606, 0, 0.4938153463316698, 1.090320182535563, 0.6750161488692394, 1, 0.4529085623117528],
[0.6787988590923072, 2.321201140907693, 0, 2, 0.2262662863641024, 0, 0.8616228747922769, 1.902421253407861, 0.5986638596167972, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690922828682, 2.45643090771713, 1, 0, 0.1811896974276229, 1.839692532554094, 0, -4.061951320071908, 1, 0.1811896974276228, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 2.238324533891975, 0, 2, 0.2538918220360087, 0, 0.8935254784177438, 1.972860645108977, 0.556677413224747, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9996551495448774, 2.00034485045512, 2, 1, 0.3332183831816261, 2.000689938835967, 0.4999138022488869, -3.313640459625586, 0.9630012664681802, 0.2591060056068915, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2758019453970965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9965338673854116, 2.003466132614586, 1, 1, 0.3321779557951375, 1.003478188477109, 0.4991349660076204, -1.113565219202748, 0.8896578056837638, 0.5540137172740386, 0.4529085623117528],
[0.6461620190155266, 2.186629647932129, 0, 2, 0.2281007906634266, 0, 0.914649630718845, 2.019501742361098, 0.5958283893744271, 1, 0.4529085623117528],
[0.9985294502759385, 2.001470549724059, 0, 1, 0.3328431500919798, 0, 0.4996326326849372, 1.103164466873167, 0.6671568499080203, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690813698946, 2.456430918630103, 1, 0, 0.181189693789965, 1.839692569488712, 0, -4.061951401621741, 1, 0.181189693789965, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.453977963665683, 0, 1, 0.1812740292094829, 0, 0.4075016217774948, 0.8997436915246421, 0.8187259707905171, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993069202062559, 2.000693079793741, 0, 1, 0.333102306735419, 0, 0.4998267900757141, 1.103593156915558, 0.666897693264581, 1, 0.4529085623117528],
[0.6458402413023928, 1.98242079459412, 1, 1, 0.2457291085175995, 1.54837053507755, 0.5044337724497787, -2.304961419363039, 0.9396172052271458, 0.4310754222623449, 0.4529085623117528],
[1.15027525483766, 1.714460542573627, 0, 0, 0.4015292634933748, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690921589096, 2.456430907841088, 1, 0, 0.1811896973863033, 1.839692532973628, 0, -4.061951320998219, 1, 0.1811896973863033, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438034949386843, 2.456196505061313, 1, 0, 0.1812678316462282, 1.838899546080985, 0, -4.060200444643408, 1, 0.1812678316462282, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9989269211133046, 2.000894148589848, 0, 2, 0.3329955013657376, 0, 0.9995531254911819, 2.206964514844289, 0.4448950011983439, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5438246133806155, 2.456175386619382, 0, 1, 0.181274871126872, 0, 0.4071370495151711, 0.898938733763493, 0.8187251288731281, 1, 0.4529085623117528],
[0.6068720214534987, 2.021198037037969, 0, 1, 0.2309192707753948, 0, 0.4947560712385625, 1.092397257215033, 0.7690807292246052, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.0005833596192740104, 1.786694197433705, 0, 1, 0.0003263956496135415, 0, 0.5596928682235254, 1.235774535519311, 0.9996736043503864, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069553251889418, 2.226497775068733, 2, 1, 0.2142104717151468, 3.295135435836915, 0.4491358631468336, -6.283828148806514, 0.9901707112631397, 0.1179998011035567, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7616754661080264, 2.238324533891975, 0, 0, 0.2538918220360087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457399634776003, 2.187313856844039, 1, 1, 0.2279307081445734, 1.548610983614132, 0.4571817605740622, -2.409822453938948, 0.9480475922847134, 0.4039090085738601, 0.4529085623117528],
[1.000817066567164, 1.997904534740621, 1, 2, 0.3337479098195356, 0.9991836004855849, 1.001048831524701, 0.004118339096076249, 0.7401878003613179, 0.7042561286759021, 0.4529085623117528],
[1.000202885657104, 1.999307200981349, 1, 1, 0.3334554166403988, 0.9997971554971359, 0.5001732597717626, -1.103145176092883, 0.888807485113178, 0.5557183183939758, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6068720214521411, 2.021198037047273, 0, 1, 0.2309192707741799, 0, 0.4947560712362849, 1.092397257210004, 0.76908072922582, 1, 0.4529085623117528],
[1.000161216333587, 1.999693671293581, 0, 2, 0.3334031990876387, 0, 1.000153187816122, 2.208289423169885, 0.4443512949865942, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.3549106775913853, 2.645089322408613, 0, 1, 0.1183035591971285, 0, 0.3780590664852868, 0.8347359664731961, 0.8816964408028715, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5450866643802292, 2.45491333561977, 3, 0, 0.1816955547934098, 5.503711971033156, 0, -12.15192740658491, 0.9999999999999999, 0.005998365249751281, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.151586928294352, 1.713439059504353, 1, 0, 0.4019464162624071, 0.868366925179611, 0, -1.917311787499137, 1, 0.4019464162624071, 0.4529085623117528],
[0.9988284687499134, 2.001171531250084, 0, 2, 0.3329428229166381, 0, 0.9994145772954546, 2.20665860719039, 0.4449652774984237, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.7616967786126462, 2.238303221387355, 1, 1, 0.2538989262042153, 1.312858381548363, 0.446766993160192, -1.912287513328153, 0.9355353352723466, 0.443333187680777, 0.4529085623117528],
[0.6792883093293146, 2.320711690670686, 0, 2, 0.2264294364431048, 0, 0.8618045955643892, 1.902822484003248, 0.5984114168017323, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.207951191948687, 0.4444444444444445, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 1, 0.1811116657406323, 0, 0.4070559066332436, 0.8987595742406229, 0.8188883342593677, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 0, -4.415902383897374, 1, 0.1111111111111109, 0.4529085623117528],
[0.9749141483756629, 2.025085851624336, 0, 0, 0.3249713827918878, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0, 1.78611948476847, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614412026384705, 2.23855879736153, 1, 1, 0.2538137342128234, 1.313299039420115, 0.446715985829207, -1.913373086098576, 0.935578588324942, 0.4432060567505892, 0.4529085623117528],
[0.7614411812832299, 2.000026908902227, 1, 1, 0.2757378164134761, 1.31329907625266, 0.4999932728649531, -1.79573951800867, 0.9239686565995281, 0.4754442894264803, 0.4529085623117528],
[0.6457400220737552, 2.187534107313807, 1, 0, 0.2279130054434012, 1.548610843089081, 0, -3.419257156863195, 1, 0.2279130054434012, 0.4529085623117528],
[0.8330729099116219, 2.000201219475939, 0, 1, 0.2940318768560874, 0, 0.4999497001916657, 1.103864536452576, 0.7059681231439126, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435693735074149, 2.455940713126337, 1, 1, 0.1812193851021332, 1.839691580758935, 0.407175952845796, -3.162924588135934, 0.9671595344632047, 0.3295983046674712, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744193557344, 1, 2, 0.3333617586952029, 1.000000000000001, 1.000127919582654, 0.0002824401949935247, 0.7407028394502926, 0.703741602570217, 0.4529085623117528],
[0.5440586820931117, 2.454961796537606, 1, 3, 0.1814121263825167, 1.838037022316753, 1.222014943055773, -1.360146684170989, 0.8470512736199103, 0.5509846094285991, 0.4529085623117528],
[0.3545668284018837, 2.645433171598115, 1, 0, 0.118188942800628, 2.820342795481562, 0, -6.227179236987401, 1, 0.118188942800628, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0, 2.999999999999996, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.761441202633852, 2.238558797366149, 1, 0, 0.2538137342112839, 1.31329903942808, 0, -2.899700179490293, 1, 0.2538137342112838, 0.4529085623117528],
[0.3560403389256013, 2.643959661074397, 0, 3, 0.1186801129752005, 0, 1.134661789348527, 2.505277850250708, 0.6845429629840334, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6071571198056698, 2.226612172892107, 0, 3, 0.2142577807481463, 0, 1.347338362972908, 2.974857344484222, 0.4851100449288804, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.002452759891094, 1.997291511878817, 0, 2, 0.3341794063330693, 0, 1.001356080524588, 2.210945351559327, 0.4433170629509841, 1, 0.4529085623117528],
[0.9983298592223371, 2.00167014077766, 0, 3, 0.3327766197407793, 0, 1.49874843955782, 3.309163403552921, 0.2970392011189588, 1, 0.4529085623117528],
[0.6466245556862872, 1.981845175504096, 1, 3, 0.2460079901294672, 1.546492460278843, 1.51374084972956, -0.07231395755052779, 0.7449995196477881, 0.6768032577558254, 0.4529085623117528],
[0.9988302958847963, 2.000990741068944, 3, 3, 0.3329632946701011, 3.00351322177558, 1.499257312103992, -3.321323628755236, 0.9002278903967071, 0.3188851748716545, 0.4529085623117528],
[0.6789439927160893, 2.321056007283911, 0, 1, 0.2263146642386964, 0, 0.4308383756625483, 0.9512701050813589, 0.7736853357613036, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 2, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.000000000000001, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.4529085623117528],
[1.000816712460516, 1.998927559314472, 1, 2, 0.3336340106979584, 0.9991839540144092, 1.000536508029284, 0.002986373249317002, 0.7403397472353961, 0.7041044260699654, 0.4529085623117528],
[0.9997442730715237, 2.000255726928474, 0, 1, 0.3332480910238415, 0, 0.4999360764413693, 1.10383445587687, 0.6667519089761584, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995096569987233, 2.000490343001274, 0, 1, 0.3331698856662414, 0, 0.4998774442968472, 1.103704998963486, 0.6668301143337585, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.5446937674264749, 2.455306232573523, 1, 2, 0.1815645891421585, 1.83589396428147, 0.8145623439825285, -2.25505036841393, 0.9130737074725098, 0.451782071117189, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.8332741293875633, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2941028969786567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.999510086915695, 2.000489913084302, 0, 1, 0.3331700289718986, 0, 0.4998775517234308, 1.10370523615614, 0.6668299710281014, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438245813286153, 2.455685276022412, 0, 3, 0.1813044821292522, 0, 1.22165492023442, 2.697354437281564, 0.5487407825461884, 1, 0.4529085623117528],
[0.9990192409883457, 2.000980759011651, 0, 3, 0.3330064136627823, 0, 1.499264791272554, 3.310303482936932, 0.2967324029782464, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.592542870009604, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993070065510008, 2.000692993448996, 0, 1, 0.3331023355170006, 0, 0.499826811646948, 1.10359320454379, 0.6668976644829994, 1, 0.4529085623117528],
[0.7611124988639486, 2.238631762319396, 1, 2, 0.253725795466212, 1.313866217533702, 0.8934028515381398, -0.9283625901206571, 0.8395377612123733, 0.5843810980773796, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.8325590019471429, 2.000894009443301, 0, 2, 0.2938319423686458, 0, 0.9995531950022929, 2.206964668321429, 0.4986733256188396, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 3, 1, 0.3333333333333333, 3.000000000000003, 0.5000000000000004, -5.519877979871718, 0.9876543209876545, 0.1111111111111109, 0.4529085623117528],
[0.9990199224764589, 2.000834925801958, 0, 3, 0.3330227537674982, 0, 1.499374066952357, 3.310544758304405, 0.2967105953333684, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6789439576048572, 2.321056042395143, 0, 1, 0.2263146525349523, 0, 0.4308383691451415, 0.9512700906912429, 0.7736853474650477, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993070253807282, 2.000692974619269, 1, 1, 0.3331023417935765, 1.000693455166102, 0.4998268163511194, -1.105889092178872, 0.8890428298916353, 0.5552475134787882, 0.4529085623117528],
[0.6455950846189755, 1.982075536345365, 2, 0, 0.2456910236268675, 3.097917018963027, 0, -6.840049574577534, 0.9999999999999999, 0.06036407909081809, 0.4529085623117528],
[0.999509989439208, 2.000490010560789, 0, 1, 0.3331699964797363, 0, 0.4998775273662447, 1.103705182376661, 0.6668300035202637, 1, 0.4529085623117528],
[0.5447496107534966, 2.45510535677276, 0, 3, 0.1815919824959766, 0, 1.221943486752644, 2.697991578069432, 0.5481628835187203, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[1.188913653043675, 1.354911553110702, 0, 1, 0.4673723847720705, 0, 0.7380555562495051, 1.629590645145445, 0.5326276152279295, 1, 0.4529085623117528],
[0.6469803271347823, 1.592162378154565, 0, 1, 0.2889410869644317, 0, 0.6280766420062471, 1.386762570352821, 0.7110589130355682, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.999509962452544, 2.000490037547453, 0, 1, 0.3331699874841816, 0, 0.4998775206228835, 1.103705167487649, 0.6668300125158184, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457400220737552, 1.592584511818219, 1, 0, 0.2884925810784684, 1.548610843089081, 0, -3.419257156863195, 1, 0.2884925810784684, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.5434139530075042, 2.456586046992494, 0, 1, 0.1811379843358349, 0, 0.4070689895940192, 0.8987884607794616, 0.8188620156641652, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995099872462848, 2.000490012753712, 0, 2, 0.3331699957487619, 0, 0.9997550536365648, 2.207410362333575, 0.4446622545697062, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[2.384838251560849, 4.769676503121699, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1492006463152711],
[0.9996198530006051, 1.64881665849104, 1, 1, 0.3774377254894444, 1.000380291566093, 0.6064955705355245, -0.8696782392898184, 0.857540763377355, 0.6124162143562435, 0.4529085623117528],
[0.978589627501865, 2.021410372498132, 1, 1, 0.326196542500622, 1.02187880588188, 0.4947041004663312, -1.163976019187459, 0.8935958156606401, 0.5459889006618838, 0.4529085623117528],
[0.9802442149216501, 2.010456999185665, 0, 1, 0.3277640074166486, 0, 0.4973993477130074, 1.098233482657433, 0.6722359925833514, 1, 0.4529085623117528],
[1.16527702458366, 1.403527505770175, 0, 1, 0.453626194914547, 0, 0.7124904897758009, 1.573144226152582, 0.546373805085453, 1, 0.4529085623117528],
[0.6813247816555233, 2.313645833465787, 1, 2, 0.2274896382006494, 1.467728793850916, 0.8644365404034406, -1.332039850092762, 0.8682912697033007, 0.5389872462206049, 0.4529085623117528],
[1.103713241993927, 1.88071272636611, 1, 3, 0.3698242991098303, 0.9060324384560587, 1.595139947713633, 1.712542704435529, 0.5279088092506565, 0.8422945825486636, 0.4023885112311465],
[0.6396768562595817, 2.023988463273653, 0.5, 2.5, 0.2401491101636128, 0.7816446618432907, 1.235184906121665, 1.001394722951134, 0.6467012258785572, 0.5612823274016664, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 2, 2, 0.3333333333333333, 2.000000000000002, 1.000000000000001, -2.207951191948687, 0.8888888888888891, 0.4074074074074072, 0.4529085623117528],
[0.9909252355390811, 2.007605032228056, 1, 4, 0.3304703128032708, 1.009157869973896, 1.992423776483948, 2.171003130281374, 0.4665727376628087, 0.8654606910070468, 0.4529085623117528],
[0.6777959286367522, 2.153409560722192, 1.833333333333333, 3.166666666666667, 0.2394018841741587, 2.704845597141175, 1.470536178730746, -2.725294951612796, 0.8653137931394925, 0.411608989731288, 0.4529085623117528],
[0.9799207159478133, 2.016979688754624, 1.5, 1.5, 0.3269780718806068, 1.530736084652673, 0.7436862197289499, -1.737767687381387, 0.8571073853718911, 0.4729877332128801, 0.4529085623117528],
[0.6830650654526981, 1.837201800032882, 0, 1, 0.2710288639695669, 0, 0.5443060201563608, 1.352687775530678, 0.7289711360304331, 1, 0.4023885112311465],
[0.8572250530816018, 2.519426240411113, 1, 1, 0.2538683975847894, 1.166554799588676, 0.3969157675506398, -1.912676457096777, 0.9355508367077314, 0.4432876318773099, 0.4023885112311465],
[0.6118145171145806, 2.764284644323117, 1, 1, 0.1812193563811206, 1.634482301459872, 0.3617572459672899, -3.162925928472851, 0.9671595448728123, 0.3295982576350537, 0.4023885112311465],
[0.6115509403897258, 2.251100862328474, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.611814517107484, 2.251100862328474, 1, 0, 0.2137033184781108, 1.634482301478831, 0, -4.061950716430681, 1, 0.2137033184781107, 0.4023885112311465],
[0.6091482408660543, 2.224125888521504, 2, 0, 0.214997989268948, 3.2832730455833, 0, -7.249306634488637, 1, 0.04622413538969061, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.176025360870566, 0, 1, 0.2288539429583822, 0, 0.459553467520217, 1.014671626375415, 0.7711460570416179, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5758861321435174, 2.410708861618601, 0.75, 4.25, 0.1928236447681485, 1.302340789503664, 1.762966929630175, 1.017040035135052, 0.6495915665935946, 0.6573567681460035, 0.4529085623117528],
[0.999510086633753, 2.000344800996302, 0, 1, 0.3331861453549794, 0, 0.4999138146093288, 1.103785302838282, 0.6668138546450206, 1, 0.4529085623117528],
[0.9680653951203674, 2.03193460487963, 0, 4, 0.3226884650401228, 0, 1.968567290696325, 4.346500495924145, 0.2104524023708923, 1, 0.4529085623117528],
[0.978589627501865, 2.015656177097672, 3, 2, 0.3268234110902413, 3.065636417645642, 0.9922327144502314, -4.577974177861124, 0.9578694229358916, 0.2003273002762291, 0.4529085623117528],
[0.6521667539822714, 1.59560599436221, 1, 3, 0.2901390963399668, 1.53335016526645, 1.880163405376995, 0.7657467068856645, 0.669049547039235, 0.746082267928847, 0.4529085623117528],
[0.6655374489607196, 1.62632862599348, 0, 2, 0.2903910731232494, 0, 1.229763756250834, 2.715258351429322, 0.5035448291031736, 1, 0.4529085623117528],
[1.163047507910155, 1.409816183077484, 0, 2, 0.4520439664114885, 0, 1.418624657601961, 3.132254003680046, 0.3002558147460538, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6721227106535026, 1.97437439686023, 0, 2, 0.2539669167766189, 0, 1.012979100205372, 2.236608411717559, 0.5565653612637843, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.8573041492851111, 2.251100862328474, 0, 0, 0.2758019453970965, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6120781757735683, 2.764573117719144, 1, 0, 0.1812678072364565, 1.63377823222689, 0, -4.060200991395574, 1, 0.1812678072364564, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6831418686503572, 1.836205275557245, 0, 0, 0.2711582920285575, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.613045840777259, 2.771859478658067, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[0.9401846777039349, 2.256603546290216, 0, 0, 0.2941028969786568, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[0.613045840777259, 2.771859478658067, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4014072946542334],
[1.337345957332821, 1.526250477923383, 1, 1, 0.4670162111069851, 0.7477496712925218, 0.6552004500339947, -0.2299996612114093, 0.781895858563276, 0.715928280777246, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 1.792487313986843, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 2.230715970163253, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.611814479273461, 2.764836814219251, 1, 0, 0.1811897131493899, 1.634482402553655, 0, -4.061950967617833, 1, 0.1811897131493899, 0.4023885112311465],
[0.7267660027123998, 2.462226915226252, 2, 0, 0.227898280558797, 2.7519173881768, 0, -6.838956161439707, 1, 0.05193762628165621, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 2, 2, 0.3333333333333334, 1.776908385998535, 0.8884541929992676, -2.207951191948687, 0.8888888888888888, 0.4074074074074074, 0.4023885112311465],
[0.8932644648585354, 2.483386828634177, 0, 1, 0.2645415197536042, 0, 0.4026758894223435, 1.00071418090521, 0.7354584802463958, 1, 0.4023885112311465],
[0.6115509403897258, 2.764936952488773, 0, 1, 0.1811204303973887, 0, 0.3616718996430934, 0.8988126886041634, 0.8188795696026113, 1, 0.4023885112311465],
[0.7267946239414392, 1.793271550868379, 1, 1, 0.2884029916382208, 1.375904508727591, 0.5576400292057033, -2.033518494398183, 0.9168237144141242, 0.493629697690566, 0.4023885112311465],
[0, 3.37665129349271, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7268598302207614, 2.230715970163253, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.7641857667312157, 2.612465526761499, 0, 1, 0.2263146828942361, 0, 0.3827801705921969, 0.9512701280189237, 0.7736853171057639, 1, 0.4023885112311465],
[0.6125810152327521, 2.76407027825996, 1, 1, 0.1814167238450956, 1.632437139143215, 0.361785301866319, -3.157773648629316, 0.9670879723093124, 0.3299214199995034, 0.4023885112311465],
[0.8565129581284355, 2.52013833536428, 1, 0, 0.2536575096691379, 1.167524659737895, 0, -2.90148606918657, 1, 0.2536575096691379, 0.4023885112311465],
[1.339325126104518, 1.524481181280856, 2, 0, 0.4676730834241749, 1.493289389572703, 0, -3.711063680729453, 0.9999999999999998, 0.2187181129594754, 0.4023885112311465],
[0.7298316269965274, 2.231849285300954, 1, 3, 0.2464248001755094, 1.370179042685907, 1.344176786379849, -0.06461977810077529, 0.7442997909111949, 0.6775173236060773, 0.4023885112311465],
[1.336676176683169, 1.540328862177332, 7, 0, 0.4646068250240494, 5.236870471777102, 0, -13.01446320063759, 0.9999999999999994, 0.004673035677285386, 0.4023885112311465],
[1.125550431164237, 2.251100862328474, 1, 4, 0.3333333333333334, 0.8884541929992676, 1.776908385998535, 2.207951191948687, 0.4609053497942386, 0.8683127572016461, 0.4023885112311465],
[0.00846643130313892, 3.367858267098259, 0, 3, 0.00250758800157685, 0, 0.8907738277789211, 2.213715856482862, 0.9924960842203192, 1, 0.4023885112311465],
[0.6123655879795096, 2.76373413018281, 1, 3, 0.1813825535677106, 1.633011422636409, 1.085487915511454, -1.360683746784305, 0.8470944107379268, 0.5509197202749484, 0.4023885112311465],
[0.7268129591725856, 2.23029006681034, 1, 1, 0.2457854707077704, 1.375869798934811, 0.4483721713517536, -2.304980390084419, 0.9395895023889598, 0.4311604438045005, 0.4023885112311465],
[0.7616967787104452, 2.238303221289556, 1, 1, 0.253898926236815, 1.312858381379796, 0.4467669931797127, -1.912287512912866, 0.9355353352557925, 0.4433331877294223, 0.4529085623117528],
[0.6900226153202065, 2.292997695925169, 1.5, 5.5, 0.2313167673444806, 2.173841794017029, 2.398606858512731, 0.4962702920617088, 0.6433860278349379, 0.674409458538725, 0.4529085623117528],
[0.7272874946493511, 2.230288305734664, 0, 1, 0.2459066288529002, 0, 0.4483725253944678, 1.11427765177149, 0.7540933711470998, 1, 0.4023885112311465],
[1.364829112625098, 2.010902327142049, 0, 1, 0.4043061887409035, 0, 0.4972891952545643, 1.235843423394619, 0.5956938112590966, 1, 0.4023885112311465],
[0.5661363866742937, 2.006362779018231, 1, 2, 0.2200725248911355, 1.766358820132355, 0.9968286996326033, -1.699084946797842, 0.8760213195362854, 0.52558036012361, 0.4529085623117528],
[0.6522037549509107, 2.190369160329333, 1, 1, 0.2294413457065572, 1.533263174903473, 0.4565440465979008, -2.377343282736238, 0.9473566688803641, 0.4062393602934785, 0.4529085623117528],
[1.338410770610487, 1.524241032107716, 0, 0, 0.4675422869591097, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4023885112311465],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435690977023915, 1.999999999999998, 1, 0, 0.2137032951821118, 1.839692514211888, 0, -4.061951279573212, 1, 0.2137032951821117, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614411812878936, 2.238302783100888, 1, 1, 0.2538353907291026, 1.313299076244616, 0.446767080642515, -1.913260352551332, 0.9355675944134038, 0.4432383758716091, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455983599293371, 0, 1, 0.1811528117930405, 0, 0.4071688427755451, 0.8990089317306317, 0.8188471882069596, 1, 0.4529085623117528],
[0.9746231181381735, 2.025376881861826, 1, 1, 0.3248743727127246, 1.026037635871293, 0.4937352692012318, -1.175297644966269, 0.8944566419545137, 0.5442053873799628, 0.4529085623117528],
[0.9996550682695078, 2.000344931730489, 0, 2, 0.3332183560898362, 0, 0.999827563874101, 2.207570461398972, 0.4445977606555404, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.628070077586709, 1, 0, 0.3805073572917335, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3805073572917335, 0.4529085623117528],
[0.5438248990922314, 2.456175100907767, 0, 2, 0.1812749663640773, 0, 0.8142741937497978, 1.797877676662921, 0.6703106807021428, 1, 0.4529085623117528],
[0.544976819893639, 2.461496724726435, 1, 0, 0.1812677915855426, 1.834940429567566, 0, -4.060201341958988, 1, 0.1812677915855426, 0.4519333587240857],
[0.5438740623989822, 2.4559803120304, 0, 3, 0.1813001547791584, 0, 1.221508163279961, 2.69703040508904, 0.5487494839717233, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455684618747501, 0, 1, 0.1811708714170147, 0, 0.4072184157385978, 0.8991183864134923, 0.8188291285829853, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069205213842293, 1.634773027952181, 1, 2, 0.2707419671898912, 1.647662197546489, 1.223411425196637, -0.9367249984950058, 0.8197877907070343, 0.6121679777264125, 0.4529085623117528],
[1.189033332819805, 1.354991180562256, 2, 0, 0.4673828127697904, 1.682038631547005, 0, -3.713859201427945, 1, 0.2184466936726009, 0.4529085623117528],
[0.9987529067709101, 2.000877704136075, 0, 1, 0.3329586326860832, 0, 0.4997806702193091, 1.103491326523636, 0.6670413673139168, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5435691730619658, 2.456430826938032, 1, 0, 0.1811897243539888, 1.839692259159814, 0, -4.061950716430681, 1, 0.1811897243539887, 0.4529085623117528],
[1.759550761293976, 1.239959192484112, 1, 1, 0.5866127428841174, 0.5683268832009134, 0.8064781535242449, 0.5258263811744933, 0.6558854898859724, 0.8291109756542071, 0.4529085623117528],
[1.759128795144762, 1.240726064722354, 1, 1, 0.5864046353304859, 0.5684632090384877, 0.8059796827301898, 0.5244247811950423, 0.6561296036629197, 0.8289388743238917, 0.4529085623117528],
[0.6785954221828722, 2.321404577817128, 1, 1, 0.2261984740609574, 1.473632104359398, 0.430773683120899, -2.302580494207268, 0.9488342503324945, 0.4012311984544091, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.628070008436116, 1, 0, 0.380507367303761, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.380507367303761, 0.4529085623117528],
[1.761675466108025, 1.238324533891974, 0, 0, 0.5872251553693418, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1.000000000000001, 2.207951191948687, 0.4444444444444445, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.999318596515269, 2.000479571729629, 0, 2, 0.3331286108158216, 0, 0.9997602716186628, 2.207421883383368, 0.444717449712436, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6069819328945282, 2.226292196493031, 1, 0, 0.2142333940082718, 1.647495495016265, 0, -3.637589641951251, 1, 0.2142333940082718, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.982109610698179, 0, 1, 0.2457413935382265, 0, 0.5045129666909589, 1.11394000615887, 0.7542586064617735, 1, 0.4529085623117528],
[1.000282190134992, 1.761323076969063, 0, 2, 0.3622104150981481, 0, 1.135510018662595, 2.50715069917575, 0.4067755546092767, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995099687010844, 2.000490031298913, 0, 3, 0.3331699895670284, 0, 1.49963256655276, 3.311115512805233, 0.2965141413514331, 1, 0.4529085623117528],
[0.5438246133768285, 2.456175386623169, 0, 1, 0.1812748711256097, 0, 0.4071370495145434, 0.8989387337621071, 0.8187251288743903, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.98188895708197, 0, 0, 0.2457620292018839, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089416557, 0, 1, 0.1811412469130288, 0, 0.4071370987796888, 0.8989388425371436, 0.8188587530869712, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6782507123920404, 2.32174928760796, 1, 0, 0.2260835707973468, 1.474381053686211, 0, -3.255361404873029, 1, 0.2260835707973468, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 3, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 1.500000000000001, 1.103975595974344, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.4529085623117528],
[0.00180608671071796, 2.998193913289278, 0, 2, 0.0006020289035726543, 0, 0.6670682610404699, 1.472854162075442, 0.9987963046316555, 1, 0.4529085623117528],
[0.7616967502146623, 2.238047573727935, 1, 2, 0.2539205572072075, 1.312858430495048, 0.8936360529050696, -0.9256225482913538, 0.8393164375126261, 0.5847064163193072, 0.4529085623117528],
[0.5439695690259623, 2.455739249934747, 0, 4, 0.1813407906752856, 0, 1.628837426492363, 3.596393537314442, 0.4491719285251238, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737761218, 2.238137288892948, 1, 1, 0.2538266321046586, 1.313456923203535, 0.4468001158653814, -1.913535930772718, 0.9355720408344064, 0.4432253050437235, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 1.999999999999998, 0, 0, 0.2136309207459441, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737761218, 2.238421554074184, 1, 1, 0.2538025789125659, 1.313456923203535, 0.4467433751162221, -1.913661211577456, 0.9355842509373309, 0.4431894087624625, 0.4529085623117528],
[0.3545667775772246, 2.645433222422774, 1, 0, 0.1181889258590749, 2.820343199757908, 0, -6.227180129609842, 1, 0.1181889258590749, 0.4529085623117528],
[0.9993066928497008, 2.000693307150296, 0, 1, 0.3331022309499005, 0, 0.4998267332759552, 1.103593031504463, 0.6668977690500995, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089693797, 0, 1, 0.1811412468962862, 0, 0.4071370987337334, 0.8989388424356762, 0.8188587531037138, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.646348361644151, 1.591976172247823, 1, 1, 0.2887643645313075, 1.54715329896752, 0.6281501051539168, -2.029114197185395, 0.9166151417768302, 0.4941438708394451, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[1.000202855279466, 1.761265317643675, 1, 1, 0.3621996679471796, 0.9997971858624521, 0.5677736284149735, -0.9538869286160718, 0.868811400538953, 0.5932107364333119, 0.4529085623117528],
[0.9993185795221052, 2.000681420477892, 0, 1, 0.3331061931740354, 0, 0.4998297029024918, 1.103599588294914, 0.6668938068259646, 1, 0.4529085623117528],
[0.6067354386524979, 2.227075574316026, 0, 1, 0.214105822821586, 0, 0.4490193379751459, 0.9914127824902329, 0.785894177178414, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321545912475824, 0, 1, 0.1896536066761759, 0, 0.4307474578151009, 0.951069362911718, 0.8103463933238241, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000004, 1.103975595974344, 0.6666666666666667, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.189116661104267, 1.35421833611763, 0, 0, 0.4675422869591098, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.543824700539326, 2.456175299460672, 0, 1, 0.1812749001797755, 0, 0.4071370639626498, 0.8989387656628206, 0.8187250998202246, 1, 0.4529085623117528],
[0.9995100866384666, 2.000489913361531, 1, 1, 0.3331700288794892, 1.000490153494279, 0.4998775516541576, -1.10532819093743, 0.8889977318564403, 0.5553377896154188, 0.4529085623117528],
[0.6461612170953308, 1.98150940386901, 0, 1, 0.245906473946949, 0, 0.5046657856114349, 1.114277422876487, 0.754093526053051, 1, 0.4529085623117528],
[0.3542183361176297, 2.645781663882369, 0, 0, 0.1180727787058766, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.3549115593141681, 2.64508844068583, 0, 1, 0.1183038531047228, 0, 0.3780591925087827, 0.8347362447269242, 0.8816961468952772, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457400225583756, 2.187534106829186, 1, 0, 0.2279130056144473, 1.548610841926867, 0, -3.419257154297082, 1, 0.2279130056144473, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744185095911, 2, 0, 0.3333617596355224, 2.000000000000002, 0, -4.415902383897374, 1, 0.1111300627872919, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 1.592542870009604, 0, 0, 0.288511185086951, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456175089411855, 0, 1, 0.1811412469133128, 0, 0.4071370987804683, 0.8989388425388646, 0.8188587530866872, 1, 0.4529085623117528],
[1.189058746874499, 1.354755472949743, 1, 0, 0.4674314411830962, 0.8410013404539942, 0, -1.856889912085839, 1, 0.4674314411830962, 0.4529085623117528],
[0.9993185965687686, 2.000681403431229, 0, 1, 0.3331061988562565, 0, 0.4998297071612552, 1.103599597698056, 0.6668938011437435, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.9989652588823585, 2.001034741117639, 0, 1, 0.3329884196274531, 0, 0.4997414484875308, 1.103404726854206, 0.6670115803725469, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993315137098531, 2.000668486290144, 1, 1, 0.3331105045699513, 1.000668933462996, 0.4998329342680396, -1.105821441393315, 0.8890373917451523, 0.5552584008850552, 0.4529085623117528],
[0.6069136841779709, 2.226539327212471, 1, 1, 0.2141957822269105, 1.647680759339677, 0.4491274812791903, -2.646347138907656, 0.9541201668762019, 0.3825117313300229, 0.4529085623117528],
[0.9992752750026498, 2.000724724997347, 0, 1, 0.3330917583342169, 0, 0.4998188843801717, 1.103575701525662, 0.6669082416657831, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 0, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0, -2.207951191948687, 1, 0.3333333333333333, 0.4529085623117528],
[0.6456300088257436, 2.187823198987703, 1, 1, 0.2278597744424977, 1.548874721326501, 0.4570753251280523, -2.41063977820522, 0.948079923191014, 0.4037994720760095, 0.4529085623117528],
[1.001773636022355, 1.996629897130816, 2, 3, 0.3341023397770856, 1.996459008385573, 1.502531843438306, -1.090567072581153, 0.7889828753446257, 0.5406127971565095, 0.4529085623117528],
[0.9996551116049682, 2.000344888395029, 0, 1, 0.3332183705349897, 0, 0.4999137927671798, 1.103785254611883, 0.6667816294650103, 1, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7613496737756894, 2.238650326224311, 1, 0, 0.2537832245918964, 1.313456923204281, 0, -2.900048779162145, 1, 0.2537832245918964, 0.4529085623117528],
[0.543803421709369, 1.999999999999998, 1, 0, 0.213775725383665, 1.838899793709723, 0, -4.060200991395574, 1, 0.213775725383665, 0.4529085623117528],
[0.9979198520562519, 2.002080147943745, 0, 1, 0.3326399506854176, 0, 0.4994805033290297, 1.10282857268046, 0.6673600493145824, 1, 0.4529085623117528],
[0.645740022559491, 1.981930598404849, 1, 0, 0.2457461819634411, 1.548610841924192, 0, -3.419257154291176, 1, 0.2457461819634411, 0.4529085623117528],
[0.6785991998106071, 2.321400800189393, 0, 0, 0.2261997332702024, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[1.000202871145215, 1.761265283459966, 1, 1, 0.362199676095203, 0.9997971700031391, 0.5677736394346696, -0.9538868692685314, 0.8688113946365299, 0.5932107468269361, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.003675517278120767, 2.996324482721875, 0, 2, 0.001225172426040258, 0, 0.6674844502098755, 1.473773087448107, 0.997551156195393, 1, 0.4529085623117528],
[0.9993185965152689, 2.000681403484728, 0, 1, 0.3331061988384233, 0, 0.4998297071478894, 1.103599597668545, 0.6668938011615767, 1, 0.4529085623117528],
[0.001816916753518583, 1.786616862050495, 0, 2, 0.001015926211555687, 0, 1.119434190106437, 2.471656054353619, 0.997969179682956, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.321400800189393, 0, 0, 0.189663213519683, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.187492465505191, 0, 0, 0.2279277028594343, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456174711400373, 0, 1, 0.181141269741534, 0, 0.4071371614398945, 0.8989389808878193, 0.818858730258466, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 1, 1, 0.3333333333333333, 1.000000000000001, 0.5000000000000004, -1.103975595974344, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.455194838303841, 0, 1, 0.1812004639022151, 0, 0.4072996506830573, 0.8992977492059396, 0.8187995360977849, 1, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999999999999998, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.6460621214441559, 1.981829104020207, 2, 2, 0.2458481215598995, 3.095677541858295, 1.009168750192907, -4.606909573569006, 0.9515219326571454, 0.2547322067325565, 0.4529085623117528],
[0.9986136107264624, 2.001386389273535, 0, 1, 0.3328712035754878, 0, 0.4996536427745873, 1.103210856125653, 0.6671287964245123, 1, 0.4529085623117528],
[0.5433349972218966, 2.456665002778101, 0, 0, 0.1811116657406323, 0, 0, 0, 1, 1, 0.4529085623117528],
[0.7614412027764528, 2.000026894187094, 1, 1, 0.2757378235199305, 1.313299039182129, 0.4999932765436375, -1.795739428036392, 0.9239686526804917, 0.4754442997203527, 0.4529085623117528],
[0.9999999999999991, 1.999744258992808, 0, 1, 0.3333617514233559, 0, 0.5000639434282762, 1.104116779943022, 0.6666382485766441, 1, 0.4529085623117528],
[0.6457816638823707, 2.186215010662715, 0, 1, 0.2280305163091708, 0, 0.4574115515275264, 1.009942380406299, 0.7719694836908292, 1, 0.4529085623117528],
[1.18703089438516, 1.357779054384369, 0, 1, 0.4664516872700515, 0, 0.7364968525408654, 1.626149103434059, 0.5335483127299485, 1, 0.4529085623117528],
[0.6493439970659085, 1.591440621134464, 1, 1, 0.2897842085275524, 1.540015776720116, 0.6283614900360823, -2.012888168929142, 0.91602511248806, 0.4955935295431648, 0.4529085623117528]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1024":{
"Global MG94xREV":0.0009720924959577413,
"Nucleotide GTR":0.0009642578153907593,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1025":{
"Global MG94xREV":0.0006193489172141957,
"Nucleotide GTR":0.0006143572102047725,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1032":{
"Global MG94xREV":0.0005640301873733476,
"Nucleotide GTR":0.000559484327420122,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1038":{
"Global MG94xREV":0.0009720770988531882,
"Nucleotide GTR":0.0009642425423807723,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1041":{
"Global MG94xREV":0.0009705853355988183,
"Nucleotide GTR":0.0009627628021474882,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "V", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "GTT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1056":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.0004653767103277664,
"Nucleotide GTR":0.0004616259583325671,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "D", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAC", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1071":{
"Global MG94xREV":0.0009718783048551833,
"Nucleotide GTR":0.0009640453505836672,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1075":{
"Global MG94xREV":0.0009717106502328375,
"Nucleotide GTR":0.000963879047191186,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1083":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1086":{
"Global MG94xREV":0.0009717856675877535,
"Nucleotide GTR":0.0009639534599359282,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACA", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1092":{
"Global MG94xREV":0.0005889173430479834,
"Nucleotide GTR":0.0005841709024753793,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1102":{
"Global MG94xREV":0.000591295153869873,
"Nucleotide GTR":0.0005865295490836627,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "CTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1105":{
"Global MG94xREV":0.0005910718363402804,
"Nucleotide GTR":0.000586308031404924,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1108":{
"Global MG94xREV":0.000591295153869873,
"Nucleotide GTR":0.0005865295490836627,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node113":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node116":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAT", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1183":{
"Global MG94xREV":0.0005907928219498236,
"Nucleotide GTR":0.0005860312657599642,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "E", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "GAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node133":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node141":{
"Global MG94xREV":0.000505527388897253,
"Nucleotide GTR":0.0005014530383325275,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node145":{
"Global MG94xREV":0.0009716985947808297,
"Nucleotide GTR":0.000963867088901348,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node148":{
"Global MG94xREV":0.0009715082184545109,
"Nucleotide GTR":0.0009636782469328291,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.000919365438278022,
"Nucleotide GTR":0.0009119557169159264,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAT", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.0009722823434944004,
"Nucleotide GTR":0.000964446132831453,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node296":{
"Global MG94xREV":0.0009719094743483141,
"Nucleotide GTR":0.0009640762688630271,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node308":{
"Global MG94xREV":0.0009712694488896375,
"Nucleotide GTR":0.0009634414017560964,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAC", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.0009710344175044315,
"Nucleotide GTR":0.0009632082646307808,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "Y", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "TAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node411":{
"Global MG94xREV":0.0009712694485347104,
"Nucleotide GTR":0.0009634414014040285,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.0004655733175057488,
"Nucleotide GTR":0.0004618209809345528,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.0009719536790293398,
"Nucleotide GTR":0.0009641201172718278,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node563":{
"Global MG94xREV":0.0009716985947808297,
"Nucleotide GTR":0.000963867088901348,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node580":{
"Global MG94xREV":0.0009721253753888726,
"Nucleotide GTR":0.0009642904298266939,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.0009711317651304809,
"Nucleotide GTR":0.000963304827673515,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "I", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ATT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node587":{
"Global MG94xREV":0.0005871394767149302,
"Nucleotide GTR":0.0005824073650409329,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node593":{
"Global MG94xREV":0.0006965504798104276,
"Nucleotide GTR":0.0006909365587784417,
"amino-acid": [
["G", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node609":{
"Global MG94xREV":0.0009722035691961251,
"Nucleotide GTR":0.0009643679934228265,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node615":{
"Global MG94xREV":0.0005899905345280843,
"Nucleotide GTR":0.0005852354444571372,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "V", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node620":{
"Global MG94xREV":0.0009722035691961251,
"Nucleotide GTR":0.0009643679934228265,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "L", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CTA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node641":{
"Global MG94xREV":0.0005034641793401502,
"Nucleotide GTR":0.0004994064574274205,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node642":{
"Global MG94xREV":0.0004682063521419797,
"Nucleotide GTR":0.0004644327943543017,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0009723476063794103,
"Nucleotide GTR":0.0009645108697234538,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node653":{
"Global MG94xREV":0.0009711301365058718,
"Nucleotide GTR":0.0009633032121749746,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node656":{
"Global MG94xREV":0.0009718959276629737,
"Nucleotide GTR":0.0009640628313586061,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node662":{
"Global MG94xREV":0.0009717861223914839,
"Nucleotide GTR":0.0009639539110741197,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node675":{
"Global MG94xREV":0.0004429215987907232,
"Nucleotide GTR":0.0004393518261022473,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node676":{
"Global MG94xREV":0.0005287393214375931,
"Nucleotide GTR":0.0005244778918885605,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node681":{
"Global MG94xREV":0.0009722618509336161,
"Nucleotide GTR":0.0009644258054325952,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690":{
"Global MG94xREV":0.0009720482028879344,
"Nucleotide GTR":0.0009642138793055537,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690_1":{
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node693":{
"Global MG94xREV":0.0009717353332879155,
"Nucleotide GTR":0.0009639035313106146,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "I", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "ATT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node696":{
"Global MG94xREV":0.0009723363289476497,
"Nucleotide GTR":0.0009644996831833259,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "F", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.00048550595406203,
"Nucleotide GTR":0.0004815929683335508,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node704":{
"Global MG94xREV":0.000486006394703511,
"Nucleotide GTR":0.000482089375621637,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node719":{
"Global MG94xREV":0.0009719121992734086,
"Nucleotide GTR":0.0009640789718263055,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.0009716958311979454,
"Nucleotide GTR":0.0009638643475918472,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node767":{
"Global MG94xREV":0.0009720602424740742,
"Nucleotide GTR":0.000964225821857398,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node770":{
"Global MG94xREV":0.000972188718473853,
"Nucleotide GTR":0.0009643532623914939,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "S", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGT", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node775":{
"Global MG94xREV":0.0009722110825333952,
"Nucleotide GTR":0.0009643754462055746,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node779":{
"Global MG94xREV":0.0004628606761616671,
"Nucleotide GTR":0.0004591302024054927,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node780":{
"Global MG94xREV":0.0005088387615494811,
"Nucleotide GTR":0.0005047377226324882,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node786":{
"Global MG94xREV":0.0009715304627723225,
"Nucleotide GTR":0.0009637003119702499,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node803":{
"Global MG94xREV":0.0008611164660317071,
"Nucleotide GTR":0.0008541762083192145,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "A", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GCA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node806":{
"Global MG94xREV":0.0009714673091596636,
"Nucleotide GTR":0.0009636376673506964,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node811":{
"Global MG94xREV":0.0002869077989919281,
"Nucleotide GTR":0.0002845954357480754,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node812":{
"Global MG94xREV":0.0002970405024005357,
"Nucleotide GTR":0.000294646473579779,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node823":{
"Global MG94xREV":0.000971541171243436,
"Nucleotide GTR":0.0009637109341353253,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node831":{
"Global MG94xREV":0.0009711079612695685,
"Nucleotide GTR":0.0009632812156622946,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node832":{
"Global MG94xREV":0.0009712318250215003,
"Nucleotide GTR":0.0009634040811214354,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node837":{
"Global MG94xREV":0.0005913561648462581,
"Nucleotide GTR":0.0005865900683357382,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node847":{
"Global MG94xREV":0.00029431566469142,
"Nucleotide GTR":0.0002919435969835577,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node852":{
"Global MG94xREV":0.0005913561648462581,
"Nucleotide GTR":0.0005865900683357382,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCT", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node857":{
"Global MG94xREV":0.000441876554278918,
"Nucleotide GTR":0.0004383152042353669,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node858":{
"Global MG94xREV":0.0005297827637719833,
"Nucleotide GTR":0.0005255129244909413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node866":{
"Global MG94xREV":0.0005913684186189582,
"Nucleotide GTR":0.0005866022233478832,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node87":{
"Global MG94xREV":0.0005057207883436676,
"Nucleotide GTR":0.0005016448790559907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "I", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATT", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node872":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "S", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "AGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node875":{
"Global MG94xREV":0.000591661472816435,
"Nucleotide GTR":0.0005868929156445784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "V", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "GTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node881":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node884":{
"Global MG94xREV":0.0005919688534927615,
"Nucleotide GTR":0.0005871978189543766,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node887":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node893":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node896":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAT", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node899":{
"Global MG94xREV":0.000591661472816435,
"Nucleotide GTR":0.0005868929156445784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node902":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node905":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node908":{
"Global MG94xREV":0.000591295153869873,
"Nucleotide GTR":0.0005865295490836627,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAG", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node91":{
"Global MG94xREV":0.000591661472816435,
"Nucleotide GTR":0.0005868929156445784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.000591661472816435,
"Nucleotide GTR":0.0005868929156445784,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "T", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ACC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node954":{
"Global MG94xREV":0.0009710031833737852,
"Nucleotide GTR":0.0009631772822348604,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node97":{
"Global MG94xREV":0.0005913806723916686,
"Nucleotide GTR":0.0005866143783600381,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node977":{
"Global MG94xREV":0.0009717358677755367,
"Nucleotide GTR":0.0009639040614904764,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node989":{
"Global MG94xREV":0.0009712490600961673,
"Nucleotide GTR":0.0009634211772882264,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node992":{
"Global MG94xREV":0.0009720845857540209,
"Nucleotide GTR":0.0009642499689401464,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node998":{
"Global MG94xREV":0.0004923689153635719,
"Nucleotide GTR":0.0004884006168847479,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node999":{
"Global MG94xREV":0.000479177557212953,
"Nucleotide GTR":0.0004753155758570211,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718890792584197,
"Nucleotide GTR":0.0009640560381494797,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "D", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAC", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009712803784242803,
"Nucleotide GTR":0.0009634522432030171,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "D", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "GAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "IV", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "RTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414010_England_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009712611562186775,
"Nucleotide GTR":0.0009634331759207801,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAG", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717668526344996,
"Nucleotide GTR":0.0009639347966237476,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "F", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "TTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719927226780153,
"Nucleotide GTR":0.0009641588462441571,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "S", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "TCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719062452831576,
"Nucleotide GTR":0.0009640730658228548,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "N", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "AAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCG", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038054505,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290420485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "E", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "GAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720335315627672,
"Nucleotide GTR":0.0009641993262254595,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "I", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "ATA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124602880113,
"Nucleotide GTR":0.0009636824545788307,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAC", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009715119379962767,
"Nucleotide GTR":0.0009636819364965616,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "L", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "CTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCM", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417236_England_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "Y", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "TAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417240_England_20200303_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724795925431703,
"Nucleotide GTR":0.000964641792131,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "I", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ATA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCM", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417312_England_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038054505,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290420485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCG", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972123440712866,
"Nucleotide GTR":0.0009642885107434103,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "K", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "AAA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "HY", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "YAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "G", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GGA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716230605728797,
"Nucleotide GTR":0.0009637921634692031,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "K", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAA", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTR", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418715_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "Y", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "TAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009709847801858067,
"Nucleotide GTR":0.0009631590273692888,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAC", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCW", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001946374800153743,
"Nucleotide GTR":0.001930687790032546,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "DAGV", "F", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GNT", "TTC", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "IV", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "RTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "MV", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "RTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009723531319072946,
"Nucleotide GTR":0.0009645163507177712,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "V", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "GTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717668619841647,
"Nucleotide GTR":0.0009639348058980558,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "D", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAT", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124602880113,
"Nucleotide GTR":0.0009636824545788307,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAC", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719245041262648,
"Nucleotide GTR":0.0009640911775069195,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420696_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "PL", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CYA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420697_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717056704923537,
"Nucleotide GTR":0.0009638741075854388,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "T", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ACT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420725_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "RC", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "YGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420726_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009242236207849835,
"Nucleotide GTR":0.0009167747443957291,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAC", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "TI", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "AYT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726190445219939,
"Nucleotide GTR":0.0009647801201820972,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "K", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "AAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124602880113,
"Nucleotide GTR":0.0009636824545788307,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "A", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GCT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719056235700715,
"Nucleotide GTR":0.0009640724491205312,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAA", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718760039613231,
"Nucleotide GTR":0.0009640430682341003,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATT", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718760230916502,
"Nucleotide GTR":0.0009640430872102452,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAT", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "C", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TGC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DA", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GMT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124865374033,
"Nucleotide GTR":0.0009636824806166638,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "A", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GCT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719693930669063,
"Nucleotide GTR":0.0009641357046604756,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAG", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421775_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "RS", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGW", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421895_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DV", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GWT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421947_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGW", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "NY", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "WAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421953_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "GV", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GKT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421956_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "YAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QH", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAK", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421964_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "RM", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AKG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "PS", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "YCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003793648296017734,
"Nucleotide GTR":0.0003763072993043616,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAG", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "ED", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAM", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGR", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038551036,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290913002,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "V", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "GTT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124865374033,
"Nucleotide GTR":0.0009636824806166638,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAC", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717671027402408,
"Nucleotide GTR":0.0009639350447137353,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAA", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719017923170955,
"Nucleotide GTR":0.0009640686487459363,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "V", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "GTT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423052_England_20200319_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TWA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423060_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QP", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CMG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423068_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "PS", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "YCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423130_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "LF", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "YTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423227_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009732603107629589,
"Nucleotide GTR":0.0009654162180711018,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "D", "Q", "VL", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GAT", "CAA", "KTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423324_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "GC", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "KGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423328_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000465903151587225,
"Nucleotide GTR":0.0004621481566839468,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "F", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "TTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423354_England_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTK", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "TI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AYT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423446_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725038947775024,
"Nucleotide GTR":0.0009646658984989469,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "N", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AAT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423453_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009712783239790608,
"Nucleotide GTR":0.0009634502053158129,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "L", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "CTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423548_England_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "AG", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GSA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423579_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "QE", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "SAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423639_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "NI", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AWT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAR", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423740_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716230543586902,
"Nucleotide GTR":0.0009637921573050962,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "I", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "ATT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423752_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGY", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423780_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "AS", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "KCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423825_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716456468220816,
"Nucleotide GTR":0.0009638145676821797,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACG", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423913_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800148220406365,
"Nucleotide GTR":0.002777580134613794,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "I", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "ATT", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423927_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAY", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423933_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "AG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GSA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424007_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009739968550470777,
"Nucleotide GTR":0.0009661468260999643,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "LF", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "E", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTN", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GAA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424062_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGY", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424138_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718754314913775,
"Nucleotide GTR":0.0009640425003780355,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAT", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721523064690666,
"Nucleotide GTR":0.0009643171438530481,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972120535599463,
"Nucleotide GTR":0.0009642856290440719,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACC", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714229121091303,
"Nucleotide GTR":0.0009635936281228122,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "P", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "CCA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "A", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "GCG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719062452462722,
"Nucleotide GTR":0.0009640730657862694,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "Q", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CAG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "ND", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "RAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425023_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124602880113,
"Nucleotide GTR":0.0009636824545788307,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAC", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720127510410673,
"Nucleotide GTR":0.0009641787131865329,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009723316529610617,
"Nucleotide GTR":0.0009644950448833379,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTC", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425404_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCG", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425485_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718017792431922,
"Nucleotide GTR":0.0009639694417378041,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "C", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TGC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425585_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716450854171894,
"Nucleotide GTR":0.000963814010801987,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGG", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038551036,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290913002,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCG", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721234511034078,
"Nucleotide GTR":0.0009642885210502105,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "M", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "ATG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713221691347126,
"Nucleotide GTR":0.0009634936970968732,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "N", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "AAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728322451622516,
"Nucleotide GTR":0.0009649916025096229,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "V", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GTC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718727261455639,
"Nucleotide GTR":0.0009640398168362371,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "V", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GTG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTT", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009812165769131217,
"Nucleotide GTR":0.0009733083598667911,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "-", "-", "-", "I", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "---", "---", "---", "ATA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717440592881594,
"Nucleotide GTR":0.0009639121869827517,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "L", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "CTT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972030387624341,
"Nucleotide GTR":0.0009641962076259304,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "TTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.05052005108060629,
"Nucleotide GTR":0.05011287947493077,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "A", "G", "F", "K", "F", "L", "-", "I", "S", "T", "L", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "E", "V", "S", "G", "N", "C", "W", "T", "T", "P", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "L", "-", "-", "L", "N", "-", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "GCT", "GGG", "TTT", "AAA", "TTC", "TTG", "---", "ATT", "TCT", "ACT", "CTG", "AGT", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "GAA", "GTT", "TCA", "GGT", "AAT", "TGT", "TGG", "ACA", "ACA", "CCA", "TCA", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTC", "TTA", "---", "---", "TTG", "AAC", "---", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 1.5, 1, 2, 2.166666666666667, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2.25, 0, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0.5, 1, 1, 0.8333333333333334, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.75, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001943630774809272,
"Nucleotide GTR":0.00192796588044571,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAC", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTC", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "KR", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ARA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711137412860118,
"Nucleotide GTR":0.0009632869490940956,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "C", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TGC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAY", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719434927362337,
"Nucleotide GTR":0.000964110013076212,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "G", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GGA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009723013673778581,
"Nucleotide GTR":0.0009644650033899431,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "K", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AAG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711137597835499,
"Nucleotide GTR":0.0009632869674425497,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "G", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GGT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009711137597835499,
"Nucleotide GTR":0.0009632869674425497,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTG", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971113741334892,
"Nucleotide GTR":0.0009632869491425816,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "G", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GGC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711137413710076,
"Nucleotide GTR":0.0009632869491784054,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCG", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "L", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CTA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429008_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720395738409457,
"Nucleotide GTR":0.0009642053198052692,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "I", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "ATA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971192459225355,
"Nucleotide GTR":0.0009633650325980189,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "V", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "GTT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717446466257981,
"Nucleotide GTR":0.0009639127695866835,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "T", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "ACG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "V", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GTT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009720385258956313,
"Nucleotide GTR":0.0009642042803059768,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "L", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CTC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719777931257319,
"Nucleotide GTR":0.0009641440370181524,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "TI", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "AYC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "IM", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATR", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725438921734739,
"Nucleotide GTR":0.0009647055735317471,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "C", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGT", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGY", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009711773289649445,
"Nucleotide GTR":0.0009633500242815158,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTC", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "VF", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "KTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711477059224787,
"Nucleotide GTR":0.0009633206399890413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "M", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATG", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTY", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "KAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "GC", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "KGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "GV", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GKC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "SL", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "C", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TYA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "TGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "VL", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "KTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "AV", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GYT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009731334575653129,
"Nucleotide GTR":0.000965290387259996,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "T", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "ACT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTR", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "KE", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "RAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972030388896968,
"Nucleotide GTR":0.0009641962088883009,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "Y", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "TAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "DG", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GRT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "KT", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AMG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "PL", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CYA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACK", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "VF", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711477059224787,
"Nucleotide GTR":0.0009633206399890413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAG", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432532_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "C", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "TGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432558_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009729062586625667,
"Nucleotide GTR":0.0009650650194904339,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "EAGV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATC", "G-A", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432594_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717671045837159,
"Nucleotide GTR":0.0009639350465423532,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "N", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AAT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432760_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721606590251948,
"Nucleotide GTR":0.0009643254290908808,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "R", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "AGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432908_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713502014888037,
"Nucleotide GTR":0.0009635215035212913,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGC", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433000_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "G", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "GGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728708397778808,
"Nucleotide GTR":0.0009650298860679341,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACA", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009719527807526481,
"Nucleotide GTR":0.0009641192262348899,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "I", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ATA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711773289649445,
"Nucleotide GTR":0.0009633500242815158,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTC", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717680128293642,
"Nucleotide GTR":0.0009639359474679,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "G", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GGA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719843471901424,
"Nucleotide GTR":0.0009641505382593996,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433719_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009713502199949188,
"Nucleotide GTR":0.0009635215218782541,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "L", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "CTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719612214931614,
"Nucleotide GTR":0.0009641275989463789,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTA", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711773364765997,
"Nucleotide GTR":0.0009633500317326293,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "L", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "CTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718017793003279,
"Nucleotide GTR":0.0009639694417944796,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "A", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "GCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001949937727094995,
"Nucleotide GTR":0.001934222001193578,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "C", "T", "V", "K", "Y", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "TGT", "ACA", "GTT", "AAA", "TAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "SG", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "RGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001943132182102707,
"Nucleotide GTR":0.00192747130619892,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "L", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "TTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTC", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009721353155413721,
"Nucleotide GTR":0.0009643002898655028,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "D", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GAT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTC", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711773289649445,
"Nucleotide GTR":0.0009633500242815158,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAC", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717722745544475,
"Nucleotide GTR":0.000963940174845168,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "DG", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GRT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "MI", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATK", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721226340604769,
"Nucleotide GTR":0.0009642877105923205,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "T", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "ACT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009724874362819885,
"Nucleotide GTR":0.0009646495726523894,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCA", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000971766852657502,
"Nucleotide GTR":0.0009639347966465628,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "L", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TTG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "KQ", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "MAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "V", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "GTG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "KR", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "ARA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "TS", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "WCT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009720131814196865,
"Nucleotide GTR":0.0009641791400964723,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "I", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ATT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "LF", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTK", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001944938665409077,
"Nucleotide GTR":0.001929263229965209,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "V", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "Q", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GTA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "CAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAR", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009709129994035236,
"Nucleotide GTR":0.0009630878251116844,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "H", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "CAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009720131620441719,
"Nucleotide GTR":0.0009641791208771161,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAT", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717668620073182,
"Nucleotide GTR":0.0009639348059210255,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "C", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGT", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971964001835364,
"Nucleotide GTR":0.0009641303568801232,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTT", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718133176176436,
"Nucleotide GTR":0.0009639808871175268,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGG", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008294368531565257,
"Nucleotide GTR":0.0008227519205786207,
"amino-acid": [
["C", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["TGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972285093998957,
"Nucleotide GTR":0.0009644488611680305,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "F", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718909380330449,
"Nucleotide GTR":0.000964057881943118,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717668619841647,
"Nucleotide GTR":0.0009639348058980558,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "Y", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "TAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718779419553759,
"Nucleotide GTR":0.0009640449906086889,
"amino-acid": [
["S", "L", "K", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "AAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002919759655890061,
"Nucleotide GTR":0.002896227549293844,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "M", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "V", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "ATG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GTA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAG", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716082616639588,
"Nucleotide GTR":0.0009637774838336267,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "T", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "ACA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437571_California_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971511566334829,
"Nucleotide GTR":0.0009636815678305582,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "G", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GGC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "L", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "CTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717572416211763,
"Nucleotide GTR":0.0009639252630713853,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGC", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "F", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "TTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACA", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003531131755634999,
"Nucleotide GTR":0.0003502672232019321,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "R", "K", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "AGA", "AAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTY", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009708448542879951,
"Nucleotide GTR":0.0009630202292188022,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "GV", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GKA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711250690897687,
"Nucleotide GTR":0.0009632981856002392,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAG", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009775172926649292,
"Nucleotide GTR":0.0009696388903847167,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "P", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CCT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711250765922276,
"Nucleotide GTR":0.0009632981930422299,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "R", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CGT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438260_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711773364765997,
"Nucleotide GTR":0.0009633500317326293,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAC", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438282_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720303861612602,
"Nucleotide GTR":0.0009641962061746424,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "C", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "TGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438396_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "LF", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTW", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438461_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "ED", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAM", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438473_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713730345785863,
"Nucleotide GTR":0.000963544152585412,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCC", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438515_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009727021152761096,
"Nucleotide GTR":0.0009648625214188309,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438534_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726190638496067,
"Nucleotide GTR":0.0009647801393539374,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "N", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "AAT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003802918257178761,
"Nucleotide GTR":0.0003772268241988602,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "E", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "GAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038054505,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290420485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAG", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003801079985034864,
"Nucleotide GTR":0.000377044478559023,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "F", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TTT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717796429383708,
"Nucleotide GTR":0.0009639474838428329,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "F", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "TTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000972216779608097,
"Nucleotide GTR":0.0009643810973641088,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "V", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GTA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009722618673149849,
"Nucleotide GTR":0.0009644258216819332,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTT", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726190637929692,
"Nucleotide GTR":0.0009647801392977558,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "T", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "ACA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711194496637904,
"Nucleotide GTR":0.0009632926114646089,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "E", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GAA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439379_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731334575653129,
"Nucleotide GTR":0.000965290387259996,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATA", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439379_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439399_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "AS", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "KCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439399_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439408_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "PS", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "YCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439408_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439419_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "RW", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "YGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439419_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0009711477058785305,
"Nucleotide GTR":0.0009633206399454488,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTG", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439434_England_20200401_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "AV", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GYT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439445_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439476_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACK", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439476_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTR", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439651_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439681_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713530229529878,
"Nucleotide GTR":0.0009635243022455912,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATC", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439681_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439920_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722618672993415,
"Nucleotide GTR":0.0009644258216664175,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "S", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "TCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439920_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439944_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000972277503174772,
"Nucleotide GTR":0.0009644413315228853,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439944_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440019_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACR", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440019_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717440592881594,
"Nucleotide GTR":0.0009639121869827517,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "A", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GCT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440082_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440096_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009714847941453729,
"Nucleotide GTR":0.0009636550114143462,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "V", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "GTA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440096_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440217_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711250691829219,
"Nucleotide GTR":0.0009632981856926421,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "V", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "GTA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440217_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440247_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "SL", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TYG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440247_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440277_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCY", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440277_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440325_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "YC", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TRT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440325_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440364_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "TM", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "AYG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440364_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "TR", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "ASA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440382_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440508_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "IL", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "MTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440508_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009715234443431463,
"Nucleotide GTR":0.0009636933501068304,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440515_England_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440591_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730045086062672,
"Nucleotide GTR":0.0009651624775784964,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "L", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CTA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440591_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440640_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAR", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440640_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009717671045420571,
"Nucleotide GTR":0.000963935046501029,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "K", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AAA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440669_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440731_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "ND", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "RAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440731_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440740_England_20200405_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009716905971476007,
"Nucleotide GTR":0.0009638591557258762,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "L", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CTA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440740_England_20200405_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440767_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716973446726014,
"Nucleotide GTR":0.0009638658488684974,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "L", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TTA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440767_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440779_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718246620835875,
"Nucleotide GTR":0.0009639921401515671,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGG", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440779_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440819_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009706046660049392,
"Nucleotide GTR":0.0009627819767581931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCG", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440819_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440821_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACR", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440821_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAY", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441060_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441072_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAR", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441072_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441079_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971132062421623,
"Nucleotide GTR":0.0009633051225686085,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAC", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441079_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "IV", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "RTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441130_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441224_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "GC", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "KGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441224_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441325_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001942945844523622,
"Nucleotide GTR":0.001927286470426931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "S", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "TCT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441325_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718760230916502,
"Nucleotide GTR":0.0009640430872102452,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "V", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GTC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "V", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GTT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441534_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "IF", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "WTT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441548_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441555_England_20200405_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441555_England_20200405_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441570_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "VL", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "KTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441570_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441783_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721353155413721,
"Nucleotide GTR":0.0009643002898655028,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "K", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AAA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441783_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442025_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009716451038054505,
"Nucleotide GTR":0.0009638140290420485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "G", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GGC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442025_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442207_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124865374033,
"Nucleotide GTR":0.0009636824806166638,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTC", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442207_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442209_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711346891952883,
"Nucleotide GTR":0.0009633077281715184,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "R", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CGA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442209_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442231_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "VF", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "KTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442231_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442233_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009731470447506559,
"Nucleotide GTR":0.000965303864938006,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "DG", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATT", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GRC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442233_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442282_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "NI", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "AWT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442282_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711998201557291,
"Nucleotide GTR":0.0009633723342022081,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAC", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442349_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442518_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715119008250542,
"Nucleotide GTR":0.0009636818996249239,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAA", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442518_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442533_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009712203679294896,
"Nucleotide GTR":0.0009633927163690504,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442533_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442636_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "SF", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TYT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442636_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442662_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971843556999647,
"Nucleotide GTR":0.000964010882782086,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "L", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CTT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442662_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442776_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAY", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442776_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003798752782181605,
"Nucleotide GTR":0.0003768136339070391,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAG", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442854_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442906_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "KN", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAK", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442906_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442935_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003794922525704073,
"Nucleotide GTR":0.0003764336952943278,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "T", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ACC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442935_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442963_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "SI", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AKT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442963_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443011_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "A", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAR", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "GCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443011_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443028_England_20200408_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009718443586555353,
"Nucleotide GTR":0.0009640116779769459,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "V", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GTC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443028_England_20200408_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009711477059224787,
"Nucleotide GTR":0.0009633206399890413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "G", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GGT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718610609333482,
"Nucleotide GTR":0.0009640282456410149,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "I", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "ATA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711773289649445,
"Nucleotide GTR":0.0009633500242815158,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "L", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "CTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719527807052929,
"Nucleotide GTR":0.000964119226187919,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "TTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721380864520773,
"Nucleotide GTR":0.0009643030384437648,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443325_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443382_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "YAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443382_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720007939831724,
"Nucleotide GTR":0.0009641668524977916,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "S", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "AGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443488_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443501_England_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721616823495593,
"Nucleotide GTR":0.0009643264441676569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443501_England_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443505_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCY", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443505_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720855610317391,
"Nucleotide GTR":0.0009642509363575142,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "S", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AGT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443510_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443538_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717010259037589,
"Nucleotide GTR":0.0009638695004303881,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443538_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443599_England_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTY", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443599_England_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443615_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000379492978464942,
"Nucleotide GTR":0.0003764344153384404,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAC", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443615_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443625_England_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000465331596990158,
"Nucleotide GTR":0.0004615812085905955,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "D", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAC", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443625_England_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443690_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009716206000788592,
"Nucleotide GTR":0.0009637897228057892,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "R", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CGT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443690_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443803_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "EA", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GMA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443803_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443807_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "QH", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAM", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443807_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443907_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAR", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443907_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443923_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "GV", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GKT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443923_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "PL", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CYA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443979_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443989_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009729282217659443,
"Nucleotide GTR":0.0009650868055798981,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "N", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAT", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443989_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444128_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718179760433952,
"Nucleotide GTR":0.0009639855079982111,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "S", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "AGT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444128_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444199_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000972004836325849,
"Nucleotide GTR":0.0009641708622607876,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "Y", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "TAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444199_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722940272725626,
"Nucleotide GTR":0.0009644577224429894,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCA", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444241_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720719178429337,
"Nucleotide GTR":0.0009642374031274064,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTA", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444241_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444283_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "I", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATT", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444283_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444435_England_20200418_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAT", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444435_England_20200418_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444438_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009715298663864658,
"Nucleotide GTR":0.0009636997203910268,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444438_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009721353155340546,
"Nucleotide GTR":0.0009643002898582434,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "I", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "ATT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717668619841647,
"Nucleotide GTR":0.0009639348058980558,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "C", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "TGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009720131814196865,
"Nucleotide GTR":0.0009641791400964723,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "L", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CTT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724915850237401,
"Nucleotide GTR":0.0009646536879569263,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "IM", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATN", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "Y", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "TAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720007942120193,
"Nucleotide GTR":0.0009641668527247937,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "N", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "AAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0003801226053400898,
"Nucleotide GTR":0.0003770589676703072,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "L", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TTA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721793146892438,
"Nucleotide GTR":0.0009643439343976655,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "C", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "TGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009730178326292473,
"Nucleotide GTR":0.0009651756942151277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "Y", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "TAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445109_California_20200312_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000384720624206374,
"Nucleotide GTR":0.0003816199283253537,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGT", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445109_California_20200312_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718936037597675,
"Nucleotide GTR":0.000964060526185139,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "D", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "GAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445165_California_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0003801080515630684,
"Nucleotide GTR":0.0003770445311909656,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "C", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "TGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445165_California_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719062538093974,
"Nucleotide GTR":0.0009640730742803786,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "I", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "ATT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445169_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009718332704084645,
"Nucleotide GTR":0.0009640006790967546,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "V", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GTT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718240932366389,
"Nucleotide GTR":0.0009639915758893011,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "G", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GGT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009712694783376347,
"Nucleotide GTR":0.0009634414309667518,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "L", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CTA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009731399279762796,
"Nucleotide GTR":0.0009652968055220128,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACT", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGY", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003801080515409999,
"Nucleotide GTR":0.0003770445311690751,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAT", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "IV", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "RTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009711768222167705,
"Nucleotide GTR":0.000963349521617532,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTC", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "SG", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "RGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "WC", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGK", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "NI", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AWT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "SL", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TYA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "AV", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GYT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "Y", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "TAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "SF", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TYT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719062538093974,
"Nucleotide GTR":0.0009640730742803786,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "N", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AAT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "TM", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "AYG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTR", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "WGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAY", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "VL", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "KTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "N", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAT", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009706041865968485,
"Nucleotide GTR":0.0009627815012139422,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "G", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GGA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009714613797940681,
"Nucleotide GTR":0.0009636317857734412,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "M", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATG", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "KR", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "ARA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730051194652213,
"Nucleotide GTR":0.0009651630835141688,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATT", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "SL", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TYA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719596520660151,
"Nucleotide GTR":0.0009641260421681923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "S", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "TCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009721226339736421,
"Nucleotide GTR":0.0009642877105061849,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "E", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GAA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCT", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "RG", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "RGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAY", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009772230605046958,
"Nucleotide GTR":0.0009693470296191777,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "Q", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "EG", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GRA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "SF", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TYT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0009721226340214099,
"Nucleotide GTR":0.000964287710553569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "N", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "AAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "V", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "GTT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009715124864450083,
"Nucleotide GTR":0.0009636824805250142,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAC", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004663065750612707,
"Nucleotide GTR":0.0004625483287245474,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "I", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATT", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009721723624242589,
"Nucleotide GTR":0.0009643370381651832,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "T", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "ACA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "TI", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "AYA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003801371566474895,
"Nucleotide GTR":0.0003770734016999321,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCT", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009723438741955709,
"Nucleotide GTR":0.0009645071676195379,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "N", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAT", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "F", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TTT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721353155340546,
"Nucleotide GTR":0.0009643002898582434,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCA", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAY", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "A", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GCT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711590333562128,
"Nucleotide GTR":0.0009633318761281467,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTG", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAC", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "GV", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GKT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003875885006476178,
"Nucleotide GTR":0.0003844646908181654,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "V", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GTT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009726548795503182,
"Nucleotide GTR":0.0009648156663942839,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "DAGV", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "T", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GNT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "ACA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718760039307663,
"Nucleotide GTR":0.0009640430682037907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAT", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001388930371916453,
"Nucleotide GTR":0.001377736143137818,
"amino-acid": [
["V", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GTT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447940_England_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009720131619893412,
"Nucleotide GTR":0.000964179120822729,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTT", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447940_England_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448006_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009727370641791637,
"Nucleotide GTR":0.0009648971886475665,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "S", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "I", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "TCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ATA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448006_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001944643546882456,
"Nucleotide GTR":0.001928970489977045,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "I", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCG", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ATA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003817425827422831,
"Nucleotide GTR":0.0003786658886961527,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "V", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGK", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448318_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448368_England_20200502_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCY", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448368_England_20200502_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448394_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009716082616639588,
"Nucleotide GTR":0.0009637774838336267,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTA", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448394_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448403_England_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009713502014888037,
"Nucleotide GTR":0.0009635215035212913,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCC", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448403_England_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448423_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725423019491965,
"Nucleotide GTR":0.0009647039961240476,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448423_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448489_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001943326972366456,
"Nucleotide GTR":0.001927664526530278,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTC", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAC", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448489_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448511_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726499856131805,
"Nucleotide GTR":0.0009648108119003423,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAG", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448511_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448524_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "EV", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GWA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448524_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448574_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "GV", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GKT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448574_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448589_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711477059224787,
"Nucleotide GTR":0.0009633206399890413,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAG", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448589_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448608_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009733999599593036,
"Nucleotide GTR":0.000965554741750225,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "L", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTA", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448608_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448642_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "DA", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GMT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448642_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448739_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719645799448994,
"Nucleotide GTR":0.0009641309303303254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "V", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GTT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448739_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448749_England_20200101_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009713669926190838,
"Nucleotide GTR":0.0009635381593217106,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAG", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448749_England_20200101_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448775_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "LF", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTK", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448775_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448784_England_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448784_England_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448989_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "KE", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "RAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448989_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449014_England_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTY", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449014_England_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449016_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "RC", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "YGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449016_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009728190184621044,
"Nucleotide GTR":0.0009649784824114416,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATA", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449029_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449064_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCM", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449064_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449072_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "MI", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATK", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449072_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449109_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720303861727327,
"Nucleotide GTR":0.0009641962061860207,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "L", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CTT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449109_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449114_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711137412860118,
"Nucleotide GTR":0.0009632869490940956,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAG", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449114_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "PL", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CYT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449139_England_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009706046660049392,
"Nucleotide GTR":0.0009627819767581931,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "E", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "GAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449139_England_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449142_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730178326292473,
"Nucleotide GTR":0.0009651756942151277,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "L", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CTA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449142_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449150_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "EG", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GRA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449150_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449175_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "PL", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CYA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449175_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "E", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "GAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449604_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711137412860118,
"Nucleotide GTR":0.0009632869490940956,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "V", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "GTC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449604_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449622_England_20200430_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449622_England_20200430_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449628_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009726830841312508,
"Nucleotide GTR":0.0009648436436574648,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTT", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449628_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449643_England_20200404_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAT", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449643_England_20200404_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449655_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711132114437051,
"Nucleotide GTR":0.0009632864235221066,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTG", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449655_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449670_England_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009719367712335154,
"Nucleotide GTR":0.0009641033457461427,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCT", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449670_England_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449697_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009774056498294181,
"Nucleotide GTR":0.000969528147346249,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "L", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "CTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449697_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449700_England_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "S", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "TCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449700_England_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449715_England_20200416_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0004074871006585035,
"Nucleotide GTR":0.0004042029159928459,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCT", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449715_England_20200416_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449719_England_20200417_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "N", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAT", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449719_England_20200417_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_38":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "F", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "TTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449996_Washington_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009720367213534625,
"Nucleotide GTR":0.0009642024903077029,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "L", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "TTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449996_Washington_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450185_Louisiana_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009724255889926756,
"Nucleotide GTR":0.0009645882238277367,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "S", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "AGT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450185_Louisiana_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "LF", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "YTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000677365493311809,
"Nucleotide GTR":0.0006719061956737117,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "M", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ATG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450721_Wisconsin_20200401_null_26":{
"Global MG94xREV":0.0009719645798978727,
"Nucleotide GTR":0.0009641309302836776,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTT", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450721_Wisconsin_20200401_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450806_Virgin_Islands_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450806_Virgin_Islands_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711768222167705,
"Nucleotide GTR":0.000963349521617532,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCC", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450811_Uppsala_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718610609333482,
"Nucleotide GTR":0.0009640282456410149,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "N", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAT", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450811_Uppsala_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450826_Uppsala_20200427_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "Y", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450826_Uppsala_20200427_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450832_Vastmanland_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719596520660151,
"Nucleotide GTR":0.0009641260421681923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "S", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "AGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450832_Vastmanland_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009718610609333482,
"Nucleotide GTR":0.0009640282456410149,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "I", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "ATT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009720007871374899,
"Nucleotide GTR":0.0009641668457072821,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "H", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CAT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451181_Ghent_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009708385639247826,
"Nucleotide GTR":0.0009630139895534258,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "G", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "GGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451181_Ghent_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009714151258828015,
"Nucleotide GTR":0.0009635859046503827,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAG", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451337_Sichuan_20200130_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009720367213534625,
"Nucleotide GTR":0.0009642024903077029,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "Y", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "TAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451337_Sichuan_20200130_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451376_Sichuan_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719062452831576,
"Nucleotide GTR":0.0009640730658228548,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "K", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "AAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451376_Sichuan_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451447_New_York_20200326_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0009722216553591714,
"Nucleotide GTR":0.0009643859338185606,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "Y", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "TAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451447_New_York_20200326_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451449_New_York_20200326_null_18":{
"Global MG94xREV":0.0003801080511060171,
"Nucleotide GTR":0.000377044530737598,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTT", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451449_New_York_20200326_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451624_New_South_Wales_20200419_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009717668619841647,
"Nucleotide GTR":0.0009639348058980558,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "Y", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "TAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451624_New_South_Wales_20200419_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451670_Ticino_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCY", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451670_Ticino_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451718_Graubunden_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAY", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451718_Graubunden_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATY", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451725_Graubunden_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "TA", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "RCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451725_Graubunden_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "YS", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TMT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "PA", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "SCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAW", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451775_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCS", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451775_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "TM", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "AYG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451778_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "IV", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "RTT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451778_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "ED", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAW", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "IM", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATR", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451794_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "KQ", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "MAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451794_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451808_Luzern_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "YAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451808_Luzern_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451809_Basel_Land_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAY", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451809_Basel_Land_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTY", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "GV", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GKA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "KE", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "RAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTR", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTR", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "KN", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAK", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451857_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "YTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451857_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "KR", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "ARA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "VF", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "KTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "PA", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "SCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "HY", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "YAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "DV", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GWT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAY", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451891_Ticino_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "YC", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TRT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451891_Ticino_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "LF", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTM", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "HY", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "YAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "DV", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GWT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003801080515630684,
"Nucleotide GTR":0.0003770445311909656,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "Y", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "TAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "ED", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAW", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451946_Bavaria_20200402_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0009717668813178756,
"Nucleotide GTR":0.0009639348250759471,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "L", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "TTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451946_Bavaria_20200402_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719645992457547,
"Nucleotide GTR":0.0009641309494756231,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "S", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "TCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718760039307663,
"Nucleotide GTR":0.0009640430682037907,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTT", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452014_Denmark_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711137672986586,
"Nucleotide GTR":0.0009632869748970892,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAG", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452014_Denmark_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971147705914238,
"Nucleotide GTR":0.000963320639980868,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACG", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_19":{
"Global MG94xREV":0.0004661260818234208,
"Nucleotide GTR":0.0004623692901907191,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_19",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452097_Denmark_20200509_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "H", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAT", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452097_Denmark_20200509_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0009721226340214099,
"Nucleotide GTR":0.000964287710553569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "K", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "AAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452338_Beijing_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719596520660151,
"Nucleotide GTR":0.0009641260421681923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "F", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "TTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452338_Beijing_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452399_Andalusia_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "AV", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GYT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452399_Andalusia_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452424_Andalusia_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000971964001835364,
"Nucleotide GTR":0.0009641303568801232,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "F", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "TTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452424_Andalusia_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452425_Andalusia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009730050996444354,
"Nucleotide GTR":0.0009651630638531311,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCT", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452425_Andalusia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452539_Navarra_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "GC", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "KGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452539_Navarra_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452541_Navarra_20200310_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "V", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GTC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452541_Navarra_20200310_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "EG", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GRA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452739_Basque_Country_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009711998201557291,
"Nucleotide GTR":0.0009633723342022081,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "A", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GCT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452739_Basque_Country_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452741_Basque_Country_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "PS", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "YCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452741_Basque_Country_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452809_Virginia_20200401_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000971621352073655,
"Nucleotide GTR":0.0009637904687398041,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "L", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TTA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452809_Virginia_20200401_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452884_England_20200506_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717677955747246,
"Nucleotide GTR":0.0009639357319642459,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "I", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "ATA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452884_England_20200506_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452916_England_20200507_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009711773548722941,
"Nucleotide GTR":0.0009633500499800624,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTC", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452916_England_20200507_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452930_England_20200511_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0003827604292444448,
"Nucleotide GTR":0.0003796755317585768,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "S", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "TCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452930_England_20200511_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452931_England_20200101_null_17":{
"Global MG94xREV":0.0003801080515630684,
"Nucleotide GTR":0.0003770445311909656,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "F", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "TTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452931_England_20200101_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452935_England_20200513_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAG", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452935_England_20200513_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452943_England_20200511_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009718839456175056,
"Nucleotide GTR":0.0009640509458836771,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "I", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "ATT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452943_England_20200511_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452961_England_20200511_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009721606868315268,
"Nucleotide GTR":0.0009643254566731051,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "I", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "ATA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452961_England_20200511_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452971_England_20200511_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009717663027387865,
"Nucleotide GTR":0.0009639342511599742,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "Y", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "TAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452971_England_20200511_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453101_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009708674312492003,
"Nucleotide GTR":0.0009630426242186411,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "V", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "GTT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453101_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453183_Scotland_20200516_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009717050043341428,
"Nucleotide GTR":0.0009638734467961997,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "H", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAT", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453183_Scotland_20200516_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453191_Scotland_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719645991912855,
"Nucleotide GTR":0.000964130949421593,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "S", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "TCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453191_Scotland_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453337_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001666880238451327,
"Nucleotide GTR":0.0001653445843817085,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "H", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAT", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453337_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453402_England_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009715124602880113,
"Nucleotide GTR":0.0009636824545788307,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAC", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453402_England_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453456_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0003801364602872607,
"Nucleotide GTR":0.000377072710952091,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "S", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "AGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453456_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453464_England_20200419_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0003801371587168565,
"Nucleotide GTR":0.0003770734037526202,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "F", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TTT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453464_England_20200419_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453467_Northern_Ireland_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009716967384423023,
"Nucleotide GTR":0.0009638652475241731,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAT", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453467_Northern_Ireland_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453468_Northern_Ireland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009718693799976346,
"Nucleotide GTR":0.0009640364976569352,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "I", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATT", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453468_Northern_Ireland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453520_England_20200407_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0009719645798978727,
"Nucleotide GTR":0.0009641309302836776,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "S", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "TCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453520_England_20200407_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453563_England_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "DY", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "KAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453563_England_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453601_England_20200422_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711137412860118,
"Nucleotide GTR":0.0009632869490940956,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "S", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AGT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453601_England_20200422_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453609_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "KT", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "AMA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453609_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453635_England_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009053889009716175,
"Nucleotide GTR":0.0008980918249654754,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAA", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453635_England_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453651_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "F", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453651_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009723440373246018,
"Nucleotide GTR":0.000964507329433813,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAC", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453654_England_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453664_England_20200517_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0004658806237952161,
"Nucleotide GTR":0.0004621258104570201,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACT", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453664_England_20200517_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453720_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003801080506439135,
"Nucleotide GTR":0.0003770445302792187,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAT", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453720_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453748_England_20200421_null_165":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "V", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GTT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453748_England_20200421_null_165",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453983_Portugal_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009713730085741103,
"Nucleotide GTR":0.0009635441267905219,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTC", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453983_Portugal_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_453990_Portugal_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009712783332247089,
"Nucleotide GTR":0.0009634502144869441,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "L", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "CTT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_453990_Portugal_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454052_Portugal_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "S", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGT", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454052_Portugal_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454087_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000971431258297607,
"Nucleotide GTR":0.0009636019070443127,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "H", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "CAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454087_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454097_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009719645991912855,
"Nucleotide GTR":0.000964130949421593,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "V", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GTT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454097_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454118_Portugal_20200423_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "I", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ATT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454118_Portugal_20200423_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454143_Portugal_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009722591074005168,
"Nucleotide GTR":0.0009644230840112832,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "I", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "ATT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454143_Portugal_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454154_Portugal_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "I", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "ATT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454154_Portugal_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454211_Portugal_20200401_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0009719645992457547,
"Nucleotide GTR":0.0009641309494756231,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAT", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454211_Portugal_20200401_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454249_Portugal_20200323_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0003801079918059144,
"Nucleotide GTR":0.0003770444719154308,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "V", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GTT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454249_Portugal_20200323_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454268_Portugal_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0003798926713218511,
"Nucleotide GTR":0.0003768308868292017,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "CTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454268_Portugal_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454298_Portugal_20200411_null_174":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "L", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "TTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454298_Portugal_20200411_null_174",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454331_Portugal_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009720007942120193,
"Nucleotide GTR":0.0009641668527247937,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "I", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "ATA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454331_Portugal_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454379_Pennsylvania_20200402_null_11":{
"Global MG94xREV":0.000379475671438998,
"Nucleotide GTR":0.000376417247800272,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTG", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454379_Pennsylvania_20200402_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454396_Pennsylvania_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001944639151725094,
"Nucleotide GTR":0.00192896613024291,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "R", "Y", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGG", "TAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454396_Pennsylvania_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454442_Halland_20200309_null_16":{
"Global MG94xREV":0.000971766852657502,
"Nucleotide GTR":0.0009639347966465628,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "Y", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "TAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454442_Halland_20200309_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454455_Stockholm_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003794756676457557,
"Nucleotide GTR":0.0003764172440376009,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "V", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "GTG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454455_Stockholm_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009719645799448994,
"Nucleotide GTR":0.0009641309303303254,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "V", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GTT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454525_Maharashtra_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009775173903901764,
"Nucleotide GTR":0.0009696389873223362,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "A", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GCT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454525_Maharashtra_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454537_Maharashtra_20200326_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000971766852657502,
"Nucleotide GTR":0.0009639347966465628,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "L", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "TTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454537_Maharashtra_20200326_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454541_Maharashtra_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009721226340214099,
"Nucleotide GTR":0.000964287710553569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "E", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GAA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454541_Maharashtra_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454546_Maharashtra_20200403_null_61":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "L", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "TTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454546_Maharashtra_20200403_null_61",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454595_Pula_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715124679711687,
"Nucleotide GTR":0.0009636824622000661,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "S", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TCC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454595_Pula_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454618_California_20200426_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0009731328846799884,
"Nucleotide GTR":0.0009652898189919006,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "Y", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TAC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454618_California_20200426_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454619_California_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "VL", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "KTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454619_California_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454627_California_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TSA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454627_California_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454632_California_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "HD", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "SAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454632_California_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009723618333100912,
"Nucleotide GTR":0.0009645249819907073,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "L", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "T", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CTA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ACA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454676_California_20200512_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "HR", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CRT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454676_California_20200512_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454681_California_20200512_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAY", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454681_California_20200512_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454781_Utrecht_20200404_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0003801080506439135,
"Nucleotide GTR":0.0003770445302792187,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTT", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454781_Utrecht_20200404_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454786_Utrecht_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0009720131620441719,
"Nucleotide GTR":0.0009641791208771161,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "S", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "TCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454786_Utrecht_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454799_North_Carolina_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009719596520660151,
"Nucleotide GTR":0.0009641260421681923,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCT", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454799_North_Carolina_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454812_North_Carolina_20200401_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0009721226340214099,
"Nucleotide GTR":0.000964287710553569,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "S", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "AGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454812_North_Carolina_20200401_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454831_Rajasthan_20200429_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "I", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "ATT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454831_Rajasthan_20200429_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454889_Stockholm_20200306_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "I", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ATA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454889_Stockholm_20200306_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_454900_Stockholm_20200310_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0009720131619893412,
"Nucleotide GTR":0.000964179120822729,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "I", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ATA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_454900_Stockholm_20200310_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455088_New_South_Wales_20200321_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009719927226780153,
"Nucleotide GTR":0.0009641588462441571,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "N", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAT", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455088_New_South_Wales_20200321_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455091_New_South_Wales_20200513_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009705749027192479,
"Nucleotide GTR":0.000962752453352797,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAG", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455091_New_South_Wales_20200513_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455113_Flevoland_20200401_null_50":{
"Global MG94xREV":0.0003804497677488717,
"Nucleotide GTR":0.0003773834932796318,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTT", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455113_Flevoland_20200401_null_50",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455146_Netherlands_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009716023630258024,
"Nucleotide GTR":0.0009637716327361566,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "S", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGT", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455146_Netherlands_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455165_Netherlands_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003798752780502931,
"Nucleotide GTR":0.000376813633740524,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "G", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GGT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455165_Netherlands_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455189_Netherlands_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009717668813178756,
"Nucleotide GTR":0.0009639348250759471,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "D", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAT", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455189_Netherlands_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455224_Netherlands_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009752035876670677,
"Nucleotide GTR":0.0009673438329329064,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "-", "C", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "---", "TGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455224_Netherlands_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455246_Netherlands_20200411_null_97":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "L", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "TTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455246_Netherlands_20200411_null_97",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455269_Netherlands_20200413_null_38":{
"Global MG94xREV":0.0009717677971842718,
"Nucleotide GTR":0.0009639357335608224,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "N", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "AAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455269_Netherlands_20200413_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455286_Netherlands_20200326_null_34":{
"Global MG94xREV":0.0009719375445711334,
"Nucleotide GTR":0.0009641041128509655,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCA", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455286_Netherlands_20200326_null_34",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "KGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "DV", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GWT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "SF", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TYT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455314_Andalusia_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001205821965515799,
"Nucleotide GTR":0.001196103517981485,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "A", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGG", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GCA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455314_Andalusia_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455317_Andalusia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001943303677500844,
"Nucleotide GTR":0.001927641419412059,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "R", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CGA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "CTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455317_Andalusia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001944184194189544,
"Nucleotide GTR":0.001928514839484935,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "A", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTA", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GCG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002925637746941219,
"Nucleotide GTR":0.002902058265258863,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "F", "L"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTT", "CTG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1]
],
"original name":"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009715369029324534,
"Nucleotide GTR":0.0009637067002252376,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "H", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "CAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455391_Hubei_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0009725166660454858,
"Nucleotide GTR":0.0009646785668355679,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "Y", "G", "H", "V", "ED", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "TAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GA-", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455391_Hubei_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455406_Hubei_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0009711250690897687,
"Nucleotide GTR":0.0009632981856002392,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAG", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455406_Hubei_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_27010":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_27010",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455422_Osun_State_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0009720131814196865,
"Nucleotide GTR":0.0009641791400964723,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "F", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455422_Osun_State_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455438_Quintana_Roo_20200314_null_1533":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTG", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455438_Quintana_Roo_20200314_null_1533",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455446_Mazowieckie_20200313_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAT", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTG", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455446_Mazowieckie_20200313_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_455475_Arges_20200514_null_418":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "L", "E", "N", "V", "A", "F", "N", "V", "V", "N", "K", "G", "H", "F", "D", "G", "Q", "Q", "G", "E", "V", "P", "V", "S", "I", "I", "N", "N", "T", "V", "Y", "T", "K", "V", "D", "G", "V", "D", "V", "E", "L", "F", "E", "N", "K", "T", "T", "L", "P", "V", "N", "V", "A", "F", "E", "L", "W", "A", "K", "R", "N", "I", "K", "P", "V", "P", "E", "V", "K", "I", "L", "N", "N", "L", "G", "V", "D", "I", "A", "A", "N", "T", "V", "I", "W", "D", "Y", "K", "R", "D", "A", "P", "A", "H", "I", "S", "T", "I", "G", "V", "C", "S", "M", "T", "D", "I", "A", "K", "K", "P", "T", "E", "T", "I", "C", "A", "P", "L", "T", "V", "F", "F", "D", "G", "R", "V", "D", "G", "Q", "V", "D", "L", "F", "R", "N", "A", "R", "N", "G", "V", "L", "I", "T", "E", "G", "S", "V", "K", "G", "L", "Q", "P", "S", "V", "G", "P", "K", "Q", "A", "S", "L", "N", "-", "G", "V", "T", "L", "I", "G", "E", "A", "V", "K", "T", "Q", "F", "N", "Y", "Y", "K", "K", "V", "D", "G", "V", "V", "Q", "Q", "L", "P", "E", "T", "Y", "F", "T", "Q", "S", "R", "N", "L", "Q", "E", "F", "K", "P", "R", "S", "Q", "M", "E", "I", "D", "F", "L", "E", "L", "A", "M", "D", "E", "F", "I", "E", "R", "Y", "K", "L", "E", "G", "Y", "A", "F", "E", "H", "I", "V", "Y", "G", "D", "F", "S", "H", "S", "Q", "L", "G", "G", "L", "H", "L", "L", "I", "G", "L", "A", "K", "R", "F", "K", "E", "S", "P", "F", "E", "L", "E", "D", "F", "I", "P", "M", "D", "S", "T", "V", "K", "N", "Y", "F", "I", "T", "D", "A", "Q", "T", "G", "S", "S", "K", "C", "V", "C", "S", "V", "I", "D", "L", "L", "L", "D", "D", "F", "V", "E", "I", "I", "K", "S", "Q", "D", "L", "S", "V", "V", "S", "K", "V", "V", "K", "V", "T", "I", "D", "Y", "T", "E", "I", "S", "F", "M", "L", "W", "C", "K", "D", "G", "H", "V", "E", "T", "F", "Y", "P", "K", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AGT", "TTA", "GAA", "AAT", "GTG", "GCT", "TTT", "AAT", "GTT", "GTA", "AAT", "AAG", "GGA", "CAC", "TTT", "GAT", "GGA", "CAA", "CAG", "GGT", "GAA", "GTA", "CCA", "GTT", "TCT", "ATC", "ATT", "AAT", "AAC", "ACT", "GTT", "TAC", "ACA", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GAT", "GTA", "GAA", "TTG", "TTT", "GAA", "AAT", "AAA", "ACA", "ACA", "TTA", "CCT", "GTT", "AAT", "GTA", "GCA", "TTT", "GAG", "CTT", "TGG", "GCT", "AAG", "CGC", "AAC", "ATT", "AAA", "CCA", "GTA", "CCA", "GAG", "GTG", "AAA", "ATA", "CTC", "AAC", "AAT", "TTG", "GGT", "GTG", "GAC", "ATT", "GCT", "GCT", "AAT", "ACT", "GTG", "ATC", "TGG", "GAC", "TAC", "AAA", "AGA", "GAT", "GCT", "CCA", "GCA", "CAT", "ATA", "TCT", "ACT", "ATT", "GGT", "GTT", "TGT", "TCT", "ATG", "ACT", "GAC", "ATA", "GCC", "AAG", "AAA", "CCA", "ACT", "GAA", "ACG", "ATT", "TGT", "GCA", "CCA", "CTC", "ACT", "GTC", "TTT", "TTT", "GAT", "GGT", "AGA", "GTT", "GAT", "GGT", "CAA", "GTA", "GAC", "TTA", "TTT", "AGA", "AAT", "GCC", "CGT", "AAT", "GGT", "GTT", "CTT", "ATT", "ACA", "GAA", "GGT", "AGT", "GTT", "AAA", "GGT", "TTA", "CAA", "CCA", "TCT", "GTA", "GGT", "CCC", "AAA", "CAA", "GCT", "AGT", "CTT", "AAT", "---", "GGA", "GTC", "ACA", "TTA", "ATT", "GGA", "GAA", "GCC", "GTA", "AAA", "ACA", "CAG", "TTC", "AAT", "TAT", "TAT", "AAG", "AAA", "GTT", "GAT", "GGT", "GTT", "GTC", "CAA", "CAA", "TTA", "CCT", "GAA", "ACT", "TAC", "TTT", "ACT", "CAG", "AGT", "AGA", "AAT", "TTA", "CAA", "GAA", "TTT", "AAA", "CCC", "AGG", "AGT", "CAA", "ATG", "GAA", "ATT", "GAT", "TTC", "TTA", "GAA", "TTA", "GCT", "ATG", "GAT", "GAA", "TTC", "ATT", "GAA", "CGG", "TAT", "AAA", "TTA", "GAA", "GGC", "TAT", "GCC", "TTC", "GAA", "CAT", "ATC", "GTT", "TAT", "GGA", "GAT", "TTT", "AGT", "CAT", "AGT", "CAG", "TTA", "GGT", "GGT", "TTA", "CAT", "CTA", "CTG", "ATT", "GGA", "CTA", "GCT", "AAA", "CGT", "TTT", "AAG", "GAA", "TCA", "CCT", "TTT", "GAA", "TTA", "GAA", "GAT", "TTT", "ATT", "CCT", "ATG", "GAC", "AGT", "ACA", "GTT", "AAA", "AAC", "TAT", "TTC", "ATA", "ACA", "GAT", "GCG", "CAA", "ACA", "GGT", "TCA", "TCT", "AAG", "TGT", "GTG", "TGT", "TCT", "GTT", "ATT", "GAT", "TTA", "TTA", "CTT", "GAT", "GAT", "TTT", "GTT", "GAA", "ATA", "ATA", "AAA", "TCC", "CAA", "GAT", "TTA", "TCT", "GTA", "GTT", "TCT", "AAG", "GTT", "GTC", "AAA", "GTG", "ACT", "ATT", "GAC", "TAT", "ACA", "GAA", "ATT", "TCA", "TTT", "ATG", "CTT", "TGG", "TGT", "AAA", "GAT", "GGC", "CAT", "GTA", "GAA", "ACA", "TTT", "TAC", "CCA", "AAA", "TTA", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_455475_Arges_20200514_null_418",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":11603.23590004762,
"Equilibrium frequencies": [
[0.0418138536175808],
[0.01154702429971839],
[0.0114179705092937],
[0.04676326074499237],
[0.01930708901478524],
[0.005331712021797851],
[0.005272122847305277],
[0.02159242355613853],
[0.01592031954941077],
[0.004396445215923242],
[0.004347308927232549],
[0.01780477018553661],
[0.03560094695668996],
[0.009831311013846428],
[0.009721432666122517],
[0.03981494699173951],
[0.01969466169354225],
[0.005438741409245472],
[0.005377956034954714],
[0.02202587229779503],
[0.009093794365641174],
[0.002511279287411829],
[0.002483212306478618],
[0.01017020533364618],
[0.007498598680866396],
[0.002070761092094006],
[0.002047617504528747],
[0.008386190102028174],
[0.01676833263669701],
[0.004630626638542857],
[0.004578873052143971],
[0.01875316057974939],
[0.04902275734104482],
[0.01353778523819764],
[0.01338648197134755],
[0.05482546538149959],
[0.02263572136617933],
[0.00625092408481172],
[0.006181061458228208],
[0.02531505825984382],
[0.01866505702154439],
[0.005154412911915484],
[0.005096805297483348],
[0.02087439575173819],
[0.04173871654430387],
[0.01152627496580448],
[0.01139745307756696],
[0.0466792298737553],
[0.01026762578258749],
[0.04158193914209179],
[0.01716788324068525],
[0.004740963766888271],
[0.004687977012162382],
[0.01920000504536605],
[0.003909323569350053],
[0.003865631531338709],
[0.01583201980570174],
[0.0316563983385706],
[0.008742011779161823],
[0.008644307840315373],
[0.03540349146703613]
],
"Log Likelihood":-5094.194868606949,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5812701787240828, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":705
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":12729.43354666316,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3312653094330441],
[0.1444464271230432],
[0.1955081515126937],
[0.3287801119312191]
],
"Log Likelihood":-5169.408713833233,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3929670855508249,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1535241193552656,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.07833036022974324,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.414264278809611,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.6180900903124094
},
"display order":0,
"estimated parameters":1193
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-30/sequences.endornase.compressed.fas",
"number of sequences":594,
"number of sites":347,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_454396_Pennsylvania_20200101_null_1,(epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_448989_England_20200420_null_1)Node1183,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1,epi_isl_452739_Basque_Country_20200308_null_1,epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1,epi_isl_443803_England_20200327_null_1,epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1,epi_isl_454619_California_20200426_null_1,epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1,epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1,epi_isl_440364_England_20200320_null_1,epi_isl_439419_England_20200330_null_2,epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2,epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1,epi_isl_417312_England_20200308_null_1,epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_2,epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1,epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1,epi_isl_454681_California_20200512_null_2,epi_isl_454676_California_20200512_null_1,epi_isl_454632_California_20200429_null_1,epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1,epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_2,epi_isl_451808_Luzern_20200331_null_2,epi_isl_451794_Vaud_20200325_null_1,epi_isl_451778_Basel_Stadt_20200326_null_1,epi_isl_451775_Vaud_20200326_null_1,epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1,epi_isl_451725_Graubunden_20200315_null_1,epi_isl_451718_Graubunden_20200315_null_1,epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1,epi_isl_449150_England_20200418_null_1,epi_isl_449064_England_20200504_null_1,epi_isl_449016_England_20200419_null_1,epi_isl_448318_England_20200422_null_1,epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2,epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1,epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1,epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1,epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1,epi_isl_443979_England_20200326_null_1,epi_isl_443923_England_20200323_null_1,epi_isl_440382_England_20200316_null_1,epi_isl_440325_England_20200320_null_2,epi_isl_440019_England_20200320_null_1,epi_isl_439651_England_20200325_null_1,epi_isl_439445_England_20200331_null_1,epi_isl_438461_England_20200329_null_1,epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1,epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1,epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1,epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1,epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2,epi_isl_425023_England_20200324_null_1,epi_isl_424138_England_20200320_null_1,epi_isl_423933_England_20200319_null_1,epi_isl_423825_England_20200322_null_1,epi_isl_423780_England_20200324_null_1,epi_isl_423740_England_20200323_null_1,epi_isl_423579_England_20200331_null_1,epi_isl_423130_England_20200324_null_1,epi_isl_423068_England_20200323_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1,epi_isl_421956_England_20200331_null_1,(epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1,epi_isl_455165_Netherlands_20200330_null_2)Node1108,(epi_isl_449014_England_20200420_null_3,epi_isl_455113_Flevoland_20200401_null_50)Node1105,(epi_isl_451857_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_454268_Portugal_20200409_null_1)Node1102,epi_isl_442776_England_20200406_null_1,epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1,epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1,(epi_isl_442854_England_20200408_null_1,epi_isl_443907_England_20200326_null_1)Node908,(epi_isl_451449_New_York_20200326_null_18,epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_2)Node905,(epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_2,epi_isl_451908_Bern_20200407_null_8)Node902,(epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_454379_Pennsylvania_20200402_null_11)Node899,(epi_isl_451809_Basel_Land_20200331_null_2,epi_isl_453720_England_20200422_null_1)Node896,(epi_isl_423227_England_20200324_null_1,epi_isl_452931_England_20200101_null_17)Node893,(epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1,epi_isl_454455_Stockholm_20200305_null_2)Node875,(epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1,epi_isl_453456_England_20200501_null_3)Node872,(epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1,epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1)Node116,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2,epi_isl_454249_Portugal_20200323_null_13)Node113,(epi_isl_438473_England_20200331_null_1,epi_isl_443625_England_20200414_null_6)Node107,epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1,epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1,(epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7,epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1)Node866,epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2,epi_isl_443989_England_20200327_null_2,(epi_isl_423354_England_20200329_null_2,epi_isl_442231_England_20200406_null_1)Node133,epi_isl_441130_England_20200403_null_1,epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1,(epi_isl_443599_England_20200416_null_3,epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_19)Node141,(epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15,epi_isl_449628_England_20200404_null_1)Node145,(epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1,epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3)Node148,epi_isl_444241_England_20200418_null_2,epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2,epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7,epi_isl_452961_England_20200511_null_1,epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1,epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_27010,epi_isl_448589_England_20200101_null_1,epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1,epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1,epi_isl_449029_England_20200420_null_1,epi_isl_449072_England_20200504_null_1,epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2,epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1,epi_isl_438515_England_20200401_null_1,epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6,epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1,epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1,epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_3,epi_isl_432760_England_20200322_null_1,epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_3,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1,epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1,(epi_isl_453337_England_20200412_null_1,epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1,epi_isl_453635_England_20200506_null_1)Node275,epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1,epi_isl_442662_England_20200405_null_1,(epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6,epi_isl_448006_England_20200501_null_3)Node283,epi_isl_444438_England_20200417_null_5,epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1,epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_454331_Portugal_20200314_null_3,epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1,epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2,(epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1,epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7)Node296,epi_isl_442518_England_20200324_null_1,epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5,epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1,epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1,(epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1,epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2)Node308,epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1,epi_isl_453601_England_20200422_null_2,epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1,epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4,epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4,epi_isl_438396_England_20200330_null_1,epi_isl_443488_England_20200415_null_2,epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2,epi_isl_451376_Sichuan_20200128_null_1,epi_isl_452097_Denmark_20200509_null_1,epi_isl_453520_England_20200407_null_5,epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1,epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1,epi_isl_449114_England_20200408_null_2,epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1,epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2,epi_isl_454541_Maharashtra_20200330_null_2,epi_isl_449142_England_20200101_null_1,epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_2,epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8,epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_450811_Uppsala_20200406_null_2,epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2,epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1,epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2,epi_isl_454097_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_452014_Denmark_20200311_null_1,epi_isl_442207_England_20200404_null_1,epi_isl_451624_New_South_Wales_20200419_null_5,epi_isl_448739_England_20200101_null_1,epi_isl_451946_Bavaria_20200402_null_17,epi_isl_453402_England_20200410_null_2,epi_isl_438282_England_20200331_null_1,epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1,epi_isl_440767_England_20200402_null_1,epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1,epi_isl_449996_Washington_20200416_null_2,epi_isl_452884_England_20200506_null_2,epi_isl_449604_England_20200428_null_2,epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2,epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_3,epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1,epi_isl_440669_England_20200401_null_4,epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2,epi_isl_450810_Halland_20200401_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2,epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2,epi_isl_454812_North_Carolina_20200401_null_21,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1,epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1,epi_isl_453191_Scotland_20200421_null_2,epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1,epi_isl_439379_England_20200329_null_1,(epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1)Node406,epi_isl_454211_Portugal_20200401_null_21,(epi_isl_423752_England_20200323_null_1,epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1)Node411,epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1,epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1,epi_isl_449109_England_20200408_null_2,epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1,epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2,epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2,epi_isl_452971_England_20200511_null_4,epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_454595_Pula_20200309_null_1,epi_isl_449655_England_20200404_null_1,epi_isl_425585_England_20200324_null_1,epi_isl_442025_England_20200411_null_3,epi_isl_450721_Wisconsin_20200401_null_26,epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1,epi_isl_454442_Halland_20200309_null_16,epi_isl_452916_England_20200507_null_4,epi_isl_425485_England_20200317_null_1,epi_isl_449975_Washington_20200415_null_38,epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1,epi_isl_451337_Sichuan_20200130_null_6,epi_isl_455269_Netherlands_20200413_null_38,epi_isl_455406_Hubei_20200302_null_2,epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2,epi_isl_454537_Maharashtra_20200326_null_6,epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_7,epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2,epi_isl_452424_Andalusia_20200313_null_3,epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1,epi_isl_441534_England_20200426_null_1,epi_isl_455422_Osun_State_20200329_null_6,epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1,epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1,epi_isl_454900_Stockholm_20200310_null_10,epi_isl_423913_England_20200318_null_1,epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3,epi_isl_454786_Utrecht_20200311_null_4,epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1,epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1,epi_isl_448403_England_20200501_null_1,epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3,epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1,epi_isl_447940_England_20200429_null_5,epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1,epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1,epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1,epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2,epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1,epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1,epi_isl_441783_England_20200401_null_1,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_440591_England_20200402_null_1,epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4,epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1,epi_isl_454525_Maharashtra_20200312_null_1,epi_isl_433000_England_20200402_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1,epi_isl_438260_England_20200329_null_1,epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_452425_Andalusia_20200313_null_1,epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_440082_England_20200323_null_1,epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6,epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2,epi_isl_455189_Netherlands_20200101_null_1,epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7,epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1,epi_isl_454618_California_20200426_null_3,epi_isl_440217_England_20200322_null_1,epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1,epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1,epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3,epi_isl_417240_England_20200303_null_4,epi_isl_445169_California_20200328_null_1,epi_isl_420725_England_20200328_null_1,epi_isl_423548_England_20200331_null_3,(epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_445109_California_20200312_null_4)Node587,(epi_isl_450185_Louisiana_20200404_null_1,epi_isl_454118_Portugal_20200423_null_10)Node584,((epi_isl_442533_England_20200407_null_1,epi_isl_452935_England_20200513_null_14)Node552,epi_isl_441072_England_20200403_null_2)Node551,(epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1,epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6)Node557,epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2,epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1,(epi_isl_421775_England_20200325_null_1,epi_isl_443510_England_20200416_null_2,epi_isl_423453_England_20200329_null_1,epi_isl_421895_England_20200327_null_1,epi_isl_440096_England_20200323_null_2,epi_isl_444128_England_20200408_null_1,epi_isl_454298_Portugal_20200411_null_174,epi_isl_423446_England_20200329_null_1,epi_isl_440247_England_20200321_null_1)Node563,(epi_isl_439944_England_20200328_null_2,epi_isl_449719_England_20200417_null_5)Node580,(epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4,epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1)Node593,epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3,epi_isl_432532_England_20200402_null_1,epi_isl_443690_England_20200329_null_3,epi_isl_449123_England_20200408_null_1,epi_isl_453983_Portugal_20200404_null_3,epi_isl_414010_England_20200226_null_1,epi_isl_449697_England_20200415_null_1,(epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1,epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2)Node609,epi_isl_451447_New_York_20200326_null_9,(epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2,epi_isl_448574_England_20200101_null_6)Node615,epi_isl_439434_England_20200401_null_9,(epi_isl_429008_California_20200328_null_1,epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1)Node620,epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4,epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3,epi_isl_440640_England_20200402_null_1,epi_isl_455088_New_South_Wales_20200321_null_6,epi_isl_432908_England_20200327_null_1,epi_isl_440731_England_20200403_null_1,epi_isl_444199_England_20200415_null_2,epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1,(((epi_isl_448511_England_20200405_null_1,epi_isl_448784_England_20200407_null_3)Node643,epi_isl_450826_Uppsala_20200427_null_2)Node642,epi_isl_453563_England_20200424_null_3)Node641,epi_isl_455286_Netherlands_20200326_null_34,epi_isl_417236_England_20200301_null_1,epi_isl_454799_North_Carolina_20200401_null_2,epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3,(epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1)Node662,epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1,(epi_isl_442906_England_20200408_null_1,epi_isl_455446_Mazowieckie_20200313_null_30)Node653,(epi_isl_443501_England_20200414_null_1,epi_isl_452539_Navarra_20200310_null_1,epi_isl_452541_Navarra_20200310_null_10)Node656,epi_isl_441079_England_20200403_null_1,epi_isl_451670_Ticino_20200312_null_2,epi_isl_444240_England_20200418_null_1,epi_isl_449670_England_20200415_null_5,epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2,((epi_isl_441570_England_20200406_null_1,epi_isl_454831_Rajasthan_20200429_null_5)Node676,epi_isl_442963_England_20200407_null_1)Node675,(epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1,epi_isl_454546_Maharashtra_20200403_null_61)Node681,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_443028_England_20200408_null_7,epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1,(epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1,epi_isl_453651_England_20200513_null_1)Node696,(epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_455246_Netherlands_20200411_null_97)Node690,(epi_isl_454143_Portugal_20200325_null_1,epi_isl_454154_Portugal_20200331_null_3)Node693,epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1,((epi_isl_423324_England_20200326_null_1,epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6)Node704,epi_isl_452399_Andalusia_20200316_null_1)Node703,epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3,epi_isl_453467_Northern_Ireland_20200324_null_2,epi_isl_440740_England_20200405_null_4,((epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2,epi_isl_453468_Northern_Ireland_20200324_null_1)Node780,epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1)Node779,epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5,(epi_isl_454052_Portugal_20200318_null_3,epi_isl_455146_Netherlands_20200404_null_2)Node770,(epi_isl_420696_England_20200329_null_1,epi_isl_444283_England_20200416_null_1)Node767,(epi_isl_448775_England_20200407_null_1,epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1,epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1,epi_isl_451181_Ghent_20200414_null_1,epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1,epi_isl_455438_Quintana_Roo_20200314_null_1533,epi_isl_455091_New_South_Wales_20200513_null_1,epi_isl_453101_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1,epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2,epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_1,epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1,epi_isl_420697_England_20200329_null_1,epi_isl_454087_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1,epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5,epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1,epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1,epi_isl_437571_California_20200425_null_1,epi_isl_440819_England_20200401_null_2,epi_isl_448394_England_20200501_null_1,epi_isl_449139_England_20200408_null_2)Node719,(epi_isl_443538_England_20200416_null_1,epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1,epi_isl_449700_England_20200416_null_7)Node762,(epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1)Node775,epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_2,epi_isl_421964_England_20200401_null_1,(epi_isl_449622_England_20200430_null_8,epi_isl_453183_Scotland_20200516_null_2)Node786,epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1,epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1,epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_439681_England_20200407_null_1,epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3,epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1,(epi_isl_423927_England_20200318_null_1,epi_isl_455314_Andalusia_20200228_null_1)Node803,(epi_isl_441555_England_20200405_null_5,epi_isl_443011_England_20200410_null_1)Node806,((epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3,epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2)Node812,epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2)Node811,epi_isl_440779_England_20200401_null_1,(epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10,epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1)Node823,epi_isl_439399_England_20200331_null_1,epi_isl_439920_England_20200324_null_1,epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2,epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2,epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1,(epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2,epi_isl_453464_England_20200419_null_10)Node837,(epi_isl_420726_England_20200327_null_1,epi_isl_445165_California_20200317_null_5)Node97,((epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1)Node832,epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1)Node831,epi_isl_423060_England_20200324_null_1,(epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_442935_England_20200408_null_2)Node94,(epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2,epi_isl_448368_England_20200502_null_1)Node852,epi_isl_453990_Portugal_20200405_null_2,epi_isl_455317_Andalusia_20200305_null_1,epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3,epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_5)Node847,epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3,(epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1,epi_isl_443615_England_20200414_null_2)Node91,((epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1,epi_isl_432558_England_20200402_null_2)Node858,epi_isl_441224_England_20200402_null_1)Node857,epi_isl_448524_England_20200406_null_1,(epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1,epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1)Node87,epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1,epi_isl_442349_England_20200326_null_1,epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1,epi_isl_440508_England_20200312_null_1,epi_isl_452338_Beijing_20200319_null_1,(epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1,epi_isl_454781_Utrecht_20200404_null_8)Node887,(epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5,epi_isl_442636_England_20200405_null_1)Node881,(epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1,epi_isl_455391_Hubei_20200204_null_1)Node884,epi_isl_423328_England_20200327_null_2,epi_isl_450832_Vastmanland_20200504_null_1,epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2,epi_isl_454627_California_20200430_null_2,epi_isl_452809_Virginia_20200401_null_7,epi_isl_449175_England_20200418_null_1,epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1,epi_isl_451891_Ticino_20200406_null_1,epi_isl_443382_England_20200415_null_1,epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1,epi_isl_441548_England_20200406_null_1,epi_isl_440277_England_20200317_null_1,epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1,(epi_isl_441325_England_20200401_null_3,epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3)Node1041,(epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2,epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1)Node1038,(epi_isl_443505_England_20200416_null_2,epi_isl_449715_England_20200416_null_10)Node1032,epi_isl_448749_England_20200101_null_6,epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1,((epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1,epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1)Node1025,epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1)Node1024,epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_443325_England_20200415_null_1,epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1,(epi_isl_452741_Basque_Country_20200308_null_1,epi_isl_452930_England_20200511_null_6)Node1092,epi_isl_448489_England_20200405_null_1,epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1,((epi_isl_439476_England_20200330_null_1,epi_isl_439408_England_20200330_null_1,epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1,epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1,epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1,epi_isl_442209_England_20200405_null_1,epi_isl_455475_Arges_20200514_null_418)Node1057,epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5)Node1056,(epi_isl_450806_Virgin_Islands_20200408_null_4,epi_isl_452943_England_20200511_null_2)Node1071,(epi_isl_433719_England_20200404_null_1,epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_444435_England_20200418_null_2)Node1075,epi_isl_443807_England_20200329_null_1,(epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1,epi_isl_453664_England_20200517_null_4)Node1083,(epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1,epi_isl_440821_England_20200331_null_2,epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2)Node1086,epi_isl_421953_England_20200331_null_1,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,epi_isl_421947_England_20200331_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_453609_England_20200422_null_1,epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1,epi_isl_418715_England_20200317_null_1,epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1,epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1,epi_isl_423648_England_20200323_null_1,epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1,epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2,epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1,epi_isl_442282_England_20200404_null_1,epi_isl_420694_England_20200328_null_1,epi_isl_423052_England_20200319_null_5,(epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1,epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1)Node954,epi_isl_455224_Netherlands_20200101_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_442233_England_20200403_null_1,epi_isl_424007_England_20200320_null_1,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1,epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3,epi_isl_432594_England_20200412_null_1,epi_isl_448608_England_20200101_null_2,((epi_isl_438534_England_20200331_null_1,epi_isl_449643_England_20200404_null_5)Node999,epi_isl_441060_England_20200402_null_1)Node998,epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1,(epi_isl_448423_England_20200429_null_1,epi_isl_425404_England_20200319_null_1,epi_isl_454889_Stockholm_20200306_null_18)Node992,(epi_isl_440515_England_20200311_null_2,epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1)Node989,(epi_isl_424062_England_20200311_null_1,epi_isl_453748_England_20200421_null_165,epi_isl_423639_England_20200321_null_1,epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1,epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_453654_England_20200513_null_1)Node977,epi_isl_448642_England_20200101_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1024":"test",
"Node1025":"test",
"Node1032":"test",
"Node1038":"test",
"Node1041":"test",
"Node1056":"test",
"Node1057":"test",
"Node107":"test",
"Node1071":"test",
"Node1075":"test",
"Node1083":"test",
"Node1086":"test",
"Node1092":"test",
"Node1102":"test",
"Node1105":"test",
"Node1108":"test",
"Node113":"test",
"Node116":"test",
"Node1183":"test",
"Node133":"test",
"Node141":"test",
"Node145":"test",
"Node148":"test",
"Node275":"test",
"Node283":"test",
"Node296":"test",
"Node308":"test",
"Node406":"test",
"Node411":"test",
"Node551":"test",
"Node552":"test",
"Node557":"test",
"Node563":"test",
"Node580":"test",
"Node584":"test",
"Node587":"test",
"Node593":"test",
"Node609":"test",
"Node615":"test",
"Node620":"test",
"Node641":"test",
"Node642":"test",
"Node643":"test",
"Node653":"test",
"Node656":"test",
"Node662":"test",
"Node675":"test",
"Node676":"test",
"Node681":"test",
"Node690":"test",
"Node693":"test",
"Node696":"test",
"Node703":"test",
"Node704":"test",
"Node719":"test",
"Node762":"test",
"Node767":"test",
"Node770":"test",
"Node775":"test",
"Node779":"test",
"Node780":"test",
"Node786":"test",
"Node803":"test",
"Node806":"test",
"Node811":"test",
"Node812":"test",
"Node823":"test",
"Node831":"test",
"Node832":"test",
"Node837":"test",
"Node847":"test",
"Node852":"test",
"Node857":"test",
"Node858":"test",
"Node866":"test",
"Node87":"test",
"Node872":"test",
"Node875":"test",
"Node881":"test",
"Node884":"test",
"Node887":"test",
"Node893":"test",
"Node896":"test",
"Node899":"test",
"Node902":"test",
"Node905":"test",
"Node908":"test",
"Node91":"test",
"Node94":"test",
"Node954":"test",
"Node97":"test",
"Node977":"test",
"Node989":"test",
"Node992":"test",
"Node998":"test",
"Node999":"test",
"epi_isl_406595_Guangdong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_413857_Guangdong_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_414010_England_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_416361_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_2":"test",
"epi_isl_416392_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416694_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417140_Washington_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_417236_England_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417240_England_20200303_null_4":"test",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417312_England_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417413_Turkey_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417487_Oslo_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417607_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418040_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418715_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418874_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418949_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419388_Minnesota_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_419419_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419427_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419429_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419494_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419749_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420401_Ath_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420696_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420697_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420725_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420726_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420823_Utah_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420997_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421221_Hangzhou_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421281_Indiana_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421592_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421607_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421686_Minnesota_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421735_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421738_Luxembourg_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421775_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421895_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421947_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421953_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421956_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421964_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422057_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422116_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422431_Singapore_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422572_Friesland_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422590_Netherlands_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_422601_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422709_Netherlands_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423052_England_20200319_null_5":"test",
"epi_isl_423060_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423068_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423130_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423227_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423324_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_423328_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_423354_England_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423446_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423453_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_423548_England_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_423579_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_423639_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_423648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423740_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423752_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_423780_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_423825_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_423913_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423927_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_423933_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_424007_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424062_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_424138_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424241_Washington_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_424298_Washington_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_424311_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_424474_Reykjavik_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_424541_Reykjavik_20200301_null_2":"test",
"epi_isl_424989_Michigan_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_425023_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_425159_Wisconsin_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_425203_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_425404_England_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_425485_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_425585_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_426307_New_York_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_426320_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_426457_Virginia_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_426835_Victoria_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_426880_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_426901_Northern_territory_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_427052_Victoria_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_427090_Victoria_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_427290_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427291_Ohio_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_427384_Liege_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_427406_Doha_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2":"test",
"epi_isl_427614_New_York_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_427712_New_South_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_427779_New_South_Wales_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_428204_Nebraska_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_428230_New_Taipei_City_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_428487_Karnataka_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_428792_New_York_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_429008_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_429685_Minas_gerais_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_429724_Luxembourg_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_429756_Luxembourg_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_430132_Washington_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_430285_Washington_20200301_null_3":"test",
"epi_isl_430403_New_York_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_430474_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430483_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430504_Victoria_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_430511_Victoria_20200402_null_4":"test",
"epi_isl_430520_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430524_Victoria_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_430572_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430582_Victoria_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_430595_Victoria_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_430621_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_430634_Northern_Territory_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_430644_Victoria_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_430674_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_431833_Manila_20200322_null_3":"test",
"epi_isl_431901_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432013_Wales_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_432034_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_432049_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432055_Wales_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_432181_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_432208_Wales_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_432310_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_432532_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_432558_England_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_432594_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_432760_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_432908_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433000_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_433093_Scotland_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_433188_Scotland_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_433214_Scotland_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_433456_Scotland_20200411_null_1":"test",
"epi_isl_433537_Scotland_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_433719_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_434146_Washington_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434308_Washington_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_434498_Luxembourg_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_434554_Manila_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_434694_Samut_Prakarn_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_434740_Texas_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_434820_Texas_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_434967_Texas_20200330_null_10":"test",
"epi_isl_434988_Texas_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_435053_Gujarat_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_435060_Uttar_Pradesh_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_435066_Delhi_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_435105_Ladakh_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_435126_United_Arab_Emirates_20200225_null_2":"test",
"epi_isl_435554_Louisiana_20200425_null_2":"test",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_435722_New_York_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_436111_Victoria_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_436382_Comunitat_Valenciana_20200317_null_6":"test",
"epi_isl_436429_Delhi_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_436613_Wisconsin_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_436729_Abruzzo_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_436872_Michigan_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_436876_Michigan_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_437098_Michigan_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_437187_Surabaya_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_437255_Bavaria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437355_Kinshasa_20200417_null_4":"test",
"epi_isl_437374_Minnesota_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_437430_Virginia_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_437463_Makkah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_437465_Makkah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_437536_West_Bengal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_437571_California_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_437608_Thailand_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_437694_Makkah_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_437861_Washington_20200404_null_7":"test",
"epi_isl_437868_Connecticut_20200402_null_2":"test",
"epi_isl_437893_Athens_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438044_Vienna_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_438058_Vienna_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_438084_Vienna_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_438162_Washington_20200423_null_2":"test",
"epi_isl_438167_Washington_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_438260_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438282_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438396_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_438461_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_438473_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438515_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_438534_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_439005_Scotland_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_439042_Scotland_20200425_null_1":"test",
"epi_isl_439159_Scotland_20200420_null_5":"test",
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":"test",
"epi_isl_439229_Scotland_20200424_null_1":"test",
"epi_isl_439285_Scotland_20200414_null_7":"test",
"epi_isl_439297_Scotland_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_439335_Scotland_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_439379_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_439399_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439408_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_439419_England_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_439434_England_20200401_null_9":"test",
"epi_isl_439445_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_439476_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_439681_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_439920_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_439944_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_440019_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_440082_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_440096_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_440217_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_440247_England_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_440277_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_440325_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_440364_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_440382_England_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_440508_England_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_440515_England_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_440591_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_440640_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_440669_England_20200401_null_4":"test",
"epi_isl_440731_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_440740_England_20200405_null_4":"test",
"epi_isl_440767_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_440779_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_440819_England_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_440821_England_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_441060_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_441072_England_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_441079_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441130_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_441224_England_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_441325_England_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_441391_Northern_Ireland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_441534_England_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_441548_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_441555_England_20200405_null_5":"test",
"epi_isl_441570_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_441783_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_442025_England_20200411_null_3":"test",
"epi_isl_442207_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442209_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442231_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442233_England_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_442282_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_442349_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_442518_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_442533_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_442636_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442662_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_442776_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_442854_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442906_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_442935_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_442963_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_443011_England_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_443028_England_20200408_null_7":"test",
"epi_isl_443260_Ile_de_France_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_443282_Bretagne_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_443284_Hauts_de_France_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_443291_Bretagne_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_443325_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443382_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_443501_England_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_443505_England_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_443510_England_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_443538_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_443599_England_20200416_null_3":"test",
"epi_isl_443615_England_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_443625_England_20200414_null_6":"test",
"epi_isl_443690_England_20200329_null_3":"test",
"epi_isl_443803_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_443807_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_443907_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_443923_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_443979_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_443989_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_444128_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_444199_England_20200415_null_2":"test",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_444241_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_444283_England_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_444435_England_20200418_null_2":"test",
"epi_isl_444438_England_20200417_null_5":"test",
"epi_isl_444613_New_York_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_444670_New_Jersey_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_444698_New_York_20200330_null_7":"test",
"epi_isl_444889_Unknown_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_444946_Unknown_20200329_null_7":"test",
"epi_isl_444973_Catalonia_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_445068_Luxembourg_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_445109_California_20200312_null_4":"test",
"epi_isl_445149_Louisiana_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_445165_California_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_445169_California_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445256_Santiago_20200310_null_3":"test",
"epi_isl_445266_Antofagasta_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_445273_Rancagua_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_445306_Santiago_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_445335_Puerto_Montt_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_445415_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_445426_Wales_20200402_null_1":"test",
"epi_isl_445452_Wales_20200403_null_3":"test",
"epi_isl_445511_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_445512_Wales_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_445561_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445606_Wales_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_445768_Wales_20200409_null_2":"test",
"epi_isl_445788_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_445789_Wales_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_445916_Wales_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_445918_Wales_20200401_null_5":"test",
"epi_isl_445934_Wales_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_446053_Wales_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_446084_Wales_20200416_null_1":"test",
"epi_isl_446208_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446225_Wales_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_446254_Wales_20200408_null_3":"test",
"epi_isl_446265_Wales_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_446410_Wales_20200410_null_1":"test",
"epi_isl_446454_Wales_20200412_null_2":"test",
"epi_isl_446504_Wales_20200411_null_2":"test",
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_446722_Wales_20200414_null_6":"test",
"epi_isl_446735_Wales_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_446811_Wales_20200418_null_6":"test",
"epi_isl_446829_Wales_20200415_null_5":"test",
"epi_isl_446835_Wales_20200415_null_6":"test",
"epi_isl_446846_Wales_20200417_null_3":"test",
"epi_isl_446930_Wales_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_446978_Wales_20200416_null_8":"test",
"epi_isl_447025_Bangkok_20200402_null_3":"test",
"epi_isl_447044_Gujarat_20200503_null_3":"test",
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_1":"test",
"epi_isl_447063_Michigan_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_447217_Michigan_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_447297_South_Coast_District_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_447309_South_Coast_District_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_447366_Jerusalem_District_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_447416_Tel_Aviv_District_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_447547_Gujarat_20200428_null_3":"test",
"epi_isl_447552_Gujarat_20200502_null_15":"test",
"epi_isl_447799_Cesar_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_447810_Risaralda_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_447861_Telangana_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_447863_Telangana_20200414_null_3":"test",
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":"test",
"epi_isl_447904_Bangladesh_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_447940_England_20200429_null_5":"test",
"epi_isl_448006_England_20200501_null_3":"test",
"epi_isl_448135_Scotland_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_448197_Scotland_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_448318_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_448368_England_20200502_null_1":"test",
"epi_isl_448394_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_448403_England_20200501_null_1":"test",
"epi_isl_448423_England_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_448489_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_448511_England_20200405_null_1":"test",
"epi_isl_448524_England_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_448574_England_20200101_null_6":"test",
"epi_isl_448589_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448608_England_20200101_null_2":"test",
"epi_isl_448642_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448739_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_448749_England_20200101_null_6":"test",
"epi_isl_448775_England_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_448784_England_20200407_null_3":"test",
"epi_isl_448989_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_449014_England_20200420_null_3":"test",
"epi_isl_449016_England_20200419_null_1":"test",
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":"test",
"epi_isl_449064_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_449072_England_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_449109_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_449114_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_449139_England_20200408_null_2":"test",
"epi_isl_449142_England_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_449150_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_449175_England_20200418_null_1":"test",
"epi_isl_449315_Scotland_20200508_null_1":"test",
"epi_isl_449604_England_20200428_null_2":"test",
"epi_isl_449622_England_20200430_null_8":"test",
"epi_isl_449628_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_449643_England_20200404_null_5":"test",
"epi_isl_449655_England_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_449670_England_20200415_null_5":"test",
"epi_isl_449697_England_20200415_null_1":"test",
"epi_isl_449700_England_20200416_null_7":"test",
"epi_isl_449715_England_20200416_null_10":"test",
"epi_isl_449719_England_20200417_null_5":"test",
"epi_isl_449975_Washington_20200415_null_38":"test",
"epi_isl_449996_Washington_20200416_null_2":"test",
"epi_isl_450185_Louisiana_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_5":"test",
"epi_isl_450721_Wisconsin_20200401_null_26":"test",
"epi_isl_450806_Virgin_Islands_20200408_null_4":"test",
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_450811_Uppsala_20200406_null_2":"test",
"epi_isl_450826_Uppsala_20200427_null_2":"test",
"epi_isl_450832_Vastmanland_20200504_null_1":"test",
"epi_isl_450843_Dhaka_20200506_null_3":"test",
"epi_isl_451168_Ghent_20200403_null_1":"test",
"epi_isl_451181_Ghent_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1":"test",
"epi_isl_451337_Sichuan_20200130_null_6":"test",
"epi_isl_451376_Sichuan_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_451447_New_York_20200326_null_9":"test",
"epi_isl_451449_New_York_20200326_null_18":"test",
"epi_isl_451624_New_South_Wales_20200419_null_5":"test",
"epi_isl_451670_Ticino_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_451718_Graubunden_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451725_Graubunden_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451775_Vaud_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451778_Basel_Stadt_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_451783_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451794_Vaud_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_451808_Luzern_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_451809_Basel_Land_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451840_Zurich_20200331_null_2":"test",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451852_Zurich_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_451857_Basel_Land_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_451891_Ticino_20200406_null_1":"test",
"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_2":"test",
"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451908_Bern_20200407_null_8":"test",
"epi_isl_451915_Basel_Land_20200407_null_1":"test",
"epi_isl_451946_Bavaria_20200402_null_17":"test",
"epi_isl_451961_Apulia_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_451977_Malopolska_20200403_null_2":"test",
"epi_isl_452014_Denmark_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1":"test",
"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_19":"test",
"epi_isl_452097_Denmark_20200509_null_1":"test",
"epi_isl_452098_Denmark_20200509_null_7":"test",
"epi_isl_452338_Beijing_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_452399_Andalusia_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_452424_Andalusia_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_452425_Andalusia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_452539_Navarra_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_452541_Navarra_20200310_null_10":"test",
"epi_isl_452674_Basque_Country_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_452739_Basque_Country_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_452741_Basque_Country_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_452809_Virginia_20200401_null_7":"test",
"epi_isl_452884_England_20200506_null_2":"test",
"epi_isl_452916_England_20200507_null_4":"test",
"epi_isl_452930_England_20200511_null_6":"test",
"epi_isl_452931_England_20200101_null_17":"test",
"epi_isl_452935_England_20200513_null_14":"test",
"epi_isl_452943_England_20200511_null_2":"test",
"epi_isl_452961_England_20200511_null_1":"test",
"epi_isl_452971_England_20200511_null_4":"test",
"epi_isl_453101_Scotland_20200428_null_1":"test",
"epi_isl_453183_Scotland_20200516_null_2":"test",
"epi_isl_453191_Scotland_20200421_null_2":"test",
"epi_isl_453337_England_20200412_null_1":"test",
"epi_isl_453402_England_20200410_null_2":"test",
"epi_isl_453456_England_20200501_null_3":"test",
"epi_isl_453464_England_20200419_null_10":"test",
"epi_isl_453467_Northern_Ireland_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_453468_Northern_Ireland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_453520_England_20200407_null_5":"test",
"epi_isl_453563_England_20200424_null_3":"test",
"epi_isl_453601_England_20200422_null_2":"test",
"epi_isl_453609_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_453635_England_20200506_null_1":"test",
"epi_isl_453651_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_453654_England_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_453664_England_20200517_null_4":"test",
"epi_isl_453720_England_20200422_null_1":"test",
"epi_isl_453748_England_20200421_null_165":"test",
"epi_isl_453983_Portugal_20200404_null_3":"test",
"epi_isl_453990_Portugal_20200405_null_2":"test",
"epi_isl_454052_Portugal_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_454087_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_454097_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_454118_Portugal_20200423_null_10":"test",
"epi_isl_454143_Portugal_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_454154_Portugal_20200331_null_3":"test",
"epi_isl_454211_Portugal_20200401_null_21":"test",
"epi_isl_454249_Portugal_20200323_null_13":"test",
"epi_isl_454268_Portugal_20200409_null_1":"test",
"epi_isl_454298_Portugal_20200411_null_174":"test",
"epi_isl_454331_Portugal_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_454379_Pennsylvania_20200402_null_11":"test",
"epi_isl_454396_Pennsylvania_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_454442_Halland_20200309_null_16":"test",
"epi_isl_454455_Stockholm_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_454519_Nur_Sultan_20200426_null_3":"test",
"epi_isl_454525_Maharashtra_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_454537_Maharashtra_20200326_null_6":"test",
"epi_isl_454541_Maharashtra_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_454546_Maharashtra_20200403_null_61":"test",
"epi_isl_454595_Pula_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_454618_California_20200426_null_3":"test",
"epi_isl_454619_California_20200426_null_1":"test",
"epi_isl_454627_California_20200430_null_2":"test",
"epi_isl_454632_California_20200429_null_1":"test",
"epi_isl_454645_Connecticut_20200421_null_1":"test",
"epi_isl_454676_California_20200512_null_1":"test",
"epi_isl_454681_California_20200512_null_2":"test",
"epi_isl_454781_Utrecht_20200404_null_8":"test",
"epi_isl_454786_Utrecht_20200311_null_4":"test",
"epi_isl_454799_North_Carolina_20200401_null_2":"test",
"epi_isl_454812_North_Carolina_20200401_null_21":"test",
"epi_isl_454831_Rajasthan_20200429_null_5":"test",
"epi_isl_454889_Stockholm_20200306_null_18":"test",
"epi_isl_454900_Stockholm_20200310_null_10":"test",
"epi_isl_455088_New_South_Wales_20200321_null_6":"test",
"epi_isl_455091_New_South_Wales_20200513_null_1":"test",
"epi_isl_455113_Flevoland_20200401_null_50":"test",
"epi_isl_455146_Netherlands_20200404_null_2":"test",
"epi_isl_455165_Netherlands_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_455189_Netherlands_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_455224_Netherlands_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_455246_Netherlands_20200411_null_97":"test",
"epi_isl_455269_Netherlands_20200413_null_38":"test",
"epi_isl_455286_Netherlands_20200326_null_34":"test",
"epi_isl_455308_Odisha_20200404_null_1":"test",
"epi_isl_455310_Odisha_20200408_null_1":"test",
"epi_isl_455311_Odisha_20200507_null_2":"test",
"epi_isl_455314_Andalusia_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_455317_Andalusia_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_455323_Andalusia_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_455324_Andalusia_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_455330_Galicia_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_455391_Hubei_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_455406_Hubei_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_455412_Ogun_State_20200329_null_27010":"test",
"epi_isl_455422_Osun_State_20200329_null_6":"test",
"epi_isl_455438_Quintana_Roo_20200314_null_1533":"test",
"epi_isl_455446_Mazowieckie_20200313_null_30":"test",
"epi_isl_455475_Arges_20200514_null_418":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":30
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":12
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":43
}
}
}